Clone Name | rbasd14f02 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 718/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 718/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 718/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 717/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1354 bits (683), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 714/720 (99%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctakt 1472 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 814
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttka 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 716/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1348 bits (680), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1348 bits (680), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1346 bits (679), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaa 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 715/722 (99%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 714/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttn 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 nntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 714/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccnnngtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 714/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcgcaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 714/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 714/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 714/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 714/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1334 bits (673), Expect = 0.0 Identities = 713/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacncgaatntgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1332 bits (672), Expect = 0.0 Identities = 712/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 712/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 713/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 713/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 713/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 712/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 712/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1322 bits (667), Expect = 0.0 Identities = 712/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatt-gccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1320 bits (666), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1320 bits (666), Expect = 0.0 Identities = 712/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1320 bits (666), Expect = 0.0 Identities = 712/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1316 bits (664), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacannctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1316 bits (664), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1423 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1422 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1363 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1303 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1243 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1183 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1123 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1063 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1004 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 944 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 884 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 883 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 824 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 823 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 765 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 764 ga 763
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgs 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 56331 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 56273 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 56272 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 56213 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56212 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 56153 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56152 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 56093 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56092 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 56033 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56032 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 55973 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55972 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 55913 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55912 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55854 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55853 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 55794 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55793 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 55734 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 55733 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 55674 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55673 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 55615 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 55614 ga 55613
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 711/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1517 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1459 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1458 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1399 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1339 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1279 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1219 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1159 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1099 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1040 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 980 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 920 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 919 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 860 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 859 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 801 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 800 ga 799
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaanntgat-cgccttccatacttcacaagctgcngcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1308 bits (660), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1306 bits (659), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 815 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 814 ga 813
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 815 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 814 ga 813
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 815 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 814 ga 813
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 815 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 814 ga 813
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 710/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1300 bits (656), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctactggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaan 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 812 acngctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccttt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1300 bits (656), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 815 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 814 ga 813
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1201 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1200 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1141 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1081 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1021 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 961 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 901 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcg 662 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 661 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 602 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 601 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 543 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 542 ga 541
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1201 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1200 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1141 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1081 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1021 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 961 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 901 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcg 662 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 661 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 602 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 601 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 543 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 542 ga 541
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccsscgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 937 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 819 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 818 ga 817
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1331 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1330 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1271 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1211 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1151 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1091 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1031 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 971 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 912 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 852 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 851 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 792 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 732 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 731 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 673 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 672 ga 671
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgs 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 709/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcttgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1333 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1332 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1273 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1213 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1153 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1093 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1033 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 973 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 794 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 gtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 734 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 733 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 675 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 674 ga 673
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 706/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacycgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 815 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 814 ga 813
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 937 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 819 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 818 ga 817
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1473 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1472 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1413 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1353 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1293 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1233 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1173 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 caataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 934 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 933 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 815 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 814 ga 813
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1333 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1332 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1273 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1213 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1153 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1093 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 taacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1033 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 973 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 794 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 734 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 733 acagctctcttcatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 675 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 674 ga 673
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 ccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1340 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1339 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1280 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1220 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1160 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1100 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1040 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 980 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 860 cggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 801 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 800 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 741 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 740 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 682 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 681 ga 680
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1340 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1339 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1280 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1220 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1160 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1100 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1040 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 980 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 860 cggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 801 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 800 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 741 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 740 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 682 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 681 ga 680
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcss 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 708/722 (98%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgccgcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 937 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 819 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 818 ga 817
