ナショナルバイオリソースプロジェクト
-Barley Genetic Resources Database-
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| Clone Name | rbasd3k01 |
|---|---|
| Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 689/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 689/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1296 bits (654), Expect = 0.0 Identities = 689/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1289 bits (650), Expect = 0.0 Identities = 688/694 (99%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 686/693 (98%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 1411 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 933 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 874 Query: 661 cagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 cagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 732
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 staatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 687/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagga 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 686/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 685/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnn 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 685/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 685/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 685/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 685/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 685/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 684/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 683/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 683/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 684/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 684/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 684/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 683/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 683/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 683/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 683/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 683/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 taaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 732
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1421 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1420 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1361 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1301 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1241 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1181 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1121 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1062 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1003 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 943 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 883 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 882 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 824 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 823 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 791
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 56330 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 56271 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 56270 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 56211 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56210 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 56151 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56150 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 56091 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56090 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 56031 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56030 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55971 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55970 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 55912 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55911 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 55853 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55852 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 55793 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55792 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 55733 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 55732 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 55674 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55673 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 55641
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 682/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1516 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1457 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1456 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1397 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1337 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1277 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1217 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1157 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1098 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1039 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 979 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 919 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 918 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 860 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 859 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 827
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 732
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaan 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 || ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acngctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 taaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 993 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 933 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 841
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 993 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 933 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 841
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 993 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 933 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 841
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 993 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 933 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 841
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 681/694 (98%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 993 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 933 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctnttaatcatttc-ttcacatgtaccc 841
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 732
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 732
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 840 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 781 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 780 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 721 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 720 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcgg 661 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 660 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 602 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 601 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 569
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 840 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 781 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 780 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 721 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 720 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcgg 661 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 660 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 602 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 601 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 569
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 997 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 937 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 936 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 845
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1329 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1269 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1209 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1149 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1089 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1029 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaa 970 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 911 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 851 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 791 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 732 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 731 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 699
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 680/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1271 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 972 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 913 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 853 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 793 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 taaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 734 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 733 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 701
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 677/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttygcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 993 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 933 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 841
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 997 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 937 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 936 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 845
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 993 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 933 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 874 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 873 acagctctnttaatcatttc-ttcacatgtaccc 841
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1271 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 972 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 913 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 853 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 793 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 734 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 733 acagctctcttcatcatttc-ttcacatgtaccc 701
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctnttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 732
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1278 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 979 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 920 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 860 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 800 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 799 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 741 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 740 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 708
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1278 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 979 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 920 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 860 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 800 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 799 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 741 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 740 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 708
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 679/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcac 997 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 937 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 936 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 845
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 732
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 678/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 732
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 677/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 997 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 937 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 936 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 878 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 877 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 845
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 667/682 (97%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttctt 743
