Clone Name | rbasd1d15 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1306 bits (659), Expect = 0.0 Identities = 682/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1306 bits (659), Expect = 0.0 Identities = 682/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1306 bits (659), Expect = 0.0 Identities = 682/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0 Identities = 681/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1294 bits (653), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctakttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcngctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctg 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1291 bits (651), Expect = 0.0 Identities = 680/686 (99%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcngctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1285 bits (648), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0 Identities = 679/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 678/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1281 bits (646), Expect = 0.0 Identities = 678/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccnnngtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 665/670 (99%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 caagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttc 75 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 76 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 135 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 136 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 196 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 256 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 316 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 376 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 435 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 436 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 496 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 556 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 888 Query: 616 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattca 675 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 887 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattca 829 Query: 676 agtaatgccc 685 |||||||||| Sbjct: 828 agtaatgccc 819
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 678/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 678/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 678/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1275 bits (643), Expect = 0.0 Identities = 678/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 676/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanntggcatggatacccagtcnkgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 677/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 677/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 677/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1267 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 676/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1381 taatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 669/677 (98%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1431 tacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcat 1373 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1372 taccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1313 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1253 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1193 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1192 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1133 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1132 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1073 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 1013 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 953 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 952 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 893 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 833 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 832 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtc 774 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 773 gcattcaagtaatgccc 757
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 676/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcngctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagataatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 676/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0 Identities = 676/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 645/648 (99%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacannctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctygcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaanacngctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1451 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1393 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1392 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1333 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1273 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1213 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1153 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1093 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1033 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 973 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 972 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 913 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 912 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 853 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 794 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 768
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaactctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 56301 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 56243 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 56242 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 56183 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 56182 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 56123 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56122 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 56063 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56062 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 56003 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56002 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 55943 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55942 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 55883 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55882 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 55823 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55822 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 55763 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55762 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 55703 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55702 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 55644 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55643 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 55618
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 675/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1429 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1428 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1369 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1309 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1249 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1189 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1129 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1069 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1009 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1008 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 949 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 948 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 889 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 830 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 804
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 644/648 (99%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 790 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 730 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 729 ttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 683
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcngctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1443 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1442 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1383 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1323 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1263 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1203 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1143 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1142 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1083 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1023 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1022 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 963 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 903 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 844 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 818
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1443 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1442 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1383 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1323 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1263 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1203 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1143 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1142 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1083 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1023 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1022 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 963 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 903 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 844 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 818
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1443 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1442 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1383 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1323 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1263 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1203 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1143 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1142 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1083 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1023 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1022 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 963 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 903 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 844 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 818
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1443 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1442 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1383 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1323 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1263 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1203 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1143 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1142 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1083 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1023 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1022 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 963 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 903 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 844 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 818
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1447 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1446 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1387 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1327 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1267 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1207 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1147 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1087 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1027 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1026 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 967 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 907 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 848 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 822
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 674/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1361 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcgga 1303 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1302 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1243 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1183 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1123 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1063 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1003 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1002 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 943 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 883 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 882 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 823 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcatta 763 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 762 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 704 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 703 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 678
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1447 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1446 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1387 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1327 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1267 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1207 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1206 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaa 1147 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1087 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1027 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1026 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 967 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 907 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 848 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 822
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1303 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1302 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1243 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1183 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1123 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanctggcatggatacccagtcctgag 1063 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1003 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1002 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 943 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 883 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 882 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 823 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 822 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 763 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 762 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgta- 704 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 703 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 678
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1443 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1442 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1383 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1323 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1263 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1203 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1143 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1142 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1083 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1023 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1022 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 963 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 903 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnttaatcatttcttcacatgta- 844 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 818
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1171 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1170 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1111 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1051 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 991 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 931 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 871 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 811 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 751 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 750 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 691 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 690 ggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 631 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 630 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 572 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 571 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 546
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1171 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1170 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1111 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1051 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 991 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 931 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 871 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 811 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 751 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 750 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 691 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 690 ggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 631 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 630 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 572 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 571 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 546
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1310 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1309 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1250 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1190 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1130 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1070 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1010 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1009 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 950 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 890 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 889 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgc 830 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 770 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 711 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 710 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1301 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1300 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1241 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1181 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1121 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1061 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1001 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1000 aacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 941 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 881 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 880 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 821 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 820 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 761 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 760 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 702 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 701 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 676
