Clone Name | rbasd1k13 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 601/607 (99%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 601/607 (99%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 601/607 (99%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 600/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 598/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 599/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 598/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atantatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctakttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 598/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 597/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 597/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcgcaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 597/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 597/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 597/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 597/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaacncgaatntgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1483 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1427 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1368 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1308 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1248 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1188 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1128 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1068 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1008 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 948 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 947 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 888 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 887 tgcggtg 881
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-tgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaar 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 56333 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 56277 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56276 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 56218 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56217 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 56158 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56157 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 56098 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56097 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 56038 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56037 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 55978 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55977 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 55918 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55917 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 55858 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55857 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 55798 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55797 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 55738 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 55737 tgcggtg 55731
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 596/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1519 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1463 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1404 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1344 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1284 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1224 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1164 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1104 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1044 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 984 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 983 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 924 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 923 tgcggtg 917
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 595/606 (98%), Gaps = 4/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggt 606 |||||| Sbjct: 876 tgcggt 871
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 595/607 (98%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctactgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacann-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gnncccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 592/606 (97%), Gaps = 4/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggt 606 |||||| Sbjct: 876 tgcggt 871
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1205 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1146 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1086 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1026 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 966 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 906 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 846 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 786 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 726 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 725 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatt 666 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 665 tgcggtg 659
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1205 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1146 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1086 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1026 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 966 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 906 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 846 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 786 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 726 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 725 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatt 666 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 665 tgcggtg 659
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1533 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1477 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 937 tgcggtg 931
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1533 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1477 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 937 tgcggtg 931
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1533 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1477 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 937 tgcggtg 931
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1533 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1477 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 937 tgcggtg 931
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1533 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1477 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 937 tgcggtg 931
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1391 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1335 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1334 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 916 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 856 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 855 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 796 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 795 tgcggtg 789
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 594/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcc 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 593/606 (97%), Gaps = 4/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccgg-cttgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1337 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 918 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 858 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 857 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 798 Query: 601 tgcggt 606 |||||| Sbjct: 797 tgcggt 792
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 593/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaanntgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcn 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 579/589 (98%), Gaps = 3/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 gaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactcca 78 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1517 gaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcagg-actcca 1461 Query: 79 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 138 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 139 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 198 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 199 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 259 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 319 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 379 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 439 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 498 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 499 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 559 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 932
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 593/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 593/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 593/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1533 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1477 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 937 tgcggtg 931
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 593/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1537 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1481 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1362 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 1002 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 942 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 941 tgcggtg 935
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 591/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1533 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1477 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 938 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 937 tgcggtg 931
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1537 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1481 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1362 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 1002 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 942 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 941 tgcggtg 935
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1337 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 918 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 858 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 857 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 798 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 797 tgcggtg 791
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1344 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1285 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1225 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1165 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1105 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1045 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 985 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 925 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 865 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 864 tgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 805 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 804 tgcggtg 798
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1344 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1285 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1225 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1165 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1105 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1045 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 985 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 925 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 865 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 864 tgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 805 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 804 tgcggtg 798
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 592/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1416 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 877 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 876 tgcggtg 870
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 589/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-ctcgaacycgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 591/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1537 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1481 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1362 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcat 1002 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 942 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 941 tgcggtg 935
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 533/534 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 810
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 591/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1205 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1146 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctg 1086 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1026 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 966 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 906 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 846 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 786 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 726 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 725 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatt 666 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 665 tgcggtg 659
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 590/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1537 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1481 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnn 1362 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 1002 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 942 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 941 tgcggtg 935
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 532/534 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 796
