Clone Name | rbasd16c19 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 580/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 580/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 580/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 887
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 579/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 887
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 887
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 577/583 (98%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 839
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaag 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 577/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkags 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 578/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 887
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 577/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 agcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 576/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnn 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 576/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 576/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 576/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 576/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 576/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1421 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1420 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1362 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1302 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1242 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1182 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1122 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1062 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1002 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 942 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 941 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 898
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagcca 949
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagcca 887
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaar-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56330 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 56271 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 56270 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 56212 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56211 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 56152 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56151 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 56092 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56091 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 56032 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56031 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 55972 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55971 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 55912 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55911 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55852 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55851 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 55792 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55791 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 55748
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 575/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1516 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1457 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1456 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1398 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1338 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1278 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1218 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1158 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1098 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1038 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 978 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 977 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 934
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 568/576 (98%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1140 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 840 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 780 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 720 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 575 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 719 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 684
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 568/576 (98%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1140 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 840 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 780 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 720 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 575 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 719 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 684
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 574/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 948
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 948
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 948
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 948
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 948
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1329 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1328 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1270 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1210 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1150 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1090 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1030 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 970 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 910 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 850 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 849 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 806
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/584 (98%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagcca 887
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttaga 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 839
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcc 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 948
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 572/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1272 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 972 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 912 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 852 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 851 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 808
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 948
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 887
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1272 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 972 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 912 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 852 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 851 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 808
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcggc 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 565/576 (98%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1140 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccagg 1080 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 840 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 780 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 720 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 575 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 719 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 684
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1279 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 979 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 919 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 859 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 858 gtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagcca 815
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1279 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 979 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 919 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 859 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 858 gtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagcca 815
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 571/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgct 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagcca 887
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 568/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 570/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 570/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcc 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 569/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 569/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1472 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1413 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1412 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1354 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1294 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1293 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1234 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1174 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1114 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 aataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1054 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 994 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 993 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacg 934 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 933 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 890
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 569/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 565/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgss 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1112 cttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 550/562 (97%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1330 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1271 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1270 caggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1211 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggc 1151 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 atatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccag 1091 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1031 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1030 tcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 971 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 911 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 851 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 850 ttgtcgcggcaataatgagcca 829
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 567/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1401 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1342 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1283 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1282 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccagg 1223 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1222 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1163 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1103 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1043 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 983 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 863 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 819
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 567/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 567/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 567/584 (97%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1519 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1460 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1459 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1401 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1341 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1340 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1281 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1221 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1161 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 1101 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1041 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 981 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 980 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 937
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 516/518 (99%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 827
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 566/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1381 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1322 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1321 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1263 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccagg 1203 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1202 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacc 1143 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1083 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 aacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1023 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 963 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 903 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 843 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 842 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 799
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 566/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 564/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgt 1285 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1225 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1224 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1165 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1164 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1105 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1045 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 985 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 925 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 924 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 865 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 822
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 515/518 (99%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1271 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1211 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1151 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1091 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1031 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 813
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 565/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagcca 839
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 522/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 783
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 522/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 783
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 539/551 (97%), Gaps = 1/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 33 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 92 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 93 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 152 ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 153 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 212 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 213 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 272 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 273 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 332 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 333 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 393 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 453 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 513 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 573 atagtgagcca 583 ||| ||||||| Sbjct: 829 ataatgagcca 819
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 523/530 (98%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag- 1289 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagcca 819