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 707/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgg 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 ccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 706/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1477 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1476 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1417 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1416 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccag 1357 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1297 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1237 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1177 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 938 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 937 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 819 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 818 ga 817
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 706/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1201 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1200 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1141 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccag 1081 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1021 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 961 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 901 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcg 662 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 661 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 602 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 601 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 543 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 542 ga 541
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 706/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1412 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1411 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1352 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1292 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1232 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1172 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1112 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 873 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 872 gtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 754 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 753 ga 752
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 703/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1474 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgs 1414 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 scccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1353 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccc 1294 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnna 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 816 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 815 ga 814
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 704/722 (97%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaattnnnn-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 ccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 651/654 (99%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 692
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 650/654 (99%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 791 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 731 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 730 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 678
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 701/720 (97%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1473 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggcta 1415 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1414 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1355 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1295 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1294 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1235 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1175 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1115 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 caataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1055 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 996 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 995 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgca 936 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 935 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 876 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 875 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 816 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 815 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 757
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 657/664 (98%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 652 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 651 ttga 648
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 657/664 (98%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 652 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 651 ttga 648
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 699/720 (97%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1382 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggcta 1324 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1323 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1264 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccag 1204 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1203 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcac 1144 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1084 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 taacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1024 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 964 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 905 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 845 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 785 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 725 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 666
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 699/720 (97%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1243 gtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 699/720 (97%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 699/720 (97%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1520 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggcta 1462 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1461 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1402 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1342 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1341 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1282 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1222 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 taacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1162 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1102 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 983 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 982 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 923 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 863 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 862 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 804
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 698/720 (96%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1402 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggcta 1344 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1343 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1284 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1283 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccag 1224 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1223 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1164 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1104 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1044 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttcta 984 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 805 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 745 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 744 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 686
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 668/682 (97%), Gaps = 3/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttctt 743
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 655/666 (98%), Gaps = 2/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 596 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 716 ccttga 721 |||||| Sbjct: 689 ccttga 684
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 687/706 (97%), Gaps = 4/706 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 aactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 75 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 1338 Query: 76 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 135 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1337 gcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagc 1278 Query: 136 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 195 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1277 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagg 1218 Query: 196 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 255 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcag 1158 Query: 256 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 315 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatgga 1098 Query: 316 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 375 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1038 Query: 376 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 435 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 caataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 436 acccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 495 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 a-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 919 Query: 496 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 859 Query: 556 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 858 gtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagtta 799 Query: 616 agtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatca 675 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| Sbjct: 798 agtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctcttcatca 739 Query: 676 tttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 738 tttcttcacatgtacccgcagttgca-ttcaagtaatgccccttga 694
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 652/663 (98%), Gaps = 2/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 119 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 178 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 179 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 238 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 239 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 299 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 359 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 419 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 539 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 598 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 599 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 658 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 659 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 718 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 687 Query: 719 tga 721 ||| Sbjct: 686 tga 684
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 653/664 (98%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 688 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 687 ttga 684
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 696/719 (96%), Gaps = 4/719 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 824 Query: 601 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 823 tgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaata 764 Query: 661 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 763 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 645/654 (98%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 692
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 695/720 (96%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1345 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1344 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgt 1285 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1225 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1224 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1165 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1164 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1105 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1045 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 985 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 926 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 925 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 866 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 865 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 806 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 aaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaatac 746 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 745 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 687
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 695/720 (96%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcgcaagccgcagcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 caaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 650/664 (97%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 596 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 716 cctt 719 |||| Sbjct: 689 cctt 686
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 642/654 (98%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 692
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 648/662 (97%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 764 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 706 Query: 718 tt 719 || Sbjct: 705 tt 704
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 694/718 (96%), Gaps = 6/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagt 124698 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 124697 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 124638 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124637 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124578 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124577 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 124518 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124517 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 124459 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124458 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 124400 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124399 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124281 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124280 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124221 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124220 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124161 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124160 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 124101 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124100 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 124044 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 694/718 (96%), Gaps = 6/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagt 30171 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30170 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30111 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30110 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30051 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30050 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 29991 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 29990 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 29932 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29931 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 29873 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29872 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29754 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29753 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29694 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29693 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29634 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29633 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 29574 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29573 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 29517
