Clone Name | rbasd1k17 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1407 bits (710), Expect = 0.0 Identities = 733/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1407 bits (710), Expect = 0.0 Identities = 733/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1407 bits (710), Expect = 0.0 Identities = 733/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 732/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1396 bits (704), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1394 bits (703), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagst 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0 Identities = 731/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1388 bits (700), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1388 bits (700), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1386 bits (699), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagga 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 730/737 (99%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1382 bits (697), Expect = 0.0 Identities = 729/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnnt 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1382 bits (697), Expect = 0.0 Identities = 729/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccnnngtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 729/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 729/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 729/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 729/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 729/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1374 bits (693), Expect = 0.0 Identities = 728/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1372 bits (692), Expect = 0.0 Identities = 727/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 727/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 728/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 728/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 728/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1368 bits (690), Expect = 0.0 Identities = 727/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaar-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||| |||||||||| Sbjct: 750 ttcaccagtttcggcct 734
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 727/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1356 bits (684), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1356 bits (684), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1420 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1419 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1361 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1301 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1241 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1181 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1121 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1061 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1001 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 941 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 881 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 880 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 821 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 762 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 761 ttcaccggtttcggcct 745
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||| |||||||||| Sbjct: 750 ttcaccagtttcggcct 734
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggta 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||| |||||||||| Sbjct: 750 ttcaccagtttcggcct 734
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56329 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 56270 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 56269 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 56211 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56210 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 56151 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56150 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 56091 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56090 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 56031 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56030 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55971 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55970 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55911 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55910 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55851 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55850 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 55791 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55790 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 55731 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 55730 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 55671 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55670 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 55612 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 55611 ttcaccggtttcggcct 55595
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 726/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1515 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1456 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1455 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1397 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1337 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1277 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1217 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1157 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1097 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1037 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 977 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 917 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 916 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 857 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 856 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 798 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 797 ttcaccggtttcggcct 781
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagat 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1346 bits (679), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 931 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 871 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 812 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttcaccggtttcggcct 795
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 931 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 871 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 812 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttcaccggtttcggcct 795
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 931 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 871 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 812 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttcaccggtttcggcct 795
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 931 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 871 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 812 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttcaccggtttcggcct 795
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 725/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1340 bits (676), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaanacn 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccctttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1340 bits (676), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggta 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||| |||||||||| Sbjct: 750 ttcaccagtttcggcct 734
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1340 bits (676), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1338 bits (675), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 931 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 871 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 812 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttcaccggtttcggcct 795
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1198 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1197 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 779 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 719 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 718 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtg 659 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 658 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 599 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 598 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 540 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 539 ttcaccggtttcggcct 523
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1198 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1197 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 779 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 719 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 718 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtg 659 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 658 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 599 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 598 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 540 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 539 ttcaccggtttcggcct 523
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 935 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 875 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 816 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 815 ttcaccggtttcggcct 799
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1328 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1327 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1269 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1209 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1149 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1089 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1029 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 969 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 909 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 849 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 789 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 729 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 728 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 670 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 669 ttcaccggtttcggcct 653
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 724/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||| |||||||||| Sbjct: 750 ttcaccagtttcggcct 734
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1334 bits (673), Expect = 0.0 Identities = 721/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1332 bits (672), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 931 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 871 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 812 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttcaccggtttcggcct 795
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1332 bits (672), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 935 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 875 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 816 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 815 ttcaccggtttcggcct 799
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1330 bits (671), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 931 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 871 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 gctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 812 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 811 ttcaccggtttcggcct 795
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1330 bits (671), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1330 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1329 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1271 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 971 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 911 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 851 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 791 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 731 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 730 gctctcttcatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 672 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 671 ttcaccggtttcggcct 655
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1330 bits (671), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgccc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1337 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1336 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1278 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 978 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 918 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 858 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 tgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 798 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 797 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 738 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 737 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 679 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 678 ttcaccggtttcggcct 662
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1337 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1336 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1278 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 978 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 918 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 858 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 tgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 798 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 797 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 738 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 737 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 679 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 678 ttcaccggtttcggcct 662
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||| |||||||||| Sbjct: 750 ttcaccagtttcggcct 734
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 tatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1330 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1329 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1271 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 971 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 911 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 851 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggta 791 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 731 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 730 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 672 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||| |||||||||| Sbjct: 671 ttcaccagtttcggcct 655
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1328 bits (670), Expect = 0.0 Identities = 723/737 (98%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggcct 734
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1324 bits (668), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 935 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 875 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 816 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 815 ttcaccggtttcggcct 799
