| Clone Name | basd2i19 |
|---|---|
| Clone Library Name | barley_pub |
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 921 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 981 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 1041 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 1101 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 1161 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 1221 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 1281 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 1341 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1342 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 1400 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 1458 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 1459 gtgttatgagtgt 1471
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 608/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137451.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgtyacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgktatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaagn-gttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttncaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgnaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatttacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatttacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatctnctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 440 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 499 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 618 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 440 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 499 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 618 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 440 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 499 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 618 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aaytcttnattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactkatggacttaccagtcttgatcgtthcaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttacyaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgcngaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agaggggtccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccacctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54877 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54935 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54936 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 54995 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54996 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 55055 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55056 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 55115 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55116 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 55175 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55176 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 55235 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 55236 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 55295 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55296 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 55355 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55356 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 55414 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55415 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 55472 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 55473 gtgttatgagtgt 55485
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 63 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 121 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 181 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 241 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 301 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 361 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 362 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 421 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 422 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 481 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 482 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 541 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 542 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 600 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 601 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 658 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 659 gtgttatgagtgt 671
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgnttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcnaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 27 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 85 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 86 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 145 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 146 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 205 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 265 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 266 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 325 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 326 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 385 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 386 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 445 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 446 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttgttcaaaaactttcca 505 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 506 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 564 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 565 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 622 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 623 gtgttatgagtgt 635
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcatcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-atc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtacgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 601/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggnnnccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 601/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaagatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtntgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 601/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 574/579 (99%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 598/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtwagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccaktcttgatcgttacaaasgacgatgctatcacatcsarcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>emb|Z49844.1|HBCHRBPCX H.brachyantherum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1224 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 574/579 (99%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 573/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 599/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttnggttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagaganaagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 573/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY607059.1| Psathyrostachys rupestris subsp. rupestris voucher H6701 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1611 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 599/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 136 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 376 tgttcctggggaagaggagcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcccactgcttattcaaaaactttcca 555 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 599/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 315 tgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttactcaaaaactttcca 494 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaacctaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 598/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 19 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 77 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 78 aggtgttgggtttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 137 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 138 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 197 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 198 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 257 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 258 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 317 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 318 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 377 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 378 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 437 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 438 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttgttcaaaaactttcca 497 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 498 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 556 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 557 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agc 614 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 615 gtgttatgagtgt 627
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 596/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| Sbjct: 440 agagggttccgttactaacntgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttnaaagc 499 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaananntaagttgannnagtatgg-tcgtcctt 618 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 571/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgcttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 570/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 121 cgagtaagtccacagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgncgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 561/567 (98%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 560/567 (98%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 569/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagtcctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtgtttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctagcaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 568/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagan 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 568/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 548/553 (99%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 60 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 120 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 180 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 240 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 300 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 360 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 420 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 421 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 479 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 537 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 538 gtgttatgagtgt 550
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 594/613 (96%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 66 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 124 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 125 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagta 184 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct: 185 tgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttcc 244 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 245 gccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 304 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 305 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 364 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 365 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 424 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 425 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 484 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 485 cctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttcca 544 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 545 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 603 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 604 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agc 661 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| Sbjct: 662 gtgttatgagtgt 674
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 557/567 (98%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtg 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaagatctacgaattccccctacttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 566/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttgggtttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctgcgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 61 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 60 Query: 121 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 120 Query: 181 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 180 Query: 241 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 240 Query: 301 cctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 360 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 300 Query: 361 gaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaa 420 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 301 gaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaa 360 Query: 421 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 420 Query: 481 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcc 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 421 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcc 479 Query: 541 tttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaa 600 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 480 tttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-a 537 Query: 601 gcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||| Sbjct: 538 gcgtgttatgagtgt 552
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 61 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 60 Query: 121 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 120 Query: 181 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 180 Query: 241 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 240 Query: 301 cctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 360 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 300 Query: 361 gaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaa 420 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 301 gaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaa 360 Query: 421 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 420 Query: 481 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcc 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 421 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcc 479 Query: 541 tttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaa 600 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 480 tttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-a 537 Query: 601 gcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||| Sbjct: 538 gcgtgttatgagtgt 552
