Clone Name | rbasd11p24 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 659/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 659/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 659/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 658/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctakttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 656/659 (99%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1460 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 1400 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 1340 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1280 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1220 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1160 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 1100 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 1040 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 920 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 861
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 656/659 (99%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1456 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1398 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 1338 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 1278 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1218 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1158 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1098 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 1038 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 978 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 918 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 858 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 799
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 657/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 656/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 981 gaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 655/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 655/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcgcaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 655/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 655/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 655/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 655/661 (99%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 654/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaacncgaatntgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 653/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanntggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 653/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 654/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 654/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 654/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 653/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 653/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 653/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatt-gccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 653/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 653/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacannctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaanacngctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1411 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1410 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1351 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1350 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1291 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1231 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1171 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1111 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1051 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 991 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 931 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 930 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 871 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 870 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 811 Query: 660 t 660 | Sbjct: 810 t 810
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56319 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 56261 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 56260 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 56201 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 56200 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 56141 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56140 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 56081 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56080 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 56021 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56020 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55961 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55960 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 55901 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55900 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 55841 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55840 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 55781 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 55780 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 55721 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55720 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 55661 Query: 660 t 660 | Sbjct: 55660 t 55660
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 652/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1447 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1446 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1387 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1386 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1327 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1267 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1207 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1147 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1087 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1027 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 967 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 966 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 907 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 906 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 847 Query: 660 t 660 | Sbjct: 846 t 846
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaanntgat-cgccttccatacttcacaagctgcngctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtcaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 650/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1460 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1459 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacga 1400 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1399 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1340 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtc 1280 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1220 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1160 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 1100 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 1040 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 agtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 920 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaatacagctctcttaat 861
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 650/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1101 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1041 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 981 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 921 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 920 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 861 Query: 660 t 660 | Sbjct: 860 t 860
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1101 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1041 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 981 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 921 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 920 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 861 Query: 660 t 660 | Sbjct: 860 t 860
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1101 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1041 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 981 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 921 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 920 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 861 Query: 660 t 660 | Sbjct: 860 t 860
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1101 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1041 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 981 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 921 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 920 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 861 Query: 660 t 660 | Sbjct: 860 t 860
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 651/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 650/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 650/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 650/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 650/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1319 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1318 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1259 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1258 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1199 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1198 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1139 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1079 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1019 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctacta 959 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 899 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 839 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 838 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 779 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 719
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 650/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 650/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1290 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1170 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 870 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 810 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 751
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1463 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1462 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1403 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1402 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1343 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1283 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1223 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1163 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 1043 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 923 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 922 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 864
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 650/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 650/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1101 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1041 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 981 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 921 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 920 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnttaa 861 Query: 660 t 660 | Sbjct: 860 t 860
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 648/658 (98%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 gaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1318 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1317 tgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgag 1258 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1257 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1198 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1138 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1078 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1018 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 958 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 898 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 838 Query: 543 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 602 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 837 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggtta 778 Query: 603 agtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 agtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 720
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 650/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1188 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1128 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 829 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 769 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 768 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 709 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 708 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 649 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 648 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 589 Query: 660 t 660 | Sbjct: 588 t 588
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 650/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1188 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1128 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 829 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 769 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 768 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 709 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 708 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 649 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 648 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 589 Query: 660 t 660 | Sbjct: 588 t 588
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 646/656 (98%), Gaps = 2/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1319 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1318 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1259 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1258 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1199 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1198 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1139 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1138 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanctggcatg 1079 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1019 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 959 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 899 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 839 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 779 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 723
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 648/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1463 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1462 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1403 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1402 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1343 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1283 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1223 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1163 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 cgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 1043 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 923 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 922 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 864
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 649/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 649/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 647/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaacycgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1462 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1461 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1402 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1401 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1342 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcgg 1282 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1281 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacnnngca 1222 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 tggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1162 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1102 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 862 Query: 660 t 660 | Sbjct: 861 t 861
