Clone Name | rbasd13c12 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 602/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 602/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 602/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 601/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgcttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcggttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnc 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 ||||||||| Sbjct: 893 gcctaattct 884
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 599/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 598/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 592/601 (98%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1483 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcg 1425 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1424 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1365 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1364 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1305 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1245 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1185 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 1125 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1124 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 1065 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 1005 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 945 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 885 Query: 610 t 610 | Sbjct: 884 t 884
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 598/610 (98%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 597/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 cytt-cgcgagcaaratcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 597/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacannctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1441 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1382 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1381 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1323 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1263 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1203 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1143 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1083 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1082 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1023 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 963 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 962 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 903 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 843 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 842 ccctaattct 833
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 56291 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 56232 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 56231 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 56173 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56172 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 56113 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56112 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 56053 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56052 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 55993 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55992 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 55933 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 55932 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 55873 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55872 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 55813 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 55812 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 55753 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55752 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 55693 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 55692 ccctaattct 55683
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 596/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1477 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1418 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1417 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1359 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1299 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1239 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1179 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1119 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1118 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1059 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 999 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 998 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 939 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 879 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 878 ccctaattct 869
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 573/580 (98%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1491 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1432 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1431 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1373 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1313 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1253 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1193 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1192 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1133 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1132 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1073 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1013 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1012 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 953 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 893 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 892 ccctaattct 883
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 592/606 (97%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaa 606 |||||| Sbjct: 893 ccctaa 888
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1491 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1432 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1431 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1373 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1313 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1253 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1193 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1192 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1133 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1132 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1073 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1013 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1012 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 953 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 893 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 892 ccctaattct 883
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1491 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1432 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1431 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1373 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1313 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1253 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1193 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1192 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1133 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1132 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1073 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1013 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1012 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 953 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 893 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 892 ccctaattct 883
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1491 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1432 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1431 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1373 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1313 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1253 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1193 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1192 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1133 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1132 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1073 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1013 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1012 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 953 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 893 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 892 ccctaattct 883
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1491 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1432 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1431 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1373 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1313 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1253 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1193 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1192 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1133 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1132 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1073 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1013 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1012 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 953 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 893 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 892 ccctaattct 883
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1495 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1436 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1435 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1377 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1317 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1257 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1197 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1137 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1136 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1077 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1017 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1016 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 957 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 897 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 896 ccctaattct 887
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 595/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1495 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1436 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1435 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1377 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1317 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1257 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1197 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1196 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagt 1137 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1136 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1077 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1017 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1016 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 957 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 897 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 896 ccctaattct 887
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgnncccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1351 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1292 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1291 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1233 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1173 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1113 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 accacctgaagctaccggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1053 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 993 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 992 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 933 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 873 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 872 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 813 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 753 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 752 ccctaattct 743
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagatcacgcccttcgtt 1268 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 1208 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 1148 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1088 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1028 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 968 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 908 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 848 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 788 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 787 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 748
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1023 tatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1219 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1160 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1159 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1101 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1041 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 981 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 921 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 861 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 860 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 801 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 741 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 740 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 681 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 680 acgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 621 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 620 ccctaattct 611
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1219 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1160 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1159 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1101 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1041 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 981 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 921 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 861 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 860 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 801 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 741 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 740 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 681 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 680 acgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 621 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 620 ccctaattct 611
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1358 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1299 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1298 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1240 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1180 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1120 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1060 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1000 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 999 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 940 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 880 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 879 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatg 820 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 760 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 759 ccctaattct 750
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1491 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1432 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1431 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1373 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1313 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1253 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1193 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1192 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagt 1133 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1132 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1073 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1013 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1012 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 953 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 893 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 892 ccctaattct 883
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1349 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1290 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1289 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1231 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1171 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1111 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1051 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 991 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 990 aatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 931 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 871 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 870 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 811 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 751 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 750 ccctaattct 741
