Clone Name | rbasd11n24 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 686/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 686/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 686/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 685/691 (99%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 683/690 (98%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 1411 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkags 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1302 bits (657), Expect = 0.0 Identities = 684/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagga 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 683/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnn 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0 Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0 Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0 Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0 Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0 Identities = 682/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 681/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 681/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 681/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 681/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 680/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 aaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1480 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1421 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1420 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1361 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1301 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1241 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1181 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1121 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1061 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1002 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 942 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 882 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 881 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 822 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 821 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 791
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 56330 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 56271 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 56270 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 56211 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56210 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 56151 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56150 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 56091 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56090 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 56031 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56030 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55971 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55970 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55911 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55910 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55852 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55851 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 55792 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55791 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 55732 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 55731 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 55672 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55671 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 55641
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 679/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1516 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1457 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1456 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1397 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1337 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1277 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1217 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1157 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1097 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1038 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 978 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 918 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 917 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 858 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 857 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 827
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttaga 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaanac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 ngctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 aaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 678/691 (98%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 agctctnttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 732
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 822 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 780 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 720 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct: 719 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggt 660 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 659 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 600 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 599 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 569
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 780 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 720 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct: 719 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggt 660 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 659 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 600 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 599 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 569
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 936 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 935 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 876 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 875 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 845
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1388 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1329 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1269 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1209 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1149 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1089 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1029 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 969 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 910 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 850 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 790 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 730 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 729 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 699
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 677/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1271 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 971 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 912 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 852 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 851 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 792 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 aaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 732 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 731 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 701
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 936 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 935 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 876 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 875 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 845
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1052 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 992 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 932 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 931 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 872 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 871 agctctnttaatcatttcttcacatgtaccc 841
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1271 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 971 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 912 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 852 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 851 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 792 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 732 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct: 731 agctctcttcatcatttcttcacatgtaccc 701
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctnttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1278 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 978 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 919 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 859 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 gtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 799 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 798 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 739 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 738 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 708
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1278 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 978 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 919 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 859 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 gtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 799 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 798 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 739 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 738 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 708
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 676/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 936 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 935 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 876 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 875 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 845
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 732
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 675/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 732
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1056 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 996 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 936 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 935 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 876 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 875 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 845
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 780 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 720 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct: 719 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggt 660 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 659 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 600 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 599 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 569
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 674/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctg 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 991 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 931 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 871 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 870 gaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatac 811 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 810 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 780
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 671/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1111 ttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagc 1053 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 873 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 872 agctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 842
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 672/691 (97%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaagcatttcttcacatgtaccc 732
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 664/680 (97%), Gaps = 2/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattnctt 679 |||||||||||||||| ||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttctt 743
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 671/690 (97%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1472 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1413 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1353 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1293 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1292 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1233 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1173 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1113 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1053 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 994 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 993 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacg 934 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 933 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 874 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 814 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 813 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 784
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 621/625 (99%), Gaps = 1/625 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 620/625 (99%), Gaps = 1/625 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 791 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 731 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 730 cttaatcatttcttcacatgtaccc 706
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 627/635 (98%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 676
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 627/635 (98%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 676
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 669/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1381 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1322 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1321 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1262 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggt 1202 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1201 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacca 1142 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1082 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 acacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1022 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 962 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 903 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 843 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 783 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 723 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 722 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 693
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 669/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 669/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagc 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 669/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1519 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1460 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1459 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1400 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1340 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1339 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1280 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1220 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1160 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1159 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagc 1100 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1041 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 981 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 980 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 921 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 861 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 860 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 831