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 677/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 840 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 781 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 780 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 721 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 720 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcgg 661 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 660 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 602 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 601 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 569
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 677/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctg 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 932 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 872 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 871 tgaatccccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaat 813 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 812 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 780
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 674/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1112 cttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnag 1054 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 994 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 934 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 842
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 675/694 (97%), Gaps = 5/694 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaagcatttc-ttcacatgtaccc 732
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 674/693 (97%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1472 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1413 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1353 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1293 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1292 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1233 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1173 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1113 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1054 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 995 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 994 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcac 935 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 934 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 875 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 816 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 815 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 784
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 623/628 (99%), Gaps = 4/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 720
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 672/693 (96%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1381 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1322 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1321 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1262 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggt 1202 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1201 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacca 1142 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1082 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 acacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1022 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 963 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 904 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 844 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 784 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 783 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 725 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 724 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 693
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 672/693 (96%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 733
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 672/693 (96%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctag 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 733
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 672/693 (96%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1519 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1460 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1459 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1400 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1340 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1339 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1280 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1220 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1160 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1159 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctag 1101 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1042 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 982 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 981 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 922 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 863 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 862 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 831
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 622/628 (99%), Gaps = 4/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 912 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 852 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 851 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 792 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 733 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 732 ctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 706
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 629/638 (98%), Gaps = 4/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 772 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 gcggtgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 713 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 712 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 676
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 629/638 (98%), Gaps = 4/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 772 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 gcggtgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 713 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 712 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 676
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0 Identities = 671/693 (96%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1401 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1342 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggt 1222 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1221 gcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1162 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1102 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1042 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaa 983 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 924 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 864 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 804 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 803 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 745 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 744 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 713
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 660/679 (97%), Gaps = 5/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 aactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 74 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 75 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 134 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 135 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 194 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 195 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 255 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 315 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 374 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 375 aataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 434 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtga-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 435 acccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 494 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 a-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 919 Query: 495 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 859 Query: 555 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggtt 614 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 858 gtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agtt 800 Query: 615 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| Sbjct: 799 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctcttcatc 740 Query: 675 atttctttcacatgtaccc 693 ||||| ||||||||||||| Sbjct: 739 atttc-ttcacatgtaccc 722
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 670/693 (96%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 733
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 658/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 985 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 926 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 925 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 866 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 865 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 806 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 aaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaata 747 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 cagctctcttaatcatttctt 726
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 668/693 (96%), Gaps = 5/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 733
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 627/640 (97%), Gaps = 4/640 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 473 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 474 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 534 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 593 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtat 810 Query: 594 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 653 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 ttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctcta 751 Query: 654 gcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 750 gcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 712
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 624/637 (97%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 416 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 986 Query: 417 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 476 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 477 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 537 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 596 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 597 cggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 656 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 806 cggtgaatccccc-agttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagca 748 Query: 657 aatacagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 747 aatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 712
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 625/638 (97%), Gaps = 4/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 987 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 807 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 712
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 659/681 (96%), Gaps = 6/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124281 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124280 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124221 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124220 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124161 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 124160 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 124102 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124101 cagctctcttaatcatttctt 124081 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 659/681 (96%), Gaps = 6/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29754 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29753 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29694 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29693 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29634 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 29633 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 29575 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 29574 cagctctcttaatcatttctt 29554
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 617/628 (98%), Gaps = 4/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 720