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1071 tatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1358 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1299 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1298 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1240 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1180 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1120 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1060 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1000 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 999 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 940 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 880 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 879 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatg 820 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 760 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 759 ccctaattct 750
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1071 aatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 594/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1351 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcatta 1292 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1291 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1233 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1173 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1113 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1053 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 993 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 992 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 933 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 873 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 872 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 813 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 agccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 753 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 752 ccctaattct 743
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagac 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 581/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagat 1251 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 718
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 581/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagat 1251 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 718
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 592/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1491 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1432 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1431 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1373 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1313 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ttgtaatacagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1253 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1193 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1192 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagt 1133 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1132 catttygcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1073 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1013 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1012 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 953 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 893 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 892 ccctaattct 883
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1495 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1436 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1435 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1377 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1317 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1257 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1197 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1137 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1136 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1077 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1076 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatc 1017 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1016 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 957 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 897 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 896 ccctaattct 887
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 591/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 acmgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1023 tatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1023 tatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 592/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1071 aatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 592/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagac 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 593/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgccgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 592/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1495 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1436 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1435 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1377 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 tcgattagctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1317 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1257 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1197 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1137 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1136 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 1077 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1017 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1016 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 957 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 897 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 896 ccctaattct 887
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 592/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 592/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 592/610 (97%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1023 aatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 580/595 (97%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaag 1289 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattct 754
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 591/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttctcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 591/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1219 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1160 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1159 cctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1101 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgattagctgcctgaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1041 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 981 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 921 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 861 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 860 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 801 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 741 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 740 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 681 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 680 acgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 621 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 620 ccctaattct 611
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 591/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1372 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1313 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1312 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1254 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1194 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1134 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1133 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1074 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 accgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1014 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1013 gatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 954 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 894 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 893 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatg 834 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 833 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 774 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 773 ccctaattct 764
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 591/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1430 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1371 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1370 cctt-cgcgagcaagatcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1312 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1252 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1192 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1132 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1072 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 1071 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggaatggatatgatctccccc 1012 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 952 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 951 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatg 892 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 891 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaac 832 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 831 ccctaattct 822
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 588/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1492 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1433 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1432 cctt-cgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1374 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1314 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 ttgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1254 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1194 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1134 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1133 catttcgcgttccccttctaacttacctannnctgtaccggagtggatatgatctccccc 1074 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 agacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1014 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtg 954 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 894 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 893 ccctaattct 884
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 577/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 agttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatc 78 ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagatc 1286 Query: 79 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcacc 138 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 139 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtc 198 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 199 cccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 258 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 259 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 319 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 379 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgcttt 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 439 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 499 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 558 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 559 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattct 754
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 578/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagat 1287 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattct 754
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 577/593 (97%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1277 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 744
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 567/580 (97%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 588/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1433 acttcacaagccgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1374 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1373 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1315 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1314 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1255 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1195 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1194 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1135 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1134 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagt 1075 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1074 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1015 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 955 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 954 agtaactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 895 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 835 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 834 ccctaattct 825
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 577/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1289 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 754
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 575/593 (96%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1305 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 772
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 554/565 (98%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 cggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 105 ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcc-cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 106 agcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 165 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 166 agttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcat 225 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 226 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 286 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 346 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 406 gatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 465 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 466 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 526 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 585 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 586 cattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattct 736
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 587/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1362 acttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1303 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1302 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 764 Query: 601 ccctaattct 610 ||||||||| Sbjct: 763 tcctaattct 754
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 576/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1290 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 755
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 554/565 (98%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 cggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 105 ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcc-cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 106 agcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 165 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 166 agttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcat 225 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 226 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 286 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 346 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 406 gatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 465 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 466 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 526 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 585 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 586 cattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattct 736
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 587/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagccgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctagcttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 587/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1480 acttcacaagccgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcatta 1421 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1420 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1362 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1302 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1242 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagat 1182 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1122 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1121 catttcgcgttccccttctagcttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 1062 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 1002 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1001 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 942 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 882 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 881 ccctaattct 872
