Clone Name | rbasd3p10 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 569/570 (99%), Gaps = 1/570 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 77 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 137 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 197 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 257 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 317 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 377 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 437 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1070 Query: 497 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 1010 Query: 557 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 569/570 (99%), Gaps = 1/570 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 77 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 137 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 197 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 257 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 317 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 377 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 437 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1070 Query: 497 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 1010 Query: 557 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 569/570 (99%), Gaps = 1/570 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1427 Query: 77 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1367 Query: 137 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1307 Query: 197 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1247 Query: 257 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1187 Query: 317 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1127 Query: 377 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1067 Query: 437 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 496 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1008 Query: 497 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 948 Query: 557 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 566/568 (99%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
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>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 558/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 563/568 (99%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 557/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 557/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 557/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 557/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 557/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 556/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 557/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 557/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 556/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatantatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 556/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 562/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 556/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 561/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 accttcttatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 558/563 (99%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1431 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1371 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1311 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1251 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1191 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1131 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1071 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1012 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 952 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 gcattgcacggtgaatgtgaaga 929
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 558/563 (99%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1209 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1149 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1089 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1029 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 969 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 909 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 849 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 790 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 730 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 729 gcattgcacggtgaatgtgaaga 707
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 558/563 (99%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 558/563 (99%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56340 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 56281 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56280 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 56221 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56220 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 56161 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56160 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 56101 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56100 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 56041 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56040 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 55981 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55980 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 55921 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55920 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 55862 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55861 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 55802 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55801 gcattgcacggtgaatgtgaaga 55779
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 558/563 (99%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1467 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1407 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1347 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1287 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1227 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1167 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1107 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1048 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 988 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 gcattgcacggtgaatgtgaaga 965
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 563/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 563/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 563/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 563/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 552/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 783 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 722 acggtgaatgtgaaga 707
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 561/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 555/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 561/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 561/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 551/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 554/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 552/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 551/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 552/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 555/560 (99%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 554/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 562/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 557/563 (98%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 562/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1426 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1366 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1306 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1246 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1186 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1126 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1066 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagaca 1007 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 947 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 553/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 556/562 (98%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1480 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1420 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 agatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1360 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1300 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1240 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1180 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1120 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 504 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 ccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1061 Query: 505 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 1001 Query: 565 cattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 cattgcacggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 562/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 562/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 562/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 551/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 555/563 (98%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 554/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 559/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 554/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1059 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 999 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 998 ttgcacggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 554/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1336 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 917 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 857 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ttgcacggtgaatgtgaaga 837
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 554/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 559/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 551/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 551/556 (99%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 554/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 555/562 (98%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1371 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1311 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 504 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 505 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 892 Query: 565 cattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaaga 870
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 550/556 (98%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 558/568 (98%), Gaps = 1/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttyg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 550/556 (98%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 561/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 935 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 846
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 561/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 561/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 935 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 846
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 553/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 553/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 552/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 552/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 553/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 560/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 553/562 (98%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1419 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1359 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 agatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1299 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1239 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1179 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1178 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacga 1119 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1059 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 504 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 505 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 565 cattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 552/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1338 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 919 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 859 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 858 ttgcacggtgaatgtgaaga 839
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 552/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 549/556 (98%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacca 1082 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 783 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 722 acggtgaatgtgaaga 707
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 549/556 (98%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1334 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1274 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1214 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1154 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1094 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1034 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 974 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 915 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 855 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 854 acggtgaatgtgaaga 839
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 559/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataa 1012 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 551/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||| |||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtcaatgtgaaga 870
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 548/556 (98%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 558/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 558/569 (98%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 983
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 553/563 (98%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1482 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1423 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 cgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagc 1363 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1303 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgga 1243 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 atcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1183 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1123 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1063 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 503 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1004 Query: 504 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1003 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcat 944 Query: 564 gcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gcattgcacggtgaatgtgaaga 921
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 550/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 549/560 (98%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 555/569 (97%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 550/562 (97%), Gaps = 1/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagcc 1371 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcga 1071 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcc 1011 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 504 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 505 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 892 Query: 565 cattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 548/560 (97%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 544/556 (97%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1404 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggct 1345 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1285 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacca 1225 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1165 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttct 985 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaaga 850