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 648/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 800
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 648/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1326 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1325 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1266 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1265 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1206 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1146 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1086 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1026 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 966 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 906 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 846 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 agtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 786 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 785 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 727
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 648/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagrtttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaacttacctacta 1101 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1041 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 981 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 921 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 920 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 861 Query: 660 t 660 | Sbjct: 860 t 860
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 648/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1326 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1325 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1266 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1265 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1206 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1146 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1086 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1026 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 966 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 906 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 846 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 agtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 786 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 785 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 727
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 648/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1461 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1460 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1401 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1400 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1341 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1281 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1221 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1161 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 cgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1101 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1041 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 981 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 921 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 920 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnttaa 861 Query: 660 t 660 | Sbjct: 860 t 860
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 648/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 647/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1463 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1462 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1403 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1402 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1343 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1283 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1223 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1163 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 1043 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 tgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 923 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 922 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 864
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 648/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcag 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 649/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgccgctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 648/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggccccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 646/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1463 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1462 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacga 1403 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct: 1402 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcatttccccaa 1343 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1283 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1223 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1163 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 1103 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 1043 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 923 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 922 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 864
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 648/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 604/605 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 648/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 agacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 643/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1460 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1459 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacga 1400 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1399 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1340 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtc 1280 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1220 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1160 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1159 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctannnct 1100 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1099 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaaa 1040 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 agtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 920 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 861
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 603/605 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 790 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 730 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 729 ttaat 725
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 631/641 (98%), Gaps = 1/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 78 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 79 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 138 ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1273 Query: 139 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 199 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 259 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 1093 Query: 319 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 379 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 438 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1032 acctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatg 973 Query: 439 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 913 Query: 499 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 853 Query: 559 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattac 618 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 852 gcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattac 793 Query: 619 aataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 aataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 647/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1189 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1188 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttac 1129 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct: 1128 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcatttcccc 1069 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1009 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 949 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 889 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 829 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 769 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 768 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 709 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 708 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 649 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 648 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 589 Query: 660 t 660 | Sbjct: 588 t 588
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 647/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1400 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1399 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgccttcgttac 1340 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1339 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1280 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 1220 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1160 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1100 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1040 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ctgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 980 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 920 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 919 gaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 860 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctcttaa 800 Query: 660 t 660 | Sbjct: 799 t 799
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 610/615 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 710 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 709 tacagctctcttaat 695
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 610/615 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 710 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 709 tacagctctcttaat 695
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 645/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1403 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1402 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1343 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1283 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1282 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1223 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1163 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1103 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 cgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1043 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 983 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 aatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 923 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 922 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccag 863 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 ttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 803 Query: 660 t 660 | Sbjct: 802 t 802
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 639/654 (97%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 aactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 63 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 1338 Query: 64 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 123 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1337 gcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagc 1278 Query: 124 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 183 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1277 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagg 1218 Query: 184 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcag 1158 Query: 244 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatgga 1098 Query: 304 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 363 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1038 Query: 364 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 423 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 caataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 424 accggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 483 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 accggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 918 Query: 484 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 858 Query: 544 taagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaa 603 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 857 taagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaa 798 Query: 604 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 797 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctctt 744
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 608/617 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagca 748 Query: 644 aatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||| Sbjct: 747 aatacagctctcttaat 731
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 643/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1312 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1311 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1252 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1251 gagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1192 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1191 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcgg 1132 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1072 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 aggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1012 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 952 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 892 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 832 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 831 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 772 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 ttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 712 Query: 660 t 660 | Sbjct: 711 t 711
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 643/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 643/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcag 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 643/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1450 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1449 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1390 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1389 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1330 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1329 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcag 1270 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1210 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 tggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1150 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1149 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctacta 1090 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1030 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 970 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 969 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccag 910 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 ttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 850 Query: 660 t 660 | Sbjct: 849 t 849
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 605/614 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 107 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 166 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 167 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 226 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 227 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 287 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 347 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 407 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 467 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 527 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 586 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 805 Query: 587 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 646 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 gtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaat 745 Query: 647 acagctctcttaat 660 |||||||||||||| Sbjct: 744 acagctctcttaat 731