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 550/559 (98%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 121 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 550/559 (98%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 121 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 550/559 (98%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaggtgttggattcaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 564/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagannnt 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagcatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 541/548 (98%), Gaps = 3/548 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 127 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 60 Query: 128 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 120 Query: 188 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 180 Query: 248 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 240 Query: 308 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagg 367 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 241 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagg 300 Query: 368 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 301 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctac 360 Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 420 Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt- 478 Query: 548 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgtt 607 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 479 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgtt 537 Query: 608 atgagtgt 615 |||||||| Sbjct: 538 atgagtgt 545
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 534/539 (99%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 62 Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 63 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 122 Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 182 Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 183 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaag 242 Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 243 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 302 Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 362 Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 363 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 422 Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 423 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 480 Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 481 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 538
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 534/539 (99%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 62 Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 63 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 122 Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 182 Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 183 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaag 242 Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 243 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 302 Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 362 Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 363 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 422 Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 423 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 480 Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 481 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 538
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 554/567 (97%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tattacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 562/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 561/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctgcttatacaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 536/546 (98%), Gaps = 3/546 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 70 ggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaact 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaact 60 Query: 130 aaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaa 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaa 120 Query: 190 gaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggact 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggact 180 Query: 250 gatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgct 309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 181 gatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcct 240 Query: 310 ggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggt 369 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 241 ggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggt 300 Query: 370 tccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgt 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 301 tccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgt 360 Query: 430 gctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccg 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccg 420 Query: 490 cctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggg 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 421 cctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gg 478 Query: 550 gatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttat 609 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 479 gatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttat 537 Query: 610 gagtgt 615 |||||| Sbjct: 538 gagtgt 543
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 560/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacttatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 cccgttgcttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 558/577 (96%), Gaps = 3/577 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 39 gtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataa 98 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 gtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataa 60 Query: 99 attgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccg 158 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 attgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccg 120 Query: 159 agtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 218 ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 agtaactcctcaacctggggttcctccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 180 Query: 219 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 240 Query: 279 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgt 338 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 241 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgt 300 Query: 339 agcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 398 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 agcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 360 Query: 399 gggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcc 458 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcc 420 Query: 459 ccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 518 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 tcctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 480 Query: 519 gttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggatta 578 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 gttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggatta 538 Query: 579 tccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 574
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 559/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatactatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 557/577 (96%), Gaps = 3/577 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 39 gtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataa 98 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 gtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattataa 60 Query: 99 attgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccg 158 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 attgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccg 120 Query: 159 agtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 218 ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 agtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 180 Query: 219 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 240 Query: 279 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgt 338 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 241 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgt 300 Query: 339 agcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 398 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 agcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 360 Query: 399 gggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcc 458 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcc 420 Query: 459 ccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 518 |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 480 Query: 519 gttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggatta 578 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 gttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggatta 538 Query: 579 tccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 574
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 544/560 (97%), Gaps = 3/560 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 60 Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctg 120 Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180 Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240 Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 300 Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 301 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360 Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 361 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaa 420 Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-t 479 Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 480 cgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacgg 538 Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615 ||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 535/548 (97%), Gaps = 3/548 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 60 Query: 128 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 120 Query: 188 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 180 Query: 248 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttc 240 Query: 308 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagg 367 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 241 ctggggaagaggagcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagg 300 Query: 368 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 301 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctac 360 Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgctctacgtttggaggatctacgaattcccactgcttattcaaaaactttccaaggcc 420 Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt- 478 Query: 548 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgtt 607 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 479 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgtt 537 Query: 608 atgagtgt 615 |||||||| Sbjct: 538 atgagtgt 545
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcgattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 558/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatatatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 545/562 (96%), Gaps = 3/562 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 aactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 62 Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct: 63 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 122 Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 tggagttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 182 Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 183 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 242 Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 243 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 302 Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 362 Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 363 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaa 422 Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 423 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 482 Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 483 -tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattac 540 Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 541 ggtag-agcgtgttatgagtgt 561
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 544/561 (96%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 62 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 63 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcct 122 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 182 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 183 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 242 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 243 atcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagat 302 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 362 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 363 ttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaa 422 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 423 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg- 481 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 482 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacg 540 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 541 gtag-agcgtgttatgagtgt 560