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 624/639 (97%), Gaps = 4/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 473 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 474 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 534 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 593 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 810 Query: 594 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 653 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 751 Query: 654 gcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 750 gcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 713
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 655/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54993 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54992 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54933 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54932 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54873 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 54872 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 54814 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54813 cagctcttttaatcatttctt 54793
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 622/637 (97%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgctcccctt 1005 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 946 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 886 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 885 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 826 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 767 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 766 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 731
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 655/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 125334 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 125333 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 125274 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125273 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 125214 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 125213 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 125155 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125154 cagctcttttaatcatttctt 125134 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 655/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 30274 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 30273 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 30214 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30213 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 30154 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 30153 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 30095 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30094 cagctcttttaatcatttctt 30074
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 655/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 822 gaatccccc-tgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 764 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 763 cagctctcttaatcatttctt 743
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 655/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 33527627 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 33527628 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 33527687 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527688 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 33527747 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 33527748 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 33527806 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527807 cagctcttttaatcatttctt 33527827 Score = 190 bits (96), Expect = 4e-45 Identities = 112/116 (96%), Gaps = 1/116 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 566 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatg 625 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccgg-ttaagtagtcatg 39115414 Query: 626 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115413 cattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 39115358
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 655/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 72824 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 72825 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 72884 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72885 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 72944 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 72945 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 73003 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 73004 cagctcttttaatcatttctt 73024
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 655/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54972 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54971 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54912 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54911 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54852 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 54851 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 54793 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54792 cagctcttttaatcatttctt 54772
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 635/655 (96%), Gaps = 4/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 97 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 98 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 157 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 158 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 217 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 218 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 277 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 278 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 337 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 338 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 398 cattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 457 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1003 ca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 458 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 518 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 577 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 578 tgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaatagg 637 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaatagg 767 Query: 638 aacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 766 aactcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatcatttc-ttcacatgtacc 713
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 | ||||||||| |||||||||| Sbjct: 764 atagctctcttcatcatttctt 743
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1349 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1348 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1289 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1288 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1229 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1228 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1169 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1168 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1109 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1049 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 990 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 931 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 930 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 871 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 811 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 810 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 752 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 | ||||||||| |||||||||| Sbjct: 751 atagctctcttcatcatttctt 730
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1347 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1346 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1287 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1286 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1227 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1226 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1167 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1166 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1107 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1047 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 988 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 929 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 928 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 869 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 809 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 808 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 750 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 | ||||||||| |||||||||| Sbjct: 749 atagctctcttcatcatttctt 728
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1336 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagt 1277 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1157 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1097 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1037 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 acaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 977 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 918 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 859 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 799 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 739 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 738 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 680 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 679 acagctctcttaatcatttctt 658
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 655/682 (96%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1361 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1360 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1301 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1300 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1241 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1240 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1181 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1180 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1121 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1061 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1002 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 943 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 942 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 883 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 823 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 822 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 764 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 | ||||||||| |||||||||| Sbjct: 763 atagctctcttcatcatttctt 742
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 612/626 (97%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 739 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttcatcatgtctt 713
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 822 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 764 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 763 cagctcttttaatcatttctt 743
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54925 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 54924 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 54866 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54865 cagctcttttaatcatttctt 54845
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54925 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 54924 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 54866 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54865 cagctcttttaatcatttctt 54845
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 621/637 (97%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 733 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 732 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 697
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124241 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 124240 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 124182 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124181 cagctcttttaatcatttctt 124161 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29660 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 29659 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 29601 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29600 cagctcttttaatcatttctt 29580
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 124241 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 124240 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 124182 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124181 cagctcttttaatcatttctt 124161 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 29660 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 29659 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 29601 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29600 cagctcttttaatcatttctt 29580