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1320 bits (666), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1320 bits (666), Expect = 0.0 Identities = 722/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcggcc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 721/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggt 1355 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 935 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 875 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 816 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 815 ttcaccggtttcggcct 799
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 721/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1198 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1197 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggt 1079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 779 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 719 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 718 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtg 659 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 658 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 599 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 598 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 540 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 539 ttcaccggtttcggcct 523
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1310 bits (661), Expect = 0.0 Identities = 718/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgssc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1111 ttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagct 1052 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 872 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 813 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 812 ttcaccggtttcggcct 796
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1308 bits (660), Expect = 0.0 Identities = 719/735 (97%), Gaps = 3/735 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgctg 1350 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 870 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 aatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaataca 810 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 809 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 751 Query: 720 ttcaccggtttcggc 734 ||||||||||||||| Sbjct: 750 ttcaccggtttcggc 736
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0 Identities = 719/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgccc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 669/672 (99%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 668/672 (99%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1271 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1211 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1151 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1091 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1031 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 791 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 731 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 730 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 672 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 671 cggtttcggcct 660
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 717/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1471 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1412 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1411 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1353 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1293 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1292 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1233 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1173 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1113 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1053 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 993 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 992 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacgg 933 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 932 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 873 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 872 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 813 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 812 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 754 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 753 ttcaccggtttcggcct 737
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 675/682 (98%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 652 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 651 ttgatttcaccggtttcggcct 630
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 675/682 (98%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 652 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 651 ttgatttcaccggtttcggcct 630
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 715/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1380 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1321 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1320 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1262 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggt 1202 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1201 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacca 1142 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1082 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 acacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1022 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 962 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 902 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 842 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 782 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 722 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 721 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 663 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 662 ttcaccggtttcggcct 646
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 715/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 715/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagc 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 715/737 (97%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1518 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagtt 1459 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1458 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1400 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1340 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1339 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1280 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1220 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1160 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1159 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagc 1100 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1040 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 980 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 979 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 920 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 860 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 859 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 801 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 800 ttcaccggtttcggcct 784
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 714/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1341 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1340 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1282 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggt 1222 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1221 gcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1162 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1102 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1042 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 862 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 802 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 801 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 742 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 741 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 683 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 682 ttcaccggtttcggcct 666
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 673/684 (98%), Gaps = 2/684 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag- 1289 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 472 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 473 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 533 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 592 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 593 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 652 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 653 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 712 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 713 ccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 689 ccttgatttcaccggtttcggcct 666
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 671/682 (98%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1287 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 688 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 687 ttgatttcaccggtttcggcct 666
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1249 bits (630), Expect = 0.0 Identities = 713/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 667/678 (98%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 595 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 596 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 655 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 656 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 715 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 687 Query: 716 tgatttcaccggtttcgg 733 |||||||||||||||||| Sbjct: 686 tgatttcaccggtttcgg 669
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 712/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgt 1285 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1225 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1224 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1165 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1164 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1105 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1045 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 985 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 925 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 924 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 865 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 864 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggta 805 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaataca 745 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 686 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 685 ttcaccggtttcggcct 669
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 662/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 | |||||||||| Sbjct: 685 cagtttcggcct 674
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 681/698 (97%), Gaps = 2/698 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1330 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1271 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1270 caggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1211 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggc 1151 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 atatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccag 1091 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1031 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1030 tcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 971 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 911 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 851 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 850 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 791 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 790 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctcttcatcatttcttca 731 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 718 |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 730 catgtacccgcagttgca-ttcaagtaatgccccttga 694
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 711/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 712/737 (96%), Gaps = 5/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124638 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124637 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124578 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124577 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 124518 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124517 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 124459 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124458 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 124400 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124399 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124280 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124279 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124220 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124219 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124160 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124159 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124100 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 124099 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 124041 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 124040 ttcaccggtttcggcct 124024 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 712/737 (96%), Gaps = 5/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30111 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30110 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30051 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30050 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 29991 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 29990 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 29932 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29931 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 29873 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29872 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29692 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29633 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29632 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 29573 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 29572 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 29514 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 29513 ttcaccggtttcggcct 29497
