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carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3110
Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0
Identities = 686/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137459.1 | Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1612
Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0
Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137457.1 | Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0
Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137452.1 | Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0
Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1614
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Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
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carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
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Length = 1614
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Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933
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Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
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large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
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>gb| AY137441.1 | Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1589
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Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137439.1 | Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0
Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137438.1 | Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1621
Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0
Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836169.1 | Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3089
Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0
Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137455.1 | Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
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Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb| AY137448.1 | Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0
Identities = 683/690 (98%), Gaps = 2/690 (0%)
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Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 1110 tacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>emb| Z49841.1 |HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0
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carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
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Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137440.1 | Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0
Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137433.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0
Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137432.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0
Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137431.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
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Strand = Plus / Minus
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ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
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subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0
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Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836170.1 | Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3102
Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0
Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137434.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1617
Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb| AY836171.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3108
Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 871
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY137443.1 | Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagga 1352
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112
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Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb| AY137450.1 | Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1610
Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagt 1352
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatac 873
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb| AY137430.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb| AY137429.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137425.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137424.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137423.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0
Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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>gb| AY137454.1 | Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1589
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Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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>gb| AY137449.1 | Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1616
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Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232
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Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172
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Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
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ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0
Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137418.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
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Strand = Plus / Minus
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ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
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Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137458.1 | Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0
Identities = 681/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137446.1 | Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1614
Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0
Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137437.1 | Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1628
Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0
Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1619
Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0
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Strand = Plus / Minus
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chloroplast product
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>gb| AY137419.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0
Identities = 681/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb| AY836172.1 | Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3095
Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0
Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836164.1 | Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2374
Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0
Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgc 1350
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Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>emb| Z49845.1 |PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0
Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagt 1362
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Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302
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Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>gb| AY836176.1 | Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3106
Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0
Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410
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Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290
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Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836165.1 | Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2366
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subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic
spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII
(psaI) gene, partial cds; chloroplast
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Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
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>gb| AY836158.1 | Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 2365
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Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836177.1 | Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2752
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Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY328025.1 | Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1519
Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836184.1 | Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3179
Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836178.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3089
Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836175.1 | Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2136
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Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Length = 134545
Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>dbj| D00206.1 |WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete
cds
Length = 1755
Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| Z49842.1 |HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836167.1 | Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2372
Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 810 ngctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836159.1 | Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 2373
Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110
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Sbjct: 870 aaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836162.1 | Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3192
Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410
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Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350
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Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290
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Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871
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carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
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carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast
Length = 1617
Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY607057.1 | Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast
Length = 1594
Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY607056.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1589
Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 871 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb| AY836183.1 | Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI
intergenic spacer, partial sequence; chloroplast
Length = 2360
Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0
Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836181.1 | Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic
spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII
(psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3155
Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836156.1 | Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2360
Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290
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Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931
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>gb| AY836157.1 | Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3183
Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY607055.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1589
Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| Z49846.1 |PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| Z49843.1 |LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943
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Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 822 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 763
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>emb| X62118.1 |CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large
subunit of ribulose 1,5 bisphosphate
carboxylase/oxygenase and apoprotein I
Length = 4811
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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>emb| X62117.1 |CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for
large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate
carboxylase/oxygenase and apoprotein I
Length = 4075
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 838 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 780
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 720
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 719 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggt 660
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 659 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 600
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 599 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 569
>gb| AY601671.1 | Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1619
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1531 gtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412
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Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053
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Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993
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>gb| AY607052.1 | Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
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Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836185.1 | Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3054
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836182.1 | Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3138
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836166.1 | Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3166
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836163.1 | Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3190
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871
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Sbjct: 810 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836160.1 | Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 2268
Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0
Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY601672.1 | Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1619
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Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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>gb| AY607053.1 | Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1614
Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0
Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 875 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 845
>gb| AY137461.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1589
Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0
Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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>gb| AY607058.1 | Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1471
Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0
Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 911 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 852
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 731 agctctcttcatcatttcttcacatgtaccc 701
>gb| AY836179.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
psaI gene, partial sequence; chloroplast
Length = 3071
Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0
Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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>emb| Z49837.1 |EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
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Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 762 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 732
>gb| AY137462.1 | Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1477
Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0
Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338
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Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1278
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
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>gb| AY836174.1 | Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3158
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Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY836168.1 | Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
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Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY836154.1 | Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic
spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII
(psaI) gene, partial cds; chloroplast
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Strand = Plus / Minus
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb| AY607050.1 | Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast
Length = 1614
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Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Length = 1431
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>emb| Z49839.1 |ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0
Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcc 1302
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>gb| AY607051.1 | Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1614
Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0
Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| X62119.1 |CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for
large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate
carboxylase/oxygenase and apoprotein I
Length = 3830
Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0
Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 599 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 569
>gb| AY836155.1 | Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic
spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII
(psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3234
Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0
Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY137435.1 | Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1619
Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0
Identities = 671/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472
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Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssc 1412
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172
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Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112
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Sbjct: 1111 ttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagc 1053
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Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933
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>emb| Z49838.1 |EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0
Identities = 672/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062
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Sbjct: 762 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 732
>emb| Z49836.1 |BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1434
Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0
Identities = 664/680 (97%), Gaps = 2/680 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943
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Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823
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Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatac 763
Query: 660 agctctcttaatcattnctt 679
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttctt 743
>gb| AY772669.1 | Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast
Length = 1510
Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0
Identities = 671/690 (97%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1472 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1413
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1412 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1353
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Sbjct: 1352 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1293
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Sbjct: 1112 ataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1053
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Sbjct: 1052 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 994
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>gb| AY691640.1 | Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
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Strand = Plus / Minus
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>gb| AY691639.1 | Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1333
Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0
Identities = 620/625 (99%), Gaps = 1/625 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
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Query: 666 cttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 730 cttaatcatttcttcacatgtaccc 706
>gb| AY395539.1 | Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1309
Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0
Identities = 627/635 (98%), Gaps = 1/635 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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>emb| AJ746290.1 | Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1309
Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0
Identities = 627/635 (98%), Gaps = 1/635 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250
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Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190
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Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950
Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771
Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 676
>emb| AJ746268.1 | Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1388
Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0
Identities = 669/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 722 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 693
>emb| AJ746261.1 | Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0
Identities = 669/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1122
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1121 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>emb| AJ746257.1 | Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0
Identities = 669/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242
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Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1181 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122
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Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagc 1002
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Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943
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Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823
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Sbjct: 822 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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cds
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>gb| AY395528.1 | Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence;
chloroplast
Length = 1408
Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0
Identities = 668/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| AJ746258.1 | Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1397
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Strand = Plus / Minus
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>emb| AJ746256.1 | Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
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Identities = 667/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>gb| AY395531.1 | Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1350
Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0
Identities = 625/637 (98%), Gaps = 1/637 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb| AJ746287.1 | Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1344
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Identities = 622/634 (98%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176
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Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296
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Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105
Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356
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Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045
Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 416
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Query: 417 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476
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Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926
Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536
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Query: 657 tacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 745 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb| AJ746286.1 | Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1350
Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0
Identities = 623/635 (98%), Gaps = 1/635 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166
Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106
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Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046
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Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807
Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb| AJ746271.1 | Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1409
Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0
Identities = 664/689 (96%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344
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Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984
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Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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>gb| L14621.1 |PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds
Length = 1484
Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0
Identities = 665/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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>gb| AY691636.1 | Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0
Identities = 615/625 (98%), Gaps = 1/625 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305
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Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984
Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865
Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
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Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805
Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
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Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>dbj| BA000029.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome
Length = 490520
Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0
Identities = 665/689 (96%), Gaps = 4/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 124099 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 124071
Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0
Identities = 665/689 (96%), Gaps = 4/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caa 29872
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 29692 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29633
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 29632 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 29573
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 29572 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 29544
>gb| AY395536.1 | Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0
Identities = 622/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113
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Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288
Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173
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Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228
Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233
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Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168
Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293
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Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108
Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353
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Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048
Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413
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Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988
Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473
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Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929
Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533
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Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869
Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593
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Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809
Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653
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Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749
Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb| AJ784827.1 | Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1363
Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0
Identities = 620/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184
Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064
Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004
Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825
Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 764 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 731
>gb| AY395554.1 | Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1332
Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0
Identities = 619/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150
Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030
Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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>emb| AJ746298.1 | Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1332
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Identities = 619/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY622890.1 | Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1342
Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0
Identities = 619/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857
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Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatgtcttcgcatgtacc 703
>gb| AY691642.1 | Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 612/625 (97%), Gaps = 1/625 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
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>gb| AY522329.1 | Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast,
complete genome
Length = 134496
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 54811 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 54783
>gb| DQ167399.1 | Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion,
complete genome
Length = 491515
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Strand = Plus / Minus
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>emb| AJ746275.1 | Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361
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Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001
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sequence
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Strand = Plus / Plus
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Identities = 120/125 (96%)
Strand = Plus / Minus
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>dbj| AP003280.2 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC
clone:P0557A01
Length = 147201
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Plus
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>dbj| AP006728.1 | Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome
Length = 134494
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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>gb| AY395527.1 | Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1408
Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0
Identities = 632/652 (96%), Gaps = 1/652 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 98 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 157
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Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124
Query: 278 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 337
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Query: 338 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 397
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Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004
Query: 398 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccc 457
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Query: 458 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 517
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Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885
Query: 518 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 577
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Query: 578 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 637
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>emb| AJ784828.1 | Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1358
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Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293
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Sbjct: 1169 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1110
Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353
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Sbjct: 1109 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1050
Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413
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Sbjct: 1049 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccct 990
Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473
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Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533
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Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593
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Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653
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Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 750 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 715
>emb| AJ784820.1 | Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1350
Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0
Identities = 620/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113