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 549/568 (96%), Gaps = 3/568 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 48 aacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgactta 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 aacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgactta 60 Query: 108 ctacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcc 167 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 61 ctacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcc 120 Query: 168 tcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactgg 227 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 tcagcctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactgg 180 Query: 228 tacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatg 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatg 240 Query: 288 ctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcc 347 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 ctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcc 300 Query: 348 attagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgt 407 ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 301 attagacttatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgt 360 Query: 408 atttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctactta 467 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 361 atttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgctta 420 Query: 468 ttcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaa 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ttcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaa 480 Query: 528 gtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaa 587 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 481 gtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaa 538 Query: 588 aattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 aattacggtag-agcgtgttatgagtgt 565
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 548/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 542/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 543/561 (96%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 60 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct: 61 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacct 120 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 180 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 atcgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 300 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 360 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 361 ttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaa 420 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg- 479 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 480 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacg 538 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 543/561 (96%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 62 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct: 63 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacct 122 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 182 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 183 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 242 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 243 atcgatcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 302 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 362 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 363 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaa 422 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 423 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg- 481 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 482 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacg 540 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 541 gtag-agcgtgttatgagtgt 560
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 542/560 (96%), Gaps = 3/560 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 60 Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctg 120 Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180 Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240 Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 300 Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 301 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360 Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 361 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaa 420 Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-t 479 Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 480 cgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacgg 538 Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615 ||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttat 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 gcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 gcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 gcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattgtccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 541/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagatct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 556/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaaatgttggatttaaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaacccctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgcctggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattaggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 540/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacccgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 545/566 (96%), Gaps = 3/566 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 50 cagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109 |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 cagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattataaattgacttact 60 Query: 110 acaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 169 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 61 acaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctc 120 Query: 170 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 229 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 180 Query: 230 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 240 Query: 290 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccat 349 |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 241 atcacatcgagcctgttgctggggaagagagtcaatttatcgcttatgtagcttatccat 300 Query: 350 tagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 409 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 tagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 360 Query: 410 ttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttatt 469 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 ttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttatt 420 Query: 470 caaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 529 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 caaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 480 Query: 530 atggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 589 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 atgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 538 Query: 590 ttatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 ttacggtag-agcgtgttatgagtgt 563
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 532/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttaaagcaggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccc 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 gctggggaagacaatcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccactgcttattcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 539/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttattcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 544/566 (96%), Gaps = 3/566 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 50 cagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109 |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 4 cagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattatagattgacttact 63 Query: 110 acaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 169 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 64 acaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 123 Query: 170 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 229 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124 accctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 183 Query: 230 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 289 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 184 catggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 243 Query: 290 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccat 349 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 244 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatggatctgttatgtagcttatccat 303 Query: 350 tagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 409 |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 304 tagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtat 363 Query: 410 ttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttatt 469 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 364 ttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttatt 423 Query: 470 caaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 529 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 424 caaaaactttccaaggcccgcctcacggtatccaagtggaaagagataagttgaacaagt 483 Query: 530 atggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 589 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 484 atgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaa 541 Query: 590 ttatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 542 ttacggtag-agcgtgttatgagtgt 566
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 546/569 (95%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 47 aaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgactt 106 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 aaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgactt 60 Query: 107 actacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtc 166 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 61 actacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactc 120 Query: 167 ctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactg 226 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactg 180 Query: 227 gtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgat 286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 gtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgat 240 Query: 287 gctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatc 346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 gctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatc 300 Query: 347 cattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacg 406 |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 cattagacttatttgaagaaggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacg 360 Query: 407 tatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctactt 466 ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 361 tatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgctt 420 Query: 467 attcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaaca 526 || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 atgcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaaca 480 Query: 527 agtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaa 586 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 481 agtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaa 538 Query: 587 aaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 aaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 566
>emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1301 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 530/548 (96%), Gaps = 3/548 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 68 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 127 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaa 60 Query: 128 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 187 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 61 ccaaggatactgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcctggggttccgccgg 120 Query: 188 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 180 Query: 248 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 240 Query: 308 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagg 367 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 241 ctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagaag 300 Query: 368 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 301 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctac 360 Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgctctacgtctggaagatctacgaattccccctgcttattcaaaaactttccaaggcc 420 Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattg 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tcgtcctttatt- 478 Query: 548 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgtt 607 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 479 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgtt 537 Query: 608 atgagtgt 615 |||||||| Sbjct: 538 atgagtgt 545
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 523/539 (97%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 2 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 61 Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196 ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 62 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcag 121 Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 181 Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 241 Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 242 acggccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtta 301 Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 361 Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 362 gtttggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatg 421 Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 422 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 479 Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 480 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 537
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 538/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 538/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746280.1| Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1316 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 538/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggattccaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccgttagactt 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtcggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatgcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 523/539 (97%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 2 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 61 Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196 ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 62 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcag 121 Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 181 Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 241 Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 242 acggccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtta 301 Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 361 Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 362 gtttggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatg 421 Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 422 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 479 Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 480 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 537