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1081 aacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1310 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1309 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1250 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1190 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1130 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1070 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1010 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1009 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 950 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 890 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 889 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgc 830 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 770 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 711 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 710 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 672/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1235 bits (623), Expect = 0.0 Identities = 673/686 (98%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1081 aacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1443 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1442 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1383 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1323 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgcc 1263 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1203 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1202 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaa 1143 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1142 aacctaaagtcatttygcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1083 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1023 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1022 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 963 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 903 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 844 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 818
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 672/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1447 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1446 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1387 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1327 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1267 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1207 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1147 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1087 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnn 1027 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1026 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 967 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 907 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 848 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 822
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 651/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1251 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 653
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1443 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1442 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1383 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1323 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1263 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1203 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1202 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaa 1143 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1142 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1083 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1023 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1022 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 963 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 903 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnttaatcatttcttcacatgta- 844 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 843 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 818
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 651/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1251 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 653
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctnttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 672/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 672/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1081 aacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcagtcaaagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctygcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 672/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgccgctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcac 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctagcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1447 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1446 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggctt 1387 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1327 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1267 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1207 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1147 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 1087 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1027 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1026 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 967 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 907 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 848 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 822
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 671/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcggccccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaagcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 668/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1384 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1324 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1264 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1204 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1144 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctannnctgtaccggagtggatat 1084 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 gatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 1024 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1023 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 964 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 904 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 845 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 819
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 670/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1171 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1170 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1111 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1051 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 991 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 931 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 871 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 870 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 811 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 751 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 750 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 691 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 690 ggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 631 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 630 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 572 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 571 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 546
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 670/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1440 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1382 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1381 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1322 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1321 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1262 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1202 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1142 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1082 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1081 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggaatggatat 1022 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 962 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 961 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcac 902 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 901 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcatta 842 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 caataggaacccctaattctctagcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 783 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 757
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 639/648 (98%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 649/661 (98%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 gctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaag 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1289 Query: 85 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 144 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 145 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 204 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 205 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 264 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 265 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 325 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 385 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 445 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 505 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 564 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 565 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 624 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 625 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgcc 684 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgcc 690 Query: 685 c 685 | Sbjct: 689 c 689
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 646/658 (98%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 agttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatc 87 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 88 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 147 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 148 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 207 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 208 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 268 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 328 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 388 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 448 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 508 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 567 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 568 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 627 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 628 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 689
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 647/659 (98%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1287 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 689
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 667/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1443 cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1385 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1384 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1325 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1265 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1205 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1145 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1144 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaa 1085 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 1025 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 965 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 964 tctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 905 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 904 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 845 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 786 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 785 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 760
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 667/686 (97%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1324 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1323 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1264 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1204 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 ctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1144 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1084 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 tgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1024 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1023 aacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 964 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 904 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 844 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 843 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 784 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 783 caataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctcttcatcatttcttcacatgta- 725 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 cccgcagttgcattcaagtaatgccc 699
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 636/648 (98%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/630 (98%), Gaps = 1/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 cggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 115 ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 116 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 176 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 235 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 236 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 296 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 356 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 416 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 476 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 536 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 596 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 700 Query: 656 gtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 699 gta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 671
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/630 (98%), Gaps = 1/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 cggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 115 ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 116 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 176 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 235 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 236 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 296 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 356 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 416 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 476 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 536 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 596 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 700 Query: 656 gtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 699 gta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 671
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 646/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 gctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaag 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1289 Query: 85 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 144 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 145 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 204 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 205 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 264 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 265 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 324 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 325 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 385 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 445 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 505 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 564 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 565 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 624 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 625 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgcc 684 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgcc 690 Query: 685 c 685 | Sbjct: 689 c 689
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 658/677 (97%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1383 tacttcacaagccgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcat 1325 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1324 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1265 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1205 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 attgtaatacagaatcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1145 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1144 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaaga 1085 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1025 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatttcgcgttccccttctagcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 965 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 905 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 904 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 845 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 785 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 784 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtc 726 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 725 gcattcaagtaatgccc 709
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 658/677 (97%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1481 tacttcacaagccgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcat 1423 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1422 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1363 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1303 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 attgtaatacagaatcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1243 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1242 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaaga 1183 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1123 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 tcatttcgcgttccccttctagcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 1063 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 1003 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 943 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 883 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 882 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtc 824 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 823 gcattcaagtaatgccc 807
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 635/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 644/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1363 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1305 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 764 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 707
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 665/686 (96%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1294 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1293 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1234 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 ctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1174 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 ctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1114 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct: 1113 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgag 1054 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 994 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 993 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 934 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 874 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 873 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 814 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 813 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 754 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 753 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 695 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 694 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 669