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 590/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 589/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaattnnnn-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 589/607 (97%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1475 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcg 1419 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1418 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1360 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1300 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1299 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1240 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1180 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1120 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1060 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1000 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 999 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcat 940 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 939 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 880 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 879 tgcggtg 873
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 574/588 (97%), Gaps = 3/588 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 20 aactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccat 79 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccat 1340 Query: 80 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 139 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1339 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacga 1280 Query: 140 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 199 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1279 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1220 Query: 200 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtc 1160 Query: 260 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1159 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatg 1100 Query: 320 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1040 Query: 380 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 439 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactact 980 Query: 440 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 499 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 920 Query: 500 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 860 Query: 560 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 agtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 812
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 586/607 (96%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcg 1478 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgn 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 nnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 939 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 938 tgcggtg 932
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 539/545 (98%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1251 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 770 cggtg 766
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 539/545 (98%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1251 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 770 cggtg 766
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 540/547 (98%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1289 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 808 tgcggtg 802
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 587/607 (96%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1404 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcg 1348 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1289 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgc 1229 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 989 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 808 tgcggtg 802
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 538/545 (98%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1287 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 806 cggtg 802
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 587/607 (96%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1384 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcg 1328 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1327 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 909 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 849 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 848 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 789 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 788 tgcggtg 782
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 587/607 (96%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 587/607 (96%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctagcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 587/607 (96%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1522 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcg 1466 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1465 gctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1407 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1347 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1287 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1227 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1167 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1107 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ttctagcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1047 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 987 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 986 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 927 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 926 tgcggtg 920
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 537/544 (98%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 agttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 184 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 243 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 544 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 603 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 604 ggtg 607 |||| Sbjct: 805 ggtg 802
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 527/533 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 606 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 811
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 583/604 (96%), Gaps = 4/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggct 63 ||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcggct 1365 Query: 64 agttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 1364 agttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatc 1306 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 184 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 243 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1126 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 544 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 603 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 826 Query: 604 ggtg 607 |||| Sbjct: 825 ggtg 822
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 555/569 (97%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataa 98 |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaag-cagcagctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataa 1311 Query: 99 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 158 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1310 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1251 Query: 159 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 218 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1191 Query: 219 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 278 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1131 Query: 279 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 338 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1071 Query: 339 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 1011 Query: 399 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1010 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 951 Query: 459 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 891 Query: 519 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 890 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggc 831 Query: 579 aatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 830 aataatgagccaaactagtatttgcggtg 802
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 536/545 (98%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 796 cggtg 792
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 585/607 (96%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcgcaagcc-gca 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 537/547 (98%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1289 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 808 tgcggtg 802
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 526/534 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 810
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 580/602 (96%), Gaps = 4/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccgg-ctcgaactcsaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1347 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 gttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1288 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1228 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1227 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1168 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1167 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1108 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1048 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 988 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 928 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 868 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 867 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 808 Query: 605 gt 606 || Sbjct: 807 gt 806
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 535/545 (98%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1363 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1305 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 824 cggtg 820
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 536/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1290 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 809 tgcggtg 803
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 525/534 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 810
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 525/534 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 810
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 525/534 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 812
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 534/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcagg-actccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1271 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 790 cggtg 786
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 534/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1346 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1288 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 807 cggtg 803
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 534/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcagg-actccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1271 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 790 cggtg 786
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 534/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 796 cggtg 792
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 535/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1349 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1291 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1231 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1171 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1111 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1051 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1050 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 991 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 931 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 871 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 870 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 811 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 810 tgcggtg 804
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 554/571 (97%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 gccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcgga 95 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 gccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1319 Query: 96 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 155 |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1318 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1259 Query: 156 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 215 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1199 Query: 216 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 275 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1198 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1139 Query: 276 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 335 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 aaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1079 Query: 336 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1019 Query: 396 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1018 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 959 Query: 456 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 958 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 899 Query: 516 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 575 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 898 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 839 Query: 576 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 606 ||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 838 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 808
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 525/535 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1356 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1297 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1237 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1236 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1177 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1176 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacacc 1117 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1057 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 997 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 937 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 acggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 877 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 525/535 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1326 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1267 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1207 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1206 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1147 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1146 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacacc 1087 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1027 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 847 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 792