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 521/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1287 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 819
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 520/527 (98%), Gaps = 1/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atc 1286 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 417 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 537 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 819
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 546/562 (97%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1325 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagcca 824
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 521/530 (98%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 819
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 561/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1286 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1226 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1225 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1166 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1165 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1106 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1046 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 986 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 926 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 823
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 563/583 (96%), Gaps = 4/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124638 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124637 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124578 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124577 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 124518 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124517 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 124459 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124458 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 124400 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124399 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124280 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124279 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124220 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124219 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 124177 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 563/583 (96%), Gaps = 4/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30111 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30110 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30051 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30050 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 29991 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 29990 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 29932 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29931 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 29873 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29872 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29692 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 29650
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 519/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1305 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 837
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 519/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 536/551 (97%), Gaps = 1/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 33 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 92 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 93 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 152 ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 153 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 212 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 213 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 272 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 273 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 332 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 333 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 393 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 453 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 513 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 573 atagtgagcca 583 ||| ||||||| Sbjct: 829 ataatgagcca 819
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 511/518 (98%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 561/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 561/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1349 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1348 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1290 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1289 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1230 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1229 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1170 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1169 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1110 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1050 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 990 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 930 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 929 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 870 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 869 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 826
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 561/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1347 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1346 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1288 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1287 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1228 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1227 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1168 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1167 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1108 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1048 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 988 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 928 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 927 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 868 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 824
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 561/584 (96%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1361 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1360 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1302 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1301 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1242 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1241 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1182 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1181 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1122 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1062 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1002 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 942 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 941 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 882 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 881 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 838
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 54941
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 54941
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55352 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55351 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55292 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55291 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55232 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55231 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55172 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55171 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55112 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55111 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54992 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54991 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54932 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54931 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 54889
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 125693 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125692 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 125633 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 125632 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 125573 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 125572 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 125513 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125512 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 125453 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125452 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 125333 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125332 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 125273 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 125272 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 125230 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30633 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30632 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30573 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30572 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30513 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30512 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 30453 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30452 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 30393 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30392 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 30273 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30272 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 30213 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 30212 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 30170
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 124257 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30139 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 29676
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 124257 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30139 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 29676
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55396 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55395 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55336 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55335 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55276 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55275 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55216 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55215 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55156 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55155 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55036 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55035 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54976 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54975 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 54933
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||| |||| |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 33527268 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527269 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 33527328 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 33527329 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 33527388 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527389 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 33527448 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527449 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 33527508 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527509 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 33527628 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527629 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 33527688 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 33527689 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 33527731
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 72465 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72466 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 72525 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 72526 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 72585 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 72586 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 72645 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72646 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 72705 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72706 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 72825 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72826 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 72885 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 72886 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 72928
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1357 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1297 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1296 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1237 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1236 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1177 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1117 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 936 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 894
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1100 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1040 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1039 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 980 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 979 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 920 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 860 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 800 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 740 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 739 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 680 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 679 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 637
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55331 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55330 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55271 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55270 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55211 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55210 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55151 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55150 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55091 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55090 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54971 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54970 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54911 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54910 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 54868
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/583 (96%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1722 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1721 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1662 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1661 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1602 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1601 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1542 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1482 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1301 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 1259 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 29/30 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaag 1917
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 518/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 803
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 518/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 820
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 518/528 (98%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 803