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 668/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1401 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1342 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggt 1222 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1221 gcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1162 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1102 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1042 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 863 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 803 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 802 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 743 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 742 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 657/676 (97%), Gaps = 2/676 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 aactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttg 74 |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 75 caagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 134 |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 135 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 194 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 195 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 255 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 315 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 374 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 375 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 434 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 435 cccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 494 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 -ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 918 Query: 495 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 858 Query: 555 taagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaa 614 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 857 taagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaa 798 Query: 615 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| Sbjct: 797 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctcttcatcat 738 Query: 675 tncttcacatgtaccc 690 | |||||||||||||| Sbjct: 737 ttcttcacatgtaccc 722
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 667/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 625/637 (98%), Gaps = 1/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 622/634 (98%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatca 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 417 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 537 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 596 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 597 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 656 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 657 tacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0 Identities = 623/635 (98%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 712
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0 Identities = 664/689 (96%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 925 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 924 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 865 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 864 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggta 805 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaataca 745 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 716
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 665/690 (96%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 615/625 (98%), Gaps = 1/625 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 665/689 (96%), Gaps = 4/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caa 124399 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124280 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124279 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124220 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124219 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124160 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124159 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124100 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 124099 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 124071 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 665/689 (96%), Gaps = 4/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caa 29872 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29692 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29633 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29632 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 29573 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 29572 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 29544
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 620/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 731
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 619/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 697
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 619/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 697
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 619/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatgtcttcgcatgtacc 703
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 612/625 (97%), Gaps = 1/625 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54992 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54991 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54932 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54931 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54872 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54871 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54812 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 54811 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 54783
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 125333 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125332 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 125273 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 125272 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 125213 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 125212 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 125153 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 125152 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 125124 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 30273 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30272 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 30213 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30212 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 30153 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30152 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 30093 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 30092 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 30064
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 733
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 33527628 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527629 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 33527688 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 33527689 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 33527748 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527749 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 33527808 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 33527809 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 33527837 Score = 210 bits (106), Expect = 5e-51 Identities = 120/125 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 565 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 624 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 625 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacat 684 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcat 39115353 Query: 685 gtacc 689 ||||| Sbjct: 39115352 gtacc 39115348
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 72825 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72826 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 72885 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 72886 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 72945 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 72946 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 73005 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 73006 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 73034
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54971 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54970 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54911 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54910 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54851 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54850 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54791 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 54790 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 54762
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 632/652 (96%), Gaps = 1/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncatt 97 ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 98 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 157 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 158 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 217 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 218 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 277 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 278 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 337 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 338 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 398 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccc 457 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccc 945 Query: 458 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885 Query: 518 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 577 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 884 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 825 Query: 578 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 637 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765 Query: 638 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 ctcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 620/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 1349 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1290 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1230 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1170 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1110 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1050 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccct 990 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 931 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 871 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 870 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 811 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 751 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 750 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 715
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 620/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 714
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 598/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 624 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcaca 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 684 tgtaccc 690 ||||||| Sbjct: 700 tgtaccc 694
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 598/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 624 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcaca 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 684 tgtaccc 690 ||||||| Sbjct: 700 tgtaccc 694
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 613/628 (97%), Gaps = 1/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 122 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 181 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 182 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 241 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 242 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 362 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 422 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 542 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 601 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 602 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 661 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 662 ctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 ctctcttaatcatttcttcacatgtacc 721
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 618/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctcttttaatcatttcttcacatgtacc 714
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 661/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| Sbjct: 1408 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1349 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1348 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1289 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1288 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1229 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1228 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1169 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1168 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1109 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1049 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 989 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 930 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 929 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 870 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 810 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 809 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 750 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 749 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 720
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 661/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| Sbjct: 1406 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1347 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1346 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1287 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1286 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1227 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1226 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1167 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1166 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1107 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1047 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 987 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 928 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 927 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 868 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 808 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 807 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 748 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 747 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 718
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 661/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| Sbjct: 1420 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1361 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1360 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1301 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1300 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1241 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1240 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1181 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1180 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1121 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1061 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1001 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 942 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 941 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 882 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 822 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 821 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 762 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 761 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 732
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 761 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 733
