Clone Name | rbasd1p04 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 668/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 668/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 668/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 667/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctakttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagsta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1277 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 666/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 yttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1273 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 yttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggag 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 665/671 (99%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 664/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnnta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 664/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 664/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 664/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 664/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 664/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 663/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 canntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 663/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 663/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 663/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaar-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcssscc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 662/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaa 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1419 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1418 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1360 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1300 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1240 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1180 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1120 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1060 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1000 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 940 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 880 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 879 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 820 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 819 ctctcttaatc 809
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgsscc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56328 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 56269 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 56268 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 56210 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56209 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 56150 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56149 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 56090 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56089 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 56030 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56029 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55970 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55969 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55910 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55909 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55850 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55849 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 55790 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55789 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 55730 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 55729 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 55670 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 55669 ctctcttaatc 55659
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 661/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1514 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1455 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1454 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1396 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1336 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1276 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1216 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1156 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1096 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1036 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 976 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 916 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 915 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 856 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 855 ctctcttaatc 845
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagata 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 caatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaanacng 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcssscc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaa 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1410 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1350 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1290 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 930 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 929 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 870 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 869 ctctcttaatc 859
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1410 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1350 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1290 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 930 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 929 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 870 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 869 ctctcttaatc 859
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1410 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1350 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1290 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 930 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 929 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 870 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 869 ctctcttaatc 859
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1410 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1350 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1290 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 930 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 929 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 870 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 869 ctctcttaatc 859
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 660/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcssscc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcssscc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 658/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaa 752
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 658/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1327 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1326 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1268 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1208 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1148 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1088 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1028 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 968 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 908 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 848 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 788 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 787 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 728 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 727 ctctcttaa 719
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 658/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaa 800
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 658/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaa 800
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1410 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1350 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1290 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 930 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 929 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 870 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 869 ctctnttaatc 859
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 820 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1138 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1078 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1018 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 958 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 898 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 838 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 837 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 778 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 718 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 717 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtga 658 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 657 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 598 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 597 ctctcttaatc 587
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1138 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1078 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1018 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 958 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 898 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 838 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 837 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 778 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 718 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 717 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtga 658 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 657 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 598 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 597 ctctcttaatc 587
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 658/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1414 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1354 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1294 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 934 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 933 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 874 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 873 ctctcttaatc 863
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 658/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgsscc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 659/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 atctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1329 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1328 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1270 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1210 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1150 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1090 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1030 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 970 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 910 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 850 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 849 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaa 790 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 730 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 729 ctctcttaatc 719
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 656/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcssscc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 657/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcccc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaa 752
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 657/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1410 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1350 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1290 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 agrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaact 1110 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 930 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 929 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 870 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 869 ctctcttaatc 859
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 658/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1414 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1354 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1294 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 934 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 933 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 874 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 873 ctctcttaatc 863
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 656/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcssscc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaa 800
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 657/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1410 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1350 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1290 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 930 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 929 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 870 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 869 ctctnttaatc 859
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 655/667 (98%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1329 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1328 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1270 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1210 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1150 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1090 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 canctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1030 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 970 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 910 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 850 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 790 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 730 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 729 ctctctt 723
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 657/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 808 ctctnttaatc 798