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggastatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 gctggggaagacagtcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb|AJ746255.1| Aira praecox chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1126 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccg 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| Sbjct: 241 gctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccgttagacttatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtcggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatgcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|AF458076.1| Trithuria submersa ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1333 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaastcctcaacccggggttccgccg 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 gctggggaagatagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgkgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 525/543 (96%), Gaps = 3/543 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 73 tttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaag 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1 tttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaag 60 Query: 133 gatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaa 192 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 61 gatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaa 120 Query: 193 gcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgat 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgat 180 Query: 253 ggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggg 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggg 240 Query: 313 gaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttcc 372 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 241 gaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttcc 300 Query: 373 gttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgct 432 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 301 gttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgct 360 Query: 433 ctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcct 492 |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 ctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcct 420 Query: 493 catggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggat 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 421 catggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggat 478 Query: 553 gtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgag 612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 479 gtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgag 537 Query: 613 tgt 615 ||| Sbjct: 538 tgt 540
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 522/539 (96%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 60 Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196 ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 61 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcag 120 Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 180 Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 240 Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 241 acaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgtta 300 Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 360 Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496 || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatg 420 Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 421 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 478 Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 536
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 565/597 (94%), Gaps = 3/597 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 19 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaa 78 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 400 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaa 459 Query: 79 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatact 138 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 460 gctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggatact 519 Query: 139 gatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 198 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 520 gatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagcaggg 579 Query: 199 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 258 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 580 gctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 639 Query: 259 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct: 640 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggaagaa 699 Query: 319 agccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttact 378 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 700 gatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttact 759 Query: 379 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgt 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 760 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgt 819 Query: 439 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggt 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 820 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcacggt 879 Query: 499 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtacta 558 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 880 atccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-gcgtcctttatt-gggatgtacta 937 Query: 559 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 938 ttaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 993
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagacagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggactactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagacagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 536/559 (95%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaaatgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaacccctcaacctgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgcctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattaggattatccgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 548/575 (95%), Gaps = 3/575 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttaaagccggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttattacactccagagtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcctggggttccccctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggatgaaggtcaatatatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 cctcctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatga 611 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatga 572
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 564/597 (94%), Gaps = 3/597 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 19 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaa 78 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 420 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaa 479 Query: 79 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatact 138 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 480 gctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggatact 539 Query: 139 gatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 198 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 540 gatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagcaggg 599 Query: 199 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 258 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 600 gctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 659 Query: 259 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || Sbjct: 660 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggaggaa 719 Query: 319 agccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttact 378 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 720 gatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttact 779 Query: 379 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgt 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 780 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgt 839 Query: 439 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggt 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 840 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcacggt 899 Query: 499 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtacta 558 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 900 atccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-gcgtcctttatt-gggatgtacta 957 Query: 559 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 958 ttaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 1013
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 519/538 (96%), Gaps = 3/538 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 78 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatac 137 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatac 60 Query: 138 tgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 197 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 tgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcagg 120 Query: 198 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 180 Query: 258 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgttgctggggaaga 240 Query: 318 cagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttac 377 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 241 caaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttac 300 Query: 378 taacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacg 437 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 taacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacg 360 Query: 438 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatgg 497 | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 361 tctggaggatctacgaattcccgttgcttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatgg 420 Query: 498 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtact 557 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 421 tatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtact 478 Query: 558 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 535
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 519/538 (96%), Gaps = 3/538 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 78 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatac 137 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatac 60 Query: 138 tgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 197 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 tgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcagg 120 Query: 198 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 180 Query: 258 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgttgctggggaaga 240 Query: 318 cagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttac 377 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 241 caaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttac 300 Query: 378 taacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacg 437 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 taacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacg 360 Query: 438 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatgg 497 | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 361 tctggaggatctacgaattcccgttgcttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatgg 420 Query: 498 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtact 557 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 421 tatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtact 478 Query: 558 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 535
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 527/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccg 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgctgtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgctgctatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 gctggggaagaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccacctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb|AJ746294.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1295 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 517/537 (96%), Gaps = 3/537 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 79 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatact 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatact 60 Query: 139 gatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 198 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 gatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 120 Query: 199 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 121 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaacagtttggactgatggactt 180 Query: 259 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagac 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 181 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagac 240 Query: 319 agccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttact 378 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 241 ggccaatggatcgcttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttact 300 Query: 379 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgt 438 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 aacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgt 360 Query: 439 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggt 498 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 361 ctggaagatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggt 420 Query: 499 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtacta 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtacta 478 Query: 559 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 534
>gb|L24073.1|RICCHRBCLA Oryza sativa chloroplast rubisco large subunit (rbcL) mRNA, complete cds Length = 1355 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 575/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 60 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 61 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 120 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 121 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 180 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 240 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 241 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 300 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 360 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 361 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 420 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 480 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 481 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 539 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 540 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 597 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 598 atgttatgagtgt 610