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 574/593 (96%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1271 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 738
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 574/593 (96%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1288 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 755
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 574/593 (96%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1271 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 738
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 570/588 (96%), Gaps = 1/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacg 81 |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcg 1303 Query: 82 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccagg 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 142 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtcccc 201 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 202 aaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 261 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1123 Query: 262 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 322 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 382 cttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagc 441 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 442 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 501 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 502 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 561 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 562 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 775
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 573/592 (96%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1277 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattc 745
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 564/580 (97%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagatcgcgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 564/580 (97%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagatcgcgtccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 586/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1362 acttcacaagccgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcatta 1303 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1302 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1243 tcgattcgctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaa 1184 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1003 aatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 944 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 764 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 763 ccctaattct 754
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 575/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1349 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1291 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1290 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1231 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1230 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1171 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1111 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1051 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1050 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 991 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 931 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 871 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 870 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 811 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 756
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 586/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1342 acttcacaagccgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1283 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1282 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaac 1224 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1164 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 ttgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1104 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 accacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagat 1044 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 984 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 983 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 924 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 864 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 863 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 804 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 744 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 743 ccctaattct 734
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 586/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagccgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacccgaagctaccggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 586/610 (96%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagccgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 783 ccctaattct 774
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 568/587 (96%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcc 83 ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcc 1289 Query: 84 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtg 143 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 144 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaa 203 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 204 agatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 263 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1109 Query: 264 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 323 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 324 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 384 tacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagcta 443 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 444 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 504 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 563 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 564 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 583/607 (96%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55430 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 55371 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 55370 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55312 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55311 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55252 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55251 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55192 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55191 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55132 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55131 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55072 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 55071 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55012 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55011 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 54952 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 54951 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54892 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54891 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54832 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 54831 ctaattc 54825
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 583/607 (96%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 125771 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 125712 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 125711 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 125653 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125652 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 125593 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125592 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 125533 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125532 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 125473 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125472 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 125413 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 125412 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 125353 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125352 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 125293 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 125292 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 125233 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125232 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 125173 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 125172 ctaattc 125166 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 583/607 (96%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30711 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 30652 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 30651 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 30593 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30592 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 30533 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30532 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 30473 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30472 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 30413 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30412 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 30353 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 30352 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 30293 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30292 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 30233 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 30232 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 30173 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30172 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 30113 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 30112 ctaattc 30106
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 583/607 (96%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 33527190 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 33527249 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 33527250 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 33527308 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527309 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 33527368 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527369 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 33527428 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527429 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 33527488 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527489 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 33527548 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 33527549 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 33527608 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527609 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 33527668 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 33527669 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 33527728 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527729 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 33527788 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 33527789 ctaattc 33527795 Score = 149 bits (75), Expect = 1e-32 Identities = 81/83 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 527 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 586 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 587 attacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattc 39115390
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 566/584 (96%), Gaps = 1/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 26 gactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgccct 85 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgccct 1269 Query: 86 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgca 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1209 Query: 146 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaag 205 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1208 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1149 Query: 206 atttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 265 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 266 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1029 Query: 326 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 386 cctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaat 445 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 446 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 505 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 506 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 565 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 566 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 583/607 (96%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 72387 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 72446 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 72447 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 72505 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72506 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 72565 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72566 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 72625 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72626 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 72685 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72686 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 72745 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 72746 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 72805 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72806 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 72865 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 72866 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 72925 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72926 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 72985 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 72986 ctaattc 72992
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 583/607 (96%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55409 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 55350 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 55349 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55291 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55290 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55231 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55230 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55171 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55111 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55051 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 55050 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 54991 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54990 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 54931 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 54930 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54871 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54870 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54811 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 54810 ctaattc 54804
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 563/580 (97%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1342 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgtt 1284 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1224 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1223 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttc 1164 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1104 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1044 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 984 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 924 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 864 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 804 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 764
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1294 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 759
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 585/610 (95%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1362 acttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1303 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1302 cctt-cacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 764 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 763 ccctaattct 754
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 573/594 (96%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1296 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattc 762
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 572/593 (96%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1271 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 738