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 658/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1336 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1335 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1277 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1217 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1157 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1097 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1037 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 977 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 917 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 857 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 gaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 797 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 796 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 737 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 736 ctctcttaatc 726
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 658/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1336 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1335 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1277 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1217 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1157 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1097 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1037 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 977 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 917 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 857 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 gaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 797 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 796 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 737 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 736 ctctcttaatc 726
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 657/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 658/671 (98%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 656/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcggccc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaa 752
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 657/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1414 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1354 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1294 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 934 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 933 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 874 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 873 ctctcttaatc 863
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 657/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 657/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0 Identities = 656/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1414 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1413 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtg 1354 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1294 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 934 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 933 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 874 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 873 ctctcttaatc 863
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 656/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcc 1138 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtg 1078 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1018 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 958 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 898 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 838 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 837 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 778 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 718 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 717 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtga 658 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 657 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 598 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 597 ctctcttaatc 587
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 656/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgctgc 1349 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1289 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1229 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 869 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 868 atcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacag 809 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 808 ctctcttaatc 798
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 653/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgsscc 1411 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaa 1291 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 tacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagcta 1051 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 931 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 871 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 870 ctctcttaatc 860
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 653/669 (97%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcccc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaa 668 ||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaa 752
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 654/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1470 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1411 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1410 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1352 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1292 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1291 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaa 1232 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1172 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1112 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 taaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1052 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 992 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggt 932 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 931 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 872 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 871 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 812 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 811 ctctcttaatc 801
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 605/607 (99%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 604/607 (99%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1271 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1211 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1151 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1091 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1031 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 791 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 731 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 730 cttaatc 724
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 611/617 (99%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatc 694
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 611/617 (99%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatc 694
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 652/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1379 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1320 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1319 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1261 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtg 1201 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1200 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaa 1141 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1081 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 cacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1021 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 961 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 901 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 841 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 781 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 780 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 721 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 720 ctctcttaatc 710
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 652/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1240 cattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 caccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 652/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagct 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 652/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1517 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttc 1458 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1457 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1399 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1339 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1338 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1279 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 agatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1219 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1159 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1158 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagct 1099 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1039 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 979 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 978 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 919 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 859 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 858 ctctcttaatc 848
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 633/647 (97%), Gaps = 1/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1330 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1271 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1270 caggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1211 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggc 1151 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 atatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccag 1091 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1031 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1030 tcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 971 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 911 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 851 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 850 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 791 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 790 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctctt 744
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 651/671 (97%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1399 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1340 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1339 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1281 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1280 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtg 1221 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1220 catttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaa 1161 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1101 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1041 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 981 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 921 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 861 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 860 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 801 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 800 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 741 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 740 ctctcttaatc 730
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 650/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 820 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 649/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 atctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1343 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | Sbjct: 1342 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtc 1284 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 924 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 923 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 864 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 863 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaa 804 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaatacag 744 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 743 ctctcttaatc 733
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 609/619 (98%), Gaps = 1/619 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 111 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag- 1289 Query: 112 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 171 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 172 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 231 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 232 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 292 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 352 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 412 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 472 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 532 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 591 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 592 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 651 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 652 aaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatc 730
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 1/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atc 1286 Query: 115 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 174 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 234 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 235 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 295 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 355 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 415 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 475 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 535 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 594 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 595 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 654 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 655 tacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaatc 730
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/617 (98%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1287 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatc 730