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 606/615 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaat 731
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 598/605 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 642/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1332 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1331 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1272 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1271 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcatttcccc 1212 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1211 aaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1152 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1092 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1032 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctacta 972 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 912 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 852 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 851 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccag 792 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 791 ttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 732 Query: 660 t 660 | Sbjct: 731 t 731
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 603/612 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 736 Query: 646 tacagctctctt 657 |||||||||||| Sbjct: 735 tacagctctctt 724
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 606/617 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 808 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 748 Query: 644 aatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||| Sbjct: 747 aatacagctctcttaat 731
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 641/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 gggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 604/615 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 824 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 764 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 763 tacagctctcttaat 749
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 640/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 ctcgaactcsaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1335 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 1334 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttac 1275 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1274 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1215 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1214 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1155 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1095 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1035 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 975 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 974 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 915 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 914 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaa 855 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | Sbjct: 854 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccag 795 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 ttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 735 Query: 660 t 660 | Sbjct: 734 t 734
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 617/633 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 87 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 88 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 147 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 148 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 208 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 267 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 268 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 327 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 328 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 388 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 448 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 508 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 568 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 627 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 764 Query: 628 ccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 763 tcctaattctctcgcaaatacagctcttttaat 731
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 603/615 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 730 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 729 tacagctctcttaat 715
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 603/615 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 730 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 729 tacagctctcttaat 715
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 611/626 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 35 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 94 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 95 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 154 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 155 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 214 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 215 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 274 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 275 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 334 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 335 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 394 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 395 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 455 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 515 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 574 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 819 Query: 575 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 634 |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 818 ctagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 759 Query: 635 tctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 758 tctctcgcaaatacagctctcttaat 733
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 595/605 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 604/617 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 809 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 749 Query: 644 aatacagctctcttaat 660 ||||||||||| ||||| Sbjct: 748 aatacagctcttttaat 732
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 639/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 991 ctgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccctg 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 641/661 (96%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124746 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 124688 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124687 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 124628 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124627 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 124568 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124567 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcgg 124508 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124507 tcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggca 124449 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124448 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaaatcat 124390 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124389 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 124330 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124329 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 124270 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124269 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 124210 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124209 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 124150 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124149 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaa 124090 Query: 660 t 660 | Sbjct: 124089 t 124089 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 641/661 (96%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30219 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 30161 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30160 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 30101 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30100 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 30041 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 30040 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcgg 29981 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 29980 tcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggca 29922 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29921 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaaatcat 29863 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29862 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 29803 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29802 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 29743 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29742 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 29683 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29682 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 29623 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 29622 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaa 29563 Query: 660 t 660 | Sbjct: 29562 t 29562
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 639/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcgcaagccgcagctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttctg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 811 tgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 597/609 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 52 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 111 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 112 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 171 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 172 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 231 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 232 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 292 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 351 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 352 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 412 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 471 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 472 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 532 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 591 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808 Query: 592 tcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagc 651 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagc 748 Query: 652 tctcttaat 660 ||||||||| Sbjct: 747 tctcttaat 739
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 581/587 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 554 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 614 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 713
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 602/615 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 747 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||| ||||| Sbjct: 746 tacagctcttttaat 732
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 581/587 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 554 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 614 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 713
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 599/611 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 530 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 589 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 590 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 649 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 650 gctctcttaat 660 ||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaat 751
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 602/615 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaaa 736 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 735 tacagctctcttaat 721
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 806 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 746 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 745 ttaat 741
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 603/617 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 813 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 753 Query: 644 aatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||| Sbjct: 752 aatacagctctcttaat 736
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 615/633 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 87 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 88 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 147 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 148 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 208 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 267 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 268 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 327 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 328 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 388 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 448 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 508 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 568 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaac 627 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaac 764 Query: 628 ccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 763 ccctaattctcttgcaaatacagctctcttaat 731
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 601/615 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 730 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 729 tacagctctcttaat 715
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 114 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 174 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 234 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 294 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 354 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 414 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 473 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 474 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 533 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 534 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 593 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 788 Query: 594 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 653 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 787 ccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 728 Query: 654 tcttaat 660 ||||||| Sbjct: 727 tcttaat 721
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 635/658 (96%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1336 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1335 atttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1276 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1275 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1216 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1215 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1156 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1096 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1036 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 976 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 975 ctgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 916 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 915 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaa 856 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 855 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 796 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 738
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55460 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55402 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55401 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55342 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55341 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55282 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55281 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55222 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55221 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55162 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55161 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55102 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55101 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 55042 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55041 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 54982 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54981 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 54922 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54921 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 54862 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54861 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 54802 Query: 660 t 660 | Sbjct: 54801 t 54801
