Clone Name | rbasd11d03 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 672/673 (99%), Gaps = 1/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 69 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 70 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 130 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 190 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 250 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 310 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 370 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 430 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 489 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1070 Query: 490 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 1010 Query: 550 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 950 Query: 610 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 890 Query: 670 aattctctcgcaa 682 ||||||||||||| Sbjct: 889 aattctctcgcaa 877
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 672/673 (99%), Gaps = 1/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 69 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 70 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 130 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 190 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 250 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 310 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 370 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 430 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 489 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1070 Query: 490 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 1010 Query: 550 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 950 Query: 610 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 890 Query: 670 aattctctcgcaa 682 ||||||||||||| Sbjct: 889 aattctctcgcaa 877
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 672/673 (99%), Gaps = 1/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 69 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1427 Query: 70 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1367 Query: 130 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1307 Query: 190 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1247 Query: 250 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1187 Query: 310 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1127 Query: 370 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1067 Query: 430 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 489 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1008 Query: 490 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 948 Query: 550 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 888 Query: 610 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 828 Query: 670 aattctctcgcaa 682 ||||||||||||| Sbjct: 827 aattctctcgcaa 815
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1306 bits (659), Expect = 0.0 Identities = 669/671 (99%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 888 Query: 672 ttctctcgcaa 682 ||||||||||| Sbjct: 887 ttctctcgcaa 877
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 661/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 888 Query: 672 ttctctcgcaa 682 ||||||||||| Sbjct: 887 ttctctcgcaa 877
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 660/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatantatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 659/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 658/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 657/663 (99%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 656/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 879 caa 877
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 665/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 665/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 665/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 665/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 accttcttatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 826 Query: 672 ttctctcgcaa 682 ||||||||||| Sbjct: 825 ttctctcgcaa 815
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 663/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 664/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 664/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 664/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 663/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1426 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1366 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1306 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1246 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1186 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1126 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1066 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagaca 1007 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 947 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 946 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagcca 887 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 886 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 827 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 826 attctctcgcaa 815
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 826 Query: 672 ttctctcgcaa 682 |||||| |||| Sbjct: 825 ttctcttgcaa 815
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 652/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 658/666 (98%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 tatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 821 Query: 677 tcgcaa 682 |||||| Sbjct: 820 tcgcaa 815
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 655/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctyg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 672 ttctctcgcaa 682 |||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaa 876
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 672 ttctctcgcaa 682 |||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaa 876
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 672 ttctctcgcaa 682 |||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaa 876
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 652/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 652/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 652/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 657/666 (98%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1431 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1371 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1311 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1251 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1191 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1131 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1071 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1012 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 952 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 951 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 892 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 832 Query: 677 tcgcaa 682 | |||| Sbjct: 831 ttgcaa 826
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 657/666 (98%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56340 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 56281 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56280 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 56221 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56220 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 56161 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56160 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 56101 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56100 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 56041 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56040 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 55981 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55980 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 55921 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55920 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 55862 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55861 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 55802 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55801 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 55742 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55741 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 55682 Query: 677 tcgcaa 682 | |||| Sbjct: 55681 ttgcaa 55676
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 654/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 657/666 (98%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1467 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1407 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1347 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1287 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1227 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1167 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1107 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1048 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 988 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 987 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 928 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 868 Query: 677 tcgcaa 682 | |||| Sbjct: 867 ttgcaa 862
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 651/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggct 1365 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1305 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1185 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 656/665 (98%), Gaps = 1/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 77 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1480 Query: 78 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1420 Query: 138 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 197 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 agatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1360 Query: 198 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 257 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1300 Query: 258 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1240 Query: 318 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1180 Query: 378 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1120 Query: 438 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 497 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 ccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1061 Query: 498 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 1001 Query: 558 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 617 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1000 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 941 Query: 618 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 881 Query: 678 cgcaa 682 |||| Sbjct: 880 tgcaa 876
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 655/666 (98%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 tatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 821 Query: 677 tcgcaa 682 |||||| Sbjct: 820 tcgcaa 815
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 654/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 672 ttctctcgcaa 682 |||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaa 876
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 654/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1059 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 999 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 998 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 939 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 938 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 879 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 878 caa 876
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 654/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1336 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 917 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 857 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 856 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 797 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 737 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 736 caa 734
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 650/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 654/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 653/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 826 Query: 672 ttctctcgcaa 682 |||||| |||| Sbjct: 825 ttctcttgcaa 815
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 651/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 654/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 656/666 (98%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 821 Query: 677 tcgcaa 682 | |||| Sbjct: 820 ttgcaa 815
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 658/671 (98%), Gaps = 1/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 71 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttyg 1126 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 672 ttctctcgcaa 682 |||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaa 876
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 654/665 (98%), Gaps = 1/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 77 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1419 Query: 78 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1359 Query: 138 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 197 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 agatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1299 Query: 198 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 257 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1239 Query: 258 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1179 Query: 318 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1178 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacga 1119 Query: 378 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1059 Query: 438 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 497 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 498 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 558 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 617 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 618 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 820 Query: 678 cgcaa 682 ||||| Sbjct: 819 cgcaa 815
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 653/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1338 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 919 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 859 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 858 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 799 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 739 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 738 caa 736
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 661/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 671 attctctcgcaa 682 ||||||| |||| Sbjct: 891 attctcttgcaa 880
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 650/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 653/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 653/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 652/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 652/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 655/666 (98%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1209 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1149 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1089 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1029 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 969 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 909 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 849 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 790 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 730 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 729 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtag 670 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 669 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 610 Query: 677 tcgcaa 682 | |||| Sbjct: 609 ttgcaa 604
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 660/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 671 attctctcgcaa 682 ||||||| |||| Sbjct: 891 attctcttgcaa 880
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 660/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 935 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 755 Query: 671 attctctcgcaa 682 ||||||| |||| Sbjct: 754 attctcttgcaa 743