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 611/625 (97%), Gaps = 1/625 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtaccc 720
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54864 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 54863 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 54835
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54864 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 54863 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 54835
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 481 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>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124240 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124239 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124180 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 124179 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 124151 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| 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cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 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>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55036 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55035 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54976 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54975 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54916 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54915 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54856 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 54855 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 54827
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 761 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 733
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 926 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 806 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 805 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 746 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||| ||||| |||| |||||||| Sbjct: 745 gctctcttcatcatatcttcgcatgtacc 717
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 53246 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53245 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 53186 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 53185 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 53126 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 53125 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 53066 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 53065 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 53037
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 128179 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 128118 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 128059 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 128058 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 127999 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 127998 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 127970
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10346793 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10346734 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10346733 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 10346674 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 10346673 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 10346645
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 936 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 877 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 876 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 817 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 816 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 788
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 740 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 739 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 680 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 679 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 620 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 619 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 560 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 559 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 531
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10352893 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352892 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10352833 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10352832 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10352773 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10352772 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 10352713 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 10352712 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 10352684
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1329 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1269 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 1209 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1208 aatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1149 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 1148 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 1120
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 660/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1301 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 1242 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1241 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1182 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 1181 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 1153 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 31/33 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 610/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 747 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 746 cttaatcatttcttcacatgtacc 723
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 619/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 753 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 718
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 659/688 (95%), Gaps = 2/688 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1336 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagt 1277 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1157 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1097 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1037 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 acaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 977 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 858 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 798 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 738 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 737 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatac 678 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgta 687 |||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct: 677 agctctcttaatcatttcttcgcatgta 650
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 617/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 697
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 660/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 762 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 733
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 614/630 (97%), Gaps = 1/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 733
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 653/681 (95%), Gaps = 2/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttc 680 ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 762 agctctcttcatcatttcttc 742
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 618/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 630/652 (96%), Gaps = 1/652 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncatt 97 ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 98 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 157 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 158 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 217 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 218 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 277 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 278 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 337 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 338 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 398 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccc 457 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccc 945 Query: 458 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885 Query: 518 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 577 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 884 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 825 Query: 578 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 637 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765 Query: 638 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 cccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 660/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 915 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 914 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 855 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 854 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 795 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 794 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 735 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||| |||||| |||| ||||||||| Sbjct: 734 agctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 704
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 620/639 (97%), Gaps = 1/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagca 110 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 111 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 170 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 171 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 230 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 231 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 290 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 291 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 351 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 410 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 411 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 470 ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 471 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 531 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 590 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 591 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 650 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 651 cgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 733
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 660/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||| |||||| |||| ||||||||| Sbjct: 762 agctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 732
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 610/626 (97%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 gactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 123 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 124 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 184 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 244 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 304 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 364 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 424 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 483 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 484 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 543 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 544 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 603 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 604 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 663 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 664 ctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 728 ctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 658/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614084 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614083 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614024 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614023 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613964 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613963 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 5613904 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 5613903 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 5613875 Score = 646 bits (326), Expect = 0.0 Identities = 372/385 (96%), Gaps = 2/385 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 425 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 485 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 544 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866 Query: 545 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 604 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13436865 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13436806 Query: 605 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 664 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13436805 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13436746 Query: 665 tcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 13436745 tcttaatcatttcttcgcatgtacc 13436721 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 584 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 585 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 89.7 bits (45), Expect = 1e-14 Identities = 53/56 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 659/689 (95%), Gaps = 3/689 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 23204112 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 23204171 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 23204172 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 23204231 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 23204232 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 23204260 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 61/63 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 113 atc 115 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 61/63 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 113 atc 115 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 659/689 (95%), Gaps = 3/689 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 154699 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154700 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 154759 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 154760 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 154819 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 154820 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 154879 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 154880 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 154908
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 659/689 (95%), Gaps = 3/689 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38813 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38814 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38873 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38874 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38933 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 38993 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 38994 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 39022