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 2/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 625 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 626 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 685 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 686 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 700 tgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 666
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 661/680 (97%), Gaps = 2/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 99 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 100 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 159 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 160 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 219 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 220 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 279 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 280 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 339 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 340 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 400 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccc 459 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccc 945 Query: 460 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885 Query: 520 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 579 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 884 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 825 Query: 580 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 639 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765 Query: 640 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcg 699 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 764 ctcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcg 705 Query: 700 catttcaagtaatgcccctt 719 || ||||||||||||||||| Sbjct: 704 ca-ttcaagtaatgcccctt 686
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 2/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 625 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 626 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 685 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 686 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 700 tgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 666
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 649/664 (97%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatgtcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 677 ttga 674
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 641/654 (98%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 692
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 647/662 (97%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 718 tt 719 || Sbjct: 671 tt 670
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 647/662 (97%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 718 tt 719 || Sbjct: 671 tt 670
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 655/673 (97%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 106 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 107 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 166 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 167 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 226 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 227 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 286 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 287 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 346 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 347 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 407 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 466 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 586 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 820 Query: 587 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 actagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaa 760 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 706 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 759 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttca 701 Query: 707 agtaatgcccctt 719 ||||||||||||| Sbjct: 700 agtaatgcccctt 688
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 648/664 (97%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 596 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 715 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 691 Query: 716 cctt 719 |||| Sbjct: 690 cctt 687
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 690/718 (96%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 55412 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55411 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55352 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55351 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55292 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55291 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55232 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55231 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55172 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55171 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55112 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55111 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54993 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54992 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54933 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54932 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54873 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54872 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 54813 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 54812 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 54756
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 646/662 (97%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 689 Query: 718 tt 719 || Sbjct: 688 tt 687
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 690/718 (96%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 125753 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 125752 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 125693 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125692 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 125633 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 125632 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 125573 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 125572 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 125513 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125512 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 125453 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125452 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 125334 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 125333 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 125274 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125273 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 125214 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125213 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 125154 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 125153 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 125097 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 690/718 (96%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 30693 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30692 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30633 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30632 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30573 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30572 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30513 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30512 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 30453 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30452 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 30393 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30392 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 30274 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 30273 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 30214 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30213 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 30154 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30153 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 30094 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30093 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 30037
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 693/722 (95%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 1409 agtatctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggcta 1351 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1350 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1291 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1290 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1231 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1230 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1171 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1170 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1111 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1051 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 991 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 872 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 812 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 811 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 752 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 751 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 693 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 692 ga 691
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 693/722 (95%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 1407 agtatctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggcta 1349 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1348 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1289 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1288 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1229 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1228 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1169 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1168 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1109 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1049 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 989 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 870 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 810 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 809 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 750 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 749 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 691 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 690 ga 689
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 693/722 (95%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 1421 agtatctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggcta 1363 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1362 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1303 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1302 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1243 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1242 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1183 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1182 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1123 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1063 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1003 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 884 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 824 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 764 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 763 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 705 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 704 ga 703
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 690/718 (96%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 33527208 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 33527209 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 33527268 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527269 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 33527328 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 33527329 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 33527388 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527389 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 33527448 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527449 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 33527508 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527509 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 33527627 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 33527628 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 33527687 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527688 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 33527747 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527748 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 33527807 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 33527808 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 33527864 Score = 248 bits (125), Expect = 2e-62 Identities = 147/153 (96%), Gaps = 1/153 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 567 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 626 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 627 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 686 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcat 39115353 Query: 687 gtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 39115352 gtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 39115321
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 690/718 (96%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 72405 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 72406 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 72465 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72466 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 72525 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 72526 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 72585 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 72586 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 72645 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72646 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 72705 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72706 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 72824 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 72825 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 72884 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72885 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 72944 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72945 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 73004 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 73005 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 73061