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 685/705 (97%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 32 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 91 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 92 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 151 ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 152 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 212 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 271 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 272 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 331 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 332 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 392 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 452 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 512 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 572 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 631 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 632 aggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgc 691 |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 769 aggaactcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgc 710 Query: 692 agtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 709 agtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcggcct 666
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 665/679 (97%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttctt 678 ||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttctt 743
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 660/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatata 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 669/684 (97%), Gaps = 2/684 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 472 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 473 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 533 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 592 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 593 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 652 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 653 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 712 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 713 ccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 689 ccttaatttcaccggtttcggcct 666
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 646/654 (98%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 443 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 623 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 683 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 700 tgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 648
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 667/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1305 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 764 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 706 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 || ||||||||||||||||||| Sbjct: 705 ttaatttcaccggtttcggcct 684
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 646/654 (98%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 443 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 623 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 683 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 700 tgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 648
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 667/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatgtcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 659/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgtccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55352 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55351 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55292 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55291 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55232 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55231 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55172 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55171 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55112 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55111 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54992 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54991 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54932 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54931 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54872 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54871 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54812 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54811 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54753 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 54752 ttcaccggtttcggcct 54736
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 666/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 || ||||||||||||||||||| Sbjct: 671 ttaatttcaccggtttcggcct 650
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 125693 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125692 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 125633 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 125632 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 125573 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 125572 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 125513 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125512 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 125453 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125452 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 125333 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125332 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 125273 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 125272 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 125213 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 125212 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 125153 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 125152 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 125094 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 125093 ttcaccggtttcggcct 125077 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30633 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30632 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30573 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30572 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30513 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30512 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 30453 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30452 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 30393 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30392 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 30273 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30272 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 30213 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30212 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 30153 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30152 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 30093 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 30092 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 30034 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 30033 ttcaccggtttcggcct 30017
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 666/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 || ||||||||||||||||||| Sbjct: 671 ttaatttcaccggtttcggcct 650
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcggtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1348 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1347 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1289 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1288 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1229 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1228 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1169 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1168 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1109 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1049 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 989 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 929 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 928 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 869 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 809 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 808 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 749 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 748 gctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 690 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 689 ttcaccggtttcggcct 673
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1286 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1226 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1225 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1166 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1165 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1106 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1046 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 986 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 926 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 806 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 805 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 746 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 gctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 687 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 686 ttcaccggtttcggcct 670
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1346 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1345 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1287 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1286 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1227 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1226 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1167 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1166 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1107 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1047 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 987 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 927 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 926 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 867 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 807 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 806 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 747 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 746 gctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 688 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 687 ttcaccggtttcggcct 671
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1360 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1359 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1301 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1300 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1241 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1240 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1181 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1180 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1121 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1061 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1001 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 941 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 940 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 881 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 821 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 820 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 761 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 760 gctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 702 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 701 ttcaccggtttcggcct 685
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 33527268 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527269 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 33527328 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 33527329 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 33527388 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527389 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 33527448 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527449 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 33527508 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527509 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 33527628 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527629 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 33527688 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 33527689 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 33527748 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527749 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 33527808 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 33527809 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 33527867 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 33527868 ttcaccggtttcggcct 33527884 Score = 280 bits (141), Expect = 6e-72 Identities = 166/173 (95%), Gaps = 1/173 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 564 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 623 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 624 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 683 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcat 39115353 Query: 684 gtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 39115352 gtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcggcct 39115301 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.65 Identities = 41/46 (89%), Gaps = 1/46 (2%) Strand = Plus / Plus Query: 691 cagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 30074767 cagtcgcatt-caagtaatgaaccttaatttaaccggtttcggcct 30074811
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 72465 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72466 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 72525 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 72526 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 72585 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 72586 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 72645 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72646 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 72705 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72706 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 72825 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72826 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 72885 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 72886 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 72945 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 72946 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 73005 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 73006 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 73064 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 73065 ttcaccggtttcggcct 73081
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1209 bits (610), Expect = 0.0 Identities = 708/737 (96%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55331 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55330 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55271 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55270 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55211 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55210 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55151 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55150 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55091 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55090 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54971 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54970 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54911 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54910 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54851 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54850 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54791 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54790 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54732 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 54731 ttcaccggtttcggcct 54715
