Clone Name | rbasd3n20 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 632/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 632/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 632/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 631/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaag 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 628/634 (99%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 1411 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gcgg 934 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttka 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 630/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 agcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 629/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttn 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 nntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 628/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 627/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 627/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 627/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 627/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1422 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1421 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1362 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1302 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1242 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1182 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1122 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1063 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1004 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 944 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 943 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 885 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 849
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgss 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56331 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 56272 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 56271 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 56212 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56211 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 56152 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56151 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 56092 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56091 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 56032 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56031 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 55972 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55971 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 55913 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55912 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55854 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55853 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 55794 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 55793 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 55735 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55734 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 55699
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 626/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1517 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1458 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1457 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1398 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1338 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1278 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1218 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1158 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1099 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1040 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 980 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 979 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 921 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 885
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 935 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 899
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 935 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 899
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 935 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 899
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 935 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 899
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 935 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 899
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 625/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1200 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1199 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1140 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 841 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtattt-gc 663 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 627
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1200 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1199 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1140 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 841 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtattt-gc 663 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 627
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 935 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 899
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 939 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 903
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1330 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1329 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1270 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1210 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1150 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1090 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1030 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 971 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 912 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 852 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 851 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 793 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 757
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 624/636 (98%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttygcgttccccttcta 1113 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 993 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 935 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 899
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 939 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 903
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1332 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1331 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1272 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 973 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 795 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 759
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcc 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1339 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1338 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1279 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 980 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 860 cggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 802 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 766
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1339 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1338 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1279 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 980 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 860 cggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 802 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 766
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgss 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1332 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1331 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1272 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 973 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 795 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 ggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 759
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 623/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaat 838
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 620/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 939 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 903
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 838
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaat 790
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 622/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggc 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 621/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccagg 1356 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 997 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 939 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 903
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 621/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 621/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1200 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1199 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1140 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccagg 1080 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 841 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtattt-gc 663 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 627
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 621/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgct 1351 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 874 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaat 838
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 619/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcc 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 617/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgss 1413 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnna 1055 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gc 936 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 900
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 618/636 (97%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1473 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1414 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1413 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1354 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1294 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1293 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1234 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1174 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1114 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1113 aataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1055 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 996 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 995 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgca 936 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 935 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 877 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 876 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 841
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 605/620 (97%), Gaps = 3/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 77 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 136 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 137 tgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 196 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 197 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 257 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 317 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 376 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 377 aataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 436 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtga-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 437 acccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 496 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 a-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 919 Query: 497 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 859 Query: 557 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggtt 616 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 858 gtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccagtt 800 Query: 617 aagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||| Sbjct: 799 aagtagtcatgcattacaat 780
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1402 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1343 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1342 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1283 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1282 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccagg 1223 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1222 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1163 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1103 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1043 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 984 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 806 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1382 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1323 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1322 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1263 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccagg 1203 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1202 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacc 1143 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1083 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 aacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1023 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1022 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 964 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 905 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 845 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 844 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 786 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 785 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 750
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 790
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 790
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 616/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1520 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctag 1461 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1460 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1401 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1341 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1340 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1281 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1221 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1161 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1160 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1102 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 983 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 982 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 924 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 923 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 888