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 602/617 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 748 Query: 644 aatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||| Sbjct: 747 aatacagctctcttaat 731
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125801 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 125743 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125742 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 125683 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 125682 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 125623 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 125622 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 125563 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 125562 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 125503 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125502 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 125443 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125442 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 125383 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125382 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 125323 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125322 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 125263 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125262 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 125203 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 125202 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 125143 Query: 660 t 660 | Sbjct: 125142 t 125142 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30741 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 30683 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30682 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 30623 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30622 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 30563 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 30562 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 30503 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30502 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 30443 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30442 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 30383 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30382 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 30323 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30322 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 30263 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30262 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 30203 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30202 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 30143 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30142 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 30083 Query: 660 t 660 | Sbjct: 30082 t 30082
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1325 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagctgcggcaagttcagggctcc 1267 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1266 atttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1207 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1206 gagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcatttcccc 1147 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1146 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcgg 1087 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 1086 taagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacaccaggca 1027 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 967 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 907 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 847 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 787 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 786 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 727 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 726 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 667 Query: 660 t 660 | Sbjct: 666 t 666
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527160 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 33527218 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527219 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 33527278 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33527279 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 33527338 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 33527339 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 33527398 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 33527399 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 33527458 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527459 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 33527518 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527519 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 33527578 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527579 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 33527638 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527639 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 33527698 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527699 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 33527758 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33527759 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 33527818 Query: 660 t 660 | Sbjct: 33527819 t 33527819 Score = 188 bits (95), Expect = 2e-44 Identities = 104/107 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 554 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 613 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 614 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaat 39115366
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72357 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 72415 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72416 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 72475 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 72476 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 72535 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 72536 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 72595 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 72596 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 72655 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72656 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 72715 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72716 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 72775 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72776 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 72835 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72836 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 72895 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72896 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 72955 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 72956 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 73015 Query: 660 t 660 | Sbjct: 73016 t 73016
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55439 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55381 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55380 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55321 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55320 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55261 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55260 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55201 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55200 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55141 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55140 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55081 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55080 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 55021 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55020 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 54961 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54960 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 54901 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54900 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 54841 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54840 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 54781 Query: 660 t 660 | Sbjct: 54780 t 54780
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 604/620 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 41 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 100 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 101 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 160 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 161 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 220 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 221 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 280 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 281 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 341 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 400 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 401 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 460 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 461 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 520 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 521 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 580 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta 831 Query: 581 tttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 640 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 tttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 771 Query: 641 gcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||| Sbjct: 770 gcaaatacagctctcttaat 751
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 634/658 (96%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 991 ctgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 754
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 634/658 (96%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1339 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1338 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1279 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1278 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1219 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1218 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1159 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1099 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1039 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 979 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 978 ctgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 919 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 918 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaa 859 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 858 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 799 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 798 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 741
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 634/658 (96%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1337 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1336 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1277 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1276 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1217 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1216 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1157 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1097 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1037 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 977 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 976 ctgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 917 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 916 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaa 857 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 856 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 797 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 796 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 739
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 634/658 (96%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1351 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1291 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1290 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1231 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1230 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1171 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1111 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1051 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 991 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 990 ctgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 931 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 930 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaa 871 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 870 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 811 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 810 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 753
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 592/605 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55454 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55453 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55394 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55393 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55334 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55333 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55274 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55273 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55214 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55213 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55154 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55153 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 55094 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55093 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 55034 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55033 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 54974 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54973 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccgg 54914 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54913 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 54854 Query: 660 t 660 | Sbjct: 54853 t 54853
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55454 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55453 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55394 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55393 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55334 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55333 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55274 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55273 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55214 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55213 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55154 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55153 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 55094 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55093 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 55034 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55033 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 54974 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54973 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccgg 54914 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54913 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 54854 Query: 660 t 660 | Sbjct: 54853 t 54853