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 690/718 (96%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 55391 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55390 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55331 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55330 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55271 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55270 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55211 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55210 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55151 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55150 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55091 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55090 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54972 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54971 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54912 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54911 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54852 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54851 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 54792 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 54791 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 54735
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 638/652 (97%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 747 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 746 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 696
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 647/664 (97%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 596 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 753 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 695 Query: 716 cctt 719 |||| Sbjct: 694 cctt 691
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 659/680 (96%), Gaps = 2/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 99 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 100 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 159 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 160 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 219 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 220 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 279 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 280 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 339 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 340 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 400 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccc 459 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccc 945 Query: 460 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885 Query: 520 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 579 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 884 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 825 Query: 580 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 639 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765 Query: 640 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcg 699 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 764 cccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcg 705 Query: 700 catttcaagtaatgcccctt 719 || ||||||||||||||||| Sbjct: 704 ca-ttcaagtaatgcccctt 686
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 691/720 (95%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcggtcgca-ttcaagtaatgccccttga 704
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 691/720 (95%), Gaps = 4/720 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1346 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1345 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1286 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1226 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1225 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1166 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1165 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1106 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1046 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 986 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 927 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 926 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 867 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 807 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 806 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 747 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 746 agctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 688
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 644/660 (97%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 704
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 762 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 640/656 (97%), Gaps = 2/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 124 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 183 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 184 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 243 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 244 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 304 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 363 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 364 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 424 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 483 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 484 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 544 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 603 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 604 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 663 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 664 ctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 748 ctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaaataatgcccctt 694
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 55464 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55463 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55404 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54925 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54924 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 54865 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 54864 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 54808
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 55464 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55463 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55404 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54925 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54924 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 54865 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 54864 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 54808
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 124780 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 124779 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 124720 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124241 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124240 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 124181 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124180 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 124124 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 30199 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30198 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30139 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29660 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29659 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 29600 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29599 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 29543
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 124780 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 124779 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 124720 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124241 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124240 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 124181 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124180 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 124124 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 30199 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30198 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 30139 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29660 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29659 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 29600 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29599 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 29543
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 55456 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 55455 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 55396 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55395 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55336 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55335 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55276 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55275 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55216 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55215 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55156 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55155 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55037 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55036 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54977 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54976 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54917 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54916 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 54857 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 54856 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 54800
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 762 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 645/662 (97%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 718 tt 719 || Sbjct: 671 tt 670
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 692/722 (95%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactccaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 692/722 (95%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1363 gttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcac 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccg 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct: 1243 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 53666 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 53665 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 53606 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53605 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 53546 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 53545 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 53486 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 53485 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 53426 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53425 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 53366 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53365 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 53247 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 53246 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 53187 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53186 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 53127 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53126 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 53067 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 53066 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 53010
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 128599 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 128598 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 128539 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128538 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 128479 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 128478 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 128419 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 128418 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 128359 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128358 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 128299 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128298 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 128180 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 128179 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 128120 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128119 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 128060 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128059 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 128000 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 127999 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 127943
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 10347274 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 10347273 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 10347214 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347213 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10347154 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10347153 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10347094 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347093 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10347034 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347033 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10346974 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346973 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10346855 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10346854 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10346795 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10346794 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 10346735 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10346734 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 10346675 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10346674 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 10346618
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1417 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1416 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1357 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1297 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1296 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1237 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1236 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1177 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1117 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 998 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 997 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 938 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 937 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 878 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 877 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 818 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 817 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 761