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Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289
Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173
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Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229
Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233
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Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169
Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293
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Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109
Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353
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Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049
Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413
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Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989
Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473
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Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930
Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533
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Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870
Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593
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Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810
Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653
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Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750
Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 714
>gb| AY395541.1 | Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1299
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 598/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 84 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143
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Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240
Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203
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Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180
Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263
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Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120
Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323
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Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060
Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383
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Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000
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Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503
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Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881
Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563
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Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761
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bisphosphate carboxylase large chain
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Identities = 598/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701
Query: 684 tgtaccc 690
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>gb| AY691631.1 | Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0
Identities = 613/628 (97%), Gaps = 1/628 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121
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Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361
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Query: 422 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481
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Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541
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Query: 542 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 601
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Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749
Query: 662 ctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 748 ctctcttaatcatttcttcacatgtacc 721
>emb| AJ784835.1 | Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1346
Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0
Identities = 618/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 747 atacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 714
>emb| AJ746272.1 | Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1415
Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0
Identities = 661/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1048 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 989
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 749 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 720
>emb| AJ746265.1 | Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1413
Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0
Identities = 661/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1286 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1227
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1226 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1167
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1166 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1107
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1106 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1047
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1046 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 987
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 986 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 928
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 867 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 808
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 807 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 748
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 747 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 718
>emb| AJ746259.1 | Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1427
Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0
Identities = 661/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1420 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1361
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1180 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1121
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1120 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1061
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1060 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1001
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1000 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 942
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 941 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 882
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 881 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 822
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 821 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 762
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 761 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 732
>ref| NM_195989.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large
subunit from chromosome 10 chloroplast insertion
(OSJNBb0075K12.39), mRNA
Length = 1434
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
|| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||
Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001
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Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 761 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 733
>gb| AY691632.1 | Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
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Strand = Plus / Minus
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complete genome
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Strand = Plus / Minus
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>gb| AY522331.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast,
complete genome
Length = 134551
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 54863 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 54835
>gb| DQ167807.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion,
complete genome
Length = 490673
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 124179 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 124151
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 29598 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 29570
>gb| DQ167400.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion,
complete genome
Length = 490669
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719
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Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 124239 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124180
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 124179 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 124151
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198
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Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078
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Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018
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Sbjct: 29837 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29659
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 29658 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 29599
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 29598 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 29570
>emb| X15901.1 |CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome
Length = 134525
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| AJ746297.1 | Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1428
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Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| AJ746267.1 | Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1412
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 865 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 806
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 805 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 746
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 745 gctctcttcatcatatcttcgcatgtacc 717
>gb| AC122148.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone
OSJNAb0075K12, complete sequence
Length = 125936
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 53065 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 53037
>gb| AC092750.2 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from
chromosome 10, complete sequence
Length = 134933
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
|| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 128118 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 128059
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 128058 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 127999
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
||||| ||||||||| |||| ||||||||
Sbjct: 127998 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 127970
>dbj| AP008216.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete
sequence
Length = 22685906
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973
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Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 10346912 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 10346793 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10346734
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 10346733 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 10346674
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
||||| ||||||||| |||| ||||||||
Sbjct: 10346673 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 10346645
>dbj| AK105600.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full
insert sequence
Length = 2485
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||
Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356
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Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||
Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116
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Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
|||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 936 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 877
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Sbjct: 876 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 817
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 816 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 788
>dbj| AK058623.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full
insert sequence
Length = 1243
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Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159
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Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 679 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 620
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 619 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 560
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 559 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 531
>gb| AE016959.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence
Length = 22698374
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 10352712 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 10352684
>emb| X04789.1 |CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone
pCT-1)
Length = 1989
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688
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Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 1268 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 1209
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Sbjct: 1208 aatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1149
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 1148 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 1120
>dbj| D00207.1 |RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate
carboxylase large subunit, complete cds
Length = 2062
Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 1420 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1301 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 1242
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 1241 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1182
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
||||| ||||||||| |||| ||||||||
Sbjct: 1181 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 1153
Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002
Identities = 31/33 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 83 tcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb| AJ784832.1 | Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1345
Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0
Identities = 610/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166
Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305
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Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986
Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867
Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807
Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 747
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 746 cttaatcatttcttcacatgtacc 723
>emb| AJ784823.1 | Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1360
Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0
Identities = 619/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113
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Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293
Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233
Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233
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Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173
Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113
Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053
Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993
Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473
|||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934
Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874
Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593
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Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814
Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653
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Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754
Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 753 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 718
>emb| AJ746263.1 | Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1343
Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0
Identities = 659/688 (95%), Gaps = 2/688 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1336 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagt 1277
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1276 tcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1157
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1097
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1096 aagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1037
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1036 acaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 977
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 916 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 858
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 798
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 797 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 738
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 737 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 678
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgta 687