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 674/693 (97%), Gaps = 2/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 103 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 104 cgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 163 |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1240 Query: 164 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 223 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1180 Query: 224 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 283 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1120 Query: 284 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 343 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1060 Query: 344 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1059 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttc 1000 Query: 404 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 463 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 464 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 524 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 583 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 820 Query: 584 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 643 | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 actagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaa 760 Query: 644 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 703 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 759 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttca 701 Query: 704 agtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 700 agtaatgccccttaatttcaccggtttcggcct 668
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 683/705 (96%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 32 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 91 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 92 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 151 ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 152 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 212 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 271 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 272 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 331 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 332 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 392 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 452 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 512 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 572 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 631 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 632 aggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgc 691 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 769 aggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgc 710 Query: 692 agtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 709 agtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcggcct 666
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 667/684 (97%), Gaps = 2/684 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1290 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 472 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 473 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 533 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 592 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 593 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 652 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 653 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 712 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 691 Query: 713 ccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 690 ccttaatttcaccggtttcggcct 667
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54864 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54863 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54805 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 54804 ttcaccggtttcggcct 54788
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54864 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54863 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54805 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 54804 ttcaccggtttcggcct 54788
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 665/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 689 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 || ||||||||||||||||||| Sbjct: 688 ttaatttcaccggtttcggcct 667
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124240 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124239 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124180 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 124179 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 124121 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 124120 ttcaccggtttcggcct 124104 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 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aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 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>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124240 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124239 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124180 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 124179 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 124121 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 124120 ttcaccggtttcggcct 124104 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29659 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29658 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 29599 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 29598 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 29540 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 29539 ttcaccggtttcggcct 29523
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55396 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55395 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55336 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55335 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55276 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55275 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55216 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55215 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55156 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55155 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55036 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55035 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54976 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54975 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54916 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54915 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54856 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54855 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54797 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 54796 ttcaccggtttcggcct 54780
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 662/678 (97%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 478 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 598 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 599 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 658 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 659 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 718 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 704 Query: 719 tttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||| Sbjct: 703 tttcaccggtttcggcct 686
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 53606 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53605 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 53546 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 53545 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 53486 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 53485 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 53426 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53425 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 53366 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53365 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 53246 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53245 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 53186 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 53185 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 53126 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 53125 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 53066 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 53065 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 53007 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 53006 ttcaccggtttcggcct 52990
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 128539 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128538 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 128479 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 128478 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 128419 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 128418 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 128359 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128358 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 128299 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128298 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 128179 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 128118 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 128059 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 128058 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 127999 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 127998 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 127940 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 127939 ttcaccggtttcggcct 127923
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10347214 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347213 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10347154 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10347153 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10347094 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347093 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10347034 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347033 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10346974 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346973 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10346793 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10346734 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10346733 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 10346674 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 10346673 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 10346615 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 10346614 ttcaccggtttcggcct 10346598
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1357 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1297 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1296 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1237 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1236 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1177 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1117 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 936 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 877 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 876 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 817 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 816 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 758 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 757 ttcaccggtttcggcct 741
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1100 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1040 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1039 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 980 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 979 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 920 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 860 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 800 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 740 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 739 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 680 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 679 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 620 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 619 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 560 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 559 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 501 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 500 ttcaccggtttcggcct 484
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10353253 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353252 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10353193 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10353192 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10353133 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353132 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10353073 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353072 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10353013 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353012 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10352893 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352892 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10352833 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10352832 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10352773 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10352772 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 10352713 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 10352712 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 10352654 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 10352653 ttcaccggtttcggcct 10352637
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1689 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1688 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1629 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1628 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1569 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1568 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1509 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1449 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1448 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1329 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1269 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 1209 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1208 aatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1149 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 1090 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ttcaccggtttcggcct 1073