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 552/569 (97%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 497 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 498 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 557 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 558 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 980
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 547/560 (97%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1388 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1329 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1328 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 910 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 850 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 849 ttgcacggtgaatgtgaaga 830
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 544/556 (97%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 agcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaaga 870
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 544/556 (97%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1522 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1463 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1462 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1403 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1343 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1283 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1223 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1163 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1103 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 agcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 1044 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 984 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 983 acggtgaatgtgaaga 968
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 546/560 (97%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 538/552 (97%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 925 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 924 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 865 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 864 tgaatgtgaaga 853
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 528/538 (98%), Gaps = 1/538 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 109 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 168 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 169 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 228 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 229 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 289 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 349 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 409 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 468 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 469 cccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 528 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 -ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 918 Query: 529 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 860
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 538/552 (97%), Gaps = 3/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124280 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124279 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124220 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 124219 tgaatgtgaaga 124208 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 538/552 (97%), Gaps = 3/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 29692 tgaatgtgaaga 29681
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaaga 54972
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaaga 54972
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54992 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54991 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54932 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 54931 tgaatgtgaaga 54920
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 125333 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125332 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 125273 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 125272 tgaatgtgaaga 125261 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 30273 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30272 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 30213 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 30212 tgaatgtgaaga 30201
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaaga 124288 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaaga 29707
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaaga 124288 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaaga 29707
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55036 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55035 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54976 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 54975 tgaatgtgaaga 54964
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 538/556 (96%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 538/556 (96%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1352 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1292 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1291 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1232 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1231 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1172 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1171 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1112 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1052 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 992 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 933 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 873 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||| Sbjct: 872 ccggtgaatgtgaaga 857
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 926 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 865 tgaatgtgaaga 854
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 538/556 (96%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1350 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1290 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1289 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1230 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1229 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1170 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1169 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1110 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1050 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 990 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 931 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 871 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||| Sbjct: 870 ccggtgaatgtgaaga 855
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 541/560 (96%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgctcggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 538/556 (96%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1364 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1304 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1303 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1244 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1243 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1184 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1183 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1124 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1064 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1004 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 945 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 885 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||| Sbjct: 884 ccggtgaatgtgaaga 869
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 33527628 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527629 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 33527688 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 33527689 tgaatgtgaaga 33527700
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 72825 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72826 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 72885 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 72886 tgaatgtgaaga 72897
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 936 tgaatgtgaaga 925
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 740 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 739 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 680 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 679 tgaatgtgaaga 668
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54971 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54970 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54911 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 54910 tgaatgtgaaga 54899
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 535/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 1301 tgaatgtgaaga 1290 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 117 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 495/499 (99%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 448 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 507 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 508 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 568 tgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaaga 850
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 534/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaaga 870
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 510/520 (98%), Gaps = 1/520 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 126 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 127 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 186 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 187 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 246 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 247 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 306 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 307 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 366 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 367 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 427 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatc 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatc 950 Query: 487 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 547 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 540/560 (96%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 acctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 cttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgctcggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 537/556 (96%), Gaps = 1/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 519/532 (97%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 855
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 540/560 (96%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 atcgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgc 1284 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1283 ggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 865 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 805 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||| Sbjct: 804 ttgcacggtgaatgtgaaga 785
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 534/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 53246 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53245 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 53186 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 53185 tgaatgtgaaga 53174
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 534/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 128179 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 128118 tgaatgtgaaga 128107
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 534/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 10346793 tgaatgtgaaga 10346782
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 534/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10352893 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352892 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10352833 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 10352832 tgaatgtgaaga 10352821
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 534/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1329 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1269 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 1268 tgaatgtgaaga 1257
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 485/487 (99%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 454 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 513 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 915 Query: 514 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 573 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 914 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 855 Query: 574 gtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||| Sbjct: 854 gtgaatgtgaaga 842
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 492/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaaga 814
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 492/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaaga 814
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 492/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 491/496 (98%), Gaps = 1/496 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 533/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaaga 870
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 533/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614084 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614083 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614024 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 5614023 tgaatgtgaaga 5614012 Score = 428 bits (216), Expect = e-117 Identities = 242/248 (97%), Gaps = 2/248 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 339 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 399 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 459 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 518 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 519 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 578 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866 Query: 579 tgtgaaga 586 |||||||| Sbjct: 13436865 tgtgaaga 13436858 Score = 159 bits (80), Expect = 1e-35 Identities = 86/88 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaaga 13398009 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 142 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 284 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 313 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 364 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.51 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 282 ggtcagagctggcatatgccaa 303 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 533/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614073 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614072 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614013 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 5614012 tgaatgtgaaga 5614001 Score = 428 bits (216), Expect = e-117 Identities = 242/248 (97%), Gaps = 2/248 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 339 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 399 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 459 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 518 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 519 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 578 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391199 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13391140 Query: 579 tgtgaaga 586 |||||||| Sbjct: 13391139 tgtgaaga 13391132 Score = 159 bits (80), Expect = 1e-35 Identities = 86/88 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaaga 13352283 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 142 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 284 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 313 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 364 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.51 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 282 ggtcagagctggcatatgccaa 303 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 533/552 (96%), Gaps = 1/552 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 38862 tgaatgtgaaga 38873
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 484/487 (99%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 850 gtgaaga 844