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124828 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 124770 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124769 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 124710 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124709 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 124650 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 124649 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 124590 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124589 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 124530 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124529 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 124470 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124469 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 124410 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124409 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 124350 Query: 480 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>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124828 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 124770 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124769 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 124710 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124709 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 124650 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 124649 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 124590 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124589 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 124530 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124529 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 124470 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124469 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 124410 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124409 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 124350 Query: 480 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>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55504 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 55446 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55445 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 55386 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55385 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 55326 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 55325 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 55266 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55265 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 55206 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55205 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 55146 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55145 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 55086 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55085 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 55026 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55025 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 54966 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54965 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccgg 54906 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54905 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 54846 Query: 660 t 660 | Sbjct: 54845 t 54845
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccgg 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 53714 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 53656 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53655 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 53596 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 53595 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 53536 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 53535 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 53476 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 53475 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 53416 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53415 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 53356 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53355 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 53296 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53295 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 53236 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53235 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 53176 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53175 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 53116 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 53115 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 53056 Query: 660 t 660 | Sbjct: 53055 t 53055
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 128647 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 128589 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128588 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 128529 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 128528 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 128469 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 128468 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 128409 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 128408 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 128349 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128348 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 128289 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128288 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 128229 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128228 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 128169 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128168 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 128109 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128108 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 128049 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 128048 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 127989 Query: 660 t 660 | Sbjct: 127988 t 127988
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 10347322 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 10347264 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10347263 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 10347204 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10347203 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 10347144 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 10347143 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 10347084 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 10347083 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 10347024 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347023 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 10346964 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346963 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 10346904 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346903 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 10346844 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10346843 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 10346784 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346783 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 10346724 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10346723 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 10346664 Query: 660 t 660 | Sbjct: 10346663 t 10346663
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1407 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1406 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1347 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1346 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1287 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1286 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1227 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1167 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1107 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1047 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 987 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 986 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 927 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 926 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccgg 867 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 866 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 807 Query: 660 t 660 | Sbjct: 806 t 806
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1150 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1149 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1090 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1089 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1030 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1029 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 970 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 910 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 850 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 790 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 730 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 729 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 670 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 669 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccgg 610 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 609 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 550 Query: 660 t 660 | Sbjct: 549 t 549
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 10353361 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcc 10353303 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10353302 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 10353243 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10353242 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 10353183 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 10353182 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 10353123 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 10353122 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 10353063 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353062 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 10353003 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353002 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 10352943 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352942 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 10352883 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10352882 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 10352823 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352822 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 10352763 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10352762 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 10352703 Query: 660 t 660 | Sbjct: 10352702 t 10352702
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1797 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1739 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1738 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1679 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1678 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1619 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1618 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1559 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1558 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1499 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1498 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1439 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1379 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1378 ctgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1319 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1318 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 1259 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 1199 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1198 tcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 1139 Query: 660 t 660 | Sbjct: 1138 t 1138
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 636/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1830 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1772 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1771 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1712 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1711 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 1652 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1651 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 1592 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1591 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1532 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1472 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 1412 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1352 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 1292 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1291 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccgg 1232 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1231 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 1172 Query: 660 t 660 | Sbjct: 1171 t 1171 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 73 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 597/612 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 108 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 109 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 168 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 169 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 228 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 229 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 288 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 289 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 349 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 408 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 409 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 468 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 469 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 529 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 588 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 589 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 648 ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 724 Query: 649 agctctcttaat 660 |||||||||||| Sbjct: 723 agctctcttaat 712
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 597/612 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 108 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 109 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 168 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 169 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 228 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 229 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 288 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 289 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 349 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 408 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 409 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 468 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 469 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 529 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 588 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 589 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 648 ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 724 Query: 649 agctctcttaat 660 |||||||||||| Sbjct: 723 agctctcttaat 712
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 594/609 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 52 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 111 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 112 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 171 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 172 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 231 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 232 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 292 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 351 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 352 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 412 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 471 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 472 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 532 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 591 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808 Query: 592 tcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagc 651 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagc 748 Query: 652 tctcttaat 660 ||| ||||| Sbjct: 747 tcttttaat 739