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1160 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1159 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1100 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1040 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1039 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 980 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 979 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 920 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 860 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 800 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 741 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 740 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 681 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 680 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 621 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 620 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 561 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 560 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 504
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 10353313 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 10353312 tcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 10353253 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353252 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10353193 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10353192 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10353133 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353132 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10353073 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353072 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10353013 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353012 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10352894 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10352893 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10352834 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10352833 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 10352774 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10352773 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 10352714 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10352713 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 10352657
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1749 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1748 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1689 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1688 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1629 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1628 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1569 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1568 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1509 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1449 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1448 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1330 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1329 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1270 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 1210 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1209 gaatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 1150 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1149 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 1093
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 689/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1782 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1781 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1722 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1721 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1662 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1661 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1602 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1601 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1542 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1482 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1363 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1303 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1302 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 1243 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1242 gaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 1183 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1182 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 1126 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 85 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0 Identities = 691/721 (95%), Gaps = 4/721 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaagctgcggctag 1335 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1334 ttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1275 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1274 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1215 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1214 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1155 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1154 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1095 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1094 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1035 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 975 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 916 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 915 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 856 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 855 ggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 796 Query: 601 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 795 tgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 736 Query: 661 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 720 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 735 cagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttg 677 Query: 721 a 721 | Sbjct: 676 a 676
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 646/664 (97%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 596 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 716 cctt 719 |||| Sbjct: 689 cctt 686
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 640/656 (97%), Gaps = 2/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 126 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 186 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 246 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 306 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 366 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 426 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 485 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 486 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 545 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 546 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 605 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 606 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 666 ctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 728 ctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 674
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 648/667 (97%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 112 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 113 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 172 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 173 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 232 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 233 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 292 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 293 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 353 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 412 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 413 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 472 ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 473 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 533 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 592 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 593 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 652 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 653 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaat 712 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaat 713 Query: 713 gcccctt 719 ||||||| Sbjct: 712 gcccctt 706
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 691/722 (95%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggcta 1364 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1244 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1243 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1184 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1124 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 764 atagctctcttcatcatttcttcgactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 706 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 705 ga 704
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 691/722 (95%), Gaps = 4/722 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggcta 59 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 1337 agtatctactggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagctgcggcaa 1279 Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1278 gttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1219 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1218 gcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccg 1159 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1158 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccc 1099 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1098 caaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggta 1039 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 taacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 979 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 919 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 860 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 800 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 740 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 739 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 680 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 679 acagctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagttgca-ttcaagtaatgcccctt 621 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 620 ga 619
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 636/652 (97%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 694
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 641/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 601 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 661 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 667
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 641/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 601 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 661 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 667
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 643/662 (97%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 688 Query: 718 tt 719 || Sbjct: 687 tt 686
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 640/658 (97%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 752 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 751 agctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 695
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 687/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagt 5614504 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 5614503 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 5614444 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614443 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614384 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614383 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614324 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614323 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614264 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614263 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614204 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614203 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614085 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614084 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614025 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614024 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 5613965 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5613964 gaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 5613905 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 5613904 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 5613848 Score = 684 bits (345), Expect = 0.0 Identities = 399/413 (96%), Gaps = 3/413 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 307 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 367 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866 Query: 547 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 606 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13436865 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13436806 Query: 607 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13436805 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13436746 Query: 667 tcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13436745 tcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 13436694 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 586 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 587 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 7e-04 Identities = 33/35 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>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 688/718 (95%), Gaps = 5/718 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 23203632 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 23203633 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 23203692 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203693 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 23203751 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 23203752 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 23203811 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203812 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 23203871 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203872 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 23203931 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203932 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 23204050 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 23204051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 23204110 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23204111 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 23204170 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23204171 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 23204230 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 23204231 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 23204287 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 115 atc 117 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 115 atc 117 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 688/718 (95%), Gaps = 5/718 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 154280 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 154281 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 154340 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154341 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 154399 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 154400 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 154459 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 154460 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 154519 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154520 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 154579 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154580 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 154698 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 154699 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 154758 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154759 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 154818 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154819 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 154878 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 154879 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 154935