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55037 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55036 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54977 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54976 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 54917 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 54916 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 54858 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54857 cagctcttttaatcatttctt 54837
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 621/637 (97%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 733 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 732 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 697
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 823 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 822 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 764 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 763 cagctcttttaatcatttctt 743
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 986 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 927 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 926 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 867 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 807 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 806 gaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 748 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 747 tagctctcttcatcatatctt 727
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 53247 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 53246 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 53187 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53186 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 53127 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 53126 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 53068 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53067 cagctcttttaatcatttctt 53047
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 128180 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 128179 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 128120 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128119 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 128060 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 128059 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 128001 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128000 cagctcttttaatcatttctt 127980
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10346855 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10346854 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10346795 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10346794 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 10346735 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 10346734 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 10346676 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10346675 cagctcttttaatcatttctt 10346655
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 998 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 997 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 938 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 937 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 878 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 877 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 819 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 818 cagctcttttaatcatttctt 798
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 800 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 741 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 740 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 681 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 680 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 621 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 620 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 562 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 561 cagctcttttaatcatttctt 541
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10352894 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10352893 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10352834 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10352833 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 10352774 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 10352773 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 10352715 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10352714 cagctcttttaatcatttctt 10352694
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1330 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1329 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1270 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 1210 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1209 gaatccccc-ggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 1151 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1150 cagctcttttaatcatttctt 1130
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 654/681 (96%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1363 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1303 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1302 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 1243 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1242 gaa-ccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 1184 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1183 cagctcttttaatcatttctt 1163 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 614/628 (97%), Gaps = 4/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 720
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 629/648 (97%), Gaps = 4/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 104 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 105 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 164 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 165 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 224 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 225 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 284 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 285 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 344 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 345 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttc 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttc 1000 Query: 405 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 464 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 941 Query: 465 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 881 Query: 525 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 584 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 880 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 821 Query: 585 aagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 644 || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 aactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccct 762 Query: 645 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 761 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 715
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 622/639 (97%), Gaps = 4/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 990 Query: 414 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 473 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 931 Query: 474 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 871 Query: 534 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 593 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 870 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 811 Query: 594 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 653 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 752 Query: 654 gcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 751 gcaaatacagctcttttaatcatttc-ttcacatgtacc 714
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 4/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 384 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 443 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 444 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 504 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 822 Query: 564 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagtca 763 Query: 624 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttc 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 762 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttc 704 Query: 684 acatgtaccc 693 |||||||||| Sbjct: 703 acatgtaccc 694
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 600/610 (98%), Gaps = 4/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 384 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 443 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 444 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 504 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 822 Query: 564 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagtca 763 Query: 624 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttc 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 762 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttc 704 Query: 684 acatgtaccc 693 |||||||||| Sbjct: 703 acatgtaccc 694
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 654/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 | ||||||||| |||||||||| Sbjct: 764 atagctctcttcatcatttctt 743
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 615/631 (97%), Gaps = 4/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 122 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 181 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 182 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 241 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 242 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 362 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 422 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 481 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 482 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 542 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 601 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 810 Query: 602 aatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 aatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 751 Query: 662 agctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 750 agctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 721
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 620/637 (97%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 809 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttc-ttcacatgtacc 714
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 613/628 (97%), Gaps = 4/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtaccc 693 |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtaccc 720
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 612/627 (97%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 928 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 868 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 808 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 749 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 748 ctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 723
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 621/639 (97%), Gaps = 4/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 994 Query: 414 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 473 ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 935 Query: 474 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 875 Query: 534 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 593 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 874 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 815 Query: 594 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 653 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 756 Query: 654 gcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 755 gcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 718
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 633/655 (96%), Gaps = 4/655 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 97 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 98 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 157 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 158 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 217 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 218 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 277 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 278 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 337 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 338 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 398 cattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 457 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1003 ca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 458 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 518 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 577 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 578 tgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaatagg 637 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaatagg 767 Query: 638 aacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 766 aacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 713