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 665/686 (96%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 657/677 (97%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcat 1305 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1304 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1245 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1185 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 attgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1125 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 taccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1065 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1005 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1004 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccc 945 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 884 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 825 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 764 ctcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtc 706 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 705 gcattcaagtaatgccc 689
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 634/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 806 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 746 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 ttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 699
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 637/651 (97%), Gaps = 2/651 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgnc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgtg 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttctt 650 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctctagcaaatacagctctcttaatcatttctt 743
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 643/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcagg-actccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1271 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 673
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 643/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcagg-actccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1271 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 673
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 643/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatgtcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 664/686 (96%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1372 cgccttccatacttcacaagccgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcgga 1314 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1313 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1254 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1253 ctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1194 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 caccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1134 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1133 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1074 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1014 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 954 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 894 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 893 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 834 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 833 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 774 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 773 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 715 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 714 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 689
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 651/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 caagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttc 75 ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1300 Query: 76 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 135 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 acgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1240 Query: 136 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 195 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1180 Query: 196 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 255 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1120 Query: 256 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 315 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1060 Query: 316 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1059 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttc 1000 Query: 376 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 435 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 436 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 496 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 555 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 820 Query: 556 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 615 | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 actagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaa 760 Query: 616 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattca 675 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 759 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattca 701 Query: 676 agtaatgccc 685 |||||||||| Sbjct: 700 agtaatgccc 691
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 644/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 gctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaag 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1290 Query: 85 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 144 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 145 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 204 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 205 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 264 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 265 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 324 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 325 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 385 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 444 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 445 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 505 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 564 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 565 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 624 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 625 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgcc 684 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgcc 691 Query: 685 c 685 | Sbjct: 690 c 690
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 656/677 (96%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1383 tacttcacaagccgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcat 1325 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1324 taccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1265 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1205 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 attgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1145 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 taccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1085 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1025 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccc 965 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 905 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 904 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 845 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 785 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 784 cccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtc 726 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 725 gcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1160 bits (585), Expect = 0.0 Identities = 633/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaaataatgccc 697
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 642/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1346 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1288 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctcttttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 690
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 643/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 gctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaag 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1294 Query: 85 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 144 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 145 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 204 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 205 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 264 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 265 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 325 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 385 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 444 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 445 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 505 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 564 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 565 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 624 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 625 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgcc 684 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 753 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgcc 695 Query: 685 c 685 | Sbjct: 694 c 694
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 655/677 (96%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcat 1305 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1304 taccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1245 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1185 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 attgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1125 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 taccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1065 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1005 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1004 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccc 945 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 885 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 884 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 825 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 gagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaa 765 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 764 cccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtc 706 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 705 gcattcaagtaatgccc 689
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 633/649 (97%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 actccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1356 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1297 Query: 97 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1237 Query: 157 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 216 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1236 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1177 Query: 217 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 276 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1176 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacacc 1117 Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1057 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 997 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 937 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 acggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 877 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 817 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 816 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 757 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 756 cttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 633/649 (97%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 actccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1326 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1267 Query: 97 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1207 Query: 157 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 216 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1206 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1147 Query: 217 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 276 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1146 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacacc 1087 Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1027 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 847 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 726 cttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 632/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 641/659 (97%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1329 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1271 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 673
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 662/686 (96%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1375 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1317 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1257 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1197 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1137 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1077 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1017 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1016 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 957 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 956 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 897 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 896 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 837 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 836 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtcatgcatta 777 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 776 caataggagcccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta- 718 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 717 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 692
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 642/661 (97%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 gctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaag 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1289 Query: 85 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 144 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 145 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 204 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 205 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 264 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 265 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 324 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 325 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 385 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 444 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 445 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 505 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 564 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 565 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 624 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 625 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgcc 684 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgcc 690 Query: 685 c 685 | Sbjct: 689 c 689
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 644/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 22 gcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagc 81 |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagc 1312 Query: 82 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 141 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 142 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 201 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 202 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 261 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 262 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 322 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 381 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 382 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 441 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 442 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 502 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 561 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 562 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 621 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 622 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaat 681 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaat 713 Query: 682 gccc 685 |||| Sbjct: 712 gccc 709
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 661/686 (96%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcgcaagccgcagctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttctgtcagagccggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgaatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcac 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 631/649 (97%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 actccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1317 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttc 1258 Query: 97 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 156 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 attacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1198 Query: 157 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 216 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1197 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1138 Query: 217 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 276 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1078 Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1018 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1017 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 958 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 898 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 838 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 837 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 778 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 718 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 717 cttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 670
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 631/649 (97%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 actccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1345 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1286 Query: 97 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 156 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1226 Query: 157 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 216 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1225 cccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1166 Query: 217 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 276 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacacc 1106 Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1046 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 986 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 926 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 925 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaat 866 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 865 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 806 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 746 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 745 cttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 698
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 631/649 (97%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 actccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1317 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttc 1258 Query: 97 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 156 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 attacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1198 Query: 157 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 216 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1197 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1138 Query: 217 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 276 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1078 Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1018 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1017 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 958 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 898 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 838 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 837 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 778 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 718 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 717 cttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 670