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 614/635 (96%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcg 825 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 564/569 (99%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 778
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 612/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 985 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 926 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 925 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 866 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 865 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 807 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 | |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 taaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 773
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 563/569 (98%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 912 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 852 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 851 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gcggtgaat 793 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 764
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 613/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 570/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 772 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 -gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 734
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 570/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 772 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 -gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 734
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 611/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 986 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 927 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 926 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 867 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 866 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcgg 808 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 tgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 774
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 613/634 (96%), Gaps = 5/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124281 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124280 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124221 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 124220 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 124162 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124161 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 124128 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 613/634 (96%), Gaps = 5/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29754 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29753 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29694 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 29693 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 29635 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29634 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 29601
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 612/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 612/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1409 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1350 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1349 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1290 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1289 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1230 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1229 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1170 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1169 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1110 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1050 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1049 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 991 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 872 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 871 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 813 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 777
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 612/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1407 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1348 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1347 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1288 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1287 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1228 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1227 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1168 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1167 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1108 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1048 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 989 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 870 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 869 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 811 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 775
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 612/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1421 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1362 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1361 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1302 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1301 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1242 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1241 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1182 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1181 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1122 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1062 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1003 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 884 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 825 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 789
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 610/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54993 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54992 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54933 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 54932 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 54874 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54873 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 54840
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 610/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 125334 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 125333 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 125274 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 125273 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 125215 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125214 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 125181 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 610/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 30274 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 30273 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 30214 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 30213 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 30155 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30154 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 30121
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 610/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 33527627 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 33527628 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 33527687 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 33527688 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 33527746 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527747 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 33527780 Score = 105 bits (53), Expect = 2e-19 Identities = 66/69 (95%), Gaps = 1/69 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 568 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 627 ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttg-cggtgaatcccccggttaagtagtcatg 39115414 Query: 628 cattacaat 636 ||||||||| Sbjct: 39115413 cattacaat 39115405
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 610/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 72824 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 72825 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 72884 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 72885 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 72943 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72944 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 72977
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 610/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54972 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54971 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54912 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 54911 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 54853 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54852 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 54819
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 611/636 (96%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 824 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 54926 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54925 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 54892
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 54926 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54925 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 54892
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 124242 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124241 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 124208 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 29661 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29660 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 29627
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 124242 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124241 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 124208 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 29661 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29660 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 29627
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55037 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55036 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54977 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 54976 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 54918 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54917 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 54884
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 824 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 824 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 53247 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 53246 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 53187 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 53186 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 53128 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53127 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 53094
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 128180 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 128179 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 128120 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 128119 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 128061 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128060 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 128027
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10346855 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10346854 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10346795 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 10346794 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 10346736 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346735 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 10346702
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 998 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 997 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 938 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 937 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 879 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 845
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 800 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 741 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 740 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 681 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 680 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 622 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 621 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 588
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10352894 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10352893 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10352834 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 10352833 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 10352775 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352774 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 10352741
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1330 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1329 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1270 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1269 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcgg 1211 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 tgaatcccccggtcaagtagtcatgcattacaat 1177
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 609/634 (96%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1363 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1303 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1302 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 1244 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaat 1210 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 85 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 569/581 (97%), Gaps = 3/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 416 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 475 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 476 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 536 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 595 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtat 810 Query: 596 ttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 809 tt-gcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaat 770