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 658/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614073 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614072 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614013 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614012 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613953 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613952 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 5613893 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 5613892 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 5613864 Score = 646 bits (326), Expect = 0.0 Identities = 372/385 (96%), Gaps = 2/385 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 425 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 485 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 544 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391199 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13391140 Query: 545 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 604 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13391139 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13391080 Query: 605 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 664 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13391079 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13391020 Query: 665 tcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 13391019 tcttaatcatttcttcgcatgtacc 13390995 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 584 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 585 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 89.7 bits (45), Expect = 1e-14 Identities = 53/56 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 658/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 421 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861 Query: 541 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 600 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38862 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38921 Query: 601 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 660 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38922 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 38981 Query: 661 gctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||| ||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 38982 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacc 39010
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 608/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 613/631 (97%), Gaps = 1/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 419 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 539 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 598 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 599 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 658 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 659 cagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 694
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 613/631 (97%), Gaps = 1/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 419 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 539 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 598 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 599 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 658 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 659 cagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 694
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 605/620 (97%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 656 atacagctctcttaatcatt 675 |||||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatt 717
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 615/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 713
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 612/630 (97%), Gaps = 1/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 752 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 751 agctctcttaatcatttcttcacatgtacc 722
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 608/626 (97%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 122 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 181 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 182 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 241 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 242 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 362 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 422 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 542 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 601 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 602 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 661 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 662 ctctcttaatcattncttcacatgta 687 |||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 748 ctcttttaatcatttcttcacatgta 723
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 614/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 750 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 717
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 657/690 (95%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1332 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1331 tcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1272 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 ccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1212 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1211 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1152 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1151 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1092 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1091 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttca 1032 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 972 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 913 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 912 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 853 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 852 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 793 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 792 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 733 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 732 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 614/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcacatgtacc 703
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 606/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 ||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 606/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 ||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacc 721
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 606/624 (97%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 815 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 755 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 754 cttaatcatttcttcacatgtacc 731
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 655/688 (95%), Gaps = 2/688 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 atataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggt 823 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgta 687 |||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgta 735
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 620/643 (96%), Gaps = 1/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 actgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 702
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 592/606 (97%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 623 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 624 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcaca 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 684 tgtacc 689 |||||| Sbjct: 697 tgtacc 692
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 613/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgta 687 |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| Sbjct: 755 aaatacggctcttttaatcatttcttcgcatgta 722
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 592/606 (97%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 564 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 623 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 624 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcaca 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 684 tgtacc 689 |||||| Sbjct: 697 tgtacc 692
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 641/670 (95%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 786 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatcttc 727 Query: 681 acatgtaccc 690 ||||||||| Sbjct: 726 gcatgtaccc 717
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 619/642 (96%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgtacc 703
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 605/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 605/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 618/642 (96%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 703
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 655/690 (94%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 858 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 798 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 797 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggt 738 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | Sbjct: 737 gaatcctccagttaaatagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatgc 678 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 677 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 648
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 618/642 (96%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 612/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcgcatgtacc 703
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 596/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 970 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 616 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 617 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattn 676 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 730 Query: 677 cttcacatgtacc 689 ||||||||||||| Sbjct: 729 cttcacatgtacc 717
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 616/640 (96%), Gaps = 1/640 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1253 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1194 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1193 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagct 1134 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1133 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacn 1074 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1073 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1014 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 gcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 954 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 cgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 894 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 893 tccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 714 agtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 655 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgta 687 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct: 654 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta 615
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 604/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctct 745 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacc 721
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 604/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 726 cttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 612/635 (96%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| Sbjct: 747 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtaccc 713
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 601/621 (96%), Gaps = 1/621 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 catttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 429 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 488 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 489 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 549 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 608 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 609 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 668 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctt 734 Query: 669 aatcattncttcacatgtacc 689 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 733 aatcatttcttcacatgtacc 713
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 614/636 (96%), Gaps = 2/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 656 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 786 atgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 645/678 (95%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccat 71 |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 72 ttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131 |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 431 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 432 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 491 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 492 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 551 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 552 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 611 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 612 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751 Query: 672 cattncttcacatgtacc 689 |||| |||| |||||||| Sbjct: 750 catttcttcgcatgtacc 733
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 595/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 616 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 617 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattn 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 677 cttcacatgtacc 689 ||||||||||||| Sbjct: 688 cttcacatgtacc 676
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 595/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 557 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 616 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 617 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattn 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 677 cttcacatgtacc 689 ||||||||||||| Sbjct: 688 cttcacatgtacc 676
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 622/649 (95%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattacc 100 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 101 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 160 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 161 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 220 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 221 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 280 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 281 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 340 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 341 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1021 Query: 401 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 461 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 520 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 521 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 581 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 640 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 641 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttgttcgcatgtacc 733
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 613/637 (96%), Gaps = 1/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaaga 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 414 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 594 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 653 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 654 aaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtaccc 702
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 547/549 (99%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 142 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 202 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 262 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 322 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 382 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggag 441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggag 1876 Query: 442 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1875 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1816 Query: 502 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1815 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 1756 Query: 562 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1755 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 1696 Query: 622 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttca 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1695 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 1636 Query: 682 catgtaccc 690 ||||||||| Sbjct: 1635 catgtaccc 1627
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 631/660 (95%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 969 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 849 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 848 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 789 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 788 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttc 729
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 617/643 (95%), Gaps = 1/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 actgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtaccc 702