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 630/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttcatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 630/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttcatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 630/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctt 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-gctgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 630/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 814 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 754 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 753 ttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 707
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 639/659 (96%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1345 tagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1287 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 689
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/630 (97%), Gaps = 1/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 cggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 115 ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 116 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 176 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 235 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 236 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 296 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 356 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 416 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 476 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 536 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 595 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 596 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 697 Query: 656 gtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 696 gta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 668
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/630 (97%), Gaps = 1/630 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 cggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 115 ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 116 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 176 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 235 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 236 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 296 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 356 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 416 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 476 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 536 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 595 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 596 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 697 Query: 656 gtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 696 gta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 668
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 662/686 (96%), Gaps = 5/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124728 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 124670 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124669 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 124610 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124609 ctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttc 124550 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124549 ctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 124490 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124489 aaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 124431 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124430 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 124372 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 124371 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatat 124312 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124311 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 124252 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 124251 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgc 124192 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124191 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 124132 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 124131 caataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta- 124073 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124072 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 124047 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 662/686 (96%), Gaps = 5/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30201 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcgga 30143 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30142 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 30083 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30082 ctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttc 30023 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30022 ctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 29963 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29962 aaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 29904 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29903 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 29845 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct: 29844 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatat 29785 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29784 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 29725 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 29724 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgc 29665 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29664 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 29605 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 29604 caataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta- 29546 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29545 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 29520
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 652/677 (96%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1383 tacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcat 1325 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 1265 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1264 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaa 1205 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 attgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1145 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 taccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1085 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1084 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaag 1025 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1024 tcatgtcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccc 965 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 cagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctat 905 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 904 caataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataat 845 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 gagccaaactagtatttgcggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaa 785 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| Sbjct: 784 cccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcggtc 726 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 725 gcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 629/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 629/648 (97%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 645/668 (96%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cccgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 638/659 (96%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1349 tagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1291 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 atacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 693
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 638/659 (96%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 638/659 (96%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcgtcgactgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 649/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 55430 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 55372 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 55371 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55312 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55311 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55252 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55251 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55192 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55191 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55132 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55131 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55072 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 55071 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55012 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55011 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 54952 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 54951 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54892 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54891 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54832 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 54831 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 54773 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 54772 ttcaagtaatgccc 54759
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 649/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 125771 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 125713 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 125712 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 125653 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125652 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 125593 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125592 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 125533 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125532 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 125473 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125472 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 125413 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 125412 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 125353 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125352 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 125293 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 125292 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 125233 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125232 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 125173 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 125172 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 125114 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 125113 ttcaagtaatgccc 125100 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 649/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 30711 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 30653 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 30652 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 30593 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30592 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 30533 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30532 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 30473 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30472 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 30413 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30412 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 30353 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 30352 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 30293 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30292 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 30233 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 30232 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 30173 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30172 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 30113 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 30112 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 30054 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 30053 ttcaagtaatgccc 30040
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 649/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 33527190 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 33527248 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 33527249 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 33527308 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527309 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 33527368 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527369 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 33527428 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527429 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 33527488 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527489 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 33527548 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527549 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 33527608 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527609 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 33527668 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 33527669 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 33527728 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527729 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 33527788 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 33527789 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 33527847 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 33527848 ttcaagtaatgccc 33527861 Score = 242 bits (122), Expect = 1e-60 Identities = 144/150 (96%), Gaps = 1/150 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 536 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 595 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 596 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 655 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcat 39115353 Query: 656 gtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115352 gta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 39115324
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 649/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 72387 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 72445 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 72446 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 72505 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72506 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 72565 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72566 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 72625 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72626 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 72685 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72686 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 72745 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 72746 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 72805 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72806 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 72865 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 72866 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 72925 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72926 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 72985 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 72986 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 73044 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 73045 ttcaagtaatgccc 73058
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 649/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 55409 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 55351 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 55350 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55291 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55290 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55231 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55230 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55171 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55111 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55051 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 54991 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54990 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 54931 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 54930 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54871 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54870 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54811 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 54810 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 54752 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 54751 ttcaagtaatgccc 54738
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 620/637 (97%), Gaps = 1/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 108 |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 109 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 168 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 169 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 228 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 229 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 288 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 289 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 349 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 409 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 469 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 529 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 588 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 789 Query: 589 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc 648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc 729 Query: 649 ttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 728 ttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 693
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 628/648 (96%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctctc 744 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 697
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 628/648 (96%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 786 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 785 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctc 726 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 725 ttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 644/668 (96%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 571/572 (99%), Gaps = 1/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 114 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 174 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 234 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 294 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 354 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1875 Query: 414 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1874 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1815 Query: 474 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1814 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 1755 Query: 534 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1754 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 1695 Query: 594 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcac 653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1694 gcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcac 1635 Query: 654 atgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1634 atgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 1604
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 1322 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1262 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 962 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 723 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccc 709