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 599/615 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 746 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaat 731
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 596/611 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 530 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 589 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 811 Query: 590 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 649 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 751 Query: 650 gctctcttaat 660 ||||||||||| Sbjct: 750 gctctcttaat 740
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 633/658 (96%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactccaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 991 ctgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaa 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 871 gaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 754
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 598/614 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 736 Query: 646 tacagctctcttaa 659 |||||||||||||| Sbjct: 735 tacagctctcttaa 722
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 600/617 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 815 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 814 gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgca 755 Query: 644 aatacagctctcttaat 660 ||||| ||||| ||||| Sbjct: 754 aatacggctcttttaat 738
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 603/621 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 631/656 (96%), Gaps = 2/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 cgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccat 1322 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacga 1262 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1261 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaa 1202 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1201 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtc 1142 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 agagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatg 1082 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 gatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcg 1022 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 962 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 902 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 901 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 842 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 841 agtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagtt 782 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 781 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctctt 726
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 625/648 (96%), Gaps = 2/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 69 |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 1327 Query: 70 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 129 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 130 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 189 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 190 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 249 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 250 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 309 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1087 Query: 310 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 370 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 429 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 967 Query: 430 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 490 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 550 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 609 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 610 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 786 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 739
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 2/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 69 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 1327 Query: 70 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 129 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 tgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 130 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 189 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 190 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 249 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 250 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 309 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 1087 Query: 310 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 370 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 429 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 967 Query: 430 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 490 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 550 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 609 ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 610 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 786 atgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 631/656 (96%), Gaps = 2/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacga 1290 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaa 1230 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 542 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtt 601 |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 869 agtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagtt 810 Query: 602 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctctt 754
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 598/615 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 810 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 750 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 749 tacagctctcttaat 735
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 607/627 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1021 Query: 391 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccaga 961 Query: 451 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 510 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 901 Query: 511 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 570 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 900 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841 Query: 571 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 caaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 781 Query: 631 taattctctcgcaaatacagctctctt 657 |||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 780 taattccctcgcaaatatagctctctt 754
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 588/602 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctc 744 Query: 656 tt 657 || Sbjct: 743 tt 742
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 588/602 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctc 744 Query: 656 tt 657 || Sbjct: 743 tt 742
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 597/614 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 736 Query: 646 tacagctctcttaa 659 |||||||||||||| Sbjct: 735 tacagctctcttaa 722
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 590/605 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 814 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 754 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 753 ttaat 749
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 604/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 714 agtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 655 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 654 cctcgcaaatacagctctcttaat 631
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 634/661 (95%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614552 ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 5614494 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 5614493 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattac 5614434 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614433 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 5614374 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 5614373 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 5614314 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614313 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 5614254 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614253 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 5614194 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614193 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 5614134 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614133 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 5614074 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614073 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 5614014 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614013 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccctgg 5613954 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5613953 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 5613894 Query: 660 t 660 | Sbjct: 5613893 t 5613893 Score = 638 bits (322), Expect = e-180 Identities = 356/366 (97%), Gaps = 1/366 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 295 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 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cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 13436745 Query: 655 cttaat 660 |||||| Sbjct: 13436744 cttaat 13436739 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 454 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 514 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 573 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 574 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 98 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 269 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 320 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.58 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 238 ggtcagagctggcatatgccaa 259 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 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>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 635/661 (96%), Gaps = 3/661 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203584 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 23203642 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 23203643 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttac 23203701 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23203702 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 23203761 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 23203762 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 23203821 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203822 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 23203881 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203882 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 23203941 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203942 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctacta 23204001 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204002 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 23204061 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23204062 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 23204121 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204122 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 23204181 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23204182 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 23204241 Query: 660 t 660 | Sbjct: 23204242 t 23204242 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 102 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 103 atc 105 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 102 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 103 atc 105 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 635/661 (96%), Gaps = 3/661 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154232 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 154290 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 154291 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttac 154349 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 154350 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 154409 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 154410 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 154469 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154470 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 154529 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154530 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 154589 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154590 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctacta 154649 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154650 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 154709 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154710 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 154769 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154770 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 154829 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 154830 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 154889 Query: 660 t 660 | Sbjct: 154890 t 154890
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 635/661 (96%), Gaps = 3/661 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38346 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 38404 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 38405 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttac 38463 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38464 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 38523 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 38524 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 38583 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38584 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 38643 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38644 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 38703 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38704 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctacta 38763 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38764 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 38823 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38824 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 38883 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38884 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg 38943 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38944 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 39003 Query: 660 t 660 | Sbjct: 39004 t 39004