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>emb| AJ746281.1 | Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1329
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Identities = 617/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270
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Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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>emb| AJ746270.1 | Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0
Identities = 660/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823
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Sbjct: 762 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 733
>emb| AJ746172.1 | Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1362
Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0
Identities = 614/630 (97%), Gaps = 1/630 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002
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Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 733
>emb| AJ746277.1 | Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0
Identities = 653/681 (95%), Gaps = 2/681 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 883
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 763
Query: 660 agctctcttaatcattncttc 680
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Sbjct: 762 agctctcttcatcatttcttc 742
>gb| AY395535.1 | Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1349
Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0
Identities = 618/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113
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Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288
Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173
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Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228
Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233
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Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168
Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293
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Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108
Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353
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Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048
Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413
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Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988
Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473
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Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929
Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533
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Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869
Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593
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Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809
Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653
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Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749
Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb| AJ746282.1 | Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1408
Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0
Identities = 630/652 (96%), Gaps = 1/652 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 38 tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncatt 97
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Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304
Query: 98 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 157
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Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244
Query: 158 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 217
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Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184
Query: 218 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 277
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Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124
Query: 278 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 337
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Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064
Query: 338 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 397
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Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004
Query: 398 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccc 457
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Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccc 945
Query: 458 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 517
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Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885
Query: 518 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 577
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Sbjct: 884 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 825
Query: 578 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 637
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Sbjct: 824 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765
Query: 638 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 764 cccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>gb| DQ005609.1 | Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1393
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 660/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 973 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 915
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 914 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 855
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 854 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 795
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 794 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 735
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 734 agctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 704
>emb| AJ746262.1 | Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1370
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 620/639 (97%), Gaps = 1/639 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 51 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagca 110
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Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311
Query: 111 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 170
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Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251
Query: 171 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 230
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Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191
Query: 231 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 290
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Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131
Query: 291 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 350
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Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071
Query: 351 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 410
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Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011
Query: 411 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 470
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Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952
Query: 471 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 530
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Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892
Query: 531 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 590
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Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832
Query: 591 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 650
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Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772
Query: 651 cgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>emb| AJ746260.1 | Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 660/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1362
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1361 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1302
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1242
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1182
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1122
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1062
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 822 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 762 agctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 732
>gb| AY622885.1 | Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds;
chloroplast
Length = 1330
Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0
Identities = 610/626 (97%), Gaps = 1/626 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 64 gactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 123
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Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268
Query: 124 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 183
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Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208
Query: 184 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 243
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Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148
Query: 244 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 303
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Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088
Query: 304 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 363
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Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028
Query: 364 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 423
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Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968
Query: 424 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 483
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Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909
Query: 484 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 543
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Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849
Query: 544 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 603
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Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789
Query: 604 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 663
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Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729
Query: 664 ctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 728 ctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>dbj| AP008218.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete
sequence
Length = 27566993
Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0
Identities = 658/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 5614142 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614084
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 5614083 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614024
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 5614023 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613964
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 5613963 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 5613904
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 5613903 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 5613875
Score = 646 bits (326), Expect = 0.0
Identities = 372/385 (96%), Gaps = 2/385 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364
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Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045
Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424
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Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985
Query: 425 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484
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Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926
Query: 485 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 544
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Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866
Query: 545 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 604
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Sbjct: 13436865 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13436806
Query: 605 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 664
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Sbjct: 13436805 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13436746
Query: 665 tcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 13436745 tcttaatcatttcttcgcatgtacc 13436721
Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79
Identities = 171/177 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524
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Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037
Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 584
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Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977
Query: 585 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 641
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Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920
Score = 89.7 bits (45), Expect = 1e-14
Identities = 53/56 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 108
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Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378
Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05
Identities = 30/30 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279
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Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093
Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04
Identities = 33/35 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364
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Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962
Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60
Identities = 22/22 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269
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Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj| AP008212.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete
sequence
Length = 30731886
Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0
Identities = 659/689 (95%), Gaps = 3/689 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 23203993 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23204112 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 23204171
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 23204172 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 23204231
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 23204232 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 23204260
Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21
Identities = 61/63 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaag 112
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Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441
Query: 113 atc 115
|||
Sbjct: 26711440 atc 26711438
Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21
Identities = 61/63 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaag 112
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Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333
Query: 113 atc 115
|||
Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj| AP004236.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC
clone:P0417D05
Length = 165752
Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0
Identities = 659/689 (95%), Gaps = 3/689 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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>dbj| AP003623.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC
clone:P0642B07
Length = 139297
Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0
Identities = 659/689 (95%), Gaps = 3/689 (0%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 38994 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 39022
>gb| DP000011.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence
Length = 27492551
Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0
Identities = 658/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 5613892 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 5613864
Score = 646 bits (326), Expect = 0.0
Identities = 372/385 (96%), Gaps = 2/385 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364
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Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424
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Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259
Query: 425 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484
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Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200
Query: 485 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 544
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Query: 545 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 604
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Query: 605 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 664
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Query: 665 tcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 13391019 tcttaatcatttcttcgcatgtacc 13390995
Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79
Identities = 171/177 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524
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Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 584
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Query: 585 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 641