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 688/718 (95%), Gaps = 5/718 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagt 38394 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 38395 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 38454 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38455 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38513 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38514 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38573 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38574 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38633 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38634 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38693 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38694 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38812 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38813 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38872 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38873 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 38932 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38933 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 38992 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38993 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 39049
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 687/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagt 5614493 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 5614492 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 5614433 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614432 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614373 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614372 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614313 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614312 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614253 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614252 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614193 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614192 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614074 Query: 482 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tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 367 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391199 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13391140 Query: 547 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 606 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13391139 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13391080 Query: 607 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13391079 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13391020 Query: 667 tcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13391019 tcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 13390968 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 586 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 587 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 7e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 332 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.63 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 ggtcagagctggcatatgccaa 271 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 687/718 (95%), Gaps = 4/718 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagt 38381 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 38382 tcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 38441 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38442 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38501 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38502 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38561 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38562 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38621 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38622 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38681 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38682 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38800 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38801 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38860 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38861 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 38920 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38921 gaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 38980 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38981 agctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 39037
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 651/673 (96%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 644/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 677 ttga 674
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 644/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcgtcgactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 677 ttga 674
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 637/656 (97%), Gaps = 2/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 124 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 183 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 184 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 243 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 244 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 304 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 363 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 364 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 424 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 483 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 484 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 544 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 603 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 604 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 663 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 664 ctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 748 ctcttttaatcatttcttcacatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 694
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 642/662 (96%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 750 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 692 Query: 718 tt 719 || Sbjct: 691 tt 690
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 688/721 (95%), Gaps = 4/721 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctag 1333 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1332 ttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1273 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 cccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1213 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1212 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1153 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1152 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1093 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1092 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttc 1033 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 973 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 914 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 913 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 854 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 853 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 794 Query: 601 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 793 tgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 734 Query: 661 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 720 |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 733 cagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttg 675 Query: 721 a 721 | Sbjct: 674 a 674
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 650/673 (96%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 634/652 (97%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 694
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 634/652 (97%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 694
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 634/652 (97%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 815 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 755 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 754 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 704
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 672/700 (96%), Gaps = 4/700 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 1327 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1087 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagt 621 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagt 788 Query: 622 catgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 787 catgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatctt 728 Query: 682 cacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 727 cgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 689
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 620/634 (97%), Gaps = 2/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 625 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 626 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 685 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 686 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 697 tgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 665
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 644/666 (96%), Gaps = 2/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 596 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 715 |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 755 aaatacggctcttttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 697 Query: 716 ccttga 721 |||||| Sbjct: 696 ccttga 691
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 620/634 (97%), Gaps = 2/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 386 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 446 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 506 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 566 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 625 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 626 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 685 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 686 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 697 tgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 665
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 687/721 (95%), Gaps = 4/721 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatt-gctttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctgg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttg 944 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 884 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcgg 824 Query: 601 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 823 tgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 764 Query: 661 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 720 |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 763 cagctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttg 705 Query: 721 a 721 | Sbjct: 704 a 704
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 649/673 (96%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 649/673 (96%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 633/652 (97%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 694
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 633/652 (97%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 694
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 642/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 689 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 688 ttga 685
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 642/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 677 ttga 674
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 653/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 102 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 103 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 162 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 163 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 222 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 223 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 282 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 283 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 342 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 343 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 402 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1021 Query: 403 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 463 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 522 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 523 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 582 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 583 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 642 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 643 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcat 702 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttgttcgcatgtacctgcagtcgca- 723 Query: 703 ttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccccttga 704
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 648/673 (96%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 716 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 tagtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 656 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| Sbjct: 655 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaag 597 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 596 taatgccccttga 584
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 643/666 (96%), Gaps = 2/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 416 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 475 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 476 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 535 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 536 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 595 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 596 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 715 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 680 Query: 716 ccttga 721 |||||| Sbjct: 679 ccttga 674
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 624/641 (97%), Gaps = 2/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 139 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 970 Query: 439 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 499 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 559 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 618 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 619 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 730 Query: 679 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 729 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 690