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 634/661 (95%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614541 ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 5614483 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 5614482 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattac 5614423 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614422 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 5614363 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 5614362 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 5614303 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614302 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 5614243 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614242 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 5614183 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614182 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 5614123 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614122 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 5614063 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614062 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 5614003 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614002 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccctgg 5613943 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5613942 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 5613883 Query: 660 t 660 | Sbjct: 5613882 t 5613882 Score = 638 bits (322), Expect = e-180 Identities = 356/366 (97%), Gaps = 1/366 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 295 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 355 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 415 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 474 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 475 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 534 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 535 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 594 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13391079 Query: 595 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13391078 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 13391019 Query: 655 cttaat 660 |||||| Sbjct: 13391018 cttaat 13391013 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 454 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 514 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 573 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 574 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 98 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 269 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 320 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.58 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 238 ggtcagagctggcatatgccaa 259 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 634/661 (95%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38333 ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcc 38391 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 38392 atttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattac 38451 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38452 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccc 38511 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 38512 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcgg 38571 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38572 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 38631 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38632 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 38691 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38692 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 38751 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38752 ctgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 38811 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38812 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 38871 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38872 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccctgg 38931 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38932 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctcttttaa 38991 Query: 660 t 660 | Sbjct: 38992 t 38992
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 602/621 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 604/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaat 721
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 576/587 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 554 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 613 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 614 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 710
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 576/587 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 554 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 613 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 614 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 710
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 589/605 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 589/605 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 589/605 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 786 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 785 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctc 726 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 725 ttaat 721
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 601/621 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 603/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaat 721
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 594/612 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 747 Query: 646 tacagctctctt 657 |||||||||||| Sbjct: 746 tacagctctctt 735
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 623/648 (96%), Gaps = 2/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 69 |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1387 aatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagc 1329 Query: 70 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 129 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 tgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1269 Query: 130 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 189 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1268 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1209 Query: 190 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 249 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1149 Query: 250 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 309 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1148 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1089 Query: 310 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 369 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 gtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1029 Query: 370 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 429 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 969 Query: 430 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 489 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909 Query: 490 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 849 Query: 550 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 609 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 848 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 789 Query: 610 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 788 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 741
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 628/655 (95%), Gaps = 2/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 gaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1319 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1318 tggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttgcgag 1259 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 1199 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1198 ggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtca 1139 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 gagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatgg 1079 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 atacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgc 1019 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 959 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 taccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 899 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 898 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839 Query: 543 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 602 ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 838 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagtta 779 Query: 603 agtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 778 agtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 580/594 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 427 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 487 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 547 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 606 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 789 Query: 607 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 735
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 632/661 (95%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 59 |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatt-gctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 60 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 119 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 120 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 179 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1291 gagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgcattccccc 1232 Query: 180 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcgg 1172 Query: 240 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 299 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 300 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 359 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaatataatcat 1052 Query: 360 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 420 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaatacacgga 932 Query: 480 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 540 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 599 |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || | Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggtgaatcctccag 812 Query: 600 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaa 752 Query: 660 t 660 | Sbjct: 751 t 751
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 617/642 (96%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 78 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1307 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgat 1248 Query: 79 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 138 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1247 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1188 Query: 139 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 198 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1128 Query: 199 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 258 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 tccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1068 Query: 259 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 318 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 aacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 1008 Query: 319 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 378 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 948 Query: 379 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 888 Query: 439 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 498 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 828 Query: 499 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 558 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 827 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 768 Query: 559 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattac 618 |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| Sbjct: 767 gcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgcattac 708 Query: 619 aataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 707 aataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaat 666
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctc 744 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 743 ttaat 739
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 597/617 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 797 gcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgca 738 Query: 644 aatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||| Sbjct: 737 aatacagctctcttaat 721
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 585/602 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 59 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 118 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 119 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 178 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 179 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 239 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 299 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 359 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 419 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 478 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 479 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 539 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccg 598 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccca 793 Query: 599 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 658 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 gttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctta 733 Query: 659 at 660 || Sbjct: 732 at 731
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 602/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaat 721
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 631/660 (95%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 540 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 600 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 601 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 604/627 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1005 Query: 391 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccaga 945 Query: 451 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 510 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 885 Query: 511 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 570 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 825 Query: 571 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 824 caaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccc 765 Query: 631 taattctctcgcaaatacagctctctt 657 |||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 764 taattccctcgcaaatatagctctctt 738
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 592/611 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 107 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 166 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 167 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 226 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 227 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 287 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 346 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 347 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 407 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 466 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 467 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 526 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 527 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 586 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 587 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 646 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 647 acagctctctt 657 | ||||||||| Sbjct: 764 atagctctctt 754
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 595/615 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaa 736 Query: 646 tacagctctcttaat 660 ||||||||||||||| Sbjct: 735 tacagctctcttaat 721
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 599/621 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 601/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaat 721
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 601/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaat 721
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 592/612 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 585 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 645 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 736 Query: 646 tacagctctctt 657 |||||||||||| Sbjct: 735 tacagctctctt 724
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 601/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 tctcgcaaatgcagctctcttaat 721
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 630/660 (95%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tcgaactcgaatttgatncgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 540 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 600 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 601 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 576/591 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 427 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 486 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 487 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 547 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 606 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 607 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctctt 697
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 576/591 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 427 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 486 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 487 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 547 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 606 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 607 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctctt 697
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 591/611 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 530 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 589 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 802 Query: 590 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 649 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 801 aatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 742 Query: 650 gctctcttaat 660 ||||||||||| Sbjct: 741 gctctcttaat 731