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 650/671 (96%), Gaps = 4/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124755 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 124696 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 124695 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 124637 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caa 124399 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124279 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124278 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124219 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 124218 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 124159 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124158 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 124099 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 124098 ctctcttaatc 124088 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 650/671 (96%), Gaps = 4/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30228 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 30169 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 30168 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 30110 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caa 29872 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29752 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29751 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29692 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 29691 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 29632 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29631 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 29572 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 29571 ctctcttaatc 29561
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 648/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 820 atcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 603/613 (98%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737 Query: 654 atacagctctctt 666 ||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctctt 724
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 623/640 (97%), Gaps = 1/640 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 90 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 91 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 150 ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 151 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 211 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 270 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 271 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 330 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 331 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 391 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 451 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 511 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 571 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 630 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 631 aggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 769 aggaactcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatc 730
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 607/619 (98%), Gaps = 1/619 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 112 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 171 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 172 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 231 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 232 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 292 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 351 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 352 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 412 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 472 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 532 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 591 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 592 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 651 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 652 aaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatc 730
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/617 (98%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1305 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 764 atacagctctcttaatc 748
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 646/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55469 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55410 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 55409 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 55351 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54991 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54990 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54931 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 54930 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 54871 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54870 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 54811 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 54810 ctcttttaatc 54800
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 646/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125810 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 125751 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 125750 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 125692 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 125332 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 125331 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 125272 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 125271 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 125212 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125211 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 125152 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 125151 ctcttttaatc 125141 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 646/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30750 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 30691 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 30690 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 30632 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 300 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30211 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 30152 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30151 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 30092 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 30091 ctcttttaatc 30081
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 643/667 (96%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 accggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 63 |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 accgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1356 Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1355 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1297 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1237 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1236 tccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagat 1177 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1176 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1117 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1057 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 atcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacc 997 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 937 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 936 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 877 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 876 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 817 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 816 ccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 757 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 756 cttaatc 750
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 643/667 (96%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1344 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1343 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1285 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 925 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 924 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 865 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 805 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 804 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatag 745 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 744 ctctctt 738
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 646/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527151 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 33527210 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 33527211 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 33527269 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 33527629 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33527630 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 33527689 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 33527690 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 33527749 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527750 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 33527809 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 33527810 ctcttttaatc 33527820 Score = 190 bits (96), Expect = 4e-45 Identities = 105/108 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 563 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 622 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 623 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatc 39115365
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 646/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72348 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 72407 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 72408 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 72466 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 72826 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 72827 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 72886 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 72887 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 72946 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72947 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 73006 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 73007 ctcttttaatc 73017
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 646/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55448 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55389 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 55388 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 55330 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54970 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54969 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54910 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 54909 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 54850 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54849 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 54790 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 54789 ctcttttaatc 54779
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatc 714
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatc 714
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 820 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 760 ctcttttaatc 750
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55521 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55462 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 55461 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 55403 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 54923 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54922 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 54863 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 54862 ctcttttaatc 54852
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55521 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55462 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 55461 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 55403 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 54923 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54922 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 54863 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 54862 ctcttttaatc 54852
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 612/628 (97%), Gaps = 1/628 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 102 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 103 cgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 162 |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1240 Query: 163 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 222 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1180 Query: 223 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 282 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1120 Query: 283 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 342 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1060 Query: 343 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 402 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1059 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttc 1000 Query: 403 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 462 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 463 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 523 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 582 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 820 Query: 583 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 642 | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 actagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaa 760 Query: 643 ttctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 ttctctcgcaaatacagctctcttaatc 732
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124837 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 124778 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 124777 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 124719 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 480 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>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124837 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 124778 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 124777 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 124719 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124299 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 124298 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 124239 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124238 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 124179 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 124178 ctcttttaatc 124168 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30256 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 30197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 30196 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 30138 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29718 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 29717 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 29658 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29657 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 29598 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 29597 ctcttttaatc 29587