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 566/578 (97%), Gaps = 3/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 119 cgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 178 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 179 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 238 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 239 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 299 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 359 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 986 Query: 419 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 478 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 479 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 539 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 598 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt- 808 Query: 599 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaat 770
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 610/636 (95%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1337 agtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaag 1278 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1277 ttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1218 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1217 cccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1158 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1157 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1098 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1097 aaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1038 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 978 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 977 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 919 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 860 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 800 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 799 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gc 741 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 740 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 705
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 567/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 987 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 807 -gcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaat 770
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 584/602 (97%), Gaps = 3/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 94 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 95 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaa 154 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 155 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 214 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 215 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 274 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 275 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 334 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 335 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 395 aaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgat 454 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgat 951 Query: 455 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 891 Query: 515 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 890 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggc 831 Query: 575 aatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 634 |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 830 aataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattaca 772 Query: 635 at 636 || Sbjct: 771 at 770
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 593/614 (96%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtaaatcccccagttaagtag 789 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 788 tcatgcattacaat 775
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 609/636 (95%), Gaps = 3/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 60 ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctag 1363 Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1303 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1243 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1183 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1123 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1063 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 608/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 61 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 975 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 916 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 915 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 856 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 855 ggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcg 797 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 gtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 762
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 566/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 -gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 607/634 (95%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614085 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614084 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614025 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 5614024 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 5613966 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613965 tgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaat 5613932 Score = 527 bits (266), Expect = e-146 Identities = 318/330 (96%), Gaps = 4/330 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 307 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 367 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt-cgcgttccccttctaacttac 13436986 Query: 427 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436985 ctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 13436927 Query: 487 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 546 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13436926 acacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 13436867 Query: 547 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaa 606 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 13436866 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaa 13436808 Query: 607 tcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436807 tcccccggttaagtagtcatgcattacaat 13436778 Score = 272 bits (137), Expect = 1e-69 Identities = 162/169 (95%), Gaps = 1/169 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 468 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 528 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 587 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 588 agtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtattt-gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 13397929 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 332 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.56 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 ggtcagagctggcatatgccaa 271 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 608/634 (95%), Gaps = 4/634 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 23204050 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 23204051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 23204110 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 23204111 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 23204169 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204170 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 23204203 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 115 atc 117 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 115 atc 117 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 608/634 (95%), Gaps = 4/634 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 154698 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 154699 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 154758 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 154759 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 154817 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154818 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 154851
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 608/634 (95%), Gaps = 4/634 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38812 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38813 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38872 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 38873 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 38931 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38932 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 38965
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 607/634 (95%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614074 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614073 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614014 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 5614013 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 5613955 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613954 tgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaat 5613921 Score = 527 bits (266), Expect = e-146 Identities = 318/330 (96%), Gaps = 4/330 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 307 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 367 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt-cgcgttccccttctaacttac 13391260 Query: 427 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391259 ctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 13391201 Query: 487 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 546 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13391200 acacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 13391141 Query: 547 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaa 606 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 13391140 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaa 13391082 Query: 607 tcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391081 tcccccggttaagtagtcatgcattacaat 13391052 Score = 272 bits (137), Expect = 1e-69 Identities = 162/169 (95%), Gaps = 1/169 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 468 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 528 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 587 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 588 agtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtattt-gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 13352203 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 110 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 281 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 332 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 366 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.56 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 ggtcagagctggcatatgccaa 271 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 607/634 (95%), Gaps = 3/634 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 62 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 63 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 123 cttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 182 |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 183 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 242 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 243 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 303 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 363 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 423 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 482 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38800 Query: 483 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38801 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38860 Query: 543 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcgg 602 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 38861 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcgg 38919 Query: 603 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38920 tgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaat 38953
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 558/569 (98%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtaaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 778
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 591/614 (96%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccagttaagtag 789 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 788 tcatgcattacaat 775
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 566/581 (97%), Gaps = 3/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 416 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 475 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 476 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 536 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 595 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 810 Query: 596 ttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 809 tt-gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 564/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgctcccctt 1005 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 946 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 886 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 885 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 826 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 825 -gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 788
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 606/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 61 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1332 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1331 tcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1272 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 ccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1212 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1211 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1152 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1151 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1092 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1091 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttca 1032 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 973 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 914 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 913 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 854 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 853 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcg 795 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 564/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 -gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 581/602 (96%), Gaps = 3/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 94 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 95 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaa 154 ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 155 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 214 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 215 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 274 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 275 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 334 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 335 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 395 aaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgat 454 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgat 951 Query: 455 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 891 Query: 515 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 890 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggc 831 Query: 575 aatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 634 |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 830 aataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattaca 772 Query: 635 at 636 || Sbjct: 771 at 770