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 552/569 (97%), Gaps = 2/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataa 98 |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaag-cagcagctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataa 1311 Query: 99 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 158 ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1310 tttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1251 Query: 159 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 218 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1191 Query: 219 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 278 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 caccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1131 Query: 279 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 338 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtga 1071 Query: 339 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 1011 Query: 399 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1010 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 951 Query: 459 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 891 Query: 519 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 890 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggc 831 Query: 579 aatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 830 aataatgagccaaactagtatttgcggtg 802
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 atctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcg 1355 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1296 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgc 1236 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1175 atctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1116 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 815 tgcggtg 809
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 579/603 (96%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggcta 1348 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1347 gttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1289 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1288 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1229 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1228 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1169 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1168 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1109 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1049 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 989 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 929 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 869 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 809 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 808 gtg 806
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcg 1353 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1294 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgc 1234 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1173 atctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1114 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 814 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 813 tgcggtg 807
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 582/607 (95%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcg 1367 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1366 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1308 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 1307 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgc 1248 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1247 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1188 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1187 atctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1128 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 cggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1068 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1008 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 948 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 tttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 888 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 887 tgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 828 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 827 tgcggtg 821
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 510/516 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 512 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 572 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 784
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 510/516 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 512 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 572 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 784
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 534/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1296 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 815 tgcggtg 809
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 534/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1294 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 813 tgcggtg 807
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 523/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 523/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 523/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 523/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 567/589 (96%), Gaps = 3/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 gaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactcca 78 ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1407 gaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaag-ctgcggctagttcagg-actcca 1351 Query: 79 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 138 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 139 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 199 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 258 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1171 Query: 259 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 318 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 319 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 379 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 438 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 439 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 498 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 990 tgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 931 Query: 499 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 559 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 870 aagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 536/550 (97%), Gaps = 1/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 117 |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagc 1312 Query: 118 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 178 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 237 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 238 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 297 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 298 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 358 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 417 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 418 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 477 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 478 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 538 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 597 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 598 atttgcggtg 607 |||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtg 822
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 532/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1271 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 790 cggtg 786
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 581/607 (95%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-ctcgaactccaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 atctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 6/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 124700 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124699 gttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 124641 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124640 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 124581 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 124580 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcc 124521 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 124520 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggt 124462 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124461 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 124402 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124401 -caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 124343 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124342 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 124283 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124282 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 124223 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124222 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 124163 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 124162 gtg 124160 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 580/603 (96%), Gaps = 6/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 30173 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30172 gttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 30114 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30113 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 30054 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 30053 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcc 29994 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 29993 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggt 29935 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29934 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 29875 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29874 -caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 29816 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29815 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 29756 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29755 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 29696 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29695 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 29636 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 29635 gtg 29633
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 523/535 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1317 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttc 1258 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 attacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1198 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1197 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1138 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1078 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1018 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1017 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 958 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 898 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 838 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 837 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 783
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 533/547 (97%), Gaps = 1/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1289 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 808 tgcggtg 802
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 523/535 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1317 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttc 1258 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 attacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1198 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1197 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1138 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1078 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1018 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1017 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 958 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 898 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 838 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 837 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 783
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55466 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55465 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 55407 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55406 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 55347 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55346 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 55287 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 55286 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 55227 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55226 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 55167 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55166 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 55107 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55106 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55047 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55046 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54987 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54986 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54927 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 54926 gtg 54924
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55466 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55465 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 55407 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55406 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 55347 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55346 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 55287 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 55286 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 55227 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55226 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 55167 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55166 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 55107 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55106 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55047 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55046 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54987 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54986 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54927 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 54926 gtg 54924