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 576/613 (93%), Gaps = 5/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123307 aattcttaattcatg-agttgtaggg-gggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 123364 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 123365 aagtgttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 123424 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 123425 cgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 123484 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123485 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 123544 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123545 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 123604 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123605 cgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 123664 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 123665 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 123724 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123725 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 123784 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 123785 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 123843 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| Sbjct: 123844 tatt-gggatgtactattaaacaaaaatggggattatccgcgataaattatggtag-agc 123901 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 123902 atgttatgagtgt 123914 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 576/613 (93%), Gaps = 5/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28780 aattcttaattcatg-agttgtaggg-gggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 28837 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 28838 aagtgttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 28897 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 28898 cgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 28957 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28958 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29017 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29018 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 29077 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29078 cgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29137 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 29138 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29197 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29198 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29257 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29258 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 29316 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| Sbjct: 29317 tatt-gggatgtactattaaacaaaaatggggattatccgcgataaattatggtag-agc 29374 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 29375 atgttatgagtgt 29387
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 518/539 (96%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 5 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 64 Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 65 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcag 124 Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 184 Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 185 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 244 Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| Sbjct: 245 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacttatttgaagaaggttccgtta 304 Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 305 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 364 Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496 || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 365 gtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggtccgcctcatg 424 Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 425 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 482 Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 483 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 540
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 518/539 (96%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 5 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 64 Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 65 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcag 124 Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 184 Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 185 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 244 Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| Sbjct: 245 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacttatttgaagaaggttccgtta 304 Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 305 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 364 Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496 || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 365 gtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggtccgcctcatg 424 Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 425 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 482 Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 483 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 540
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54070 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54128 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54129 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54188 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 54189 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54248 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54249 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54308 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54309 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54368 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54369 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54428 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54429 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54488 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54489 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54548 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 54549 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54607 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54608 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54665 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 54666 atgttatgagtgt 54678
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54070 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54128 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54129 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54188 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 54189 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54248 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54249 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54308 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54309 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54368 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54369 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54428 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54429 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54488 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54489 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54548 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 54549 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54607 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54608 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54665 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 54666 atgttatgagtgt 54678
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54018 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54076 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54077 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54136 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 54137 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54196 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54197 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54256 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54257 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54316 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54317 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54376 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54377 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54436 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54437 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54496 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 54497 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54555 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54556 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54613 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 54614 atgttatgagtgt 54626
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124359 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 124417 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124418 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 124477 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 124478 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 124537 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 124597 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124598 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 124657 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124658 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 124717 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 124718 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 124777 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124778 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 124837 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 124838 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 124896 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124897 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 124954 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 124955 atgttatgagtgt 124967 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29299 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 29357 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 29358 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 29417 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 29418 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 29477 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29478 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29537 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29538 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 29597 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29598 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29657 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 29658 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29717 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29718 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29777 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 29778 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 29836 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29837 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 29894 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 29895 atgttatgagtgt 29907
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123386 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 123444 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 123445 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 123504 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 123505 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 123564 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123565 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 123624 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 123625 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 123684 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123685 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 123744 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 123745 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 123804 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123805 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 123864 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 123865 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 123923 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 123924 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 123981 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 123982 atgttatgagtgt 123994 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28805 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 28863 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 28864 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 28923 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 28924 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 28983 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28984 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29043 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29044 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 29103 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29104 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29163 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 29164 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29223 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29224 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29283 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 29284 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 29342 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29343 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 29400 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 29401 atgttatgagtgt 29413