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 659/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 | |||||||||| Sbjct: 888 actctctcgcaa 877
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 660/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 935 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 755 Query: 671 attctctcgcaa 682 ||||||| |||| Sbjct: 754 attctcttgcaa 743
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 652/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 783 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 722 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgc 663 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 604
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 657/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 649/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1334 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1274 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1214 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1154 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1094 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1034 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 974 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 915 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 855 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 854 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 795 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 ggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 736
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 652/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctag 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 659/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataa 1012 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 671 attctctcgcaa 682 ||||||| |||| Sbjct: 891 attctcttgcaa 880
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 653/665 (98%), Gaps = 1/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 77 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1371 Query: 78 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1311 Query: 138 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 197 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 198 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 257 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 258 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 317 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 318 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 377 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 378 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 438 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 497 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 498 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 892 Query: 558 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 617 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 832 Query: 618 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 677 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 678 cgcaa 682 |||| Sbjct: 771 agcaa 767
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 651/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 658/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 671 attctctcgcaa 682 ||||||| |||| Sbjct: 891 attctcttgcaa 880
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 647/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaa 815
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 649/663 (97%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 650/663 (98%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctag 818 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 817 caa 815
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 646/659 (98%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacca 1082 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 783 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 722 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgc 663 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 604
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 654/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 70 |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 250 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 251 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 310 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 311 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 371 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 431 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 490 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 491 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 550 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 551 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 611 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 671 attctctcgcaa 682 |||||||||||| Sbjct: 888 attctctcgcaa 877
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 651/666 (97%), Gaps = 1/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1482 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1423 Query: 77 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 136 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 cgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagc 1363 Query: 137 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 196 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1303 Query: 197 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 256 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgga 1243 Query: 257 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 316 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 atcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1183 Query: 317 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1123 Query: 377 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1063 Query: 437 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 496 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1004 Query: 497 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1003 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcat 944 Query: 557 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 616 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 943 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactag 884 Query: 617 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 676 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 tatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 824 Query: 677 tcgcaa 682 |||||| Sbjct: 823 tcgcaa 818
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 646/663 (97%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1388 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1329 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1328 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 910 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 850 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 849 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 790 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 730 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 729 caa 727
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 646/663 (97%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 629/641 (98%), Gaps = 1/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 102 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 161 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 162 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 221 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 222 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 282 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 342 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 401 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 402 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 461 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 462 cccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 521 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 -ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 918 Query: 522 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 858 Query: 582 taagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaa 641 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 857 taagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaa 798 Query: 642 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 757
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 642/659 (97%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1365 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1185 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 agcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 826 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 642/659 (97%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1522 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1463 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1462 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1403 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1343 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1283 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1223 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1163 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1103 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 agcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 1044 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 984 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 983 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 924 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 865
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 641/659 (97%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1404 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggct 1345 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1285 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacca 1225 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1165 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttct 985 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 643/663 (96%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 588/590 (99%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 644/665 (96%), Gaps = 1/665 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 77 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagcc 1371 Query: 78 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 137 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 138 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 198 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 257 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 258 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 317 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 318 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcga 1071 Query: 378 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcc 1011 Query: 438 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 497 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 498 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 892 Query: 558 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 617 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 618 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 677 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 678 cgcaa 682 |||| Sbjct: 771 tgcaa 767
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 587/590 (99%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 791 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 741
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 635/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 925 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 924 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 865 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 864 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggta 805 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 804 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaa 750
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 594/600 (99%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 594/600 (99%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 637/659 (96%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 637/659 (96%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1352 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1292 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1291 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1232 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1231 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1172 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1171 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1112 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1052 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 992 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 933 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 873 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 872 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 813 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 812 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 754
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 634/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 926 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 806 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 805 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 751
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 637/659 (96%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1350 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1290 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1289 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1230 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1229 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1170 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1169 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1110 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1050 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 990 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 931 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 871 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 811 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 810 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 752
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 637/659 (96%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1364 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1304 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1303 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1244 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1243 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1184 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1183 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1124 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1064 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1004 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 945 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 885 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 825 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 824 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 766
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 636/655 (97%), Gaps = 3/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124280 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124279 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124220 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124219 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124160 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124159 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 124105 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 636/655 (97%), Gaps = 3/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29692 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29633 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29632 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 29578
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 633/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54992 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54991 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54932 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54931 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54872 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54871 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 54817