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 707/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1722 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1721 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1662 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1661 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1602 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1601 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1542 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1482 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1301 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 1242 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1241 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1182 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1181 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 1123 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 1122 ttcaccggtttcggcct 1106 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.003 Identities = 29/30 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tcggataatttcattaccttcgcgagcaag 111 ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaag 1917
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 705/735 (95%), Gaps = 3/735 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1392 tatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagtt 1333 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1332 caggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1274 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 914 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 913 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 854 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 853 tgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 794 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 793 aatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 734 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 733 gctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 675 Query: 720 ttcaccggtttcggc 734 ||||||||||||||| Sbjct: 674 ttcaccggtttcggc 660
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 657/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1287 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1227 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1226 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1167 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1107 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1047 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 747 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 746 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 688 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 687 cggtttcggcct 676
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 666/684 (97%), Gaps = 2/684 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1294 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 472 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 473 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 533 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 592 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 593 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 652 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 653 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 712 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 753 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 695 Query: 713 ccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 694 ccttaatttcaccggtttcggcct 671
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 690/716 (96%), Gaps = 2/716 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1325 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 786 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 785 tgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatcttcg 726 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 725 catgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 671
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 705/735 (95%), Gaps = 3/735 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggc 734 ||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggc 688
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 659/676 (97%), Gaps = 2/676 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 120 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1109 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 421 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 480 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 600 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 601 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 660 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 661 ctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatt 720 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 748 ctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaaataatgccccttaatt 690 Query: 721 tcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||| Sbjct: 689 tcaccggtttcggcct 674
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 706/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttcatcatttcttcgactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 702 ttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 706/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1335 tatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagtt 1276 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1275 cagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1217 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1157 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1097 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1037 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 acaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 977 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 857 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 797 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 737 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 736 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaataca 677 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 676 gctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagttgca-ttcaagtaatgccccttgat 618 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 617 ttcaccggtttcggcct 601
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 658/674 (97%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgccct 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgccct 1269 Query: 123 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1209 Query: 183 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 242 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1208 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1149 Query: 243 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 303 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1029 Query: 363 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 423 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 482 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 483 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 542 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 543 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 602 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 603 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 662 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 663 ctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttc 722 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 728 ctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttc 670 Query: 723 accggtttcggcct 736 |||||||||||||| Sbjct: 669 accggtttcggcct 656
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 665/684 (97%), Gaps = 2/684 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 472 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 473 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 533 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 592 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 593 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 652 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 653 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 712 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 713 ccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 689 ccttaatttcaccggtttcggcct 666
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 667/687 (97%), Gaps = 2/687 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 50 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 109 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 110 agnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 169 || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 ag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 170 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 229 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 230 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 289 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 290 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 350 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 409 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 410 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 469 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 470 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 530 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 589 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 590 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 649 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 650 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaat 709 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaat 713 Query: 710 gccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 712 gccccttaatttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 663/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 || |||||||||||||| |||| Sbjct: 671 ttaatttcaccggtttcagcct 650
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 705/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614444 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614443 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614384 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614383 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614324 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614323 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614264 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614263 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614204 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614203 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614084 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614083 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614024 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614023 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613964 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613963 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 5613904 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 5613903 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 5613845 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 5613844 ttcaccggtttcggcct 5613828 Score = 729 bits (368), Expect = 0.0 Identities = 418/432 (96%), Gaps = 2/432 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13436805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 13436745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436744 cttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 13436686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 13436685 cggtttcggcct 13436674 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 464 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 523 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tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 7e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.65 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 706/737 (95%), Gaps = 4/737 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 23203692 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203693 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 23203751 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 23203752 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 23203811 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203812 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 23203871 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203872 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 23203931 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203932 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 23204112 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 23204171 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 23204172 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 23204231 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 23204232 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 23204290 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 23204291 ttcaccggtttcggcct 23204307 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 52 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 111 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Score = 111 bits (56), Expect = 3e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 52 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 111 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Score = 61.9 bits (31), Expect = 3e-06 Identities = 44/47 (93%), Gaps = 1/47 (2%) Strand = Plus / Plus Query: 690 gcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 27878461 gcagtcgcatt-caagtaatgctccttaatttcaccggtttcggcct 27878506
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 706/737 (95%), Gaps = 4/737 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 154340 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154341 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 154399 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 154400 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 154459 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 154460 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 154519 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154520 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 154579 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154580 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 154699 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154700 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 154759 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 154760 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 154819 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 154820 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 154879 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 154880 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 154938 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 154939 ttcaccggtttcggcct 154955