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123386 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 123444 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 123445 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 123504 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 123505 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 123564 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123565 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 123624 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 123625 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 123684 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123685 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 123744 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 123745 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 123804 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123805 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 123864 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 123865 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 123923 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 123924 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 123981 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 123982 atgttatgagtgt 123994 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28805 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 28863 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 28864 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 28923 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 28924 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 28983 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 28984 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29043 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29044 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 29103 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29104 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29163 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 29164 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29223 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29224 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29283 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 29284 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 29342 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29343 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 29400 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 29401 atgttatgagtgt 29413
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54062 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54120 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54121 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54180 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 54181 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54240 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54241 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54300 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54301 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54360 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54361 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54420 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54421 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54480 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54481 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54540 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 54541 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54599 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54600 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54657 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 54658 atgttatgagtgt 54670
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 81 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 82 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 141 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 142 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 201 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 202 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 261 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 262 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 321 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 322 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 381 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 382 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 441 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 442 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 501 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 502 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 560 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 561 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 618 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 619 atgttatgagtgt 631
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53997 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54055 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54056 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54115 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 54116 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54175 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54176 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54235 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 54236 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54295 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54296 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54355 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 54356 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54415 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54416 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54475 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 54476 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54534 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54535 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54592 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 54593 atgttatgagtgt 54605
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 525/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 gctggggaagaaactcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccaatgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtctggaggatctacgaattcccactacttattcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 388 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 446 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 447 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 506 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 507 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 566 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 567 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 626 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 627 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 686 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 687 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 746 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 747 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 806 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 866 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 867 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 925 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 926 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 983 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 984 atgttatgagtgt 996
>gb|AY632370.1| Phaenosperma globosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1143 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 514/535 (96%), Gaps = 3/535 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 81 tggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactga 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1 tggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactga 60 Query: 141 tatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggc 200 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 tatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggc 120 Query: 201 tgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttac 260 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 tgcagtagctgtcgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttac 180 Query: 261 cagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacag 320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 181 cagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctagggaagacag 240 Query: 321 ccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaa 380 |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 241 tcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccattactaa 300 Query: 381 catgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgttt 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 301 catgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtct 360 Query: 441 ggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtat 500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 361 ggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtat 420 Query: 501 ccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactatt 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| Sbjct: 421 ccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtccttt-tttgggatgtactatt 478 Query: 561 aaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 aaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 532
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 507/526 (96%), Gaps = 3/526 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 90 agattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggc 149 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1 agattatagattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggc 60 Query: 150 agcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagc 209 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 agcattccgagtaagtcctcaacctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagc 120 Query: 210 tgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttga 269 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 121 tgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttga 180 Query: 270 tcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggat 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 181 tcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatggat 240 Query: 330 ctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttac 389 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 ctgttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttac 300 Query: 390 ttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatct 449 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 301 ttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatct 360 Query: 450 acgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttga 509 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 361 acgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcacggtatccaagtgga 420 Query: 510 aagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaa 569 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 aagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaa 478 Query: 570 ttgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 ttgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 523
>gb|AY395529.1| Arrhenatherum elatius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1259 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 501/518 (96%), Gaps = 3/518 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 98 aattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattcc 157 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 aattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattcc 60 Query: 158 gagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaat 217 |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 gagtaactcctcaacctggagttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaat 120 Query: 218 cttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttaca 277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttaca 180 Query: 278 aaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatg 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 181 aaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatagatctgttatg 240 Query: 338 tagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattg 397 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattg 300 Query: 398 tgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 457 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 301 tgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 360 Query: 458 cccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagata 517 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagata 420 Query: 518 agttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggatt 577 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 agttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggatt 478 Query: 578 atccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 atccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 515
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 52272 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 52330 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 52331 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 52390 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 52391 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 52450 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 52451 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 52510 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 52511 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 52570 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 52571 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 52630 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 52631 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 52690 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 52691 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 52750 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 52751 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 52809 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 52810 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 52867 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 52868 atgttatgagtgt 52880
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 127205 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 127263 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 127264 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 127323 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 127324 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 127383 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 127384 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 127443 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 127444 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 127503 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 127504 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 127563 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 127564 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 127623 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 127624 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 127683 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 127684 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 127742 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 127743 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 127800 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 127801 atgttatgagtgt 127813