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55513 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55454 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 55453 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 55395 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55035 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55034 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54975 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 54974 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 54915 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 54914 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 54855 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 54854 ctcttttaatc 54844
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 820 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 760 ctcttttaatc 750
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 621/640 (97%), Gaps = 1/640 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 90 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 91 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 150 ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 151 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 211 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 270 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 271 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 330 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 331 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 391 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 451 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 511 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 571 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 630 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 631 aggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 aggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatc 730
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 642/667 (96%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 820 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatag 761 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 760 ctctctt 754
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 642/667 (96%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 atctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1347 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1346 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1288 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1287 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1228 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1227 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1168 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1167 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1108 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1048 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 988 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 928 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 927 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 868 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 808 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 807 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatag 748 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 747 ctctctt 741
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 642/667 (96%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 atctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1345 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1344 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1286 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1285 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1226 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1225 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1166 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1165 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1106 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1046 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 986 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 926 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 925 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 866 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 806 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 805 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatag 746 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 745 ctctctt 739
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1334 atctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagttc 1275 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1274 agggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1216 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 1215 cttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtg 1156 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1155 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaa 1096 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1095 agatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataa 1036 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 caccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 976 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 916 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 856 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 855 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 796 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 736 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 735 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacag 676 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 675 ctctcttaatc 665
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 642/667 (96%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1359 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1358 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1300 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1299 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1240 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1239 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1180 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1179 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1120 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1060 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1000 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 940 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 939 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 880 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 820 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 819 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatag 760 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 759 ctctctt 753
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53723 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 53664 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 53663 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 53605 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 53245 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 53244 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 53185 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 53184 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 53125 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53124 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 53065 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 53064 ctcttttaatc 53054
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128656 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 128597 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 128596 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 128538 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 128178 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 128177 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 128118 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 128117 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 128058 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128057 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 127998 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 127997 ctcttttaatc 127987
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347331 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 10347272 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 10347271 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 10347213 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10346853 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10346852 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10346793 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 10346792 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 10346733 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10346732 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 10346673 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 10346672 ctcttttaatc 10346662
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1415 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1414 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1356 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 996 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 995 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 936 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 935 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 876 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 875 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 816 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 815 ctcttttaatc 805
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1158 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1157 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1099 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 739 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 738 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 679 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 678 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 619 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 618 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 559 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 558 ctcttttaatc 548
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353370 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 10353311 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 10353310 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 10353252 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10352892 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10352891 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10352832 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 10352831 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 10352772 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10352771 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 10352712 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 10352711 ctcttttaatc 10352701
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1806 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1747 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1746 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1688 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1328 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1327 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1268 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 1208 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1207 atcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 1148 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 1147 ctcttttaatc 1137
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 645/671 (96%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1839 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1780 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1779 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1721 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1361 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1360 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1301 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1300 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 1241 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1240 accccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 1181 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 1180 ctcttttaatc 1170 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 29/30 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 81 tcggataatttcattaccttcgcgagcaag 110 ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaag 1917
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatata 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 605/619 (97%), Gaps = 1/619 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1290 Query: 112 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 171 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 172 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 231 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 232 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 292 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 351 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 352 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 412 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 471 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 472 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 532 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 591 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 592 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 651 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 652 aaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||| |||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatc 731
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 598/611 (97%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1109 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 748 ctctcttaatc 738
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 582/589 (98%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 141 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 142 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 202 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 261 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 262 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 322 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 382 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 442 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 502 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 562 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 622 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 712
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 603/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 |||||||||| |||||| Sbjct: 747 atacagctcttttaatc 731