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 633/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 125333 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125332 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 125273 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 125272 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 125213 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 125212 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 125158 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 633/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 30273 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30272 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 30213 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30212 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 30153 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 30152 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 30098
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 636/659 (96%), Gaps = 1/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 83 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 639/663 (96%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 atcgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgc 1284 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1283 ggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 865 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 805 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 804 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 745 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 744 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 685 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 684 caa 682
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 633/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 33527628 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527629 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 33527688 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 33527689 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 33527748 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 33527749 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 33527803 Score = 157 bits (79), Expect = 6e-35 Identities = 88/91 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 592 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 651 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 652 attacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaa 39115382
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 633/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 72825 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72826 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 72885 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 72886 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 72945 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 72946 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 73000
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 633/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54971 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54970 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54911 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54910 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54851 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54850 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 54796
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 54869
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 54869
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124240 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124239 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 124185 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 88 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>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124240 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124239 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 124185 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 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aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29658 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 29604
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55036 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55035 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54976 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54975 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54916 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54915 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 54861
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 821 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 821 aatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 638/663 (96%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 889 ttgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 53246 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53245 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 53186 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 53185 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 53126 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 53125 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 53071
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 128179 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 128118 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 128059 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 128058 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 128004
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10346793 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10346734 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10346733 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 10346679
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 936 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 877 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 822
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 740 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 739 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 680 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 679 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 620 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 619 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 565
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10352893 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352892 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10352833 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10352832 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10352773 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10352772 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 10352718
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1329 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1269 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 1209 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1208 aatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 1154
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 632/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1301 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 1242 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1241 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 1187 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 110 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 592/602 (98%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 141 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 200 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 201 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 260 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 261 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 321 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 381 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 441 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 500 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 501 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 561 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 620 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 621 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 680 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 681 aa 682 || Sbjct: 748 aa 747
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 589/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 590/600 (98%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 590/600 (98%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 607/623 (97%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 119 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 120 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 179 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 180 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 240 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 299 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 300 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 359 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 360 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 420 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatc 950 Query: 480 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 540 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 600 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 659 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 660 aggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||| |||||||||||||||| Sbjct: 769 aggaactcctaattctctcgcaa 747
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 786 atgcattacaataggagcccctaattctctcgcaa 752
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 582/590 (98%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 631/656 (96%), Gaps = 1/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 86 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 915 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 914 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 855 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 854 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 795 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 794 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 739
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 630/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614084 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614083 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614024 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614023 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613964 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5613963 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 5613909 Score = 593 bits (299), Expect = e-166 Identities = 340/351 (96%), Gaps = 2/351 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 332 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 392 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 452 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 511 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 512 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 571 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866 Query: 572 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 631 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13436865 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13436806 Query: 632 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436805 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 13436755 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 135 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 277 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 357 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 391 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 275 ggtcagagctggcatatgccaa 296 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 631/655 (96%), Gaps = 2/655 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 23204112 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 23204171 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 23204172 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 23204226 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 140 atc 142 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 140 atc 142 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 631/655 (96%), Gaps = 2/655 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 154699 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154700 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 154759 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 154760 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 154819 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 154820 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 154874
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 631/655 (96%), Gaps = 2/655 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38813 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38814 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38873 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38874 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38933 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 38988
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 630/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614073 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614072 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614013 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614012 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613953 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5613952 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 5613898 Score = 593 bits (299), Expect = e-166 Identities = 340/351 (96%), Gaps = 2/351 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 332 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 392 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 452 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 511 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 512 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 571 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391199 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13391140 Query: 572 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 631 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13391139 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13391080 Query: 632 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391079 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 13391029 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 135 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 277 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 357 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 391 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 275 ggtcagagctggcatatgccaa 296 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 630/655 (96%), Gaps = 1/655 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 28 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 87 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 88 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 148 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 207 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 208 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 267 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 268 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 328 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 388 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 448 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 507 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801 Query: 508 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861 Query: 568 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 627 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38862 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38921 Query: 628 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38922 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 38976