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10345880 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 10345938 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 10345939 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 10345998 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 10345999 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 10346058 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346059 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 10346118 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10346119 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 10346178 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346179 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 10346238 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 10346239 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 10346298 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346299 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 10346358 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 10346359 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 10346417 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346418 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 10346475 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 10346476 atgttatgagtgt 10346488
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23205025 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 23204967 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 23204966 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 23204907 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 23204906 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 23204847 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204846 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 23204787 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23204786 ttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 23204727 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204726 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 23204667 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 23204666 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 23204607 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204606 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 23204547 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 23204546 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 23204488 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204487 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 23204430 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 23204429 atgttatgagtgt 23204417
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 560/597 (93%), Gaps = 3/597 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33547396 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 33547454 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 33547455 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 33547514 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 33547515 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 33547574 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33547575 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 33547634 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33547635 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 33547694 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33547695 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 33547754 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 33547755 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 33547814 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33547815 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 33547874 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 33547875 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 33547933 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtaga 599 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 33547934 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtaga 33547989 Score = 151 bits (76), Expect = 3e-33 Identities = 100/107 (93%), Gaps = 1/107 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 14122784 aattcttaattcat-tagttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 14122842 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109 | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 14122843 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttact 14122889 Score = 105 bits (53), Expect = 2e-19 Identities = 131/155 (84%), Gaps = 4/155 (2%) Strand = Plus / Minus Query: 149 cagcattccgagtaagtcctcagcctgggg-ttccgcccgaagaagcaggggctgcagta 207 ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||| || |||| || || Sbjct: 30075609 cagcattccgagtaactcctcagacggggggttccgcccaaaggaga---ggctacaata 30075553 Query: 208 gctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtctt 267 ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 30075552 gctaccaaatcttctactggtacatggacaattgtttggattaatggacttactagtctt 30075493 Query: 268 gatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||| | |||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct: 30075492 gattgctacaaaggcttatgctatcacatcaagcc 30075458 Score = 101 bits (51), Expect = 3e-18 Identities = 91/103 (88%), Gaps = 1/103 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487 ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 30075105 gtgctctacgtccagaggat-tacgaattccctctacttattcaaaaacttttcaaggac 30075047 Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagta 530 | |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| Sbjct: 30075046 cacctcatggtatctaagttgcaagggataagttcaacaagta 30075004 Score = 79.8 bits (40), Expect = 1e-11 Identities = 70/80 (87%) Strand = Plus / Minus Query: 36 tatgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 95 ||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || |||| Sbjct: 30075723 tatgtcaccggaaacagaaactaaagaaaatgttaaatttcaagctggtgtcaagaatta 30075664 Query: 96 taaattgacttactacaccc 115 |||||||||||||||||||| Sbjct: 30075663 taaattgacttactacaccc 30075644
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 524/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacggtgttatcacatcgagcctgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagaaagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaaactttccaaggg 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccacctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-gcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 560/597 (93%), Gaps = 3/597 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 92593 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 92651 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 92652 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 92711 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 92712 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 92771 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 92772 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 92831 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 92832 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 92891 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 92892 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 92951 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 92952 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 93011 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 93012 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 93071 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 93072 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 93130 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtaga 599 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 93131 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtaga 93186
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 155673 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 155615 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 155614 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 155555 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 155554 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 155495 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 155494 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 155435 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 155434 ttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 155375 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 155374 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 155315 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 155314 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 155255 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 155254 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 155195 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 155194 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 155136 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 155135 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 155078 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 155077 atgttatgagtgt 155065
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39787 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 39729 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 39728 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 39669 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 39668 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 39609 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39608 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 39549 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 39548 ttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 39489 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39488 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 39429 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 39428 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 39369 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39368 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 39309 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 39308 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 39250 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 39249 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 39192 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 39191 atgttatgagtgt 39179
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10351919 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 10351977 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 10351978 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 10352037 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 10352038 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 10352097 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352098 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 10352157 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10352158 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 10352217 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352218 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 10352277 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 10352278 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 10352337 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352338 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 10352397 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 10352398 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 10352456 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352457 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 10352514 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 10352515 atgttatgagtgt 10352527
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 529/556 (95%), Gaps = 3/556 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1 ctaaagcaggtgttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactc 60 Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 cagagtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctg 120 Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggttccccctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatgga 180 Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaagggacgatgctatcaca 240 Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355 ||||||| ||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tcgagcccgttcctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacc 300 Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415 ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 301 tatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtt 360 Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 361 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaa 420 Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 421 ctttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-c 479 Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 cgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 538 Query: 596 tagaagcgtgttatga 611 ||| |||||||||||| Sbjct: 539 tag-agcgtgttatga 553
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggaatacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgaacccgttcctggggaagaggatcaatatatctgttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagatctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 421 cctcctgcttatgcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagtcgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcatgttatgagtgt 576
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacattgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 503/522 (96%), Gaps = 3/522 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 94 tataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagca 153 |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 tataaattgacttactacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagca 60 Query: 154 ttccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgcc 213 |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ttccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgcc 120 Query: 214 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 180 Query: 274 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgt 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 181 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgt 240 Query: 334 tatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcc 393 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcc 300 Query: 394 attgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacga 453 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 301 attgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacga 360 Query: 454 attccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 513 |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 attcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 420 Query: 514 gataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgg 573 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 gataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgg 478 Query: 574 gattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 gattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 519