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 582/589 (98%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 141 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 142 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 202 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 261 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 262 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 322 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 382 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 442 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 502 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 562 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 622 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 712
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 600/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 118 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 178 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 237 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 238 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1123 Query: 298 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 358 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 418 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 478 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 537 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 538 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 597 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 598 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 657 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 658 agctctcttaatc 670 ||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatc 750
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 603/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatc 720
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 641/667 (96%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 820 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatag 761 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 760 ctctctt 754
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgtccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1287 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1227 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1226 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1167 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1107 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1047 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 747 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 746 cttaatc 740
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 604/619 (97%), Gaps = 1/619 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1294 Query: 112 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 171 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 172 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 231 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 232 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 291 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 292 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 352 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 412 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 471 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 472 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 532 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 591 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 592 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 651 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 652 aaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||| Sbjct: 753 aaatacagctctcttaatc 735
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 625/647 (96%), Gaps = 1/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1325 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 786 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 785 tgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 739
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1325 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtca 786 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 654 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 785 tgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatc 714
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 596/609 (97%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgccct 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgccct 1269 Query: 122 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1209 Query: 182 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 241 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1208 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1149 Query: 242 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 302 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1029 Query: 362 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 422 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 481 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 482 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 541 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 542 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 601 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 602 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 661 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 662 ctcttaatc 670 ||||||||| Sbjct: 728 ctcttaatc 720
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 640/667 (95%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1391 atctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttc 1332 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1331 aggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcc 1273 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 1272 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtg 1213 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1212 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaa 1153 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| Sbjct: 1152 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataa 1093 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1092 cacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaa 1033 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 973 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 913 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 912 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 853 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 852 gaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 793 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 792 atcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 733 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 732 ctctctt 726
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 640/667 (95%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1240 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 820 atcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 760 ctctctt 754
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 643/671 (95%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614561 atctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttc 5614502 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 5614501 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 5614443 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614083 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614082 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 5614023 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 5614022 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 5613963 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5613962 atcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 5613903 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 5613902 ctcttttaatc 5613892 Score = 640 bits (323), Expect = e-180 Identities = 357/367 (97%), Gaps = 1/367 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13436805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 13436745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 13436744 cttaatc 13436738 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 463 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 523 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 582 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 583 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 106 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 278 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 329 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.59 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 247 ggtcagagctggcatatgccaa 268 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 644/671 (95%), Gaps = 3/671 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203575 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 23203634 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 23203635 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 23203693 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 23204052 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23204053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 23204112 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 23204113 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 23204172 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23204173 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 23204232 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 23204233 ctcttttaatc 23204243 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 110 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 110 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 644/671 (95%), Gaps = 3/671 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154223 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 154282 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 154283 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 154341 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 154700 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 154701 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 154760 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 154761 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 154820 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154821 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 154880 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 154881 ctcttttaatc 154891
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 644/671 (95%), Gaps = 3/671 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38337 atctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 38396 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 38397 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 38455 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38814 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38815 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38874 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 38875 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 38934 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38935 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 38994 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 38995 ctcttttaatc 39005
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 643/671 (95%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614550 atctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttc 5614491 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 5614490 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 5614432 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614072 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614071 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 5614012 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 5614011 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 5613952 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5613951 atcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 5613892 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 5613891 ctcttttaatc 5613881 Score = 640 bits (323), Expect = e-180 Identities = 357/367 (97%), Gaps = 1/367 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13391079 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13391078 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 13391019 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 13391018 cttaatc 13391012 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 463 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 523 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 582 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 583 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 106 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 278 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 329 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.59 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 247 ggtcagagctggcatatgccaa 268 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 643/671 (95%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38324 atctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttc 38383 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 38384 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 38442 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38802 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38803 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38862 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 38863 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 38922 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38923 atcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 38982 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 38983 ctcttttaatc 38993
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 603/619 (97%), Gaps = 1/619 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 112 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 171 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 172 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 231 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 232 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 291 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 292 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 351 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 352 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 412 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 471 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 472 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 532 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 591 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 592 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 651 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 652 aaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatc 730