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 1321 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1320 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1262 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 962 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 781 ctaattc 775
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55482 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 55423 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 55422 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55364 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55363 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55304 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55303 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55244 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55243 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55184 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55183 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55124 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 55123 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55064 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55063 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 55004 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 55003 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54944 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54943 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54884 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 54883 ctaattc 54877
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55482 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 55423 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 55422 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55364 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55363 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55304 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55303 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55244 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55243 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55184 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55183 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55124 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 55123 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55064 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55063 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 55004 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 55003 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54944 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54943 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54884 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 54883 ctaattc 54877
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124798 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 124739 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 124738 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 124680 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124679 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 124620 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124619 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 124560 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124559 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 124500 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124499 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 124440 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 124439 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 124380 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124379 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 124320 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 124319 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 124260 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124259 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 124200 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 124199 ctaattc 124193 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30217 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 30158 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 30157 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 30099 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30098 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 30039 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30038 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 29979 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29978 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 29919 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29918 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 29859 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 29858 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 29799 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29798 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 29739 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 29738 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 29679 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29678 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 29619 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 29618 ctaattc 29612
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124798 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 124739 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 124738 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 124680 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124679 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 124620 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124619 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 124560 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124559 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 124500 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124499 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 124440 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 124439 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 124380 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124379 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 124320 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 124319 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 124260 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124259 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 124200 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 124199 ctaattc 124193 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30217 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 30158 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 30157 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 30099 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30098 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 30039 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30038 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 29979 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29978 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 29919 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29918 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 29859 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 29858 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 29799 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29798 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 29739 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 29738 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 29679 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29678 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 29619 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 29618 ctaattc 29612
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55474 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 55415 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 55414 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55356 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55355 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55296 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55295 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55236 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55235 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55176 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55175 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55116 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 55115 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55056 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55055 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 54996 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 54995 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54936 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54935 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54876 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 54875 ctaattc 54869
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 1321 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1320 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1262 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 962 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 781 ctaattc 775
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 53684 ttcacaagctgcggctagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 53625 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 53624 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 53566 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53565 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 53506 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53505 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 53446 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53445 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 53386 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53385 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 53326 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 53325 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 53266 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53265 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 53206 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 53205 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 53146 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53145 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 53086 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 53085 ctaattc 53079
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 128617 ttcacaagctgcggctagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 128558 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 128557 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 128499 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128498 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 128439 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128438 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 128379 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128378 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 128319 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128318 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 128259 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 128258 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 128199 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128198 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 128139 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 128138 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 128079 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128078 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 128019 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 128018 ctaattc 128012
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 10347292 ttcacaagctgcggctagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 10347233 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 10347232 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 10347174 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347173 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 10347114 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347113 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 10347054 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347053 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 10346994 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346993 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 10346934 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 10346933 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 10346874 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346873 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 10346814 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 10346813 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 10346754 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346753 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 10346694 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 10346693 ctaattc 10346687
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1435 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 1376 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1375 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1317 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1257 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1197 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1137 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1077 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1076 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 1017 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 957 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 956 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 897 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 896 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 837 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 836 ctaattc 830
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1178 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 1119 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1118 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1060 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1000 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 940 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 880 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 820 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 819 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 760 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 700 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 699 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 640 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 639 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 580 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 579 ctaattc 573
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 10353331 ttcacaagctgcggctagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 10353272 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 10353271 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 10353213 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353212 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 10353153 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353152 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 10353093 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353092 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 10353033 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353032 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 10352973 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 10352972 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 10352913 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352912 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 10352853 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 10352852 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 10352793 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352792 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 10352733 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 10352732 ctaattc 10352726
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1767 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 1708 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1707 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1649 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1648 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1589 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1588 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1529 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1469 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1409 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1408 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccag 1349 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 1289 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 1288 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 1229 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaaccc 1169 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 1168 ctaattc 1162