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 454 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 513 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 858 Query: 514 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 573 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 798 Query: 574 gtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||| Sbjct: 797 gtgaatgtgaaga 785
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 533/552 (96%), Gaps = 2/552 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 23204112 tgaatgtgaaga 23204123 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 147 atc 149 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 147 atc 149 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 533/552 (96%), Gaps = 2/552 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 154699 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154700 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 154759 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 154760 tgaatgtgaaga 154771
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 533/552 (96%), Gaps = 2/552 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 455 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 514 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38813 Query: 515 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38814 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38873 Query: 575 tgaatgtgaaga 586 |||||||||||| Sbjct: 38874 tgaatgtgaaga 38885
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 492/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 448 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 507 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 508 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 568 tgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 490/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaaga 868
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 490/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 507/520 (97%), Gaps = 1/520 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 126 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 127 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 186 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 187 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 246 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 247 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 306 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 307 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 366 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 367 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 427 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatc 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatc 950 Query: 487 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 547 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 850
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 537/560 (95%), Gaps = 1/560 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 atcgatggtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgc 1339 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1338 ggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatc 1039 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 447 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 506 |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 507 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 860 Query: 567 ttgcacggtgaatgtgaaga 586 |||| ||||||||||||||| Sbjct: 859 ttgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 482/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 489/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaaga 834
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 489/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaaga 851
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 489/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaaga 834
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 522/541 (96%), Gaps = 1/541 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 105 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 106 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 165 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 166 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 225 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 226 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 286 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 345 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 346 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 406 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 465 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 466 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 525 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 526 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 585 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 586 a 586 | Sbjct: 870 a 870
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 497/508 (97%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 498 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 499 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 559 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 852
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 515/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 855
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 481/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 490/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 448 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 507 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 508 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 568 tgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaaga 851
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 530/553 (95%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 454 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 513 ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagc 1360 Query: 514 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 573 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1359 taatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1300 Query: 574 gtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||| Sbjct: 1299 gtgaatgtgaaga 1287
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 530/553 (95%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 454 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 513 ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 1380 Query: 514 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 573 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1379 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1320 Query: 574 gtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||| Sbjct: 1319 gtgaatgtgaaga 1307
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 488/497 (98%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaaga 840
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 521/541 (96%), Gaps = 1/541 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 105 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 106 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 165 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 166 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 225 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 226 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 286 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 345 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 346 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 406 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 465 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 466 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 525 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 526 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 585 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 586 a 586 | Sbjct: 870 a 870
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 480/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 866 gtgaaga 860
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 489/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 448 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 507 |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 508 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 568 tgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaaga 855
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 491/502 (97%), Gaps = 1/502 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 504 ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 505 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 565 cattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 482/491 (98%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 155 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 156 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 215 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 216 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 275 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 276 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 336 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 395 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 396 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 456 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 515 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 516 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 576 gaatgtgaaga 586 ||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaaga 858
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 487/497 (97%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaaga 834
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 484/493 (98%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 454 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 513 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 514 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 573 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 574 gtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 513/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 969 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 857
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 507/524 (96%), Gaps = 1/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 122 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 123 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 182 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 183 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 242 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 243 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 302 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 303 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 362 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 363 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 423 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacat 974 Query: 483 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 543 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 479/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 488/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 448 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 507 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 508 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 568 tgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaaga 857
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 484/494 (97%), Gaps = 1/494 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 152 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 153 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 212 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 213 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 272 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 273 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 332 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 333 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 393 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 452 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 453 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 512 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 513 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 573 ggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaaga 831
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 484/494 (97%), Gaps = 1/494 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 152 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 153 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 212 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 213 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 272 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 273 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 332 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 333 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 393 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 452 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 453 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 512 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 513 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 573 ggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaaga 831
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 493/506 (97%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 493/506 (97%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 481/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 155 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 156 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 215 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 216 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 275 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 276 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 335 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 336 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 395 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 396 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 456 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 515 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 516 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 576 gaatgtgaaga 586 ||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaaga 858
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 486/497 (97%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaaga 850
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 98 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 157 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 158 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 218 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 278 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 338 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 398 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 458 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 517 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 518 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 577 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 578 atgtgaaga 586 ||||||||| Sbjct: 848 atgtgaaga 840
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 506/524 (96%), Gaps = 1/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 122 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 123 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 182 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 183 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 242 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 243 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 302 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 303 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 362 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 363 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 423 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatat 958 Query: 483 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 543 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 854
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 512/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 120063 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120062 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 120003 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120002 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 119951
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 512/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 58436 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58435 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 58376 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58375 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 58324