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 526/539 (97%), Gaps = 1/539 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 104 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 105 cgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 164 |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1240 Query: 165 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 224 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1180 Query: 225 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 284 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1120 Query: 285 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 344 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1060 Query: 345 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1059 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttc 1000 Query: 405 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 821
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 560/584 (95%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1275 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1274 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1215 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1214 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1155 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1154 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1095 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1094 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1035 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 975 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 915 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 914 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 855 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 854 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagcca 811
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 519/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1290 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 820
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 560/584 (95%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 560/584 (95%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagcca 839
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 538/556 (96%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 tgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctc 84 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctt 1252 Query: 85 ggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 144 |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1193 Query: 145 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 204 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1192 gcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1133 Query: 205 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 264 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1132 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcata 1073 Query: 265 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 324 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 tgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1013 Query: 325 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 384 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 tgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 953 Query: 385 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 893 Query: 445 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 504 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 atatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 833 Query: 505 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 564 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 832 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattg 773 Query: 565 tcgcggcaatagtgag 580 ||||||||||| |||| Sbjct: 772 tcgcggcaataatgag 757
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 53606 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53605 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 53546 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 53545 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 53486 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 53485 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 53426 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53425 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 53366 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53365 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 53246 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53245 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 53186 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 53185 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 53143
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 128539 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128538 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 128479 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 128478 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 128419 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 128418 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 128359 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128358 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 128299 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128298 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 128179 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 128118 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 128076
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10347214 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347213 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10347154 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10347153 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10347094 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347093 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10347034 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347033 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10346974 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346973 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10346793 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 10346751
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10353253 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353252 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10353193 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10353192 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10353133 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353132 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10353073 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353072 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10353013 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353012 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10352893 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352892 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10352833 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10352832 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 10352790
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1689 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1688 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1629 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1628 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1569 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1568 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1509 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1449 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1448 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1329 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1269 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1268 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 1226
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 517/528 (97%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 542/562 (96%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1325 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagcca 824
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 509/518 (98%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgtccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagcca 827
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 509/518 (98%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1287 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1227 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1226 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1167 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1107 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1047 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 829
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 518/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1294 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 824
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 559/584 (95%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1336 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagt 1277 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1276 tcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1218 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1217 cccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1158 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1157 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1098 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1097 aaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1038 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 978 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 918 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 858 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 798 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 797 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 754
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 520/533 (97%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 110 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 111 agnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 170 || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 ag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 171 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 230 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 231 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 290 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 291 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 351 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 410 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 411 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 470 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 471 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 531 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614444 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614443 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614384 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614383 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614324 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614323 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614264 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614263 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614204 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614203 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614084 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614083 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614024 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614023 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 5613981 Score = 480 bits (242), Expect = e-132 Identities = 270/278 (97%), Gaps = 1/278 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 13436827 Score = 196 bits (99), Expect = 6e-47 Identities = 114/119 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 13397978 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 280 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.51 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaa 270 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614433 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614432 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614373 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614372 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614313 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614312 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614253 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614252 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614193 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614192 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614073 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614072 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614013 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614012 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 5613970 Score = 480 bits (242), Expect = e-132 Identities = 270/278 (97%), Gaps = 1/278 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 13391101 Score = 196 bits (99), Expect = 6e-47 Identities = 114/119 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 13352252 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 280 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.51 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaa 270 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/583 (95%), Gaps = 2/583 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38441 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38442 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38501 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38502 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38561 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38562 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38621 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38622 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38681 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38682 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38862 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 38904
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 511/522 (97%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1109 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 422 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 542 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 516/528 (97%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 803
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 513/524 (97%), Gaps = 1/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 556/581 (95%), Gaps = 2/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctgg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 536/555 (96%), Gaps = 1/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 88 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 89 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 148 ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 149 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 208 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 209 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 268 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 269 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 328 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1094 Query: 329 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 389 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 448 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacat 974 Query: 449 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 509 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 568 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 569 ggcaatagtgagcca 583 ||||||| ||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagcca 839
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 508/518 (98%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatata 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 517/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1296 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 826
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 513/525 (97%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 119 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 178 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 179 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 238 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 239 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 298 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 299 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 359 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 418 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 419 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 539 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 800