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 653/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 975 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 916 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 915 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 856 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 855 ggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 796 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 tgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 737 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 736 acagctctcttcatcatttctt 715
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 653/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 tgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttcatcatttctt 743
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 607/622 (97%), Gaps = 3/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttctt 743
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 619/637 (97%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 792 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 733 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 732 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 697
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 652/681 (95%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614085 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614084 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614025 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614024 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 5613965 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 5613964 gaat-cccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 5613906 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5613905 cagctcttttaatcatttctt 5613885 Score = 613 bits (309), Expect = e-172 Identities = 364/377 (96%), Gaps = 4/377 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttac 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt-cgcgttccccttctaacttac 13436986 Query: 425 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 484 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436985 ctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 13436927 Query: 485 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 544 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13436926 acacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 13436867 Query: 545 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 604 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13436866 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 13436807 Query: 605 cccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagc 664 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13436806 ccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagc 13436748 Query: 665 tctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||| Sbjct: 13436747 tctcttaatcatttctt 13436731 Score = 289 bits (146), Expect = 6e-75 Identities = 171/178 (96%), Gaps = 1/178 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 466 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 526 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 585 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 586 agtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 643 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.61 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 653/681 (95%), Gaps = 5/681 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 23204050 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 23204051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 23204110 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23204111 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 23204170 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 23204171 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 23204229 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23204230 cagctcttttaatcatttctt 23204250 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 113 atc 115 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 113 atc 115 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 653/681 (95%), Gaps = 5/681 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 154698 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 154699 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 154758 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154759 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 154818 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 154819 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 154877 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154878 cagctcttttaatcatttctt 154898
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 653/681 (95%), Gaps = 5/681 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38812 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38813 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38872 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38873 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 38932 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 38933 gaatccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 38991 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38992 cagctcttttaatcatttctt 39012
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 652/681 (95%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614074 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614073 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614014 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614013 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 5613954 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 5613953 gaat-cccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 5613895 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5613894 cagctcttttaatcatttctt 5613874 Score = 613 bits (309), Expect = e-172 Identities = 364/377 (96%), Gaps = 4/377 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttac 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt-cgcgttccccttctaacttac 13391260 Query: 425 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 484 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391259 ctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 13391201 Query: 485 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 544 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13391200 acacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 13391141 Query: 545 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 604 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13391140 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaat 13391081 Query: 605 cccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagc 664 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13391080 ccccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagc 13391022 Query: 665 tctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||| Sbjct: 13391021 tctcttaatcatttctt 13391005 Score = 289 bits (146), Expect = 6e-75 Identities = 171/178 (96%), Gaps = 1/178 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 466 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 526 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 585 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 586 agtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 643 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 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ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 652/681 (95%), Gaps = 4/681 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 421 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 480 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38800 Query: 481 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38801 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38860 Query: 541 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 600 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38861 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 38920 Query: 601 gaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 660 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 38921 gaat-cccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaata 38979 Query: 661 cagctctcttaatcatttctt 681 ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38980 cagctcttttaatcatttctt 39000
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 608/624 (97%), Gaps = 3/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 739 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttc 679 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttc 715
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 620/639 (97%), Gaps = 4/639 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 473 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 474 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 534 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 593 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 810 Query: 594 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 653 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 ttgcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 751 Query: 654 gcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 750 gcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 713
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 622/642 (96%), Gaps = 4/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 110 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 111 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 170 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 171 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 230 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 231 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 290 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 291 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 351 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttc 410 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttc 1012 Query: 411 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 470 |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 953 Query: 471 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 530 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 952 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcat 893 Query: 531 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 590 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 892 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactag 833 Query: 591 tatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 650 ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 832 tatttgcggtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 774 Query: 651 ctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 773 ctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 733
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 603/618 (97%), Gaps = 3/618 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 124 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 184 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 244 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 304 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 364 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaactta 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 424 cctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 483 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 910 Query: 484 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 543 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 tacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 850 Query: 544 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 603 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 790 Query: 604 tcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 663 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 789 tccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 731 Query: 664 ctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||| Sbjct: 730 ctctcttaatcatttctt 713
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 610/627 (97%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 721
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 615/634 (97%), Gaps = 4/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 418 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 419 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 478 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 479 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 539 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 598 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 845 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 786 Query: 599 gtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 658 ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 gtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 727 Query: 659 tacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 726 tacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 694