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 512/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 1371 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 1311 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1310 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 1259
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 478/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 478/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 478/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 478/487 (98%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 487/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 448 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 507 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 508 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 568 tgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 485/497 (97%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaaga 854
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 482/493 (97%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 454 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 513 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 514 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 574 gtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaaga 859
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 485/497 (97%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaaga 840
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 511/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 982 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 922 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 921 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 511/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57855 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57854 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57795 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 57794 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 57743
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 511/532 (96%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57865 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57864 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57805 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 57804 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 57753
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 750
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 463/469 (98%), Gaps = 1/469 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 477 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 478 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 538 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 832
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 484/497 (97%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 | ||||||||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaaga 851
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 463/469 (98%), Gaps = 1/469 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 477 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 478 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 538 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 832
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 484/497 (97%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 476/487 (97%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 476/487 (97%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 864 gtgaaga 858
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccagaatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccagaatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 462/469 (98%), Gaps = 1/469 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 477 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 478 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 538 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 829
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 462/469 (98%), Gaps = 1/469 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 477 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 478 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 538 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 829
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 509/532 (95%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 349056 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 349115 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349116 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 349175 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 349176 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 349235 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349236 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 349295 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349296 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 349355 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349356 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 349415 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 349416 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 349474 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349475 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 349534 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 349535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 349586
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 509/532 (95%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 206653 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 206594 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206593 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 206534 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 206533 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 206474 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206473 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 206414 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206413 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 206354 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206353 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 206294 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 206293 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 206235 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206234 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 206175 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 206174 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 206123 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 509/532 (95%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 77961 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 77902 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77901 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 77842 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 77841 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 77782 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77781 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 77722 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77721 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 77662 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77661 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 77602 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 77601 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 77543 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77542 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 77483 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 77482 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 77431
>emb|AJ746253.1| Arthraxon sp. TH-111 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1391 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 509/532 (95%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1328 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccactggtacaacacctggcatggatacccag 1088 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 969 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 968 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacc 909 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 857
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 475/487 (97%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 460 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 519 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 520 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 580 gtgaaga 586 ||||||| Sbjct: 874 gtgaaga 868
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 484/499 (96%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 448 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 507 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 508 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 567 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 568 tgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 472/484 (97%), Gaps = 1/484 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 103 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 162 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 163 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 222 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 223 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 283 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 343 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 402 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 403 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 463 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 522 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 523 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 582 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 583 aaga 586 |||| Sbjct: 853 aaga 850
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 482/497 (96%), Gaps = 1/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 509 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 510 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 569 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 570 cacggtgaatgtgaaga 586 | ||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|DQ490951.1| Zea mays subsp. mays genotype CMS-S mitochondrion, complete genome Length = 569553 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 508/532 (95%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 540663 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 540604 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540603 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 540544 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 540543 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 540484 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540483 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 540424 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540423 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 540364 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540363 tccagagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 540304 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 540303 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 540245 Query: 475 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 534 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540244 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 540185 Query: 535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 540184 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 540133
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 466/476 (97%), Gaps = 1/476 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 170 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 171 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 230 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 231 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 290 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 291 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 351 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 410 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 411 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 471 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 530 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 531 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 813
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 466/476 (97%), Gaps = 1/476 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 170 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 171 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 230 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 231 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 290 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 291 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 351 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 410 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 411 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 471 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 530 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 531 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 813
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 481/496 (96%), Gaps = 1/496 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 510 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 511 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 570 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 571 acggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 492/511 (96%), Gaps = 1/511 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 135 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 136 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 195 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 196 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 255 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 256 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 315 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 316 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 375 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 376 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 435 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 436 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccaga 495 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccaga 943 Query: 496 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 555 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaat 883 Query: 556 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 882 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 852
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 491/507 (96%), Gaps = 3/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 139 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 140 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 199 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 200 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 259 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 260 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 319 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 320 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 379 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 380 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 440 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 499 | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 500 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 560 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/506 (96%), Gaps = 1/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 500 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccccgacatac 926 Query: 501 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 561 catgcattgcacggtgaatgtgaaga 586 |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaaga 840 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,317,732 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4317732 Number of successful extensions: 124976 Number of sequences better than 10.0: 15146 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15080 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 77 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 84482 Number of HSP's gapped (non-prelim): 22067 length of query: 586 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 563 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9651676607352 effective search space used: 9651676607352 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)