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 686/721 (95%), Gaps = 4/721 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 60 ||||| ||||||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctag 1278 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1277 ttcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1218 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccagg 1158 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1157 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1098 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1097 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtat 1038 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1037 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttc 978 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 918 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 859 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 858 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 799 Query: 541 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 600 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| Sbjct: 798 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcgg 739 Query: 601 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 738 tgaatcctccagttaaatagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatg 679 Query: 661 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 720 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 678 cagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttg 620 Query: 721 a 721 | Sbjct: 619 a 619
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 648/673 (96%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 632/652 (96%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctct 745 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 694
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 632/652 (96%), Gaps = 2/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 726 cttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 676
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 576/578 (99%), Gaps = 2/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 144 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 203 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 204 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 264 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 324 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 384 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggag 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggag 1876 Query: 444 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1875 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1816 Query: 504 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1815 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 1756 Query: 564 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1755 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 1696 Query: 624 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1695 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 1636 Query: 684 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1635 catgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 1599
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 647/673 (96%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 676/709 (95%), Gaps = 4/709 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 72 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 73 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 132 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 133 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 192 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 193 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 253 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 312 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 313 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 373 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 432 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 433 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 492 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 493 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 552 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 553 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 612 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || | Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccag 812 Query: 613 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 672 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 673 tcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 751 tcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 704
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 640/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 677 ttga 674
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 628/649 (96%), Gaps = 2/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 71 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 130 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 131 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 190 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 191 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 251 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 311 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 371 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 431 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 490 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 491 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 551 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 610 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 611 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 670 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctt 734 Query: 671 aatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 733 aatcatttcttcacatgtacctgcagttgca-ttcaagtaatgcccctt 686
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 613/629 (97%), Gaps = 2/629 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 152 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 153 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 212 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 213 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 272 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 273 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 332 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 333 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 392 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 393 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatga 452 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatga 919 Query: 453 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 859 Query: 513 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 799 Query: 573 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 632 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattaca 739 Query: 633 ataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 692 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 ataggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttcttcacatgtaccc 679 Query: 693 gcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 678 gcagttgca-ttcaagtaatgccccttga 651
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 622/641 (97%), Gaps = 2/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 139 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 439 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 498 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 499 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 559 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 618 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 619 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 679 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 688 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 649
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 622/641 (97%), Gaps = 2/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 139 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 439 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 498 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 499 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 559 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 618 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 619 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 679 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 688 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 649
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 646/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 646/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 646/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 675/709 (95%), Gaps = 4/709 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 72 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 73 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 132 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 133 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 192 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 193 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 253 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 312 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 313 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 373 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 432 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 433 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 492 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 493 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 552 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 553 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 612 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || | Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccag 812 Query: 613 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 672 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 673 tcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 751 tcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 704
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 636/660 (96%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 542 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 601 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 602 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 743 Query: 662 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 742 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 684
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 668/700 (95%), Gaps = 4/700 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 81 |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1387 aatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagc 1329 Query: 82 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 141 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 tgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1269 Query: 142 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 201 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1268 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1209 Query: 202 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 261 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1149 Query: 262 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 321 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1148 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1089 Query: 322 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 381 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 gtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1029 Query: 382 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1028 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 970 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 969 cgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 910 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 909 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 850 Query: 562 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagt 621 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagt 790 Query: 622 catgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 789 catgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttctt 730 Query: 682 cacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 729 cgactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 691
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 638/663 (96%), Gaps = 2/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 119 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 179 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 238 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 239 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 299 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 358 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 359 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 419 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 478 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 538 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 539 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 598 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 599 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 658 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 659 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 718 || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 707 Query: 719 tga 721 ||| Sbjct: 706 tga 704
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 637/662 (96%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 540 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 600 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 708 Query: 660 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 707 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 649 Query: 720 ga 721 || Sbjct: 648 ga 647
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 cccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaag 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| Sbjct: 745 ctctcgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtagca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 638/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cagtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 ataccgctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 677 ttga 674
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 638/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 417 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 538 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 597 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 598 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 658 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 717 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagttgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 718 ttga 721 |||| Sbjct: 677 ttga 674
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 649/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 102 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 1321 Query: 103 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 162 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 1261 Query: 163 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 222 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 223 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 282 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 283 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 342 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 343 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 402 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1080 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 1021 Query: 403 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccg 962 Query: 463 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 523 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 582 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842 Query: 583 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 642 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 643 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcat 702 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 781 ctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca- 723 Query: 703 ttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccccttga 704