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 615/634 (97%), Gaps = 4/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 418 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 419 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 478 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 479 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 539 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 598 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 845 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 786 Query: 599 gtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 658 ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 gtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 727 Query: 659 tacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 726 tacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 694
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 651/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 atataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttg 944 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 884 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcgg 824 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 tgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 764 acagctctcttaatcatttctt 743
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 651/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1332 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1331 tcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1272 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 ccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1212 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1211 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1152 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1151 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1092 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1091 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttca 1032 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 973 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 914 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 913 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 854 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 853 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 794 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 793 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 735 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 734 acagctctcttcatcatttctt 713
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 617/637 (96%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 987 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 808 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 807 gcggtgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgc 749 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 713
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 614/633 (96%), Gaps = 4/633 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 992 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 933 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 932 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac 873 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 872 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 813 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 812 tgaatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 754 Query: 660 acagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 753 acagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 722
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 610/629 (96%), Gaps = 4/629 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 122 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 181 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 182 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 241 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 242 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 362 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 422 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 481 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 482 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 542 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 601 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810 Query: 602 aatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 661 |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 aatccccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 751 Query: 662 agctctcttaatcatttctttcacatgta 690 |||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 750 agctcttttaatcatttc-ttcacatgta 723
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 616/637 (96%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 991 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 932 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 931 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcatt 872 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 871 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 812 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gcggtgaatccccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 753 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 752 aaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 717
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 634/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtag 789 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 680 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 788 tcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatct 729 Query: 681 t 681 | Sbjct: 728 t 728
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 616/637 (96%), Gaps = 4/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtattt 798 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-tgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaagcatttc-ttcacatgtacc 703
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 608/628 (96%), Gaps = 3/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 413 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 996 Query: 414 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 473 |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 937 Query: 474 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 877 Query: 534 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 593 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 876 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 817 Query: 594 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 653 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 816 ttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctc 758 Query: 654 gcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 757 gcaaatacggctcttttaatcatttctt 730
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 608/627 (96%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 805 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 746 ctcttcatcatttc-ttcacatgtacc 721
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 608/627 (96%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 805 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 746 ctcttcatcatttc-ttcacatgtacc 721
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 608/627 (96%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 936 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 876 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 816 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 815 cccc-agttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 757 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 756 ctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 731
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttctt 713
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 616/638 (96%), Gaps = 4/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatccccc-agttaagtag 789 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 658 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 788 tcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 649/682 (95%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 918 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 859 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 858 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 799 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| Sbjct: 798 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcgg 739 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 738 tgaatcctcc-agttaaatagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaat 680 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 679 gcagctctcttaatcatttctt 658
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 622/646 (96%), Gaps = 4/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttc-ttcacatgtacc 703
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 594/609 (97%), Gaps = 4/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 384 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 443 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 444 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 504 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 819 Query: 564 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 623 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtca 760 Query: 624 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttc 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 759 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttc 701 Query: 684 acatgtacc 692 ||||||||| Sbjct: 700 acatgtacc 692
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 594/609 (97%), Gaps = 4/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 384 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 443 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 444 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 504 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 819 Query: 564 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtca 623 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttatgtagtca 760 Query: 624 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttc 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 759 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttc 701 Query: 684 acatgtacc 692 ||||||||| Sbjct: 700 acatgtacc 692
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 633/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 970 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 969 cgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 910 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 909 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 850 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 849 cattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtag 791 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 680 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 790 tcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttct 731 Query: 681 t 681 | Sbjct: 730 t 730
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 612/635 (96%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 896 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 837 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 777 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 776 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 717 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 716 ctagtatttgcggtgaatcctcc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 658 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 657 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 623
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 607/627 (96%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 721
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 607/627 (96%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 721
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 612/635 (96%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 713
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 621/646 (96%), Gaps = 4/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 703