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1800 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 1741 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1740 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1682 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1681 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1622 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1621 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1562 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1561 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1502 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1442 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1441 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 1382 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1381 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 1322 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 1321 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 1262 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 1202 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 1201 ctaattc 1195 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.53 Identities = 32/34 (94%), Gaps = 1/34 (2%) Strand = Plus / Minus Query: 45 tcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatc 78 |||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattacctt-cacgagcaagatc 1914
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 573/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1289 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 754
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 584/610 (95%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1365 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1306 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 cctt-cacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1247 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1187 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ttgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1127 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 accccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1067 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1007 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1006 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 947 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatc 887 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 886 aataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 827 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 826 agccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagc 767 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 766 ccctaattct 757
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 584/610 (95%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1367 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1308 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 cctt-cacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1249 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1189 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ttgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1129 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 accgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1069 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1009 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1008 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 949 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 agacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatc 889 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 888 aataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 829 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 828 agccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagc 769 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 768 ccctaattct 759
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 583/609 (95%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1263 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| Sbjct: 1023 catgtcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaactagtatttgcggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 783 ccctaattc 775
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 575/598 (96%), Gaps = 1/598 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 gcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagc 72 ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacgagc 1312 Query: 73 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1311 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 133 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacaga 192 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 193 atcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 252 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 253 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 313 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 372 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 373 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaa 432 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 433 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 493 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 552 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 553 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 774
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 585/609 (96%), Gaps = 3/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124718 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 124659 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124658 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 124600 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124599 ccgattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 124540 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 ttgcaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 124480 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 acc-cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 124421 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124420 accgcgagcacgatctttt-caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 124362 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| Sbjct: 124361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctccccc 124302 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124301 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 124242 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || Sbjct: 124241 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatg 124182 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124181 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 124122 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 124121 ccctaattc 124113 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 585/609 (96%), Gaps = 3/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 30191 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatta 30132 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30131 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 30073 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30072 ccgattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 30013 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30012 ttgcaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 29953 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29952 acc-cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 29894 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29893 accgcgagcacgatctttt-caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 29835 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| Sbjct: 29834 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctccccc 29775 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29774 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 29715 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || Sbjct: 29714 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatg 29655 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29654 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 29595 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 29594 ccctaattc 29586
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 566/587 (96%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcc 83 ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcc 1289 Query: 84 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtg 143 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 144 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaa 203 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 204 agatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 263 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1109 Query: 264 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 323 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 324 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 384 tacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagcta 443 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 444 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 504 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 563 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 564 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 571/593 (96%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1287 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 754
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1365 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacc 1306 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1305 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1247 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1187 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1127 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1067 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1007 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccag 947 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 887 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 827 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 767 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 766 ctaattc 760
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1320 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 781 ctaattc 775
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1367 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1308 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1307 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1249 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1189 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1129 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1069 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1009 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1008 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 949 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 889 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 888 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 829 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 769 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 768 ctaattc 762
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacc 1305 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1304 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1246 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1186 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1126 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1066 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1006 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccag 946 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 886 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 885 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 826 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 766 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 765 ctaattc 759
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1320 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 781 ctaattc 775
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1365 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1306 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1305 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1247 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1187 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1127 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1067 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1007 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1006 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 947 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 887 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 827 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 767 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 766 ctaattc 760
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1379 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1320 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1319 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1261 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1201 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1141 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1081 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1021 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1020 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 961 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 901 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 900 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 841 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 781 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 780 ctaattc 774
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 5614522 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 5614463 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 5614462 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 5614404 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614403 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 5614344 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614343 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 5614284 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614283 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 5614224 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614223 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 5614164 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 5614163 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 5614104 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614103 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 5614044 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 5614043 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 5613984 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613983 ccaaactagtatttgcggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 5613924 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 5613923 ctaattc 5613917 Score = 593 bits (299), Expect = e-166 Identities = 332/342 (97%), Gaps = 1/342 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 268 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 328 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 388 tactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 447 |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 448 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 507 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 508 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 567 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13436805 Query: 568 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 13436763 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 427 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 487 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 546 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 547 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 87.7 bits (44), Expect = 4e-14 Identities = 48/50 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 15 ggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacctt 64 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacctt 13424384 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 213 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 293 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 327 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.53 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaa 232 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 570/592 (96%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1277 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 5614511 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 5614452 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 5614451 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 5614393 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614392 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 5614333 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614332 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 5614273 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614272 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 5614213 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614212 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 5614153 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 5614152 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 5614093 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614092 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 5614033 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 5614032 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 5613973 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613972 ccaaactagtatttgcggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 5613913 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 5613912 ctaattc 5613906 Score = 593 bits (299), Expect = e-166 Identities = 332/342 (97%), Gaps = 1/342 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 268 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 328 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 388 tactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 447 |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 448 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 507 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 508 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 567 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13391079 Query: 568 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391078 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 13391037 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 427 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 487 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 546 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 547 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 87.7 bits (44), Expect = 4e-14 Identities = 48/50 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 15 ggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacctt 64 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacctt 13378658 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 213 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 293 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 327 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.53 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaa 232 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38363 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 38422 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 38423 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 38481 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38482 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 38541 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38542 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 38601 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38602 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 38661 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38662 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 38721 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 38722 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 38781 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38782 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 38841 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 38842 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 38901 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38902 ccaaactagtatttgcggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 38961 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 38962 ctaattc 38968
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 576/600 (96%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 576/600 (96%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 561/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 561/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 561/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1161 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 572/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1367 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1309 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatc 1069 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatt 829 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 tgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 774
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 568/590 (96%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 ttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcac 80 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcac 1265 Query: 81 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccag 140 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 141 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccc 200 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 201 caaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 260 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 261 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 321 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 380 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 381 acttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttag 440 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 441 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 501 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 560 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 561 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 735
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 568/590 (96%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 ttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcac 80 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcac 1265 Query: 81 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccag 140 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 141 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccc 200 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 201 caaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 260 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 261 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 321 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 380 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 381 acttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttag 440 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 441 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 501 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 560 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 561 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 735
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 567/589 (96%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacg 81 |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcg 1292 Query: 82 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccagg 141 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1232 Query: 142 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtcccc 201 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| Sbjct: 1231 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1172 Query: 202 aaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 261 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1112 Query: 262 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 321 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1052 Query: 322 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 992 Query: 382 cttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagc 441 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 442 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 502 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 561 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 562 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 763
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 575/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1253 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattacctt-cacg 1195 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 714 agtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 655
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 580/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1320 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaa 902 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 781 ctaattc 775
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 575/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 2/607 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203614 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 23203673 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 23203674 tt-cacgagcaagatcgcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 23203731 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203732 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 23203791 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203792 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 23203851 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203852 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 23203911 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203912 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 23203971 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 23203972 tatcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 23204031 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204032 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 23204091 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 23204092 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 23204151 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204152 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 23204211 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 23204212 ctaattc 23204218 Score = 91.7 bits (46), Expect = 3e-15 Identities = 60/64 (93%), Gaps = 1/64 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 15 ggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaa 74 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaa 26711442 Query: 75 gatc 78 |||| Sbjct: 26711441 gatc 26711438 Score = 91.7 bits (46), Expect = 3e-15 Identities = 60/64 (93%), Gaps = 1/64 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 15 ggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaa 74 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaa 26711334 Query: 75 gatc 78 |||| Sbjct: 26711333 gatc 26711330
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 569/592 (96%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1277 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 2/607 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154262 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 154321 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 154322 tt-cacgagcaagatcgcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 154379 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154380 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 154439 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154440 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 154499 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154500 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 154559 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154560 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 154619 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 154620 tatcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 154679 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154680 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 154739 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 154740 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 154799 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154800 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 154859 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 154860 ctaattc 154866
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 2/607 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38376 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattacc 38435 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 38436 tt-cacgagcaagatcgcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 38493 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38494 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 38553 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38554 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 38613 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38614 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 38673 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38674 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 38733 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct: 38734 tatcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 38793 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38794 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 38853 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 38854 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 38913 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38914 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 38973 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 38974 ctaattc 38980
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 549/565 (97%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 cggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 105 ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 106 agcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 165 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 166 agttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcat 225 |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 226 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 286 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 346 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 406 gatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 465 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 466 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 526 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 585 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 586 cattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattct 733
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 549/565 (97%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 cggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 105 ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 106 agcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 165 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 166 agttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcat 225 |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 226 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 286 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 346 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 406 gatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 465 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 466 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 526 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 585 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 586 cattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattct 733
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 582/610 (95%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 1297 acttcacaagctgcggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcatta 1238 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1237 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccac 1179 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tcgattagctactgcacccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1119 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaat 1059 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 accacctgaagccaccggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 999 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 939 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| Sbjct: 938 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctccccc 879 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 819 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 818 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 759 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 758 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 699 Query: 601 ccctaattct 610 |||||||||| Sbjct: 698 ccctaattct 689
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 569/593 (95%), Gaps = 1/593 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1291 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 758
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 568/592 (95%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1288 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 756
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 579/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1367 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagctgctcggataatttcattacc 1308 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1307 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1249 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1189 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1129 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1128 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagacac 1069 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1009 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1008 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 949 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 889 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 888 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 829 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 769 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 768 ctaattc 762