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 706/737 (95%), Gaps = 4/737 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38454 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38455 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38513 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38514 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38573 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38574 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38633 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38634 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38693 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38694 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38813 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38814 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38873 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38874 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38933 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 38993 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 38994 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 39052 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 39053 ttcaccggtttcggcct 39069
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 705/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614433 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614432 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614373 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614372 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614313 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614312 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614253 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614252 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614193 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614192 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614073 Query: 480 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>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 705/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38441 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38442 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38501 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38502 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38561 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38562 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38621 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38622 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38681 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38682 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38862 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38921 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38922 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 38981 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 38982 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 39040 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| Sbjct: 39041 ttcaccggtttcggcct 39057
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 655/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 660/679 (97%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 417 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 418 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 477 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 478 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 538 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 597 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 598 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 657 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 658 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 717 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctta 666 Query: 718 atttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||| Sbjct: 665 atttcaccggtttcggcct 647
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 660/679 (97%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 417 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 418 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 477 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 478 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 538 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 597 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 598 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 657 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 658 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 717 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctta 666 Query: 718 atttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||| Sbjct: 665 atttcaccggtttcggcct 647
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 662/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1287 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 688 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 || ||||||||||||||||||| Sbjct: 687 ttaatttcaccggtttcggcct 666
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 659/678 (97%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1292 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1232 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1231 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1172 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1112 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1052 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 992 Query: 419 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 598 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 599 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 658 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 752 Query: 659 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 718 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 751 agctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaa 693 Query: 719 tttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||| Sbjct: 692 tttcaccggtttcggcct 675
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 662/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 662/682 (97%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcgtcgactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcaccggtttcggcct 656
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 682/709 (96%), Gaps = 2/709 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 87 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 88 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1094 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacat 974 Query: 448 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 508 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 567 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 568 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 627 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 628 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 687 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttgttcgcatgtac 734 Query: 688 ccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 733 ctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 686
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 683/711 (96%), Gaps = 2/711 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctc 83 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctt 1252 Query: 84 ggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1193 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1192 gcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1133 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1132 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcata 1073 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 tgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1013 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 tgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 953 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 893 Query: 444 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 503 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 atatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 833 Query: 504 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 832 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattg 773 Query: 564 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 623 ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 772 tcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgc 713 Query: 624 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 683 ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 712 attacaataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcat 653 Query: 684 gtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 652 gtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 603
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 656/676 (97%), Gaps = 2/676 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 120 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1109 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 421 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 480 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 600 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 601 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 660 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 661 ctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatt 720 |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 748 ctcttttaatcatttcttcacatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatt 690 Query: 721 tcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||| Sbjct: 689 tcaccggtttcggcct 674
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 661/682 (96%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1291 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 750 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 692 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 || ||||||||||||||||||| Sbjct: 691 ttaatttcaccggtttcggcct 670
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 703/737 (95%), Gaps = 3/737 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 tatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1331 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1330 caggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1272 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 ccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1212 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1211 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1152 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1151 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1092 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1091 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttca 1032 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 972 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 912 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 911 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 852 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 851 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 792 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 791 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 732 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 731 gctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 673 Query: 720 ttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||| |||| Sbjct: 672 ttcaccggtttcagcct 656
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 666/689 (96%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccagtttcggc 658
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 653/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 653/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 653/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1295 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1235 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1234 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagat 1175 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1115 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1055 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 815 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 755 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 754 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 696 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 695 cggtttcggcct 684
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 662/684 (96%), Gaps = 2/684 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1296 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 472 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 473 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 533 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 592 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 593 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 652 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 653 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 712 |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 755 aaatacggctcttttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 697 Query: 713 ccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 696 ccttgatttcaccggtttcggcct 673
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 686/716 (95%), Gaps = 2/716 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1386 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagctg 1327 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 848 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 847 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 788 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 787 tgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcg 728 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 727 actgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 673
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 594/595 (99%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 142 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 202 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 262 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 322 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 382 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1875 Query: 442 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1874 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1815 Query: 502 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1814 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 1755 Query: 562 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1754 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 1695 Query: 622 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcac 681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1694 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcac 1635 Query: 682 atgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1634 atgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 1581
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 667/691 (96%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 639/654 (97%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 443 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 622 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 623 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 683 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 697 tgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcggcct 645