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55414 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55413 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 55355 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55354 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 55295 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55294 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 55235 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 55234 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 55175 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55174 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 55115 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55114 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 55055 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55054 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 54995 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54994 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54935 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54934 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54875 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 54874 gtg 54872
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 531/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1345 tagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1287 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 806 cggtg 802
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 125755 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125754 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 125696 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 125695 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 125636 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 125635 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 125576 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 125575 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 125516 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125515 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 125456 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125455 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 125396 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125395 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 125336 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125335 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 125276 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125275 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 125216 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 125215 gtg 125213 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 30695 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30694 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 30636 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30635 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 30576 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 30575 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 30516 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 30515 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 30456 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30455 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 30396 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30395 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 30336 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30335 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 30276 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30275 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 30216 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30215 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 30156 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 30155 gtg 30153
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 124782 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124781 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 124723 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124722 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 124663 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 124662 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 124603 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 124602 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 124543 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124542 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 124483 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124482 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 124423 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124422 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 124363 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124362 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 124303 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124302 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 124243 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 124242 gtg 124240 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 30201 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30200 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 30142 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 30082 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 30081 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 30022 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 30021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 29962 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 29902 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 29842 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29841 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 29782 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 29722 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29721 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 29662 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 29661 gtg 29659
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 124782 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124781 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 124723 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124722 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 124663 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 124662 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 124603 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 124602 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 124543 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124542 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 124483 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124482 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 124423 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124422 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 124363 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124362 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 124303 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124302 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 124243 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 124242 gtg 124240 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 30201 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30200 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 30142 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 30082 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 30081 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 30022 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 30021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 29962 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 29902 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 29842 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29841 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 29782 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 29722 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29721 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 29662 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 29661 gtg 29659
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55458 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55457 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 55399 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55398 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 55339 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55338 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 55279 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 55278 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 55219 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55218 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 55159 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55158 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 55099 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55098 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55039 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55038 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54979 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54978 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54919 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 54918 gtg 54916
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 1245 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1244 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 1185 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 824 gtg 822
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 580/607 (95%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 ||||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1339 atagtatctactgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaag-ctgcg 1283 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1282 gcaagttcaggg-ctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 864 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 804 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 803 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 744 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 743 tgcggtg 737
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 580/607 (95%), Gaps = 4/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atagtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcg 60 |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccgg-cgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaag-ctgcg 1368 Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1367 gctagttcagg-actccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 888 tgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 829 Query: 601 tgcggtg 607 ||||||| Sbjct: 828 tgcggtg 822
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 33527206 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527207 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 33527265 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 33527266 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 33527325 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 33527326 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 33527385 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 33527386 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 33527445 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527446 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 33527505 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527506 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 33527565 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527566 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 33527625 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527626 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 33527685 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527686 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 33527745 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 33527746 gtg 33527748 Score = 56.0 bits (28), Expect = 1e-04 Identities = 34/36 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 572 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 39115437
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 72403 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72404 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 72462 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 72463 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 72522 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 72523 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 72582 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 72583 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 72642 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72643 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 72702 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72703 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 72762 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72763 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 72822 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72823 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 72882 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72883 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 72942 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 72943 gtg 72945
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1419 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1360 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1359 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 1300 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1299 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 1240 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1239 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1180 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1120 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1060 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1000 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 940 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 939 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 880 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 879 gtg 877
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1162 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1161 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1103 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1102 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 1043 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1042 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 983 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 982 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 923 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 863 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 803 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 802 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 743 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 742 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 683 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 682 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 623 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 622 gtg 620