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 590/602 (98%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 141 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 200 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 201 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 260 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 261 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 321 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 381 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 441 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 500 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 501 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 561 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 620 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 621 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 680 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 681 aa 682 || Sbjct: 748 aa 747
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 588/600 (98%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 614/635 (96%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 786 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 752
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 635/663 (95%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 atcgatggtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgc 1339 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1338 ggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatc 1039 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 860 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 859 ttgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 800 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 799 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcg 740 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 739 caa 737
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 589/602 (97%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 141 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 200 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 201 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 260 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 261 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 321 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 380 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 381 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 441 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 500 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 501 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 561 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 620 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 621 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 680 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 681 aa 682 || Sbjct: 749 aa 748
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 587/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 587/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 587/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 595/611 (97%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 131 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 132 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 191 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 192 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 251 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 252 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 311 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 312 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 371 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 372 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 432 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 491 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 492 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 552 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 611 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 820 Query: 612 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 671 | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 actagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaa 760 Query: 672 ttctctcgcaa 682 ||||||||||| Sbjct: 759 ttctctcgcaa 749
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 604/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 119 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 120 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 179 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 180 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 240 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 299 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 300 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 360 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 420 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatc 950 Query: 480 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 540 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 600 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 659 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 660 aggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 769 aggaacccctaattctcttgcaa 747
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 634/663 (95%), Gaps = 1/663 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 79 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 80 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 139 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 140 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 199 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgc 1249 Query: 200 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 259 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 acctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 260 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 319 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 320 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 379 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatc 1069 Query: 380 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 439 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 440 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 499 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 500 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 559 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 cttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 560 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 619 |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| Sbjct: 889 ttgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtat 830 Query: 620 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 679 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcg 770 Query: 680 caa 682 ||| Sbjct: 769 caa 767
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 579/590 (98%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 581/594 (97%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 89 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 148 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 149 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 208 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 209 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 268 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 269 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 329 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 388 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 389 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 449 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 508 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 509 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 569 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 628 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 629 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 565/572 (98%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 170 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 171 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 230 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 231 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 290 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 291 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 351 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 411 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 471 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 531 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 591 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 651 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 729
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 565/572 (98%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 170 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 171 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 230 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 231 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 290 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 291 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 351 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 411 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 471 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 531 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 591 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 651 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 729
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 583/596 (97%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 586/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 612/635 (96%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 969 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 849 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 848 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 789 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 788 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 754
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 606/627 (96%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 115 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 116 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 175 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 176 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 235 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 236 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 295 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 296 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 355 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 356 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 416 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacat 974 Query: 476 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 536 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 595 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 596 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 655 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 656 caataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattccctcgcaa 767
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 578/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 755
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 578/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 757
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 587/602 (97%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 141 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 200 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 201 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 260 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 261 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 320 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 321 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 381 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 441 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 500 |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 501 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 561 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 620 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 621 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 680 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 681 aa 682 || Sbjct: 753 aa 752
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 585/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 621/648 (95%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 86 ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 858 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 798 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 797 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggt 738 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 674 |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 737 gaatcctccagttaaatagtcatgcattacaataggaacccctaattc 690
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 579/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 91 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 151 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 211 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 271 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 331 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 391 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 451 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 510 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 511 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 570 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 571 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 630 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 631 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 586/602 (97%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 141 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 200 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 201 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 260 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 261 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 320 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 321 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 380 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 381 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 441 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 500 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 501 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 561 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 620 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 621 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 680 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 681 aa 682 || Sbjct: 748 aa 747
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 586/602 (97%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 141 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 200 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 201 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 260 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 261 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 321 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 381 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 441 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 500 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 501 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 561 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 620 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 621 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 680 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 681 aa 682 || Sbjct: 755 aa 754
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 78 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 137 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 138 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 197 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 198 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 257 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 258 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 317 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 318 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 378 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 437 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 438 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 497 ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 498 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 558 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 617 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 618 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 677 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 678 cgcaa 682 ||||| Sbjct: 771 cgcaa 767