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 513/525 (97%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 119 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 178 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 179 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 238 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 239 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 298 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 299 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 359 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 418 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 419 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 539 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 800
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 558/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 23203692 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203693 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 23203751 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 23203752 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 23203811 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203812 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 23203871 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203872 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 23203931 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203932 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 23204112 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 23204154 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 558/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 154340 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154341 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 154399 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 154400 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 154459 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 154460 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 154519 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154520 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 154579 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154580 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 154699 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154700 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 154759 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 154760 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 154802
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 558/583 (95%), Gaps = 3/583 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38454 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38455 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38513 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38514 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38573 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38574 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38633 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38634 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38693 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38694 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38813 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38814 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38873 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38874 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 38916
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 522/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 510/522 (97%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1109 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 422 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 542 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 515/528 (97%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1287 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 819
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 509/520 (97%), Gaps = 1/520 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgccct 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgccct 1269 Query: 124 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1209 Query: 184 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 243 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1208 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1149 Query: 244 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 304 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1029 Query: 364 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 424 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 483 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 484 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 543 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 544 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 540/562 (96%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1386 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagctg 1327 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 848 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 847 ttgtcgcggcaataatgagcca 826
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 1/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 88 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 89 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 148 ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1258 Query: 149 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 208 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1198 Query: 209 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 268 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1138 Query: 269 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 328 |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 aaacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgag 1078 Query: 329 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1018 Query: 389 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 448 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1017 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 958 Query: 449 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 509 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 568 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 838 Query: 569 ggcaatagtgagcca 583 ||||||| ||||||| Sbjct: 837 ggcaataatgagcca 823
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 507/518 (97%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 507/518 (97%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 507/518 (97%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 516/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 819
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 557/584 (95%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1332 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1331 tcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1273 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 cccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1213 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1212 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1153 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1152 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1093 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1092 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttc 1033 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 973 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 913 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 912 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 853 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 852 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 521/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 493/500 (98%), Gaps = 1/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagcca 801
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 514/528 (97%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1291 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 823
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 511/524 (97%), Gaps = 1/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1292 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1232 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1231 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1172 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1112 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1052 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 992 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 828
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 493/500 (98%), Gaps = 1/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagcca 801
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 537/559 (96%), Gaps = 1/559 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1281 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 921 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||| |||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgag 842
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 511/525 (97%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 812
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 520/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 520/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 513/528 (97%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagcca 820
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 536/559 (95%), Gaps = 1/559 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1281 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 921 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||| |||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgag 842
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 505/518 (97%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 505/518 (97%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 827
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 505/518 (97%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagcca 827
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 519/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1136 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1076 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1075 cngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1016 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aagcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 956 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cacgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 896 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 719
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 519/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 510/525 (97%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgag 812
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 491/500 (98%), Gaps = 1/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||| ||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagcca 798
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 491/500 (98%), Gaps = 1/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||| ||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagcca 798
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 535/559 (95%), Gaps = 1/559 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 120480 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 120421 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120420 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 119942 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||| |||| Sbjct: 119941 ttgtcgcggcaataatgag 119923
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 535/559 (95%), Gaps = 1/559 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58853 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58794 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58793 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 58315 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||| |||| Sbjct: 58314 ttgtcgcggcaataatgag 58296
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 531/554 (95%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1836 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1777 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1776 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtaca 1718 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1717 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1658 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1657 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1598 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1597 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1538 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1478 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1477 tcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 1418 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 tggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1358 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1357 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1298 Query: 562 ttgtcgcggcaata 575 |||||||||||||| Sbjct: 1297 ttgtcgcggcaata 1284
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 531/554 (95%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1788 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1729 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1728 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1309 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1250 Query: 562 ttgtcgcggcaata 575 |||||||||||||| Sbjct: 1249 ttgtcgcggcaata 1236
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 504/518 (97%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1295 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1235 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1234 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagat 1175 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1115 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1055 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 837
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 548/576 (95%), Gaps = 2/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagt 59 ||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 119 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1720 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1719 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccagg 1660 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1659 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcc 1600 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1599 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1540 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1539 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttc 1480 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1479 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaa 1420 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1419 cttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagc 1360 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1359 taatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1300 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 575 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1299 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaata 1264
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 513/530 (96%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1279 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 518/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 501/515 (97%), Gaps = 1/515 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgtt 128 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgtt 1274 Query: 129 acgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 188 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1273 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1214 Query: 189 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1213 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1154 Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1153 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctgg 1094 Query: 309 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1034 Query: 369 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 429 tactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 488 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 489 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 549 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 819
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 518/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 518/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttccc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 534/559 (95%), Gaps = 1/559 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 1340 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||| |||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgag 842