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 605/622 (97%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 108 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 109 agnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 168 || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 ag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 169 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 228 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 229 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 288 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 289 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 349 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 408 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 409 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 468 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 469 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 529 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 588 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 589 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 648 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 649 cgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaatc 750
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 618/640 (96%), Gaps = 1/640 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 86 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 87 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 146 ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 147 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 206 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 207 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 266 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 267 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 326 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1094 Query: 327 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 387 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacat 974 Query: 447 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 507 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 566 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 567 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 626 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 627 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 754
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 593/607 (97%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 623/647 (96%), Gaps = 1/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1386 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagctg 1327 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 848 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 847 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 788 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 787 tgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 741
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 598/614 (97%), Gaps = 1/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 117 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 176 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 177 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 236 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 237 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 296 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 297 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 357 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 416 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 417 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 476 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 477 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 537 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 596 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 597 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 656 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 657 cagctctcttaatc 670 |||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatc 711
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 598/614 (97%), Gaps = 1/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 117 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 176 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 177 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 236 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 237 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 296 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 297 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 357 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 416 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 417 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 476 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 477 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 537 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 596 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 597 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 656 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 657 cagctctcttaatc 670 |||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatc 711
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 595/611 (97%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1109 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 660 ctctcttaatc 670 |||| |||||| Sbjct: 748 ctcttttaatc 738
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 600/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1287 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatc 730
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 597/613 (97%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1292 Query: 118 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 177 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1232 Query: 178 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 237 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1231 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1172 Query: 238 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1112 Query: 298 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 357 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1052 Query: 358 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 992 Query: 418 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 478 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 538 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 597 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 598 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 657 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 752 Query: 658 agctctcttaatc 670 ||||||||||||| Sbjct: 751 agctctcttaatc 739
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 641/671 (95%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 atctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1301 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtg 1241 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1240 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaa 1181 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaa 1061 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 tataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgcta 941 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggtga 821 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 820 atcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 761 Query: 660 ctctcttaatc 670 ||||||||||| Sbjct: 760 ctctcttaatc 750
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 623/648 (96%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctc 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctt 1252 Query: 83 ggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 142 |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1193 Query: 143 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 202 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1192 gcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1133 Query: 203 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 262 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1132 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcata 1073 Query: 263 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 322 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 tgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1013 Query: 323 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 382 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 tgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 953 Query: 383 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 893 Query: 443 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 502 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 atatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 833 Query: 503 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 562 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 832 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattg 773 Query: 563 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 622 ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 772 tcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgc 713 Query: 623 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| Sbjct: 712 attacaataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaatc 665
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 638/667 (95%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 atctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1330 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 119 ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1329 aggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1271 Query: 120 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 179 ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1211 Query: 180 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 239 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1210 cattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaa 1151 Query: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1150 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1091 Query: 300 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1090 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaa 1031 Query: 360 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 971 Query: 420 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 479 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 911 Query: 480 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 910 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 851 Query: 540 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 850 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 791 Query: 600 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 659 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 790 atcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacag 731 Query: 660 ctctctt 666 ||||||| Sbjct: 730 ctctctt 724
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 601/619 (97%), Gaps = 1/619 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1296 Query: 112 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 171 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 172 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 231 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 232 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 292 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 352 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 411 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 412 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 471 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 472 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 532 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 591 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 592 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 651 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 652 aaatacagctctcttaatc 670 |||||| ||||| |||||| Sbjct: 755 aaatacggctcttttaatc 737
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 598/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 654 atacagctctcttaa 668 ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaa 722
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 603/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctctt 666 | |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 599/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1291 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 atacagctctcttaatc 734
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 588/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 664 ctt 666 ||| Sbjct: 744 ctt 742
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 588/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 664 ctt 666 ||| Sbjct: 744 ctt 742
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 591/607 (97%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1295 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1235 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1234 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagat 1175 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1115 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1055 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 815 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 755 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 754 cttaatc 748
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 605/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1136 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1076 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1075 cngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1016 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aagcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 956 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cacgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 896 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 716 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 tagtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 656 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 655 ccctcgcaaatacagctctcttaatc 630
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 597/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 654 atacagctctcttaa 668 ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaa 722
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 624/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1281 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 921 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 801 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatc 750
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 605/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatc 720
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 602/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctctt 666 | |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 577/589 (97%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 141 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 142 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 202 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 261 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 262 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 322 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 382 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 442 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 502 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 562 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 621 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 622 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 709