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 574/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 559/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1350 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgtt 1292 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1291 acgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1232 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| Sbjct: 1231 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttc 1172 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1112 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 caaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1052 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 992 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 932 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 872 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 812 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 772
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 567/591 (95%), Gaps = 1/591 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 agttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatc 78 ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatc 1306 Query: 79 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcacc 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 139 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtc 198 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 199 cccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 258 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 259 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 318 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 319 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 379 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgcttt 438 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 439 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 498 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 499 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 558 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 559 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 775
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 556/576 (96%), Gaps = 1/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 ttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 93 |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1319 ttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1261 Query: 94 agcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 153 ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1201 Query: 154 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggt 213 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct: 1200 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggt 1141 Query: 214 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 273 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 1140 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcat 1081 Query: 274 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1021 Query: 334 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 961 Query: 394 tgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 453 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 tgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 901 Query: 454 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 513 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 900 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 841 Query: 514 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 573 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 aagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 781 Query: 574 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 780 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 580/609 (95%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1354 acttcgcaagctgcggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcatta 1295 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cctt-cacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1236 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tcgattagctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1176 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1116 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1115 acccccggaagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagat 1056 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 accgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 996 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 995 tatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 936 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 876 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 875 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatg 816 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 815 agccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 756 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 755 ccctaattc 747
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 580/609 (95%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1297 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcatta 1238 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1237 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1179 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1119 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1059 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 acccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 999 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 accgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 939 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 938 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 879 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 cgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 819 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 818 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 759 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 || |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 758 agacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgcattacaataggaac 699 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 698 ccctaattc 690
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 580/609 (95%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcgcaagctgcggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 tcgattagctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1143 acccccggaagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 tatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 783 ccctaattc 775
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 542/558 (97%), Gaps = 1/558 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 tttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 112 |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1277 tttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 1219 Query: 113 aaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 172 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1159 Query: 173 ccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaa 232 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1099 Query: 233 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 292 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 acatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1039 Query: 293 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 352 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 979 Query: 353 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 412 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 978 cctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatga 919 Query: 413 tntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 472 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 859 Query: 473 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 799 Query: 533 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 592 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattaca 739 Query: 593 ataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||| Sbjct: 738 ataggaacccctaattct 721
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 573/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccct-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 502/506 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 105 aagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 164 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 165 aagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggca 224 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 225 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 285 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 345 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1875 Query: 405 ggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 464 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1874 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1815 Query: 465 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1814 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 1755 Query: 525 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 584 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1754 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 1695 Query: 585 gcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1694 gcattacaataggaacccctaattct 1669
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 578/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1304 tt-cacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1246 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1186 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1185 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatac 1126 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1066 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1006 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccag 946 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 886 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 885 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 826 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 825 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagccc 766 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 765 ctaattc 759
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 578/607 (95%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattacc 1291 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || Sbjct: 1290 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactc 1232 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaatt 1172 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 gtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1112 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1111 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacac 1052 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 992 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct: 991 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 932 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 872 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 871 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 812 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 752 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 751 ctaattc 745
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 573/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaattc 745
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcacgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcacgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcacgcccttcgtt 1282 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1281 acgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1222 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1221 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1162 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 1102 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaatc 1042 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctac 982 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 tactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 922 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 862 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 aagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 802 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 762
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 552/572 (96%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 agctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagctt 98 ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 99 gtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 158 ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 159 gtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagag 218 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 219 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 279 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 338 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 339 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 399 cggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 458 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 459 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 519 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 578 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 579 agtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattct 717
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 552/572 (96%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 agctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagctt 98 ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagctt 1270 Query: 99 gtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 158 ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1269 gtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1210 Query: 159 gtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagag 218 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||| Sbjct: 1209 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagag 1150 Query: 219 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1149 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaa 1090 Query: 279 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 1030 Query: 339 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 970 Query: 399 cggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 458 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 459 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 519 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 578 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 579 agtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattct 758
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 552/572 (96%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 agctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagctt 98 ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 99 gtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 158 ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 159 gtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagag 218 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 219 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 279 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 338 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 339 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 399 cggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 458 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 459 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 519 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 578 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 579 agtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattct 717
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 568/594 (95%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1279 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 565/590 (95%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 gttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatca 79 |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcg 1248 Query: 80 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcacca 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1247 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1188 Query: 140 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtcc 199 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || Sbjct: 1187 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1128 Query: 200 ccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 259 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1127 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1068 Query: 260 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 319 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1008 Query: 320 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 948 Query: 380 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgcttta 439 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 440 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 499 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 500 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 559 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 560 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 718
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 |||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgtt 1274 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1273 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1214 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1213 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1154 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1153 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctgg 1094 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1034 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 610 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattct 754