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 649/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 102 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58253 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58194 Query: 103 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 162 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58193 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58134 Query: 163 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 222 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58133 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58074 Query: 223 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 282 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58073 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58014 Query: 283 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 342 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58013 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57954 Query: 343 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 402 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57953 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57894 Query: 403 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 57893 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccg 57835 Query: 463 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57834 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 57775 Query: 523 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 582 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 57774 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 57715 Query: 583 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 642 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57714 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 57655 Query: 643 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcat 702 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 57654 ctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca- 57596 Query: 703 ttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||| Sbjct: 57595 ttcaagtaatgccccttga 57577
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 649/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 102 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120461 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 120402 Query: 103 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 162 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 120401 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 120342 Query: 163 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 222 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120341 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 120282 Query: 223 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 282 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120281 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 120222 Query: 283 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 342 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120221 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 120162 Query: 343 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 402 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 120161 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 120102 Query: 403 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 120101 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccg 120043 Query: 463 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120042 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 119983 Query: 523 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 582 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 119982 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 119923 Query: 583 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 642 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119922 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 119863 Query: 643 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcat 702 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 119862 ctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca- 119804 Query: 703 ttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||| Sbjct: 119803 ttcaagtaatgccccttga 119785
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 649/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 102 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58263 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58204 Query: 103 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 162 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58203 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58144 Query: 163 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 222 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58143 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58084 Query: 223 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 282 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58083 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58024 Query: 283 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 342 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58023 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57964 Query: 343 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 402 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57963 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57904 Query: 403 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 57903 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccg 57845 Query: 463 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57844 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 57785 Query: 523 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 582 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 57784 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 57725 Query: 583 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 642 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57724 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 57665 Query: 643 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcat 702 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 57664 ctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca- 57606 Query: 703 ttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||| Sbjct: 57605 ttcaagtaatgccccttga 57587
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 649/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 102 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58834 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58775 Query: 103 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 162 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58774 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58715 Query: 163 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 222 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58714 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58655 Query: 223 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 282 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58654 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58595 Query: 283 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 342 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58594 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 58535 Query: 343 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 402 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 58534 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 58475 Query: 403 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 58474 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccg 58416 Query: 463 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58415 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 58356 Query: 523 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 582 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 58355 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 58296 Query: 583 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 642 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58295 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 58236 Query: 643 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcat 702 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 58235 ctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca- 58177 Query: 703 ttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||||||| Sbjct: 58176 ttcaagtaatgccccttga 58158
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 648/678 (95%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 103 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 104 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 163 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 164 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 223 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 224 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 283 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 284 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 343 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 344 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 403 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 404 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccaga 463 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccaga 943 Query: 464 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 523 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaat 883 Query: 524 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 583 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 882 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 823 Query: 584 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 643 |||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 caaactagtatttgcggtgaatcctcctgttatgtagtcatgcattacaataggaacccc 763 Query: 644 taattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatt 703 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | Sbjct: 762 taattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-t 704 Query: 704 tcaagtaatgccccttga 721 |||||||||||||||||| Sbjct: 703 tcaagtaatgccccttga 686
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 630/654 (96%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 128 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 428 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 487 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 920 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 547 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 919 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 860 Query: 548 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 859 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatcc 800 Query: 608 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 667 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 799 cccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctct 740 Query: 668 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 721 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 739 cttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 687
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 4/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 107 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 108 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 167 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 168 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 227 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 228 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 287 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 288 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 347 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 348 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 587 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 588 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 647 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaat 747 Query: 648 tctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaa 707 || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 746 tccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaa 688 Query: 708 gtaatgccccttga 721 |||||||||||||| Sbjct: 687 gtaatgccccttga 674
>emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1301 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 611/629 (97%), Gaps = 2/629 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 91 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 150 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1301 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1242 Query: 151 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1182 Query: 211 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 270 ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 cccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1122 Query: 271 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1121 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcttgagt 1062 Query: 331 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1002 Query: 391 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1001 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtgaatat 943 Query: 451 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 883 Query: 511 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 882 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 823 Query: 571 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 630 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 822 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 763 Query: 631 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 762 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 703 Query: 691 ccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 719 | ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 675
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccccgacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 cccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 2/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 408 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 409 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 468 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 469 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 528 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 529 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 588 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaac 806 Query: 589 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 648 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 649 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 708 | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| Sbjct: 745 cccttgcaaatccagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagttgca-ttcaag 687 Query: 709 taatgccccttga 721 ||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttga 674 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 5,440,911 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 5440911 Number of successful extensions: 156478 Number of sequences better than 10.0: 15171 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15103 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 82 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 106414 Number of HSP's gapped (non-prelim): 24465 length of query: 721 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 698 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11966021797392 effective search space used: 11966021797392 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)