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 577/589 (97%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 141 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 142 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 202 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 261 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 262 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 322 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 382 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 442 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 502 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 562 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 621 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 622 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 709
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 615/640 (96%), Gaps = 1/640 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 86 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 87 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 146 ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1258 Query: 147 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 206 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1198 Query: 207 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 266 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1138 Query: 267 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 326 |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 aaacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgag 1078 Query: 327 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1018 Query: 387 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1017 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 958 Query: 447 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 507 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 566 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 838 Query: 567 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 626 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 837 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 778 Query: 627 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 777 caataggagcccctaattccctcgcaaatatagctctctt 738
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 590/607 (97%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 590/607 (97%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 590/607 (97%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1267 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 gttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1207 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1206 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1147 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1146 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1087 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 cggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1027 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 726 cttaatc 720
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 623/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1281 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 921 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 801 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatc 750
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 604/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatc 720
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 601/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctctt 666 | |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 594/613 (96%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748 Query: 654 atacagctctctt 666 ||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctctctt 735
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 581/596 (97%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 134 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1270 Query: 135 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 194 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1269 gtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1210 Query: 195 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 254 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagag 1150 Query: 255 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1149 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaa 1090 Query: 315 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 1030 Query: 375 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 970 Query: 435 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 495 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 555 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 614 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 615 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 734
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 589/607 (97%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 124 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 184 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 244 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 303 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 304 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaa 1045 Query: 364 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 423 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 424 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 483 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 484 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 603 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 604 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 663 ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctct 745 Query: 664 cttaatc 670 ||||||| Sbjct: 744 cttaatc 738
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 622/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 1340 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 801 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatc 750
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 622/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58272 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58213 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58212 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57734 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 57733 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57674 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 57673 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatc 57623
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 622/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 120480 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 120421 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120420 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 119942 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 119941 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 119882 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct: 119881 tgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatc 119831
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 598/619 (96%), Gaps = 1/619 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1279 Query: 112 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 171 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 172 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 231 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 232 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 292 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 351 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 352 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 412 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 471 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 472 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 531 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 532 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 591 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 592 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 651 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 652 aaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatc 720
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 622/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58282 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58223 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58222 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57744 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 57743 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57684 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 57683 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatc 57633
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 622/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58853 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58794 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58793 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 58315 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 58314 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 58255 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct: 58254 tgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatc 58204
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 530/530 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 141 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 201 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 261 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 321 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 381 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1875 Query: 441 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1874 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1815 Query: 501 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1814 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 1755 Query: 561 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1754 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 1695 Query: 621 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1694 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 1645
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 586/604 (97%), Gaps = 1/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgtt 126 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgtt 1274 Query: 127 acgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 186 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1273 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1214 Query: 187 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1213 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1154 Query: 247 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1153 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctgg 1094 Query: 307 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1034 Query: 367 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 427 tactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 486 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 487 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 547 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 606 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 607 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctt 734 Query: 667 aatc 670 |||| Sbjct: 733 aatc 730
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 603/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatc 720
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 596/617 (96%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737 Query: 654 atacagctctcttaatc 670 ||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatc 720
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 592/612 (96%), Gaps = 1/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atc 1306 Query: 115 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 234 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 235 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 295 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 354 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 355 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 415 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 474 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 475 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 534 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 535 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 594 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 595 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 654 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 655 tacagctctctt 666 || ||||||||| Sbjct: 765 tatagctctctt 754
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 602/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatc 720
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 602/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatc 720
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 602/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaag 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 745 ctctcgcaaatgcagctctcttaatc 720
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 599/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttccc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctctt 666 | |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 592/613 (96%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 117 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1283 Query: 118 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 177 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccagg 1223 Query: 178 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 237 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1222 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1163 Query: 238 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1103 Query: 298 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttc 1043 Query: 358 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 983 Query: 418 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 477 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 478 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 538 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 597 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 598 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 657 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 743 Query: 658 agctctcttaatc 670 ||||||||||||| Sbjct: 742 agctctcttaatc 730