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 579/594 (97%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 89 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 148 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 149 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 208 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 209 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 268 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 269 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 328 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 329 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 388 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 389 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 449 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 508 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 509 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 569 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 628 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 629 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 576/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 576/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 576/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 581/597 (97%), Gaps = 1/597 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 145 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 146 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 205 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 206 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 265 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 266 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 325 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 326 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 386 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 445 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 446 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 505 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 506 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 566 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 625 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 626 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 728
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 581/597 (97%), Gaps = 1/597 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 145 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 146 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 205 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 206 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 265 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 266 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 325 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 326 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 386 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 445 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 446 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 505 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 506 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 566 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 625 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 626 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 728
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 590/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 583/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 580/596 (97%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 756
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 583/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 610/636 (95%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 98 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 99 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 158 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 159 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 218 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 219 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 279 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 338 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 339 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 399 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 458 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 459 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 518 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 519 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 578 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 579 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 638 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 639 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 775
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 603/627 (96%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 115 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 116 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 175 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 176 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 235 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 236 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 295 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 296 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 355 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 356 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 416 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatat 958 Query: 476 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 536 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 595 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 838 Query: 596 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 655 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 837 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 778 Query: 656 caataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 777 caataggagcccctaattccctcgcaa 751
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 589/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 582/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 624/656 (95%), Gaps = 1/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 86 ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 1380 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1379 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1320 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1319 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggt 1260 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1259 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 1204
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 582/600 (97%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 609/636 (95%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 98 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 99 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 158 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 159 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 218 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 219 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 279 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 338 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 339 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 399 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 458 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 459 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 518 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 519 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 578 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 579 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 638 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 639 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 775
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 574/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 815 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 588/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 716 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 tagtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 656 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 655 ccctcgcaa 647
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 588/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 588/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 560/572 (97%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 170 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 171 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 230 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 231 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 290 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 291 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 351 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 411 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 471 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 531 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 591 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 650 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 651 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 726
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 581/600 (96%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 623/656 (94%), Gaps = 1/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 86 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagc 1360 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1359 taatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1300 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| Sbjct: 1299 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagacaaactagtatttgcggt 1240 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1239 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 1184
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 560/572 (97%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 170 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 171 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 230 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 231 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 290 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 291 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 351 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 411 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 470 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 471 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 531 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 591 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 650 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 651 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaa 726
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 580/599 (96%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 144 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 204 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 264 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 324 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 383 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 384 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 444 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 503 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 504 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 563 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 564 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 624 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 601/627 (95%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 120063 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120062 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 120003 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120002 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 119943 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 119942 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 119883 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattc 674 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119882 atgcattacaataggaacccctaattc 119856
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 601/627 (95%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 58436 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58435 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 58376 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58375 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 58316 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 58315 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 58256 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattc 674 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58255 atgcattacaataggaacccctaattc 58229
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 573/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 573/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 755
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 573/590 (97%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 587/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 564/579 (97%), Gaps = 1/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 104 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 163 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 164 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 223 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 224 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 283 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 284 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 344 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 403 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 404 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 464 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 523 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 524 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 584 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 643 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 644 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 710
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 564/579 (97%), Gaps = 1/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 104 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 163 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 164 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 223 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 224 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 283 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 284 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 343 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 344 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 404 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 970 Query: 464 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 524 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 584 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 643 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 644 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 600/627 (95%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 982 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 922 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 862 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 861 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 802 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattc 674 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 atgcattacaataggaacccctaattc 775
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 600/627 (95%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57855 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57854 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57795 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57794 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 57735 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 57734 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 57675 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattc 674 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57674 atgcattacaataggaacccctaattc 57648
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 564/579 (97%), Gaps = 1/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 104 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 163 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 164 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 223 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 224 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 283 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 284 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 344 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 403 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 404 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 464 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 523 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 524 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 584 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 643 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 644 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 710