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 55482 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 55424 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 55423 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55364 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55363 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55304 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55303 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55244 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55243 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55184 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55183 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55124 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 55123 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55064 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55063 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 55004 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 55003 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54944 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54943 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54884 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 54883 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 54825 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 54824 ttcaagtaatgccc 54811
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 658/686 (95%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1364 cgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcagg-actccatttggaagcttctcgga 1306 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 taatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1246 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 ctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1186 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1126 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1125 aaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgag 1066 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 tgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1006 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 aacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 946 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 886 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 885 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgc 826 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcatta 766 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 765 caataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgta- 707 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 706 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 681
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 55482 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 55424 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 55423 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55364 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55363 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55304 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55303 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55244 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55243 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55184 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55183 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55124 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 55123 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55064 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55063 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 55004 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 55003 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54944 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54943 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54884 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 54883 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 54825 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 54824 ttcaagtaatgccc 54811
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 124798 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 124740 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 124739 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 124680 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124679 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 124620 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124619 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 124560 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124559 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 124500 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124499 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 124440 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 124439 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 124380 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124379 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 124320 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 124319 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 124260 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124259 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 124200 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 124199 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 124141 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 124140 ttcaagtaatgccc 124127 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 30217 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 30159 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 30158 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 30099 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30098 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 30039 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30038 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 29979 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29978 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 29919 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29918 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 29859 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 29858 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 29799 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29798 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 29739 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 29738 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 29679 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29678 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 29619 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 29618 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 29560 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 29559 ttcaagtaatgccc 29546
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 124798 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 124740 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 124739 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 124680 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124679 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 124620 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124619 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 124560 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124559 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 124500 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124499 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 124440 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 124439 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 124380 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124379 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 124320 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 124319 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 124260 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124259 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 124200 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 124199 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 124141 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 124140 ttcaagtaatgccc 124127 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 30217 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 30159 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 30158 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 30099 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30098 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 30039 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30038 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 29979 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29978 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 29919 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29918 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 29859 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 29858 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 29799 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29798 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 29739 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 29738 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 29679 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29678 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 29619 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 29618 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 29560 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 29559 ttcaagtaatgccc 29546
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 55474 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 55416 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 55415 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 55356 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55355 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 55296 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55295 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 55236 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55235 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 55176 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55175 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 55116 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 55115 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 55056 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55055 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 54996 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 54995 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 54936 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54935 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 54876 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 54875 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 54817 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 54816 ttcaagtaatgccc 54803
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 1322 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1262 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 962 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 723 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccc 709
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1365 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattac 1307 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1306 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1247 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1187 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1127 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1067 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1007 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccag 947 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 887 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 827 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 767 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| Sbjct: 766 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatcttcgcatgta-cccgcagtcgca 708 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 707 ttcaagtaatgccc 694
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1367 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1309 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1308 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1249 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1189 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1129 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1069 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1009 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1008 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 949 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 889 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 888 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 829 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 769 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 768 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 710 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 709 ttcaagtaatgccc 696
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1365 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1307 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1306 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1247 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1187 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1127 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1067 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1007 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1006 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 947 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 887 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 827 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 767 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 766 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 708 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 707 ttcaagtaatgccc 694
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 658/686 (95%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcagg-actccatttggaagcttctcgga 1334 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgag 1094 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 974 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgc 854 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgta- 735 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 734 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1379 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1321 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1320 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1261 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1201 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1141 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1081 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1021 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1020 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 961 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 901 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 900 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 841 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 781 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 780 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 722 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 721 ttcaagtaatgccc 708
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 53684 ttcacaagctgcggctagttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 53626 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 53625 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 53566 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53565 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 53506 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53505 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 53446 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53445 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 53386 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53385 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 53326 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 53325 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 53266 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53265 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 53206 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 53205 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 53146 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53145 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 53086 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 53085 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 53027 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 53026 ttcaagtaatgccc 53013
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 128617 ttcacaagctgcggctagttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 128559 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 128558 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 128499 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128498 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 128439 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128438 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 128379 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128378 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 128319 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128318 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 128259 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 128258 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 128199 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128198 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 128139 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 128138 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 128079 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128078 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 128019 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 128018 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 127960 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 127959 ttcaagtaatgccc 127946
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 10347292 ttcacaagctgcggctagttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 10347234 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 10347233 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 10347174 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347173 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 10347114 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347113 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 10347054 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347053 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 10346994 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346993 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 10346934 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 10346933 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 10346874 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346873 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 10346814 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 10346813 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 10346754 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346753 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 10346694 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 10346693 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 10346635 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 10346634 ttcaagtaatgccc 10346621
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1435 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 1377 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1376 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1317 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1257 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1197 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1137 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1077 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 1017 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 957 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 956 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 897 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 896 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 837 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 836 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 778 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 777 ttcaagtaatgccc 764