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 565/581 (97%), Gaps = 3/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 990 Query: 416 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 475 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 931 Query: 476 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 871 Query: 536 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 595 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 870 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 811 Query: 596 ttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 810 tt-gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 771
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 563/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 791 -gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 754
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 563/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 809 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 808 -gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 771
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 563/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 791 -gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 754
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 605/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 61 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 atataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttg 944 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 884 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtattt-gcg 825 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 605/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 61 ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 918 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 859 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 858 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 799 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| Sbjct: 798 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtattt-gcg 740 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 739 gtgaatcctccagttaaatagtcatgcattacaat 705
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 560/575 (97%), Gaps = 3/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcg 825 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 571/590 (96%), Gaps = 3/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 106 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 107 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgatta 166 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 167 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 226 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 227 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 286 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 287 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 346 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 347 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttc 1000 Query: 407 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 466 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 941 Query: 467 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 881 Query: 527 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 586 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 880 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 821 Query: 587 aagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 820 aactagtattt-gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 772
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 589/614 (95%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 970 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 969 cgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 910 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 909 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 850 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 849 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccagttaagtag 791 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 790 tcatgcattacaat 777
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 583/606 (96%), Gaps = 3/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 90 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 91 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttc 150 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 151 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 210 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 211 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 270 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 271 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 330 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 331 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 391 acctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggata 450 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | Sbjct: 1032 acctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggaca 975 Query: 451 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt 510 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 974 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattt 915 Query: 511 ttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcg 570 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 914 ttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcg 855 Query: 571 cggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcat 630 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 854 cggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcat 796 Query: 631 tacaat 636 |||||| Sbjct: 795 tacaat 790
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 555/569 (97%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccagttaagtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 555/569 (97%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 cccccagttaagtagtcgtgcattacaat 778
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 564/581 (97%), Gaps = 3/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 415 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 996 Query: 416 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 475 |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 937 Query: 476 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 877 Query: 536 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 595 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 876 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 817 Query: 596 ttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 816 tt-gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 777
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 557/573 (97%), Gaps = 3/573 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 124 ttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 183 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 184 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 243 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 244 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 304 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 363 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 364 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 424 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 483 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 484 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 544 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggt 603 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggt 811 Query: 604 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 810 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 541/551 (98%), Gaps = 3/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 386 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 445 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 446 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 506 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 822 Query: 566 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtca 625 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccggttaagtagtca 763 Query: 626 tgcattacaat 636 ||||||||||| Sbjct: 762 tgcattacaat 752
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 541/551 (98%), Gaps = 3/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 386 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 445 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 446 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 506 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 822 Query: 566 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtca 625 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccggttaagtagtca 763 Query: 626 tgcattacaat 636 ||||||||||| Sbjct: 762 tgcattacaat 752
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 556/571 (97%), Gaps = 3/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 126 cgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 185 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 186 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 246 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 306 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 366 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaactta 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 426 cctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 485 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 910 Query: 486 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 545 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 tacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 850 Query: 546 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtga 605 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 849 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtga 791 Query: 606 atcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 atcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 554/569 (97%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 928 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 868 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 867 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaat 809 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 808 cccccagttatgtagtcatgcattacaat 780
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 563/581 (96%), Gaps = 3/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 994 Query: 416 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 475 ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 935 Query: 476 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 875 Query: 536 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 595 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 874 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 815 Query: 596 ttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 814 tt-gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 775
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 561/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 791 -gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 754
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 594/623 (95%), Gaps = 3/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 73 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 74 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 133 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 134 gcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 193 |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 194 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 254 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 313 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 314 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 374 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 433 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 434 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 493 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 494 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 553 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 554 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccg 613 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtattt-gcggtgaatcctcca 813 Query: 614 gttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaat 790
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 581/606 (95%), Gaps = 3/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 90 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 91 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttc 150 ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 151 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 210 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 211 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 270 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 271 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 330 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 331 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 391 acctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggata 450 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggata 959 Query: 451 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt 510 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 958 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattt 899 Query: 511 ttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcg 570 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 898 ttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcg 839 Query: 571 cggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcat 630 |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 838 cggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcat 780 Query: 631 tacaat 636 |||||| Sbjct: 779 tacaat 774
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 562/581 (96%), Gaps = 3/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 416 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 475 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 476 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 536 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 595 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 810 Query: 596 ttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 809 tt-gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 564/584 (96%), Gaps = 3/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 112 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 113 agatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgct 172 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 173 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 232 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 233 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 292 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 293 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 353 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttc 412 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttc 1012 Query: 413 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 472 |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 953 Query: 473 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 532 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 952 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcat 893 Query: 533 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 592 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 892 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactag 833 Query: 593 tatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 832 tattt-gcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaat 790