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 534/559 (95%), Gaps = 1/559 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58272 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58213 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58212 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57734 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||| |||| Sbjct: 57733 ttgtcgcggcaataatgag 57715
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 511/528 (96%), Gaps = 1/528 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 534/559 (95%), Gaps = 1/559 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 atttgancgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 81 |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58282 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58223 Query: 82 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58222 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57744 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||| |||| Sbjct: 57743 ttgtcgcggcaataatgag 57725
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 495/507 (97%), Gaps = 1/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 136 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 137 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 196 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 197 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 256 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 257 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 317 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 376 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 377 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagcca 782
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 495/507 (97%), Gaps = 1/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 136 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 137 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 196 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 197 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 256 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 257 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 317 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 376 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 377 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagcca 782
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 510/527 (96%), Gaps = 1/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atc 1306 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 417 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 537 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 839
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 520/538 (96%), Gaps = 3/538 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 105 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 106 gagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 165 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 1227 Query: 166 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 225 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 gctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1167 Query: 226 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 285 || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1166 acggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccct 1107 Query: 286 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 345 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1047 Query: 346 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 405 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1046 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 987 Query: 406 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 465 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 cgctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 526 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 515/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 812
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 517/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagcca 809
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 517/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagcca 809
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 511/529 (96%), Gaps = 1/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 575 ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 817
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 517/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 494/507 (97%), Gaps = 1/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 136 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1270 Query: 137 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 196 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1269 gtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1210 Query: 197 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 256 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagag 1150 Query: 257 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1149 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaa 1090 Query: 317 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 1030 Query: 377 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 970 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagcca 823
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 526/550 (95%), Gaps = 1/550 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 31 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 90 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 349066 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 349125 Query: 91 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 150 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 349126 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 349184 Query: 151 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 210 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349185 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 349244 Query: 211 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 270 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349245 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 349304 Query: 271 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 330 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349305 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 349364 Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 390 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349365 aaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 349424 Query: 391 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 450 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349425 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 349484 Query: 451 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 510 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349485 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 349544 Query: 511 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 570 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 349545 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcgg 349604 Query: 571 caatagtgag 580 ||||| |||| Sbjct: 349605 caataatgag 349614
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 526/550 (95%), Gaps = 1/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 90 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 206643 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 206584 Query: 91 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 150 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 206583 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 206525 Query: 151 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 210 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206524 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 206465 Query: 211 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 270 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206464 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 206405 Query: 271 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 330 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206404 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 206345 Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 390 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206344 aaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 206285 Query: 391 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 450 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206284 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 206225 Query: 451 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 510 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206224 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 206165 Query: 511 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 570 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 206164 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcgg 206105 Query: 571 caatagtgag 580 ||||| |||| Sbjct: 206104 caataatgag 206095 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 526/550 (95%), Gaps = 1/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 90 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 77951 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 77892 Query: 91 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 150 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 77891 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 77833 Query: 151 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 210 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77832 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 77773 Query: 211 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 270 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77772 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 77713 Query: 271 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 330 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77712 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 77653 Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 390 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77652 aaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 77593 Query: 391 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 450 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77592 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 77533 Query: 451 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 510 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77532 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 77473 Query: 511 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 570 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 77472 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcgg 77413 Query: 571 caatagtgag 580 ||||| |||| Sbjct: 77412 caataatgag 77403
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 520/542 (95%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 101 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 102 tcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 161 || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaag-atctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccg 1243 Query: 162 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 221 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 gttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1183 Query: 222 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 281 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1123 Query: 282 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 341 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1122 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagatacc 1063 Query: 342 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 401 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 gcgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1003 Query: 402 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccaga 943 Query: 462 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaat 883 Query: 522 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 581 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 882 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 823 Query: 582 ca 583 || Sbjct: 822 ca 821
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 502/518 (96%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttc 1280 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 attacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1220 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 1219 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagat 1160 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1159 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1100 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1040 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 980 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 920 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 919 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 860 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 859 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 822
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 502/518 (96%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1267 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 gttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1207 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1206 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1147 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1146 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1087 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 cggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1027 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagcca 809
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 508/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatca 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcg 1248 Query: 118 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1247 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1188 Query: 178 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1187 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1128 Query: 238 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1127 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1068 Query: 298 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 357 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1008 Query: 358 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 948 Query: 418 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 477 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 478 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 537 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 538 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 782
>gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (rbcL) gene, partial cds Length = 1324 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 501/518 (96%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1324 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttc 1266 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 attacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1206 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 1205 yycccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagat 1146 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1086 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1026 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 966 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 906 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 905 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 846 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 845 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 808
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 516/537 (96%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 583 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 809 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,299,755 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4299755 Number of successful extensions: 123823 Number of sequences better than 10.0: 15305 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15259 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 57 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 84349 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21628 length of query: 583 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 560 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9600246714240 effective search space used: 9600246714240 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)