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 639/654 (97%), Gaps = 2/654 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 443 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 622 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 623 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 683 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 697 tgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcggcct 645
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 660/682 (96%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0 Identities = 665/689 (96%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccagtttcggc 658
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 652/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 652/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 700/735 (95%), Gaps = 3/735 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 atataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 599 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggtg 822 Query: 600 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 659 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 660 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 719 |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 720 ttcaccggtttcggc 734 ||| ||||||||||| Sbjct: 702 ttcgccggtttcggc 688
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 643/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 135 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1270 Query: 136 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 195 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1269 gtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1210 Query: 196 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 255 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagag 1150 Query: 256 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1149 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaa 1090 Query: 316 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 1030 Query: 376 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 970 Query: 436 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 496 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 556 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 615 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 616 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 730 Query: 676 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcc 735 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 729 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcggcc 671 Query: 736 t 736 | Sbjct: 670 t 670
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 651/672 (96%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctct 745 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 685 cggtttcggcct 674
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 657/680 (96%), Gaps = 2/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 689 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggc 734 ||||||||||| |||||||| Sbjct: 688 ttgatttcaccagtttcggc 669
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 665/691 (96%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1136 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1076 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1075 cngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1016 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aagcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 956 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cacgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 896 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 716 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 tagtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 656 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| Sbjct: 655 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaag 597 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 596 taatgccccttgatttcaccggtttctgcct 566
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 651/672 (96%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1267 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 gttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1207 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1206 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1147 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1146 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1087 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 cggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1027 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 726 cttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 668 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 667 cggtttcggcct 656
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 665/691 (96%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 680/711 (95%), Gaps = 2/711 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1281 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 921 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 801 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcg 741 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttc 731 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 740 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccagtttc 691
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 661/686 (96%), Gaps = 2/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttc 731 ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcgccggtttc 661
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 682/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 120480 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 120421 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120420 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 119942 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 119941 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 119882 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119881 tgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcg 119822 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119821 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 119769
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 658/682 (96%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1279 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 472 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 473 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 532 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 533 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 592 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 593 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 652 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 653 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 712 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 680 Query: 713 ccttgatttcaccggtttcggc 734 ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 679 ccttgatttcaccagtttcggc 658
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 658/682 (96%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcaccggtttcggcct 656
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 682/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58853 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58794 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58793 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 58315 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 58314 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 58255 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58254 tgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcg 58195 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58194 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 58142
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 663/689 (96%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccagtttcggc 658
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 664/691 (96%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 656
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 647/669 (96%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgtt 127 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgtt 1274 Query: 128 acgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 187 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1273 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1214 Query: 188 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1213 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1154 Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1153 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctgg 1094 Query: 308 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1034 Query: 368 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 428 tactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 487 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 488 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 548 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 607 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 608 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 667 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctt 734 Query: 668 aatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccgg 727 ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 733 aatcatttcttcacatgtacctgcagttgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccgg 675 Query: 728 tttcggcct 736 ||||||||| Sbjct: 674 tttcggcct 666
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 664/691 (96%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 679/711 (95%), Gaps = 2/711 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1281 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 921 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 801 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcg 741 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttc 731 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 740 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccagtttc 691
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 681/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 1340 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 801 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcg 741 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 740 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccagtttcggc 688
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 681/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58272 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58213 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58212 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57734 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 57733 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57674 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57673 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcg 57614 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 57613 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccagtttcggc 57561
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 654/678 (96%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1283 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccagg 1223 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1222 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1163 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1103 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttc 1043 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 983 Query: 419 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 478 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 598 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 599 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 658 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 743 Query: 659 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 718 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 742 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 684 Query: 719 tttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||| Sbjct: 683 tttcaccggtttcggcct 666
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 681/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58282 atttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctg 58223 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58222 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57744 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 57743 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57684 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57683 tgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcg 57624 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 57623 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccagtttcggc 57571
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 677/709 (95%), Gaps = 2/709 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 87 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 88 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1258 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1198 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1138 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 aaacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgag 1078 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1018 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1017 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 958 Query: 448 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 508 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 567 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 838 Query: 568 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 627 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 837 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 778 Query: 628 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 687 |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 777 caataggagcccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgtac 718 Query: 688 ccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 717 cgcaagtcgca-ttcaagtaatgtcccttgatttcaccggtttcggcct 670
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 656/681 (96%), Gaps = 2/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atc 1306 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 595 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 596 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 655 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 656 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 715 || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 707 Query: 716 tgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 706 tgatttcaccggtttcggcct 686
>gb|AY137451.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 579/580 (99%), Gaps = 1/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 157 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1374 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1315 Query: 217 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1314 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1255 Query: 277 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1195 Query: 337 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1194 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1135 Query: 397 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 1075 Query: 457 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 1015 Query: 517 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 576 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 955 Query: 577 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 895 Query: 637 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcg 696 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcg 835 Query: 697 catttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 ca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 796 Score = 198 bits (100), Expect = 2e-47 Identities = 120/125 (96%), Gaps = 2/125 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgnactcga-tttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcnagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttc 124 ||||| Sbjct: 1411 ccttc 1407