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 567/588 (96%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 555/573 (96%), Gaps = 3/573 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 124 ttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 183 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 184 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 243 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 244 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 304 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 363 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 364 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 424 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 483 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 484 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 544 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggt 603 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggt 811 Query: 604 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 810 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 778
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 560/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 987 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 808 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 807 -gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 560/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt 798 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 -gcggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 593/623 (95%), Gaps = 3/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 73 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 74 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 133 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 134 gcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 193 |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 194 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 254 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 313 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 314 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 374 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 433 |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 434 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 493 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 494 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 553 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 554 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccg 613 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtattt-gcggtgaatcctcca 813 Query: 614 gttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 552/569 (97%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccagttatgtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 552/569 (97%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccagttatgtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 552/569 (97%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccagttatgtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 557/576 (96%), Gaps = 3/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 845 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 787 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 786 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaat 751
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 557/576 (96%), Gaps = 3/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 121 cccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 180 |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 181 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 300 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 301 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 361 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 420 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 421 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 480 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 481 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 541 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || Sbjct: 845 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gc 787 Query: 601 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 786 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaat 751
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 566/588 (96%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 556/575 (96%), Gaps = 3/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 992 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 933 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 932 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac 873 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 872 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcg 814 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 813 gtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 779
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 601/635 (94%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 61 ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaa 1440 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1439 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 1381 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1380 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1321 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1320 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtattt-gcg 1262 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 1227
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 559/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtattt 798 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 -gcggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 585/614 (95%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 120064 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120063 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 120004 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 120003 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 119944 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 119943 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt-gcggtgaatcctcctgttaagtag 119885 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 119884 tcatgcattacaat 119871
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 585/614 (95%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 58437 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58436 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 58377 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 58376 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 58317 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 58316 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt-gcggtgaatcctcctgttaagtag 58258 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 58257 tcatgcattacaat 58244
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 565/588 (96%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 896 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 837 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 777 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 776 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 717 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 716 ctagtattt-gcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaat 670
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 565/588 (96%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 565/588 (96%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 558/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 868 gctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 809 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 -gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 771
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 558/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 991 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 932 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 931 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcatt 872 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 871 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 812 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 811 -gcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaat 774
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 600/635 (94%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 61 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaa 1420 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1419 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttag 1361 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1360 ctaatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1301 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||| Sbjct: 1300 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagacaaactagtattt-gcg 1242 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 1207
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 584/614 (95%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 983 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 923 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 863 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 862 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt-gcggtgaatcctcctgttaagtag 804 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 803 tcatgcattacaat 790
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 584/614 (95%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57856 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57855 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57796 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57795 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57736 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57735 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt-gcggtgaatcctcctgttaagtag 57677 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 57676 tcatgcattacaat 57663
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 557/578 (96%), Gaps = 3/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 119 cgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 178 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 179 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 238 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 239 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 299 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 358 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 359 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 1006 Query: 419 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 478 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 479 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 538 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 539 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 598 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 886 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt- 828 Query: 599 gcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 790
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 584/614 (95%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57866 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57865 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57806 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57805 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57746 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57745 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt-gcggtgaatcctcctgttaagtag 57687 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 57686 tcatgcattacaat 57673
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 550/569 (96%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 936 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 876 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 875 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaat 817 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 816 cccccagttatgtagtcatgcattacaat 788
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 550/569 (96%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 848 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaat 789 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 564/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 561/584 (96%), Gaps = 3/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 632 |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcatta 764
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 564/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttccc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 ggcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 536/551 (97%), Gaps = 3/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 386 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 445 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 446 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 506 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 819 Query: 566 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtca 625 ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatcccccagttatgtagtca 760 Query: 626 tgcattacaat 636 ||||||||||| Sbjct: 759 tgcattacaat 749
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 536/551 (97%), Gaps = 3/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaa 145 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 146 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 206 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 265 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 266 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 326 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 386 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 445 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 446 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 506 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 819 Query: 566 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtca 625 ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatcccccagttatgtagtca 760 Query: 626 tgcattacaat 636 ||||||||||| Sbjct: 759 tgcattacaat 749
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 557/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 857 gctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 798 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 -gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 583/614 (94%), Gaps = 3/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 82 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 83 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtact 142 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 143 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 202 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 203 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 262 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 263 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 322 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 323 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 382 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 383 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 442 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 1372 Query: 443 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 502 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1371 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 1312 Query: 503 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1311 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 1252 Query: 563 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtag 622 | |||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1251 cgttgtcgcggcaataataagacaaactagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtag 1193 Query: 623 tcatgcattacaat 636 |||||||||||||| Sbjct: 1192 tcatgcattacaat 1179