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55393 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55392 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 55334 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55333 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 55274 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55273 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 55214 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 55213 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 55154 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55153 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 55094 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55093 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 55034 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55033 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 54974 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54973 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54914 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54913 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54854 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 54853 gtg 54851
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 537/553 (97%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1751 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1750 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1692 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1691 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 1632 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1631 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 1572 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1571 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1512 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1511 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1452 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1451 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1392 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 aacttacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1332 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1331 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 1272 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 1212 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 1211 gtg 1209
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1784 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1783 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1725 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1724 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 1665 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1664 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 1605 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1604 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1545 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1544 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1485 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1425 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1365 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 1305 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1304 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 1245 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 1244 gtg 1242 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 91 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 552/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 gccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcgga 95 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1376 gccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcgga 1319 Query: 96 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 155 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1318 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1259 Query: 156 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 215 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1199 Query: 216 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 275 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1198 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1139 Query: 276 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 335 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1138 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1079 Query: 336 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1019 Query: 396 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1018 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 959 Query: 456 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 958 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 899 Query: 516 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 575 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 898 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 839 Query: 576 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 807
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 552/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 gccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcgga 95 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 96 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 155 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 156 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 215 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 216 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 275 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 276 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 335 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1094 Query: 336 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 396 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacat 974 Query: 456 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 516 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 575 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 576 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 552/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 gccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcgga 95 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1306 gccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctttga 1249 Query: 96 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 155 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1248 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1189 Query: 156 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 215 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1129 Query: 216 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 275 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1069 Query: 276 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 335 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1009 Query: 336 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 395 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 949 Query: 396 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 889 Query: 456 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 515 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 gatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 829 Query: 516 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 575 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 828 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 769 Query: 576 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||| |||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 768 ggcaataatgagacaaactagtatttgcggtg 737
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 522/535 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1345 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1286 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1226 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1225 cccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1166 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacacc 1106 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1046 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 986 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 926 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 925 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaat 866 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 865 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 811
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 521/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 521/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 521/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 810
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 565/589 (95%), Gaps = 3/589 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 gaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactcca 78 |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1379 gaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaag-ctgcggctagttcagg-actcca 1323 Query: 79 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 138 |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 tttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacg 1263 Query: 139 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1262 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattccccca 1203 Query: 199 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1202 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggt 1143 Query: 259 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 318 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 cagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcat 1083 Query: 319 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 378 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 ggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatc 1023 Query: 379 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 438 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 963 Query: 439 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 903 Query: 499 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 902 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 843 Query: 559 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 842 aagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 794
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 521/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 820
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 576/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 gttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 1245 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1244 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 1185 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 824 gtg 822
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 530/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1349 tagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1291 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 810 cggtg 806
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 576/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 53668 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53667 gttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 53609 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 53608 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 53549 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 53548 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 53489 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 53488 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 53429 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53428 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 53369 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53368 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 53309 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53308 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 53249 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53248 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 53189 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53188 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 53129 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 53128 gtg 53126
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 576/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 128601 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128600 gttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 128542 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 128541 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 128482 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 128481 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 128422 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 128421 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 128362 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128361 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 128302 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128301 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 128242 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128241 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 128182 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128181 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 128122 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128121 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 128062 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 128061 gtg 128059
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 576/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 10347276 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10347275 gttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 10347217 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 10347216 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 10347157 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 10347156 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 10347097 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 10347096 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 10347037 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347036 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 10346977 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346976 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 10346917 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346916 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 10346857 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346856 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 10346797 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10346796 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 10346737 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 10346736 gtg 10346734