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Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194
Score = 89.7 bits (45), Expect = 1e-14
Identities = 53/56 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 108
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Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652
Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05
Identities = 30/30 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279
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Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269
Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04
Identities = 33/35 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364
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Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841
Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60
Identities = 22/22 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269
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Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb| BX000560.1 |CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from
chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of
Oryza sativa (rice), complete sequence
Length = 139684
Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0
Identities = 658/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60
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Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382
Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120
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Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442
Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180
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Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502
Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240
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Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562
Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300
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Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622
Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360
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Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682
Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420
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Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742
Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480
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Sbjct: 38743 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801
Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540
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Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861
Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600
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Sbjct: 38862 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38921
Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660
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Sbjct: 38922 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 38981
Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 38982 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 39010
>gb| AY691634.1 | Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0
Identities = 608/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164
Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305
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Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984
Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865
Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805
Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
|||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb| AY395565.1 | Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1323
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 613/631 (97%), Gaps = 1/631 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacg 118
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Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264
Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204
Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238
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Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144
Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084
Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358
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Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024
Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964
Query: 419 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478
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Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905
Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845
Query: 539 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 598
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Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785
Query: 599 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 658
|||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725
Query: 659 cagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 694
>emb| AJ746276.1 | Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1323
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 613/631 (97%), Gaps = 1/631 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacg 118
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Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264
Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178
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Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204
Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238
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Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084
Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358
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Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418
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Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964
Query: 419 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478
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Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905
Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538
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Query: 539 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 598
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Query: 599 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 658
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Query: 659 cagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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>gb| AY622886.1 | Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 605/620 (97%), Gaps = 1/620 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737
Query: 656 atacagctctcttaatcatt 675
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Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatt 717
>emb| AJ784837.1 | Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1345
Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0
Identities = 615/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166
Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046
Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb| AJ784822.1 | Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for
ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1350
Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0
Identities = 612/630 (97%), Gaps = 1/630 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 752
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 751 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 722
>gb| AY691630.1 | Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0
Identities = 608/626 (97%), Gaps = 1/626 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121
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Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288
Query: 122 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 181
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Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228
Query: 182 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 241
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Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168
Query: 242 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 301
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Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108
Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361
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Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048
Query: 362 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 421
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Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988
Query: 422 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481
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Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929
Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541
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Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869
Query: 542 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 601
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Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809
Query: 602 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 661
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Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749
Query: 662 ctctcttaatcattncttcacatgta 687
|||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 748 ctcttttaatcatttcttcacatgta 723
>emb| AJ784825.1 | Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1349
Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0
Identities = 614/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170
Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050
Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990
Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811
Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
|||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 750 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 717
>gb| U13226.1 |ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1398
Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0
Identities = 657/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1332
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1331 tcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1272
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1271 ccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1212
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1211 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1152
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1151 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1092
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1091 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttca 1032
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1031 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 972
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 971 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 913
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 912 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 853
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 852 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 793
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Sbjct: 792 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 733
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 732 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| AY622898.1 | Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0
Identities = 614/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156
Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036
Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976
Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917
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subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
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Strand = Plus / Minus
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Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
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>gb| AY691635.1 | Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0
Identities = 606/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>emb| AJ784831.1 | Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1353
Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0
Identities = 606/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
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Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 755
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 754 cttaatcatttcttcacatgtacc 731
>emb| AJ746274.1 | Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0
Identities = 655/688 (95%), Gaps = 2/688 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1061 atataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgc 943
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggt 823
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgta 687
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Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgta 735
>gb| U31440.1 |PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0
Identities = 620/643 (96%), Gaps = 1/643 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 actgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 702
>gb| AY395547.1 | Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1296
Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0
Identities = 592/606 (97%), Gaps = 1/606 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 84 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143
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Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203
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Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177
Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263
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Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117
Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323
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Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057
Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383
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Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997
Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 443
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Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938
Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503
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Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878
Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563
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Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818
Query: 564 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 623
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758
Query: 624 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcaca 683
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Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698
Query: 684 tgtacc 689
||||||
Sbjct: 697 tgtacc 692
>emb| AJ784824.1 | Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1357
Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0
Identities = 613/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113
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Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295
Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235
Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175
Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115
Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055
Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995
Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473
||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936
Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533
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Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876
Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816
Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756
Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgta 687
|||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||
Sbjct: 755 aaatacggctcttttaatcatttcttcgcatgta 722
>emb| AJ746293.1 | Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for
ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1296
Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0
Identities = 592/606 (97%), Gaps = 1/606 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 84 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143
||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237
Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203
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Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177
Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263
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Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117
Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323
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Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057
Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383
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Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997
Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 443
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Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938
Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503