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 549/569 (96%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccagtgatgtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 549/569 (96%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccagtgatgtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 549/569 (96%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 128 ttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 187 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 188 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 248 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 307 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 308 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 367 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 368 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 428 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 487 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 488 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 548 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaat 607 |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaat 807 Query: 608 cccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccccagtgatgtagtcatgcattacaat 778
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/581 (96%), Gaps = 3/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 116 tcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 175 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 176 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 236 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 296 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 355 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 356 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 979 Query: 416 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 475 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 476 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 535 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgca 860 Query: 536 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 595 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 859 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 800 Query: 596 ttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 tt-gcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 555/577 (96%), Gaps = 3/577 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 120 gcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 180 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 239 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 240 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 300 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 360 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttct 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttct 948 Query: 420 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 479 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 889 Query: 480 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 539 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 829 Query: 540 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 828 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-g 770 Query: 600 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 733
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 563/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 546/566 (96%), Gaps = 3/566 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 71 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 130 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 131 cgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 190 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 191 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 251 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 311 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 371 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctac 430 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 431 tactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 490 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 915 Query: 491 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 855 Query: 551 gaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatccc 610 ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 854 gaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatccc 796 Query: 611 ccggttaagtagtcatgcattacaat 636 || |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 795 ccagttatgtagtcatgcattacaat 770
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 563/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 563/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 553/575 (96%), Gaps = 3/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 985 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 926 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 866 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 865 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcg 807 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 772
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 556/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 118 acgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 177 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 178 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 237 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 238 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 297 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 298 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 357 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 358 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 417 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 418 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 477 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 478 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 537 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 538 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 597 || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 598 ggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 -gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 540/558 (96%), Gaps = 3/558 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 139 tactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 438 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 439 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 498 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 499 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 810 Query: 559 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaa 618 | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatcccccagttat 751 Query: 619 gtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||| Sbjct: 750 gtagtcatgcattacaat 733
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 540/558 (96%), Gaps = 3/558 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 139 tactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 438 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 971 Query: 439 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 911 Query: 499 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 851 Query: 559 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaa 618 | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 850 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccagttat 792 Query: 619 gtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||| Sbjct: 791 gtagtcatgcattacaat 774
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 540/558 (96%), Gaps = 3/558 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 138 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 139 tactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 198 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 199 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 258 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 259 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 319 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 378 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 379 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 438 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 439 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 498 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 499 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 810 Query: 559 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaa 618 | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt-gcggtgaatcccccagttat 751 Query: 619 gtagtcatgcattacaat 636 |||||||||||||||||| Sbjct: 750 gtagtcatgcattacaat 733
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 563/586 (96%), Gaps = 5/586 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 107 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 108 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattag 167 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 168 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 227 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 228 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 287 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 288 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 347 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 348 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcg 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcg 987 Query: 408 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 467 || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 cgctccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 928 Query: 468 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataac 868 Query: 528 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 587 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 867 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 808 Query: 588 agtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattac 633 |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 807 agtagtattt-gcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattac 763
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 529/544 (97%), Gaps = 3/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttcta 152 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 153 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 212 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 213 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 272 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 273 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 332 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 333 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 392 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 393 ctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatg 452 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtga-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatg 920 Query: 453 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 860 Query: 513 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 800 Query: 573 gcaatagtgagccaaagtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 632 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 799 gcaataatgagccaaagtagtattt-gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 741 Query: 633 caat 636 |||| Sbjct: 740 caat 737
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 562/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 562/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 562/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| Sbjct: 866 gcatgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 562/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 562/588 (95%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 109 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagc 168 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 169 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 228 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 229 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 288 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 289 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 348 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 349 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 408 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 409 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 469 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 528 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 529 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 588 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaa 807 Query: 589 gtagtatttggcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtattt-gcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 760
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 552/575 (96%), Gaps = 3/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 122 ccttcgttacgagcttgtactcaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 181 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 182 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 241 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 242 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 302 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 362 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 983 Query: 422 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 481 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 924 Query: 482 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 923 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 864 Query: 542 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttggcg 601 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 863 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt-gcg 805 Query: 602 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 636 |||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 gtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaat 770 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,798,220 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4798220 Number of successful extensions: 151573 Number of sequences better than 10.0: 15159 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15093 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 78 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 93306 Number of HSP's gapped (non-prelim): 27194 length of query: 636 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 613 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10508841492552 effective search space used: 10508841492552 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)