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 530/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 796 cggtg 792
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 576/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 10353315 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10353314 gttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 10353256 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 10353255 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 10353196 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 10353195 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 10353136 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 10353135 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 10353076 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353075 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 10353016 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353015 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 10352956 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352955 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 10352896 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352895 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 10352836 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10352835 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 10352776 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 10352775 gtg 10352773
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 536/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 507/516 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 512 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 572 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 781
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 507/516 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 512 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 572 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 781
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 529/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1346 tagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1288 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 807 cggtg 803
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 517/531 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 77 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 136 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 137 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 196 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 197 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 257 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 317 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 377 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 437 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 496 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 497 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 557 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 802
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 535/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 575/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgatca-ctttccatatttcacaag-ctgcggcta 5614506 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614505 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 5614447 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 5614446 cgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 5614387 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 5614386 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 5614327 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 5614326 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 5614267 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614266 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 5614207 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614206 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 5614147 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614146 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 5614087 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614086 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 5614027 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614026 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 5613967 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 5613966 gtg 5613964 Score = 505 bits (255), Expect = e-140 Identities = 286/295 (96%), Gaps = 1/295 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 13436810 Score = 222 bits (112), Expect = 1e-54 Identities = 130/136 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 472 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 532 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 591 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 592 agtagtatttgcggtg 607 | |||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtg 13397961 Score = 81.8 bits (41), Expect = 2e-12 Identities = 54/57 (94%), Gaps = 1/57 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 116 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 258 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 287 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 338 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.53 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 256 ggtcagagctggcatatgccaa 277 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 529/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 796 cggtg 792
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 575/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgatca-ctttccatatttcacaag-ctgcggcta 5614495 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614494 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 5614436 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 5614435 cgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 5614376 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 5614375 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 5614316 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 5614315 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 5614256 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614255 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 5614196 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614195 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 5614136 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614135 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 5614076 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614075 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 5614016 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614015 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 5613956 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 5613955 gtg 5613953 Score = 505 bits (255), Expect = e-140 Identities = 286/295 (96%), Gaps = 1/295 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 13391084 Score = 222 bits (112), Expect = 1e-54 Identities = 130/136 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 472 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 532 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 591 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 592 agtagtatttgcggtg 607 | |||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtg 13352235 Score = 81.8 bits (41), Expect = 2e-12 Identities = 54/57 (94%), Gaps = 1/57 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 116 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 258 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 287 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 338 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.53 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 256 ggtcagagctggcatatgccaa 277 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 575/603 (95%), Gaps = 4/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgatca-ctttccatatttcacaag-ctgcggcta 38379 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38380 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 38438 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38439 cgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 38498 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 38499 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 38558 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 38559 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 38618 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38619 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 38678 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38679 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 38738 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38739 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 38798 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38799 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 38858 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38859 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 38918 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 38919 gtg 38921
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 535/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 535/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcagctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 550/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 gccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcgga 95 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1378 gccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgctagctgctcgga 1321 Query: 96 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 155 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1320 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1261 Query: 156 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 215 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1201 Query: 216 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 275 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1141 Query: 276 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 335 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1140 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1081 Query: 336 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 395 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 tgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1021 Query: 396 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1020 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacat 961 Query: 456 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 960 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 901 Query: 516 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 575 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 900 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 841 Query: 576 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 809
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 550/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 gccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcgga 95 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1375 gccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1318 Query: 96 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 155 |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1317 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1258 Query: 156 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 215 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1198 Query: 216 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 275 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1138 Query: 276 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 335 |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 aaacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgag 1078 Query: 336 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1018 Query: 396 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1017 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 958 Query: 456 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 516 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 575 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 838 Query: 576 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 837 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 806
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 511/523 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 85 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 144 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 145 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 204 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 205 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 264 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 265 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 325 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 384 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 385 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 445 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 504 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 505 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 564 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 565 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 765
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 511/523 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 85 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 144 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 145 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 204 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 205 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 264 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 265 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 324 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 325 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 385 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 445 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 505 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 564 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 565 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 806
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 511/523 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 85 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 144 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 145 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 204 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 205 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 264 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 265 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 325 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 384 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 385 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 445 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 504 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 505 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 564 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 565 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 765