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1178 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 1120 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1119 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1060 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1000 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 940 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 880 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 820 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 760 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 700 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 699 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 640 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 639 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 580 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 579 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 521 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 520 ttcaagtaatgccc 507
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 10353331 ttcacaagctgcggctagttcacg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 10353273 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 10353272 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 10353213 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353212 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 10353153 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353152 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 10353093 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353092 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 10353033 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353032 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 10352973 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 10352972 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 10352913 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352912 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 10352853 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 10352852 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 10352793 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352792 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 10352733 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 10352732 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 10352674 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 10352673 ttcaagtaatgccc 10352660
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1767 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 1709 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1708 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1649 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1648 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1589 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1588 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1529 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1469 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1409 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccag 1349 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 1289 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 1288 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 1229 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaaccc 1169 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 1168 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 1110 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 1109 ttcaagtaatgccc 1096
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 648/674 (96%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1800 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 1742 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1741 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 1682 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1681 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1622 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1621 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1562 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1561 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1502 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1501 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1442 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 1441 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 1382 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1381 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 1322 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 1321 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 1262 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ccaaactagtatttgcggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 1202 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 1201 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 1143 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 1142 ttcaagtaatgccc 1129 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 31/33 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatc 87 |||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 638/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 gctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaag 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1296 Query: 85 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 144 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 145 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 204 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 205 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 264 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 265 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 325 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 384 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 385 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 444 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 445 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 505 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 564 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 565 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 624 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 625 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgcc 684 |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct: 755 aaatacggctcttttaatcatttcttcgcatgta-gctgcagtcgcattcaagtaatgcc 697 Query: 685 c 685 | Sbjct: 696 c 696
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 643/668 (96%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 643/668 (96%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 636/659 (96%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1346 tagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1288 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 690
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 624/645 (96%), Gaps = 1/645 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 catttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 100 |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 101 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 160 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 161 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 221 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 281 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 341 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 401 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 460 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 461 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 521 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccg 580 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccca 793 Query: 581 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 640 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 792 gttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctta 733 Query: 641 atcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 732 atcatttcttcacatgta-cctgcagttgcattcaagtaatgccc 689
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 636/659 (96%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 608/623 (97%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 122 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 123 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 183 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 242 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 243 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 302 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 303 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 362 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 363 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 422 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 423 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 483 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 543 aatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaa 602 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaa 738 Query: 603 taggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccc 662 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 737 taggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttcttcacatgta-ccc 679 Query: 663 gcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 678 gcagttgcattcaagtaatgccc 656
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1322 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaa 902 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 723 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccc 709
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattac 1306 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1305 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1246 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1186 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1126 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1066 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1006 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccag 946 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 886 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 885 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 826 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 766 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 765 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatcttcgcatgta-cctgcagtcgca 707 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 706 ttcaagtaatgccc 693
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1322 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttgttcgcatgta-cctgcagtcgca 723 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccc 709
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 649/677 (95%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1298 tacttcacaagctgcggcaagttcaggg-ctccatttgcaagctgctcgaataatttcat 1240 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1239 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagcca 1180 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 ctcgattagctactgcacccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1120 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 attgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaa 1060 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 taccacctgaagccaccggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1000 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 940 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct: 939 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccc 880 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 820 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 819 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataat 760 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 759 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaa 700 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| Sbjct: 699 cccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-gctgcagtt 641 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 640 gcattcaagtaatgccc 624
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 5614522 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 5614464 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 5614463 cttcacgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 5614404 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614403 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 5614344 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614343 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 5614284 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614283 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 5614224 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614223 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 5614164 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614163 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 5614104 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614103 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 5614044 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 5614043 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 5613984 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613983 ccaaactagtatttgcggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 5613924 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 5613923 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 5613865 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 5613864 ttcaagtaatgccc 5613851 Score = 692 bits (349), Expect = 0.0 Identities = 396/409 (96%), Gaps = 2/409 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13436805 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 13436745 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436744 cttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 13436697 Score = 303 bits (153), Expect = 4e-79 Identities = 171/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 436 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 496 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 555 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 556 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 75.8 bits (38), Expect = 2e-10 Identities = 53/57 (92%), Gaps = 1/57 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 24 ggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgag 80 |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 222 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 302 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.60 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 220 ggtcagagctggcatatgccaa 241 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 5614511 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 5614453 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 5614452 cttcacgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 5614393 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614392 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 5614333 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614332 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 5614273 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614272 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 5614213 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614212 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 5614153 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614152 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 5614093 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614092 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>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 38363 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 38421 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 38422 cttcacgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 38481 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38482 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 38541 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38542 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 38601 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38602 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 38661 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38662 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 38721 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 38722 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 38781 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38782 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 38841 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 38842 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 38901 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38902 ccaaactagtatttgcggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 38961 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 38962 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 39020 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 39021 ttcaagtaatgccc 39034
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 618/637 (97%), Gaps = 1/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 108 |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 109 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 168 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 169 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 228 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 229 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 289 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 348 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 349 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 409 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 468 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 469 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 529 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 588 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 589 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc 648 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcatttc 688 Query: 649 ttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 687 ttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 652
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 618/637 (97%), Gaps = 1/637 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 agctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 108 |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 109 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 168 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 169 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 228 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 229 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 289 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 348 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 349 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 409 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 468 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 469 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 529 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 588 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 589 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttc 648 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcatttc 688 Query: 649 ttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 687 ttcacatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 652
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 642/668 (96%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1254 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcac 1196 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1195 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1136 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1076 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1075 cngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1016 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aagcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 956 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cacgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 896 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 716 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 tagtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 656 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 655 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-gctgcagtcgcattcaag 597 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 596 taatgccc 589