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 614/638 (96%), Gaps = 3/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 101 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 160 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 161 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 220 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 221 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 280 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 281 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 340 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 341 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca- 1022 Query: 401 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 460 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccca 963 Query: 461 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 520 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 903 Query: 521 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 580 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 902 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 843 Query: 581 gccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaac 640 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 gccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaac 784 Query: 641 ccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 678 ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 783 ccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcattt 746
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 605/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtattt 798 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-tgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaagcatttctt 713
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 639/670 (95%), Gaps = 4/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 71 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 72 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 431 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 432 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 491 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 492 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 551 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 552 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 611 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctcc-a 813 Query: 612 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctctta 753 Query: 672 atcatttctt 681 |||||||||| Sbjct: 752 atcatttctt 743
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 598/616 (97%), Gaps = 4/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 971 Query: 437 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 911 Query: 497 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 851 Query: 557 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaa 616 | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 850 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttat 792 Query: 617 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 791 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 732 Query: 677 ttctttcacatgtacc 692 ||| |||||||||||| Sbjct: 731 ttc-ttcacatgtacc 717
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 597/616 (96%), Gaps = 3/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 848 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 788 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 787 cccc-ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 666 ctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||| Sbjct: 728 ctcttaatcatttctt 713
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 606/627 (96%), Gaps = 4/627 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 485 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 486 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 546 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 605 |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 806 Query: 606 ccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 665 |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 cccc-agtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagct 747 Query: 666 ctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 746 ctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 721
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 604/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 868 gctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 809 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 808 gcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 750 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctctcttcatcatttctt 724
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 603/624 (96%), Gaps = 4/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctac 428 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 429 tactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 488 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 915 Query: 489 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 855 Query: 549 gaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccc 608 ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 854 gaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccc 795 Query: 609 cgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 668 | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 c-agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctc 736 Query: 669 ttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 735 ttaatcatttc-ttcacatgtacc 713
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 638/670 (95%), Gaps = 4/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 71 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 72 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 431 |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 432 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 491 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 492 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 551 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 552 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 611 |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 871 gaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctcc-a 813 Query: 612 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctctta 753 Query: 672 atcatttctt 681 |||||||||| Sbjct: 752 atcatttctt 743
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 605/628 (96%), Gaps = 3/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 979 Query: 414 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 473 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 474 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 533 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgca 860 Query: 534 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 593 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 859 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 800 Query: 594 ttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctc 653 |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 799 ttgcagtgaatccacc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctc 741 Query: 654 gcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 740 gcaaatacagctctcttaatcatttctt 713
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 610/635 (96%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattataataggagcccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 713
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 610/635 (96%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatatctt 713
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 603/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 857 gctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 798 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgc 739 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttctt 713
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 614/641 (95%), Gaps = 3/641 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 101 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 160 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 161 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 220 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 221 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 280 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 281 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 340 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 341 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca- 1006 Query: 401 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 460 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccca 947 Query: 461 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 520 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 887 Query: 521 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 580 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 886 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 827 Query: 581 gccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaac 640 |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 826 gccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggagc 768 Query: 641 ccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 767 ccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttctt 727
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 596/616 (96%), Gaps = 4/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 437 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 496 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 497 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 810 Query: 557 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaa 616 | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttat 751 Query: 617 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 750 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcat 691 Query: 677 ttctttcacatgtacc 692 ||| |||||||||||| Sbjct: 690 ttc-ttcacatgtacc 676
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 548/552 (99%), Gaps = 4/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 142 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 202 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 262 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 322 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 382 caacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 441 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 1877 Query: 442 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1876 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 1817 Query: 502 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1816 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 1757 Query: 562 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagt 621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1756 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-ggttaagtagt 1698 Query: 622 catgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1697 catgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc-t 1639 Query: 682 tcacatgtaccc 693 |||||||||||| Sbjct: 1638 tcacatgtaccc 1627
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 596/616 (96%), Gaps = 4/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 437 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 496 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 497 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 810 Query: 557 aagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaa 616 | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc-agttat 751 Query: 617 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 750 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcat 691 Query: 677 ttctttcacatgtacc 692 ||| |||||||||||| Sbjct: 690 ttc-ttcacatgtacc 676
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 586/603 (97%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 91 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 150 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 151 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 211 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 270 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 271 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 330 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 331 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 390 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 391 ctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatg 450 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtga-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatg 920 Query: 451 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 860 Query: 511 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 800 Query: 571 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcatta 630 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 799 gcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcatta 741 Query: 631 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgta 690 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 740 caataggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttc-ttcacatgta 682 Query: 691 ccc 693 ||| Sbjct: 681 ccc 679
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 609/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 713
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 609/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 713
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 609/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| Sbjct: 866 gcatgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttctctcgcaaatgcagctctcttaatcatttctt 713