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 592/613 (96%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1277 Query: 114 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 173 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 174 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 234 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 293 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 294 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 353 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 354 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 413 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 414 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 473 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 474 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 533 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 534 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 593 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 594 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 653 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 654 atacagctctctt 666 ||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctctt 724
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 576/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 134 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 135 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 194 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 195 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 254 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 255 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 315 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 374 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 375 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 435 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 494 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 495 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 555 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 614 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 615 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctctt 697
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 576/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 134 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 135 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 194 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 195 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 254 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 255 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 315 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 374 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 375 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 435 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 494 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 495 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 555 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 614 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 615 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctctt 697
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 617/647 (95%), Gaps = 1/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1836 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1777 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1776 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtaca 1718 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1717 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1658 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1657 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1598 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1597 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1538 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1478 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1477 tcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 1418 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 tggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1358 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1357 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1298 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1297 ttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 1238 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 1237 tgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatatagctctctt 1191
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 590/611 (96%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatca 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcg 1248 Query: 116 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1247 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1188 Query: 176 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 235 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1187 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1128 Query: 236 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1127 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1068 Query: 296 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 355 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1008 Query: 356 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 948 Query: 416 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 475 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 476 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 535 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 536 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 595 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 596 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 655 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 708 Query: 656 acagctctctt 666 | ||||||||| Sbjct: 707 atagctctctt 697
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 3/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 103 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 104 gagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 163 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 1227 Query: 164 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 223 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 gctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1167 Query: 224 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 283 || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1166 acggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccct 1107 Query: 284 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 343 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1047 Query: 344 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 403 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1046 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 987 Query: 404 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 463 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 cgctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 464 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 523 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 524 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 583 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 584 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 643 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaat 747 Query: 644 tctctcgcaaatacagctctctt 666 || |||||||||||||||||||| Sbjct: 746 tccctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 620/651 (95%), Gaps = 1/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 79 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1788 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1729 Query: 80 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 139 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1728 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 140 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 199 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 200 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 260 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 319 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 320 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 379 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 380 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 439 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 440 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 499 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 500 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1309 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1250 Query: 560 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 619 |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1249 ttgtcgcggcaataataagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 1190 Query: 620 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| Sbjct: 1189 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaatc 1139
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 565/578 (97%), Gaps = 1/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 89 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 148 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 1219 Query: 149 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 208 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1159 Query: 209 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 268 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1099 Query: 269 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 328 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 acatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1039 Query: 329 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 388 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 979 Query: 389 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 448 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 978 cctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatga 919 Query: 449 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 859 Query: 509 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 799 Query: 569 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 628 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattaca 739 Query: 629 ataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 666 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 738 ataggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctctt 701
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 598/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctctt 666 | |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 598/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctctt 666 | |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 601/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 cccttgcaaatacagctctcttaatc 720
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 601/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 164 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 165 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 224 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 225 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 284 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 285 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 344 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 345 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 404 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 405 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 465 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 525 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 584 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 585 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 644 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 645 ctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatc 720
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 588/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1285 Query: 118 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1284 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1225 Query: 178 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 237 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1224 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1165 Query: 238 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1164 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1105 Query: 298 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 357 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1045 Query: 358 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 985 Query: 418 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 477 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 925 Query: 478 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 537 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 865 Query: 538 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 597 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 805 Query: 598 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 657 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 745 Query: 658 agctctctt 666 ||||||||| Sbjct: 744 agctctctt 736
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 604/631 (95%), Gaps = 1/631 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 99 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 100 tcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 159 || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaag-atctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccg 1243 Query: 160 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 219 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 gttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1183 Query: 220 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 279 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1123 Query: 280 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 339 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1122 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagatacc 1063 Query: 340 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 399 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 gcgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1003 Query: 400 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccaga 943 Query: 460 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 519 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaat 883 Query: 520 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 579 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 882 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 823 Query: 580 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 639 |||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 caaactagtatttgcggtgaatcctcctgttatgtagtcatgcattacaataggaacccc 763 Query: 640 taattctctcgcaaatacagctctcttaatc 670 |||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 762 taattccctcgcaaatacagctctcttaatc 732 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,845,778 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4845778 Number of successful extensions: 136390 Number of sequences better than 10.0: 15331 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15285 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 60 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 94336 Number of HSP's gapped (non-prelim): 23140 length of query: 670 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 647 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11091713614488 effective search space used: 11091713614488 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)