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 610/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 616/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 644/678 (94%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccat 71 |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 72 ttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131 |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 431 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 432 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 491 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 492 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 551 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 552 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 611 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 612 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751 Query: 672 cattncttcacatgtacc 689 |||| |||| |||||||| Sbjct: 750 catttcttcgcatgtacc 733
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 582/597 (97%), Gaps = 1/597 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 cattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaag 153 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1274 cattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaag 1215 Query: 154 ccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccac 213 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1214 ccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccac 1155 Query: 214 caaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacat 273 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 caaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacat 1095 Query: 274 gaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaa 333 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 gaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaa 1035 Query: 334 agataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaaccta 393 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 agataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaaccta 975 Query: 394 aagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatct 453 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 974 aagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatct 916 Query: 454 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 856 Query: 514 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaa 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 855 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaa 796 Query: 574 tagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaata 633 || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 taatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaata 736 Query: 634 ggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct: 735 ggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttcttcacatgtaccc 679
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 606/630 (96%), Gaps = 1/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 743 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 742 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 713
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 615/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 615/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 1/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 595 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 596 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 655 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 656 atacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 615/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 tctcgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 620/649 (95%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattacc 100 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 101 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 160 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 161 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 220 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 221 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 280 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 281 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 340 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 341 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1005 Query: 401 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccag 946 Query: 461 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 520 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 886 Query: 521 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 885 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 826 Query: 581 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 640 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 825 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagccc 766 Query: 641 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 765 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 717
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 608/633 (96%), Gaps = 1/633 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatca 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 417 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 537 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 596 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 597 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 656 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 657 tacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 || ||||||||| ||||| |||| |||||||| Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatatcttcgcatgtacc 733
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 607/632 (96%), Gaps = 1/632 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcac 117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 418 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 477 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 478 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 537 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 538 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 597 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 598 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 657 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 708 Query: 658 acagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 | ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 707 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 676
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 615/643 (95%), Gaps = 1/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1223 actgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtaccc 690 |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtaccc 702
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 651/690 (94%), Gaps = 2/690 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagt 59 ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 420 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 1380 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1379 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1320 Query: 540 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 599 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1319 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggt 1260 Query: 600 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 659 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1259 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatat 1200 Query: 660 agctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 1199 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 1170
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaa 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaa 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 ccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacc 703
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 614/642 (95%), Gaps = 1/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1343 gctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 actgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaa 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 467 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 468 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 527 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 528 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 587 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805 Query: 588 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 647 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 745 Query: 648 tctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtacc 689 || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 744 ccttgcaaatccagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 703
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 982 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 922 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 862 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 861 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 802 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 801 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 742 Query: 681 acatgtacc 689 |||||||| Sbjct: 741 gcatgtacc 733
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57855 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57854 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57795 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57794 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 57735 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 57734 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 57675 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57674 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 57615 Query: 681 acatgtacc 689 |||||||| Sbjct: 57614 gcatgtacc 57606
>emb|AJ746280.1| Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1316 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 586/605 (96%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 ggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaag 144 |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1316 ggataatttccttaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacagg 1257 Query: 145 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaag 204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1256 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgccctaaag 1197 Query: 205 ttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatat 264 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 ttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatat 1137 Query: 265 gccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 324 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1136 gccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggcatggatgcccagtcct 1077 Query: 325 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 1017 Query: 385 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtgg 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtgg 958 Query: 445 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 898 Query: 505 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 564 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 897 tttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838 Query: 565 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 624 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 837 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 778 Query: 625 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacat 684 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 777 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 718 Query: 685 gtacc 689 ||||| Sbjct: 717 gtacc 713
>emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1301 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 583/601 (97%), Gaps = 1/601 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 89 aattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 148 |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1301 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1242 Query: 149 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1182 Query: 209 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 268 ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 cccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1122 Query: 269 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1121 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcttgagt 1062 Query: 329 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1002 Query: 389 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1001 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtgaatat 943 Query: 449 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 883 Query: 509 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 882 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 823 Query: 569 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 628 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 822 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 763 Query: 629 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttcacatgtac 688 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 762 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 703 Query: 689 c 689 | Sbjct: 702 c 702
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 120063 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120062 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 120003 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120002 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 119943 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 119942 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 119883 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680 ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 119882 atgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 119823 Query: 681 acatgtacc 689 |||||||| Sbjct: 119822 gcatgtacc 119814
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57865 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57864 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57805 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57804 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 57745 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 57744 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 57685 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57684 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 57625 Query: 681 acatgtacc 689 |||||||| Sbjct: 57624 gcatgtacc 57616
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 635/669 (94%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaggctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 81 gctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 58436 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58435 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 58376 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58375 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 58316 Query: 561 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 58315 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 58256 Query: 621 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattncttc 680 ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58255 atgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 58196 Query: 681 acatgtacc 689 |||||||| Sbjct: 58195 gcatgtacc 58187
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 600/624 (96%), Gaps = 1/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 426 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 920 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 919 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 860 Query: 546 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 605 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 859 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatcc 800 Query: 606 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 665 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 799 cccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctct 740 Query: 666 cttaatcattncttcacatgtacc 689 |||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 739 cttaatcatttcttcgcatgtacc 716 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,931,323 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4931323 Number of successful extensions: 142088 Number of sequences better than 10.0: 15145 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15077 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 80 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 97177 Number of HSP's gapped (non-prelim): 23896 length of query: 690 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 667 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11434579568568 effective search space used: 11434579568568 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)