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 645/682 (94%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaa 1440 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1439 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 1381 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1380 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1321 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1320 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcgg 1261 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1260 tgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 1202 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 | ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1201 atagctctcttcatcatttctt 1180
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 599/622 (96%), Gaps = 3/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 983 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 924 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 923 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 864 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 804 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 803 tgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 745 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 acagctctcttaatcatttctt 723
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 602/626 (96%), Gaps = 3/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 475 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 476 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 535 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 536 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 595 || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 596 gcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 655 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 797 gcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 656 aaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttcatcatttctt 713
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 629/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 983 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 923 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 863 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 862 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 804 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 680 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 tcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttct 744 Query: 681 t 681 | Sbjct: 743 t 743
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 629/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57856 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57855 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57796 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57795 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57736 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57735 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 57677 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 680 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57676 tcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttct 57617 Query: 681 t 681 | Sbjct: 57616 t 57616
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 601/625 (96%), Gaps = 3/625 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 416 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 1006 Query: 417 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 476 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 477 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 536 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 537 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 596 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 597 cggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgca 656 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 826 cggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgca 768 Query: 657 aatacagctctcttaatcatttctt 681 |||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 767 aatatagctctcttcatcatatctt 743
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 629/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 120064 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120063 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 120004 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 120003 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 119944 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 119943 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 119885 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 680 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119884 tcatgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttct 119825 Query: 681 t 681 | Sbjct: 119824 t 119824
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 629/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57866 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57865 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57806 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 57805 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 57746 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57745 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 57687 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 680 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57686 tcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttct 57627 Query: 681 t 681 | Sbjct: 57626 t 57626
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 629/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 440 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 58437 Query: 441 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 500 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58436 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 58377 Query: 501 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 58376 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggc 58317 Query: 561 cattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtag 620 | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 58316 cgttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcc-tgttaagtag 58258 Query: 621 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttct 680 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58257 tcatgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttct 58198 Query: 681 t 681 | Sbjct: 58197 t 58197
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 600/624 (96%), Gaps = 3/624 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttct 948 Query: 418 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 477 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 889 Query: 478 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 537 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 829 Query: 538 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 597 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 769 Query: 598 ggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 657 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 768 ggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 710 Query: 658 atacagctctcttaatcatttctt 681 ||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 709 atatagctctcttcatcatttctt 686
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 608/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttctt 713
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 608/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatttctt 713
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 608/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttcccttgcaaatacagctctcttaatcatttctt 713
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 608/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 713
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 608/635 (95%), Gaps = 3/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttccc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 ggcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 747 ttccctcgcaaatacagctctcttcatcatatctt 713
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 644/682 (94%), Gaps = 4/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 59 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaa 1420 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1419 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttag 1361 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1360 ctaatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1301 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| Sbjct: 1300 ggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagacaaactagtatttgcgg 1241 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1240 tgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaat 1182 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 |||||||||| |||||||||| Sbjct: 1181 gcagctctcttcatcatttctt 1160
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 598/622 (96%), Gaps = 3/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 985 Query: 420 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 479 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 926 Query: 480 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 539 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 866 Query: 540 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 806 Query: 600 tgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tgaatccccc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 747 Query: 660 acagctctcttaatcatttctt 681 | ||||||||| |||||||||| Sbjct: 746 atagctctcttcatcatttctt 725
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 617/646 (95%), Gaps = 4/646 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 167 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 226 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 227 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 286 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 347 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 406 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 466 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 467 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 526 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 527 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 586 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaa 807 Query: 587 gtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 646 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 ctagtatttgcggtgaatcctcc-agttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 748 Query: 647 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctttcacatgtacc 692 ||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 747 ttcccttgcaaatccagctctcttaatcatttc-ttcacatgtacc 703
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 611/640 (95%), Gaps = 3/640 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 101 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 102 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 161 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 162 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 221 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 222 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 281 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 282 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 341 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 342 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 401 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-t 1003 Query: 402 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccag 944 Query: 462 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaa 884 Query: 522 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 581 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 883 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 824 Query: 582 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgggttaagtagtcatgcattacaataggaacc 641 ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 ccaaactagtatttgcggtgaatcctcc-tgttatgtagtcatgcattacaataggaacc 765 Query: 642 cctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 681 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 764 cctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 725 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 5,452,863 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 5452863 Number of successful extensions: 167759 Number of sequences better than 10.0: 15148 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15081 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 81 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 106200 Number of HSP's gapped (non-prelim): 28879 length of query: 693 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 670 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11486009461680 effective search space used: 11486009461680 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)