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Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878
Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563
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Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818
Query: 564 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 623
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Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758
Query: 624 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcaca 683
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Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698
Query: 684 tgtacc 689
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Sbjct: 697 tgtacc 692
>emb| AJ746278.1 | Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1385
Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0
Identities = 641/670 (95%), Gaps = 2/670 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80
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Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326
Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140
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Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266
Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200
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Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206
Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260
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Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146
Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320
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Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086
Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380
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Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026
Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440
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Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967
Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500
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Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907
Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560
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Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847
Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620
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Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 787
Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680
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Sbjct: 786 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatcttc 727
Query: 681 acatgtaccc 690
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Sbjct: 726 gcatgtaccc 717
>gb| U31438.1 |MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0
Identities = 619/642 (96%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgtacc 703
>gb| AY691646.1 | Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0
Identities = 605/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164
Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305
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Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984
Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865
Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
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Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805
Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
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Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb| AY691645.1 | Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0
Identities = 605/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164
Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305
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Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984
Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865
Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
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Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805
Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
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Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
|||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb| AY640153.1 | Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0
Identities = 618/642 (96%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 703
>emb| AJ746264.1 | Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1343
Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0
Identities = 655/690 (94%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 916 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 858
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 798
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||
Sbjct: 797 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggt 738
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
|||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
Sbjct: 737 gaatcctccagttaaatagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatgc 678
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
|||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct: 677 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 648
>gb| U29900.1 | Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0
Identities = 618/642 (96%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| AY622896.1 | Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0
Identities = 612/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcgcatgtacc 703
>emb| AJ784834.1 | Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1328
Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0
Identities = 596/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 77 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136
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Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269
Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196
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Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256
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Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149
Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316
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Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089
Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376
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Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029
Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436
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Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 970
Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496
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Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910
Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556
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Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850
Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 616
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Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790
Query: 617 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattn 676
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Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 730
Query: 677 cttcacatgtacc 689
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Sbjct: 729 cttcacatgtacc 717
>gb| AF352580.1 | Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene
for chloroplast product
Length = 1254
Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0
Identities = 616/640 (96%), Gaps = 1/640 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1253 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1194
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1193 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagct 1134
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1133 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacn 1074
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1073 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1014
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1013 gcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 954
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 953 cgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 894
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 893 tccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 714 agtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 655
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgta 687
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Sbjct: 654 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta 615
>gb| AY691643.1 | Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0
Identities = 604/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305
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Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984
Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865
Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
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Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805
Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctct 745
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
|||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb| L05043.2 |ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit
(rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1325
Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0
Identities = 604/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146
Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305
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Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966
Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485
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Sbjct: 965 actactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907
Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545
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Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847
Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
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Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787
Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
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Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727
Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 726 cttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb| AJ784830.1 | Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1346
Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0
Identities = 612/635 (96%), Gaps = 1/635 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167
Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047
Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987
Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928
Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808
Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
||||||||||||| |||||| |||| |||||||||
Sbjct: 747 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 713
>emb| AJ746285.1 | Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1332
Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0
Identities = 601/621 (96%), Gaps = 1/621 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 69 catttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128
|||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273
Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188
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Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213
Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248
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Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153
Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308
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Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093
Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033
Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428
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Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973
Query: 429 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 488
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914
Query: 489 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854
Query: 549 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 608
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794
Query: 609 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 668
|||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctt 734
Query: 669 aatcattncttcacatgtacc 689
||||||| |||||||||||||
Sbjct: 733 aatcatttcttcacatgtacc 713
>emb| AJ746269.1 | Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1385
Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0
Identities = 614/636 (96%), Gaps = 2/636 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326
Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266
Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200
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Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206
Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260
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Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146
Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320
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Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086
Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380
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Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026
Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440
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Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967
Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500
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Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907
Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560
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Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847
Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620
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Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtc 787
Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 656
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Sbjct: 786 atgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751
>gb| L14622.1 |CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete
cds
Length = 1510
Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0
Identities = 645/678 (95%), Gaps = 2/678 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 13 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccat 71
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Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350
Query: 72 ttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131
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Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290
Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191
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Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230
Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251
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Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170
Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311
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Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371
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Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050
Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 431
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Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990
Query: 432 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 491
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Query: 492 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 551
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Query: 552 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 611
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Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811
Query: 612 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 671
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Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751
Query: 672 cattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 750 catttcttcgcatgtacc 733
>gb| AY395555.1 | Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1287
Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0
Identities = 595/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 77 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136
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Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228
Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196
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Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168
Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256
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Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108
Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316
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Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048
Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376
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Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436
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Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929
Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496