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 575/604 (95%), Gaps = 4/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggct 63 ||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-tgctttccatacttcacaag-ctgcggct 1365 Query: 64 agttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcagg-actccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1246 Query: 184 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 tggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatcttt 1066 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 543 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 tgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 544 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 603 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| Sbjct: 885 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgc 826 Query: 604 ggtg 607 |||| Sbjct: 825 ggtg 822
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1253 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 714 agtatttgcggtg 702
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 575/604 (95%), Gaps = 4/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gtatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggct 63 ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccgg-cttgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggct 1335 Query: 64 agttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1334 agttcagg-actccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 184 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 243 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 544 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 603 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 604 ggtg 607 |||| Sbjct: 795 ggtg 792
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 519/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 792
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 575/603 (95%), Gaps = 5/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 23203630 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23203631 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 23203689 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203690 cgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 23203748 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 23203749 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 23203808 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 23203809 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 23203868 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203869 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 23203928 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 23203929 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttct 23203988 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203989 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 23204048 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204049 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 23204108 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23204109 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 23204168 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 23204169 gtg 23204171 Score = 103 bits (52), Expect = 7e-19 Identities = 62/64 (96%), Gaps = 1/64 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaa 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaa 26711442 Query: 120 gatc 123 |||| Sbjct: 26711441 gatc 26711438 Score = 103 bits (52), Expect = 7e-19 Identities = 62/64 (96%), Gaps = 1/64 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaa 119 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaa 26711334 Query: 120 gatc 123 |||| Sbjct: 26711333 gatc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 575/603 (95%), Gaps = 5/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 154278 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154279 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 154337 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154338 cgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 154396 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 154397 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 154456 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 154457 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 154516 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154517 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 154576 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 154577 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttct 154636 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154637 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 154696 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154697 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 154756 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154757 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 154816 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 154817 gtg 154819
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 575/603 (95%), Gaps = 5/603 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 5 tatctaccgggctngaactcgaatttgatangccttccatacttcacaaggctgcggcta 64 |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 38392 Query: 65 gttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38393 gttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 38451 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38452 cgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacca 38510 Query: 185 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 244 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 38511 ggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatct 38570 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 38571 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 38630 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38631 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 38690 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 38691 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttct 38750 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38751 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 38810 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38811 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 38870 Query: 545 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 604 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38871 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 38930 Query: 605 gtg 607 ||| Sbjct: 38931 gtg 38933
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 527/544 (96%), Gaps = 1/544 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 agttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 184 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 243 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 543 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 544 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 603 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 604 ggtg 607 |||| Sbjct: 825 ggtg 822
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 526/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 gctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 181 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 540 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 541 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 601 tgc 603 ||| Sbjct: 798 tgc 796
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 548/571 (95%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 ccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggat 96 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1390 ccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctttgat 1333 Query: 97 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 156 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttc 1273 Query: 157 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 217 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 276 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 277 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 336 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 1093 Query: 337 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 396 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 397 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 456 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 acctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 973 Query: 457 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 516 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 972 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgattttt 913 Query: 517 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 576 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcg 853 Query: 577 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||| |||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 852 gcaataatgagacaaactagtatttgcggtg 822
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 113 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 114 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 173 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 174 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 233 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 234 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 293 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 294 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 353 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 354 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 414 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 473 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 474 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 534 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 593 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 594 tagtatttgcggtg 607 |||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtg 792
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 499/509 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 99 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 158 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 159 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 218 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 219 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 278 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 279 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 338 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 339 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 398 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 399 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 458 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 459 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 519 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 579 aatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagtatttgcggtg 769
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 527/545 (96%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 796 cggtg 792
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 518/535 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1336 actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1277 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1217 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1216 cccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagat 1157 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1156 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1097 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1096 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttcaataaa 1037 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 977 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 917 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 916 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 857 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 802
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 518/535 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1338 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1279 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1278 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatt 1219 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1218 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagat 1159 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1158 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1099 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 tggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1039 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 979 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 tactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 919 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 918 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 859 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 804
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 547/571 (95%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 ccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggat 96 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120471 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagc-actccatttgcaagctgctttgat 120414 Query: 97 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 156 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 120413 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 120354 Query: 157 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120353 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 120294 Query: 217 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 276 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120293 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 120234 Query: 277 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 336 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120233 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 120174 Query: 337 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 396 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120173 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 120114 Query: 397 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 456 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120113 acctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 120054 Query: 457 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 516 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120053 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 119994 Query: 517 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 576 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 119993 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcg 119934 Query: 577 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 119933 gcaataatgagacaaagtagtatttgcggtg 119903