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 590/610 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 108 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 168 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 228 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 287 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 288 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 347 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 348 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 408 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 467 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 468 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 527 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 528 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 587 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 767 Query: 588 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 647 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 766 tgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 707 Query: 648 cagctctctt 657 ||||||||| Sbjct: 706 tagctctctt 697
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 601/622 (96%), Gaps = 2/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 95 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 96 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 155 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 156 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 215 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 216 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 275 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 276 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 335 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 336 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 396 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 455 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 456 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 516 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 575 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 576 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 635 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaatt 746 Query: 636 ctctcgcaaatacagctctctt 657 | |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 565/577 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 81 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 140 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 141 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 201 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 260 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 261 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 320 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 321 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 380 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 381 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 440 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 441 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 501 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 561 aatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaa 620 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaa 738 Query: 621 taggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 657 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 737 taggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctctt 701
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 529/529 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 132 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 192 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 252 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 312 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 372 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1875 Query: 432 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1874 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1815 Query: 492 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1814 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 1755 Query: 552 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 611 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1754 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 1695 Query: 612 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1694 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 1646
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 598/621 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 598/621 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctctt 657 |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 588/608 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 924 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 864 Query: 530 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 589 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 804 Query: 590 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 649 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 803 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 744 Query: 650 gctctctt 657 |||||||| Sbjct: 743 gctctctt 736
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 600/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 || |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 ccttgcaaatacagctctcttaat 721
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 600/624 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 636 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745 Query: 637 tctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaat 721
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 604/630 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 1321 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 1261 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1080 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 1021 Query: 391 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 961 Query: 451 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 901 Query: 511 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 570 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 900 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 841 Query: 571 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 781 Query: 631 taattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 780 taattcccttgcaaatacagctctcttaat 751
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 604/630 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58253 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58194 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58193 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58134 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58133 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58074 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58073 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58014 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58013 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57954 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57953 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57894 Query: 391 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57893 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 57834 Query: 451 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57833 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 57774 Query: 511 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 570 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 57773 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 57714 Query: 571 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57713 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 57654 Query: 631 taattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 57653 taattcccttgcaaatacagctctcttaat 57624
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 604/630 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120461 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 120402 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 120401 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 120342 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120341 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 120282 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120281 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 120222 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120221 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 120162 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 120161 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 120102 Query: 391 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 120101 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 120042 Query: 451 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120041 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 119982 Query: 511 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 570 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 119981 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 119922 Query: 571 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119921 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 119862 Query: 631 taattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 119861 taattcctttgcaaatacagctctcttaat 119832
>gb|AY622897.1| Olyra latifolia ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 592/614 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaactgtaatacggaatca 1158 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1157 tctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccacc 1098 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatct 1038 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatcccccccagacatacgcaatgct 918 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 524 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 583 || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 857 gctcgatgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 798 Query: 584 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 643 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 797 gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgca 738 Query: 644 aatacagctctctt 657 |||||||||||||| Sbjct: 737 aatacagctctctt 724
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 604/630 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58263 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58204 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58203 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58144 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58143 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58084 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58083 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58024 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58023 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57964 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57963 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57904 Query: 391 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57903 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 57844 Query: 451 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57843 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 57784 Query: 511 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 570 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 57783 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 57724 Query: 571 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57723 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 57664 Query: 631 taattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 57663 taattcccttgcaaatacagctctcttaat 57634
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 604/630 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58834 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58775 Query: 91 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 150 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58774 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58715 Query: 151 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 210 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58714 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58655 Query: 211 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 270 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58654 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58595 Query: 271 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 330 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58594 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 58535 Query: 331 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 390 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 58534 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 58475 Query: 391 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 58474 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 58415 Query: 451 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58414 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 58355 Query: 511 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 570 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 58354 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 58295 Query: 571 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 630 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58294 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 58235 Query: 631 taattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 |||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 58234 taattcctttgcaaatacagctctcttaat 58205
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 603/629 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 32 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 91 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 92 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 151 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 152 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 211 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 212 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 271 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 272 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 331 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 332 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 391 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 392 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagac 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagac 942 Query: 452 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 511 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaata 882 Query: 512 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 571 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 881 actgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagcc 822 Query: 572 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 631 ||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aaactagtatttgcggtgaatcctcctgttatgtagtcatgcattacaataggaacccct 762 Query: 632 aattctctcgcaaatacagctctcttaat 660 ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 761 aattccctcgcaaatacagctctcttaat 733
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 585/605 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 919 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 535 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 918 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 859 Query: 536 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 595 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 858 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatccc 799 Query: 596 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 655 || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 798 ccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctctc 739 Query: 656 ttaat 660 ||||| Sbjct: 738 ttaat 734 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,877,342 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4877342 Number of successful extensions: 127232 Number of sequences better than 10.0: 15316 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15273 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 57 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 94824 Number of HSP's gapped (non-prelim): 23007 length of query: 660 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 637 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10920280637448 effective search space used: 10920280637448 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)