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 637/661 (96%), Gaps = 2/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 gctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaag 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 85 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 144 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 145 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 205 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 264 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 265 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 324 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 325 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 385 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 444 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 445 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 504 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 505 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 564 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 565 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 624 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 625 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgcc 684 ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgcc 680 Query: 685 c 685 | Sbjct: 679 c 679
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 642/668 (96%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcagctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgta-cccgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 646/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1322 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 962 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 842 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| Sbjct: 781 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgactgta-cctgcagtcgca 723 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccc 709
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 656/686 (95%), Gaps = 3/686 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 1307 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctttga 1249 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1248 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1189 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1129 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1069 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1009 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 949 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 889 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 gatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 829 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 828 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 769 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| Sbjct: 768 ggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgcatta 709 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 708 caataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgta- 650 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 649 cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 624
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 3/674 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 23203614 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 23203672 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 23203673 cttcacgagcaagatcgcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 23203731 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203732 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 23203791 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203792 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 23203851 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203852 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 23203911 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203912 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 23203971 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203972 tatcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 23204031 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204032 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 23204091 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 23204092 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 23204151 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204152 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 23204211 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 23204212 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 23204270 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 23204271 ttcaagtaatgccc 23204284 Score = 97.6 bits (49), Expect = 5e-17 Identities = 61/64 (95%), Gaps = 1/64 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 24 ggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaa 83 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaa 26711442 Query: 84 gatc 87 |||| Sbjct: 26711441 gatc 26711438 Score = 97.6 bits (49), Expect = 5e-17 Identities = 61/64 (95%), Gaps = 1/64 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 24 ggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaa 83 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaa 26711334 Query: 84 gatc 87 |||| Sbjct: 26711333 gatc 26711330 Score = 42.1 bits (21), Expect = 2.4 Identities = 21/21 (100%) Strand = Plus / Plus Query: 663 gcagtcgcattcaagtaatgc 683 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 27878461 gcagtcgcattcaagtaatgc 27878481
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 3/674 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 154262 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 154320 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 154321 cttcacgagcaagatcgcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 154379 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154380 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 154439 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154440 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 154499 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154500 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 154559 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154560 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 154619 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 154620 tatcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 154679 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154680 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 154739 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 154740 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 154799 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154800 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 154859 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 154860 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 154918 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 154919 ttcaagtaatgccc 154932
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 647/674 (95%), Gaps = 3/674 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 38376 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgatcggataatttcattac 38434 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 38435 cttcacgagcaagatcgcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccaccc 38493 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38494 gattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 38553 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38554 gcaatacagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 38613 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38614 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 38673 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38674 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 38733 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct: 38734 tatcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccag 38793 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38794 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 38853 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 38854 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 38913 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38914 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 38973 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 38974 ctaattccctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 39032 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 39033 ttcaagtaatgccc 39046
>emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1301 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 608/625 (97%), Gaps = 1/625 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 120 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1301 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1242 Query: 121 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1182 Query: 181 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 240 ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 cccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1122 Query: 241 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1121 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcttgagt 1062 Query: 301 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1002 Query: 361 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1001 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgaatatg 942 Query: 421 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 882 Query: 481 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 881 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 822 Query: 541 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattac 600 |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 821 gcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattac 762 Query: 601 aataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacc 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 761 aataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-c 703 Query: 661 ccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 | ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 702 ctgcagtcgcattcaagtaatgccc 678
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 641/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 634/659 (96%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 645/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||| Sbjct: 1350 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttggaagcttgttggataatttcattac 1292 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1291 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactc 1232 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaatt 1172 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 gtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1112 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1111 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacac 1052 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 992 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 991 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 932 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 872 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 871 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 812 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 752 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 751 ctaattccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 693 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 692 ttcaagtaatgccc 679
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 625/649 (96%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 actccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1336 actccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1277 Query: 97 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 156 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1217 Query: 157 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1216 cccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagat 1157 Query: 217 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1156 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1097 Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1096 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttcaataaa 1037 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 977 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 917 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 916 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 857 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 797 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 796 tccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 737 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 736 cttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 689
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 647/677 (95%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 1383 tacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctttgataatttcat 1325 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1324 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttctaaagcca 1265 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 cacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1205 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 attgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1145 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 taccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1085 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1025 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 ttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 965 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 ccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctat 905 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | Sbjct: 904 caataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataat 845 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 gagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaa 785 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| Sbjct: 784 cccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtc 726 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 725 gcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY137451.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 556/557 (99%), Gaps = 1/557 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1374 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1315 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1314 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1255 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1195 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1194 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1135 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 1075 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 1015 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 955 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 895 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 894 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cccgcagtc 836 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcattcaagtaatgccc 819 Score = 143 bits (72), Expect = 9e-31 Identities = 92/97 (94%), Gaps = 2/97 (2%) Strand = Plus / Minus Query: 1 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggn 59 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1502 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcngctcgga 1444 Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1443 taatttcattaccttcgcnagcaagatcacgcccttc 1407
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 640/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 624/648 (96%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 919 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 918 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 859 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 858 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatccc 799 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 798 ccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctctc 739 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 ttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 692
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 640/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (rbcL) gene, partial cds Length = 1324 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 623/648 (96%), Gaps = 1/648 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ctccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 97 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1324 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1265 Query: 98 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 157 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatty 1205 Query: 158 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1204 ycccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1145 Query: 218 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 277 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1144 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1085 Query: 278 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1025 Query: 338 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 965 Query: 398 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 905 Query: 458 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 517 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 904 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 845 Query: 518 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 577 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 844 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatccc 785 Query: 578 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctc 637 || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 784 ccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctctc 725 Query: 638 ttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 724 ttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 678
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 640/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttccc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgta-cccgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>emb|AJ746280.1| Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1316 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 607/626 (96%), Gaps = 1/626 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 119 ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1313 taatttccttaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1254 Query: 120 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1253 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttc 1194 Query: 180 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 239 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1193 ctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1134 Query: 240 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 299 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1133 aaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgag 1074 Query: 300 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1073 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1014 Query: 360 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 954 Query: 420 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 953 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 894 Query: 480 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 539 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 893 tctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 834 Query: 540 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 599 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 833 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 774 Query: 600 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 773 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta- 715 Query: 660 cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 714 cctgcagtygcattcaagtaatgccc 689
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 644/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1367 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgctagctgctcggataatttcattac 1309 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1308 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1249 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1189 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1129 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1128 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagacac 1069 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1009 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1008 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccag 949 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 889 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 888 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 829 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 769 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| Sbjct: 768 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgactgta-cctgcagtcgca 710 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 709 ttcaagtaatgccc 696