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 518/535 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 73 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1299 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1240 Query: 133 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 192 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1239 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatt 1180 Query: 193 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1179 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagat 1120 Query: 253 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1119 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1060 Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1000 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 940 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 880 Query: 493 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 552 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 820 Query: 553 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 765
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 547/571 (95%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 ccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggat 96 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58844 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagc-actccatttgcaagctgctttgat 58787 Query: 97 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 156 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58786 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 58727 Query: 157 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58726 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 58667 Query: 217 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 276 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58666 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 58607 Query: 277 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 336 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58606 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 58547 Query: 337 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 396 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58546 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 58487 Query: 397 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 456 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58486 acctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 58427 Query: 457 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 516 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58426 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 58367 Query: 517 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 576 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 58366 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcg 58307 Query: 577 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 58306 gcaataatgagacaaagtagtatttgcggtg 58276
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 547/571 (95%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 ccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggat 96 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1390 ccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctttgat 1333 Query: 97 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 156 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttc 1273 Query: 157 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 217 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 276 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 277 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 336 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 1093 Query: 337 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 396 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 397 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 456 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 acctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 973 Query: 457 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 516 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 972 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgattttt 913 Query: 517 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 576 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcg 853 Query: 577 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||| |||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 852 gcaataatgagacaaactagtatttgcggtg 822
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 514/530 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 919 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 918 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 859 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 858 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 809
>gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (rbcL) gene, partial cds Length = 1324 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 513/530 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1324 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1265 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 193 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatty 1205 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1204 ycccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1145 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1144 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1085 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1025 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 965 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 905 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 553 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 904 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 845 Query: 554 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 844 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 795
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 526/545 (96%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 122 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1277 Query: 123 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 182 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 183 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 242 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 243 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 302 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 303 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 362 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 363 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 422 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 423 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 482 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 483 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 542 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 543 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 602 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 603 cggtg 607 ||||| Sbjct: 796 cggtg 792
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 546/571 (95%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 ccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggat 96 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1390 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagc-actccatttgcaagctgctttgat 1333 Query: 97 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 156 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1273 Query: 157 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 217 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 276 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 277 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 336 |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 1093 Query: 337 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 396 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 397 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 456 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 acctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 973 Query: 457 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 516 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 913 Query: 517 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 576 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcg 853 Query: 577 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 852 gcaataatgagacaaagtagtatttgcggtg 822
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 546/571 (95%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 ccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggat 96 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58263 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagc-actccatttgcaagctgctttgat 58206 Query: 97 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 156 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58205 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 58146 Query: 157 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58145 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 58086 Query: 217 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 276 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58085 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 58026 Query: 277 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 336 |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58025 aacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 57966 Query: 337 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 396 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57965 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 57906 Query: 397 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 456 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57905 acctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 57846 Query: 457 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 516 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57845 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 57786 Query: 517 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 576 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 57785 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcg 57726 Query: 577 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 57725 gcaataatgagacaaagtagtatttgcggtg 57695
>emb|AJ746178.1| Arundinaria oedogonata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1274 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 514/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 77 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 136 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1274 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1215 Query: 137 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 196 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1214 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1155 Query: 197 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1154 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1095 Query: 257 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 316 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1094 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1035 Query: 317 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 376 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 975 Query: 377 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 915 Query: 437 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 496 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 855 Query: 497 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 854 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 795 Query: 557 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 744
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 546/571 (95%), Gaps = 2/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 ccttccatacttcacaaggctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggat 96 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58273 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagc-actccatttgcaagctgctttgat 58216 Query: 97 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 156 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58215 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 58156 Query: 157 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58155 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 58096 Query: 217 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 276 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58095 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 58036 Query: 277 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 336 |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58035 aacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 57976 Query: 337 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 396 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57975 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 57916 Query: 397 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 456 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57915 acctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 57856 Query: 457 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 516 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57855 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 57796 Query: 517 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 576 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 57795 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcg 57736 Query: 577 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 607 |||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 57735 gcaataatgagacaaagtagtatttgcggtg 57705
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 531/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 531/553 (96%), Gaps = 1/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctgcggctagttcaggtactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 gctgcggctagttcagg-actccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 234 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 535 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 594 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 595 agtatttgcggtg 607 ||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtg 792 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,530,414 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4530414 Number of successful extensions: 120757 Number of sequences better than 10.0: 15268 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15216 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 62 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 88370 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21408 length of query: 607 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 584 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10011685859136 effective search space used: 10011685859136 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)