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 563/588 (95%), Gaps = 1/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacg 81 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcg 1283 Query: 82 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccagg 141 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccagg 1223 Query: 142 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtcccc 201 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || Sbjct: 1222 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1163 Query: 202 aaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 261 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1103 Query: 262 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 321 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttc 1043 Query: 322 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 983 Query: 382 cttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagc 441 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 442 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 501 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 502 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 561 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 562 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 755
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 572/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 572/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 563/588 (95%), Gaps = 1/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 tcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacg 81 |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcg 1285 Query: 82 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccagg 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1284 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1225 Query: 142 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtcccc 201 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || Sbjct: 1224 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1165 Query: 202 aaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 261 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1164 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1105 Query: 262 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 321 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1045 Query: 322 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 985 Query: 382 cttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagc 441 |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 925 Query: 442 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 501 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 865 Query: 502 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 561 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 805 Query: 562 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 757
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 572/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 572/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 566/592 (95%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1277 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 566/592 (95%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cgcgagcaagat 1277 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 572/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 572/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaattc 745
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 572/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 578/609 (94%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 acgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 tatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 || |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 783 ccctaattc 775
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 572/601 (95%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 610 t 610 | Sbjct: 744 t 744
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 574/601 (95%), Gaps = 3/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagct-gntcggataatttcattaccttgcgc 68 |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| | | Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattacctt-cac 1286 Query: 69 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattag 128 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 129 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaata 188 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 189 cagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 248 | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 249 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 308 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 309 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 369 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatac 428 | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 429 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 489 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 548 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 549 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 608 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaatt 746 Query: 609 c 609 | Sbjct: 745 c 745
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 576/607 (94%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 120461 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 120402 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 120401 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacac 120343 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120342 gattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 120283 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120282 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 120223 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120222 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 120163 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 120162 cgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta 120103 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct: 120102 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccg 120043 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120042 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 119983 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 119982 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 119923 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119922 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 119863 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 119862 ctaattc 119856
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 565/592 (95%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 tagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagat 77 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagat 1277 Query: 78 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcac 137 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 138 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgt 197 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct: 1216 cgggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 198 ccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 257 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccg 1097 Query: 258 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 317 |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 318 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 378 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctt 437 |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 438 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 498 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 557 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 558 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cagtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 576/607 (94%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattacc 62 |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 58834 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58775 Query: 63 ttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantc 122 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 58774 tt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacac 58716 Query: 123 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 182 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58715 gattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 58656 Query: 183 gnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 242 | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58655 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 58596 Query: 243 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 302 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58595 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 58536 Query: 303 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 362 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 58535 cgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta 58476 Query: 363 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccag 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct: 58475 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccg 58416 Query: 423 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58415 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 58356 Query: 483 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 542 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 58355 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 58296 Query: 543 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 602 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58295 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 58236 Query: 603 ctaattc 609 ||||||| Sbjct: 58235 ctaattc 58229
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 571/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 571/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccccgacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|U31101.1|CLU31101 Chasmanthium latifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 571/600 (95%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 gctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcg 69 ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | || Sbjct: 1343 gctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattacctt-cacg 1285 Query: 70 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagc 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 130 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatac 189 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1224 tactgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 190 agaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 249 |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 250 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 309 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 310 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 370 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacg 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 430 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 490 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 549 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 550 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 577/609 (94%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 ccgattagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1143 accccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgcgaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 agacatacgcaatgcttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 || ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agataaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 783 ccctaattc 775
>emb|AJ746178.1| Arundinaria oedogonata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1274 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 555/579 (95%), Gaps = 1/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 catttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgtt 90 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1274 catttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgtt 1216 Query: 91 acgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 150 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || Sbjct: 1215 acgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcc 1156 Query: 151 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatcgtccccaaagatttn 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| Sbjct: 1155 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttc 1096 Query: 211 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 270 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1095 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctgg 1036 Query: 271 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 330 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 catagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 976 Query: 331 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 916 Query: 391 tactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 450 ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 856 Query: 451 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 510 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 855 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtg 796 Query: 511 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 570 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 736 Query: 571 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 735 agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 697
>gb|AY622897.1| Olyra latifolia ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 566/594 (95%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 gctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcattaccttgcgcgagcaag 75 |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt-cacgagcaag 1279 Query: 76 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccantcgattagctgctgc 135 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 136 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgnaatacagaatc 195 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaactgtaatacggaatc 1159 Query: 196 gtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 255 || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 atctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 256 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1039 Query: 316 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 376 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntcccccagacatacgcaatgc 435 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatcccccccagacatacgcaatgc 919 Query: 436 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 495 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 496 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 555 ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 858 tgctcgatgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 799 Query: 556 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 609 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 577/609 (94%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 acttcacangctgcggctagttcaggactncatttgcaagctgntcggataatttcatta 60 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1382 acttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcatta 1323 Query: 61 ccttgcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccan 120 |||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1322 cctt-cacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttctaaagccac 1264 Query: 121 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 180 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 acgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1204 Query: 181 ttgnaatacagaatcgtccccaaagatttnggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 240 ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ttgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1144 Query: 241 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 300 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 accccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1084 Query: 301 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 accgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1024 Query: 361 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatntccccc 420 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1023 tatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 964 Query: 421 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatc 904 Query: 481 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 540 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || Sbjct: 903 aataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatg 844 Query: 541 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 600 || |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 agacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 601 ccctaattc 609 ||||||||| Sbjct: 783 ccctaattc 775 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,144,847 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4144847 Number of successful extensions: 120842 Number of sequences better than 10.0: 14962 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 14941 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 35 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 82063 Number of HSP's gapped (non-prelim): 22702 length of query: 610 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 587 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10063115752248 effective search space used: 10063115752248 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)