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 600/627 (95%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57865 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57864 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57805 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57804 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 57745 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 57744 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 57685 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattc 674 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57684 atgcattacaataggaacccctaattc 57658
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 572/590 (96%), Gaps = 1/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 153 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 212 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 213 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 273 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 332 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 333 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 392 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 393 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 453 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 512 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 513 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 573 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 632 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 633 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 755
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 581/602 (96%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 141 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 200 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 201 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 261 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 321 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 380 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 381 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 441 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 500 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 501 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 560 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 561 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 620 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 621 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 680 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 681 aa 682 || Sbjct: 738 aa 737
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 578/598 (96%), Gaps = 1/598 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 145 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 205 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 264 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 265 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 324 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 325 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 384 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 385 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 445 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 504 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 505 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 564 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 565 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 624 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 625 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 710
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 553/565 (97%), Gaps = 1/565 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 177 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 178 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 237 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 238 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 297 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 298 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 357 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 358 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 417 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 418 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatga 477 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatga 919 Query: 478 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 859 Query: 538 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 799 Query: 598 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 657 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattaca 739 Query: 658 ataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 ataggaacccctaattctctcgcaa 714
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 569/587 (96%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 155 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 156 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 215 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 216 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 276 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 336 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 396 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 456 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 515 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 516 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 576 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 635 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 636 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaa 747
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 586/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 586/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaag 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 ||||||||| Sbjct: 745 ctctcgcaa 737
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 586/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 576/596 (96%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 925 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 865 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 805 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 804 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 749
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 579/600 (96%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 579/600 (96%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 599/627 (95%), Gaps = 1/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 107 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 108 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 167 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 168 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 227 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 228 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 287 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 288 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 347 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 348 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 407 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 408 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 467 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 1371 Query: 468 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 527 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 1311 Query: 528 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 587 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1310 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 1251 Query: 588 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 647 |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 1250 gttgtcgcggcaataataagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtc 1191 Query: 648 atgcattacaataggaacccctaattc 674 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 atgcattacaataggaacccctaattc 1164
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 588/610 (96%), Gaps = 3/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 132 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 133 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 192 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 193 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 252 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 253 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 312 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 313 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 372 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 373 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 433 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 492 | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 493 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 553 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 612 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 613 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 672 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaat 747 Query: 673 tctctcgcaa 682 || ||||||| Sbjct: 746 tccctcgcaa 737
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 585/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 585/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 585/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 585/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 74 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 133 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 134 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 193 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 194 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 253 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 254 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 313 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 314 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 373 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 374 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 434 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 493 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 494 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 554 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 613 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 614 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 673 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 674 ctctcgcaa 682 | ||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaa 737
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 575/596 (96%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 146 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 147 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 206 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 207 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 266 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 267 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 327 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 387 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 447 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 506 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 507 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 567 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 626 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 627 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 747
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 578/600 (96%), Gaps = 1/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 143 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 202 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 203 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 262 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 263 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 322 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 323 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 382 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 383 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 443 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 502 ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 503 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 562 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 563 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 622 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 623 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cagtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737
>dbj|AB088833.1| Phyllostachys bambusoides chloroplast rbcL gene for RuBisCO large subunit, partial cds Length = 1356 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 589/613 (96%), Gaps = 3/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 71 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 130 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccntttgcaagctgctcggataatttnattaccttc 1294 Query: 131 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 190 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1293 acgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgatt 1234 Query: 191 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccacc-aaattgta 249 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 1233 agctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc-tccacccaaattgta 1175 Query: 250 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 309 |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1174 atacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccc 1115 Query: 310 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 369 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1055 Query: 370 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 995 Query: 430 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 489 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 994 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagac 936 Query: 490 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 549 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 atacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 876 Query: 550 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 609 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 875 actgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcc 816 Query: 610 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 669 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 815 aaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 756 Query: 670 aattctctcgcaa 682 ||||| ||||||| Sbjct: 755 aattccctcgcaa 743
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 513/514 (99%), Gaps = 1/514 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 169 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 229 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 289 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 349 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 409 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggag 468 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggag 1876 Query: 469 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1875 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1816 Query: 529 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1815 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 1756 Query: 589 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1755 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 1696 Query: 649 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1695 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 1662 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,909,803 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4909803 Number of successful extensions: 138450 Number of sequences better than 10.0: 15198 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15135 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 77 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 95492 Number of HSP's gapped (non-prelim): 23581 length of query: 682 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 659 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11297433186936 effective search space used: 11297433186936 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)