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 632/658 (96%), Gaps = 2/658 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 agttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatc 87 |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 88 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 147 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 148 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 207 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 208 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 268 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 327 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 328 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 388 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 447 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 448 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 507 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 508 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 567 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 568 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 627 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 628 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 || ||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatatcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 709
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 646/677 (95%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1383 tacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgcttggataatttcat 1325 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1324 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1265 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 cccgattagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1205 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 attgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaa 1145 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1144 taccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaaga 1085 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taccgcgcgaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1025 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 965 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 cagacatacgcaatgcttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 905 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | Sbjct: 904 caataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataat 845 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 gagataaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaa 785 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| Sbjct: 784 cccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-gctgcagtc 726 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 725 gcattcaagtaatgccc 709
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 624/649 (96%), Gaps = 1/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 actccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 96 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1299 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1240 Query: 97 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 156 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1239 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatt 1180 Query: 157 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 216 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1179 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagat 1120 Query: 217 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1119 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1060 Query: 277 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 336 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1000 Query: 337 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 940 Query: 397 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 456 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 880 Query: 457 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 516 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 820 Query: 517 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 576 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 760 Query: 577 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 636 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 759 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctct 700 Query: 637 cttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 699 cttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 652
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 646/677 (95%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tacttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcat 68 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 1383 tacttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctttgataatttcat 1325 Query: 69 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 128 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1324 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttctaaagcca 1265 Query: 129 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 188 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 cacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1205 Query: 189 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 248 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 attgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1145 Query: 249 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 308 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 taccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1085 Query: 309 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 368 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1025 Query: 369 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 428 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 ttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccc 965 Query: 429 cagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctat 488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 ccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctat 905 Query: 489 caataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagt 548 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | Sbjct: 904 caataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataat 845 Query: 549 gagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaa 608 ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 844 gagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaa 785 Query: 609 cccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtc 668 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| Sbjct: 784 cccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtc 726 Query: 669 gcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||||||| Sbjct: 725 gcattcaagtaatgccc 709
>gb|AY395529.1| Arrhenatherum elatius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1259 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 594/609 (97%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 136 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1255 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1196 Query: 137 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 196 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1195 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1136 Query: 197 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 256 || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 acggaatcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1076 Query: 257 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1016 Query: 317 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 956 Query: 377 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 436 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cgttccccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 896 Query: 437 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 836 Query: 497 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 556 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 835 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 776 Query: 557 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 616 |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 775 ctagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 716 Query: 617 tctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaa 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 715 tctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgta-cctgcagtcgcattcaa 657 Query: 677 gtaatgccc 685 ||||||||| Sbjct: 656 gtaatgccc 648
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 639/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 639/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 639/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 cccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 639/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaag 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 745 ctctcgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtagcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 639/668 (95%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 agctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgc 77 |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcagg-actccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcac 1286 Query: 78 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 137 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 138 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 197 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 198 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 257 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 258 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 317 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 318 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 377 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 378 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 438 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 498 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 557 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 558 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 617 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 618 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaag 677 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaag 687 Query: 678 taatgccc 685 |||||||| Sbjct: 686 taatgccc 679
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 643/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcag-cactccatttgcaagctgctttgataatttcattac 1322 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacac 1262 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 ccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1081 cgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta 1022 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccg 962 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 902 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 901 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 782 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 781 ctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 723 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 722 ttcaagtaatgccc 709
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 643/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 58253 ttcacaagctgcggctagttcag-cactccatttgcaagctgctttgataatttcattac 58195 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 58194 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacac 58135 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58134 gattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 58075 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58074 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 58015 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58014 ccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 57955 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 57954 cgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta 57895 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 57894 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccg 57835 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57834 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 57775 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 57774 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 57715 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57714 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 57655 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 57654 ctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 57596 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 57595 ttcaagtaatgccc 57582
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 641/671 (95%), Gaps = 2/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1306 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1305 cttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1246 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1186 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1185 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatac 1126 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1066 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1006 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccag 946 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 acatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 886 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 885 taactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 826 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 825 ccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagccc 766 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| Sbjct: 765 ctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgtaccgc-aagtcgca 707 Query: 672 ttcaagtaatg 682 ||||||||||| Sbjct: 706 ttcaagtaatg 696
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 643/674 (95%), Gaps = 2/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 ttcacaagctgcggctagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattac 71 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 120461 ttcacaagctgcggctagttcag-cactccatttgcaagctgctttgataatttcattac 120403 Query: 72 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 131 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 120402 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacac 120343 Query: 132 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 191 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120342 gattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 120283 Query: 192 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 251 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120282 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 120223 Query: 252 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 311 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120222 cccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 120163 Query: 312 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 371 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 120162 cgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta 120103 Query: 372 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccag 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 120102 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccg 120043 Query: 432 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 491 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120042 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 119983 Query: 492 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 119982 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 119923 Query: 552 ccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 611 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119922 acaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattacaataggaaccc 119863 Query: 612 ctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgca 671 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| Sbjct: 119862 ctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgta-cctgcagtcgca 119804 Query: 672 ttcaagtaatgccc 685 |||||||||||||| Sbjct: 119803 ttcaagtaatgccc 119790
>gb|U13229.1|PAU13229 Phragmites australis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1320 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 619/643 (96%), Gaps = 1/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 tttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 102 |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1320 tttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1261 Query: 103 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 162 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1201 Query: 163 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 222 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1200 agggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggt 1141 Query: 223 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 282 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1081 Query: 283 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 342 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttcaataaaatcatc 1021 Query: 343 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 402 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 961 Query: 403 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 462 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 901 Query: 463 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 522 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 900 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 841 Query: 523 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 582 ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 840 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcctccagt 781 Query: 583 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 642 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 780 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaat 721 Query: 643 catttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 720 catttcttcgcatgta-cctgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 632/659 (95%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 cgggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccg 1097 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cagtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 736 ataccgctctcttcatcatttcttcgcatgta-cccgcagtcgcattcaagtaatgccc 679
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 632/659 (95%), Gaps = 2/659 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tagttcaggnactccatttgcaagctgctcggntaatttcattaccttcgcgagcaagat 86 ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcagg-actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagat 1277 Query: 87 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 146 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 147 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 206 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 207 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 266 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 267 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 326 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 327 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 386 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 387 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 446 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 447 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 506 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 507 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 566 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 567 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 626 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 627 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccccgcagtcgcattcaagtaatgccc 685 ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgta-cctgcagttgcattcaagtaatgccc 679 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 5,170,421 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 5170421 Number of successful extensions: 145733 Number of sequences better than 10.0: 15306 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15259 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 63 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 100419 Number of HSP's gapped (non-prelim): 23800 length of query: 685 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 662 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11348863080048 effective search space used: 11348863080048 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)