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 655/680 (96%), Gaps = 2/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatca 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcg 1248 Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1247 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1188 Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1187 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1128 Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1127 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1068 Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1008 Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 948 Query: 417 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 476 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 477 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 536 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 537 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 596 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 597 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 656 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 708 Query: 657 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 716 | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 707 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 649 Query: 717 gatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||| Sbjct: 648 gatttcaccggtttcggcct 629
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 630/647 (97%), Gaps = 2/647 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 1219 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1159 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1099 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 acatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1039 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 979 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 978 cctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatga 919 Query: 450 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 859 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 799 Query: 570 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 629 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattaca 739 Query: 630 ataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 689 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 ataggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttcttcacatgtaccc 679 Query: 690 gcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 678 gcagttgca-ttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttccgcct 633
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 663/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 656/682 (96%), Gaps = 2/682 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagttgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcaccggtttcggcct 656
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 640/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 135 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 136 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 195 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 196 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 255 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 256 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 316 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 375 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 376 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 436 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 495 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 496 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 556 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 615 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 616 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 676 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcc 735 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 688 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcagcc 630 Query: 736 t 736 | Sbjct: 629 t 629
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 640/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagctt 135 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 136 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 195 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 196 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 255 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 256 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 316 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 375 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 376 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 436 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 495 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 496 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 556 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 615 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 616 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 676 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggcc 735 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 688 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcaccggtttcagcc 630 Query: 736 t 736 | Sbjct: 629 t 629
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 cccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcggc 658
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 661/689 (95%), Gaps = 2/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttccc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccagtttcggc 658
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 648/672 (96%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttc 1280 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 attacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1220 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 1219 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagat 1160 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1159 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1100 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1040 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 980 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 920 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 919 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 860 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 604 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 859 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatcc 800 Query: 605 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 664 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 799 cccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctct 740 Query: 665 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 724 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 739 cttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 681 Query: 725 cggtttcggcct 736 |||||||||||| Sbjct: 680 cggtttcggcct 669
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 654/680 (96%), Gaps = 2/680 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 cgggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 594 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 595 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 654 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cagtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 655 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 714 |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 ataccgctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 715 ttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||||||||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcaccggtttcggc 658
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 665/692 (96%), Gaps = 4/692 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 104 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 105 gagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 164 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 1227 Query: 165 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 224 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 gctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1167 Query: 225 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 284 || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1166 acggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccct 1107 Query: 285 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 344 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1047 Query: 345 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1046 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 987 Query: 405 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 464 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 cgctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 465 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 525 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 584 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 585 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 644 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaat 747 Query: 645 tctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaa 704 || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 746 tccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaa 688 Query: 705 gtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 687 gtaatgccccttgatttcaccggtttcggcct 656
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 662/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcagcct 656
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 662/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcagcct 656
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 662/691 (95%), Gaps = 2/691 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 466 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 526 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 585 ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaag 806 Query: 586 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 645 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 646 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 705 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| Sbjct: 745 ctctcgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtagca-ttcaag 687 Query: 706 taatgccccttgatttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcaccggtttcagcct 656
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 652/678 (96%), Gaps = 2/678 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1262 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccagg 1202 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1201 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1142 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1141 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtat 1082 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1081 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttc 1022 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 aataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 962 Query: 419 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 902 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 901 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 842 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 598 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| Sbjct: 841 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataattagacaaactagtatttgcggt 782 Query: 599 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 658 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 781 gaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 722 Query: 659 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 718 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 721 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 663 Query: 719 tttcaccggtttcggcct 736 |||||||||||||||||| Sbjct: 662 tttcaccggtttcggcct 645
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 679/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1836 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1777 Query: 81 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 140 || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1776 ctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtaca 1718 Query: 141 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 200 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1717 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1658 Query: 201 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 260 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1657 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1598 Query: 261 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 320 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1597 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1538 Query: 321 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 380 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1478 Query: 381 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 440 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1477 tcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 1418 Query: 441 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 500 |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 tggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1358 Query: 501 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1357 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1298 Query: 561 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 620 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1297 ttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 1238 Query: 621 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 680 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1237 tgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatatagctctcttcatcatttcttcg 1178 Query: 681 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcaccggtttcggc 734 |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 catgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgtcccttgatttcaccggtttcggc 1125 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 5,480,504 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 5480504 Number of successful extensions: 160813 Number of sequences better than 10.0: 15254 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15202 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 68 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 106823 Number of HSP's gapped (non-prelim): 24000 length of query: 736 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 713 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 12223171262952 effective search space used: 12223171262952 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 21 (42.1 bits)