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Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869
Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556
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Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809
Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 616
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Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749
Query: 617 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattn 676
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Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689
Query: 677 cttcacatgtacc 689
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Sbjct: 688 cttcacatgtacc 676
>emb| AJ746301.1 | Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1287
Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0
Identities = 595/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 77 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136
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Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228
Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196
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Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168
Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256
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Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108
Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316
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Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048
Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376
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Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988
Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436
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Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929
Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496
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Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869
Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556
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Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809
Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 616
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Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749
Query: 617 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattn 676
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Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689
Query: 677 cttcacatgtacc 689
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Sbjct: 688 cttcacatgtacc 676
>emb| AJ746266.1 | Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1392
Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0
Identities = 622/649 (95%), Gaps = 1/649 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 41 ttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattacc 100
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Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321
Query: 101 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 160
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Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261
Query: 161 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 220
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Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201
Query: 221 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 280
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Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141
Query: 281 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 340
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Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081
Query: 341 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 400
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Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1021
Query: 401 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 460
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Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccag 962
Query: 461 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 520
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Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902
Query: 521 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580
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Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842
Query: 581 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 640
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Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782
Query: 641 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttgttcgcatgtacc 733
>gb| AY622895.1 | Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0
Identities = 613/637 (96%), Gaps = 1/637 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113
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Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278
Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173
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Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218
Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233
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Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158
Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293
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Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098
Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353
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Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038
Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413
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Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978
Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473
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Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919
Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533
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Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593
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Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799
Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653
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Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739
Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtaccc 702
>emb| X00630.1 |CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB
Length = 2174
Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0
Identities = 547/549 (99%), Gaps = 1/549 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 142 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 201
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Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115
Query: 202 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 261
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Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055
Query: 262 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 321
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Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995
Query: 322 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 381
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Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935
Query: 382 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggag 441
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Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggag 1876
Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501
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Sbjct: 1875 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1816
Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561
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Sbjct: 1815 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 1756
Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 621
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Sbjct: 1755 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 1696
Query: 622 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttca 681
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Sbjct: 1695 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 1636
Query: 682 catgtaccc 690
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Sbjct: 1635 catgtaccc 1627
>emb| AJ746273.1 | Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1387
Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0
Identities = 631/660 (95%), Gaps = 2/660 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80
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Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328
Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140
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Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268
Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200
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Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208
Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260
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Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148
Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320
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Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088
Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380
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Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028
Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440
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Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 969
Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500
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Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909
Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560
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Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 849
Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620
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Sbjct: 848 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 789
Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680
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Sbjct: 788 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttc 729
>gb| U31102.1 |DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
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Identities = 617/643 (95%), Gaps = 1/643 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| AY622892.1 | Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1342
Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0
Identities = 610/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| U88406.1 |SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0
Identities = 616/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| L14623.1 |PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene,
complete cds
Length = 1430
Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0
Identities = 644/678 (94%), Gaps = 2/678 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 13 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccat 71
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Query: 72 ttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131
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Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191
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Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230
Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251
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Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170
Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311
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Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371
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Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050
Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 431
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Query: 432 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 491
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Query: 492 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 551
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Query: 552 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 611
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Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811
Query: 612 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 671
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Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751
Query: 672 cattncttcacatgtacc 689
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>gb| AY632361.1 | Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid
Length = 1277
Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0
Identities = 582/597 (97%), Gaps = 1/597 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 94 cattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaag 153
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Sbjct: 1274 cattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaag 1215
Query: 154 ccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccac 213
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Sbjct: 1214 ccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccac 1155
Query: 214 caaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacat 273
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Sbjct: 1154 caaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacat 1095
Query: 274 gaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaa 333
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Sbjct: 1094 gaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaa 1035
Query: 334 agataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaaccta 393
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Sbjct: 1034 agataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaaccta 975
Query: 394 aagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatct 453
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Sbjct: 974 aagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatct 916
Query: 454 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 513
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Query: 514 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaa 573
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Sbjct: 855 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaa 796
Query: 574 tagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaata 633
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Sbjct: 795 taatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaata 736
Query: 634 ggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 735 ggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttcttcacatgtaccc 679
>emb| AJ746299.1 | Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1341
Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0
Identities = 606/630 (96%), Gaps = 1/630 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
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Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803
Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 743
Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
|||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct: 742 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 713
>emb| AJ746289.1 | Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1344
Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0
Identities = 615/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||
Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| U88405.1 |EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0
Identities = 615/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||
Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| AY622888.1 | Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0
Identities = 609/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115
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Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276
Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175
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Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216
Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235
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Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295
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Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096
Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355
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Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036
Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415
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Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976
Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475
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Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535
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Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857
Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595
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Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797
Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655
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Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| U31378.1 |SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0
Identities = 615/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 tctcgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb| AJ746254.1 | Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1376
Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0
Identities = 620/649 (95%), Gaps = 1/649 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 41 ttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattacc 100
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Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305
Query: 101 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 160
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Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245
Query: 161 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 220
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Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185
Query: 221 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 280
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Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125
Query: 281 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 340
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Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065
Query: 341 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 400
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Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1005
Query: 401 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 460
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Sbjct: 1004 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccag 946
Query: 461 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 520
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Sbjct: 945 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 886
Query: 521 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580
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Sbjct: 885 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 826
Query: 581 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 640
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Sbjct: 825 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagccc 766
Query: 641 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 765 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 717
>emb| AJ746179.1 | Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1364
Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0
Identities = 608/633 (96%), Gaps = 1/633 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatca 116
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Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305
Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176
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Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245
Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236
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Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185
Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296
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Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125
Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356
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Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065
Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 416
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Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005
Query: 417 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476
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Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946
Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536
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Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886
Query: 537 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 596
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Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826
Query: 597 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 656
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Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766
Query: 657 tacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatatcttcgcatgtacc 733
>emb| AM110249.1 | Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher
Asmussen 105 (CP)
Length = 1306
Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0
Identities = 607/632 (96%), Gaps = 1/632 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 58 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcac 117
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Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247
Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177
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Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187
Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237
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Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127
Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297
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Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067
Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357
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Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007
Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 417
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Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947
Query: 418 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 477
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Sbjct: 946 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888
Query: 478 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 537
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Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828
Query: 538 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 597
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Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768
Query: 598 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 657
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Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 708
Query: 658 acagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
| ||||||||| |||||| |||| ||||||||
Sbjct: 707 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 676
>gb| U31437.1 |KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0
Identities = 615/643 (95%), Gaps = 1/643 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 actgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtaccc 702
>emb| X55827.1 |CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large
subunit (EC 4.1.1.39)
Length = 2010
Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0
Identities = 651/690 (94%), Gaps = 2/690 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59
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Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799
Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739
Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179
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Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679
Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239
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Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619
Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299
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Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559
Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359
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Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499
Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419
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Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439
Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479
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Sbjct: 1438 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 1380
Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539
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Sbjct: 1379 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1320
Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599
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Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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>emb| AJ746284.1 | Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
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Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>gb| U31360.1 |ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit
(rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1344
Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0
Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| U31380.1 |TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0
Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 ccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| U31439.1 |MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0
Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb| U31100.1 |CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0
Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107
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Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1284
Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167
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Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224
Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227
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Sbjct: 1223 actgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164
Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287
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Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104
Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347
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Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaa 1044
Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407
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Sbjct: 1043 cgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984
Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467
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Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925
Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527
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Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865
Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587
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Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805
Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647
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Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745
Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689
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Sbjct: 744 ccttgcaaatccagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 703
>emb| Z11973.1 |CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80
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Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341
Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140
||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281
Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221
Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161
Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320
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Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101
Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380
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Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041
Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 982
Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500
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Sbjct: 981 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 922
Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 921 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 862
Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 861 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 802
Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 801 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 742
Query: 681 acatgtacc 689
||||||||
Sbjct: 741 gcatgtacc 733
>emb| X86563.2 |ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome
Length = 140384
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80
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Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214
Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140
||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154
Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094
Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034
Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974
Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914
Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57855
Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 57854 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57795
Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 57794 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 57735
Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 57734 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 57675
Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 57674 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 57615
Query: 681 acatgtacc 689
||||||||
Sbjct: 57614 gcatgtacc 57606
>emb| AJ746280.1 | Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1316
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 586/605 (96%), Gaps = 1/605 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 85 ggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaag 144
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Sbjct: 1256 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgccctaaag 1197
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Query: 445 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 504
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Query: 505 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 564
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Query: 565 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 624
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Query: 625 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacat 684
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Query: 685 gtacc 689
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>emb| AJ746279.1 | Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1301
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 583/601 (97%), Gaps = 1/601 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 89 aattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 148
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Sbjct: 1301 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1242
Query: 149 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 208
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Query: 209 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 268
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Query: 269 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 328
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Query: 329 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 388
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Query: 509 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 568
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Query: 689 c 689
|
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>gb| AE009947.2 | Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome
Length = 141182
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Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140
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Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200
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Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260
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Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242
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Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440
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Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620
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Sbjct: 119822 gcatgtacc 119814
>gb| AY928077.1 | Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome
Length = 140454
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%)
Strand = Plus / Minus
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>dbj| AP006714.1 | Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome
Length = 141182
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 681 acatgtacc 689
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Sbjct: 58195 gcatgtacc 58187
>emb| AJ746171.1 | Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1339
Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0
Identities = 600/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125
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Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279
Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185
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Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219
Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245
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Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099
Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365
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Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039
Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425
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Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605
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Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665
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