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 503/522 (96%), Gaps = 3/522 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 94 tataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagca 153 |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 tataaattgacttactacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagca 60 Query: 154 ttccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgcc 213 |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ttccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgcc 120 Query: 214 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 180 Query: 274 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgt 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 181 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgt 240 Query: 334 tatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcc 393 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcc 300 Query: 394 attgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacga 453 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 301 attgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacga 360 Query: 454 attccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 513 |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 attcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 420 Query: 514 gataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgg 573 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 gataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgg 478 Query: 574 gattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 gattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 519
>emb|AJ746296.1| Nardus stricta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1297 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 515/538 (95%), Gaps = 3/538 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 78 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatac 137 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1 agctggtgttacagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatac 60 Query: 138 tgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 197 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 tgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcagg 120 Query: 198 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 257 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggctgctgtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 180 Query: 258 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 317 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 taccagtcttgatcgttacaaaggacgctgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 240 Query: 318 cagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttac 377 | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 241 aaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttac 300 Query: 378 taacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacg 437 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 taacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacg 360 Query: 438 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatgg 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 361 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccacctcatgg 420 Query: 498 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtact 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 421 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtact 478 Query: 558 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 535
>gb|AY632362.1| Buergersiochloa bambusoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1171 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 523/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttccgccc 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 gctggggaagaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagctcta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg-ccgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|AC135419.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 5 clone OSJNBa0044P19, complete sequence Length = 176917 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 142829 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 142887 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 142888 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccagagta 142947 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 142948 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccgggggttcc 143007 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 143008 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaactgt 143067 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 143068 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 143127 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 143128 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 143187 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 143188 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 143247 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 143248 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccttacttattcaaaaactttcta 143307 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 143308 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 143366 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 143367 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 143424 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 143425 atgttatgagtgt 143437
>gb|AC135429.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 5 clone P0636F09, complete sequence Length = 177374 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 85406 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 85464 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 85465 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccagagta 85524 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 85525 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccgggggttcc 85584 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 85585 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaactgt 85644 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 85645 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 85704 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 85705 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 85764 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 85765 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 85824 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 85825 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccttacttattcaaaaactttcta 85884 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 85885 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 85943 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 85944 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 86001 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 86002 atgttatgagtgt 86014
>dbj|AP008211.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 5, complete sequence Length = 29737217 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 20829605 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 20829663 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 20829664 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccagagta 20829723 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 20829724 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccgggggttcc 20829783 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 20829784 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaactgt 20829843 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 20829844 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 20829903 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 20829904 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 20829963 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 20829964 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 20830023 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 20830024 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccttacttattcaaaaactttcta 20830083 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 20830084 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 20830142 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 20830143 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 20830200 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 20830201 atgttatgagtgt 20830213
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 355 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 413 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 414 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 473 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 474 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 533 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 534 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 593 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 594 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 653 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 654 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 713 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 714 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 773 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 774 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 833 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct: 834 aggtccgcctcatggtatggaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 892 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 893 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 950 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 951 atgttatgagtgt 963
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 519/545 (95%), Gaps = 3/545 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccagagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 61 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccccct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggagctgcagtagctgcngaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaagggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggc 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatga 611 ||||| Sbjct: 538 tatga 542
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 571/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613110 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 5613168 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 5613169 aaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 5613228 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 5613229 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 5613288 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613289 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 5613348 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5613349 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 5613408 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613409 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 5613468 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct: 5613469 agagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttcaaagc 5613528 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613529 cctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 5613588 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| Sbjct: 5613589 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaata-cgatcgtcctt 5613647 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5613648 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 5613705 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 5613706 atgttatgagtgt 5613718
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 571/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613099 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 5613157 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 5613158 aaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 5613217 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 5613218 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 5613277 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613278 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 5613337 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5613338 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 5613397 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613398 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 5613457 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct: 5613458 agagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttcaaagc 5613517 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5613518 cctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 5613577 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| Sbjct: 5613578 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaata-cgatcgtcctt 5613636 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5613637 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 5613694 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 5613695 atgttatgagtgt 5613707
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 571/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62 ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39775 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 39717 Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122 | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 39716 aaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 39657 Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 39656 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 39597 Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39596 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 39537 Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 39536 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 39477 Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362 |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39476 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 39417 Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct: 39416 agagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttcaaagc 39357 Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39356 cctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 39297 Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| Sbjct: 39296 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaata-cgatcgtcctt 39238 Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 39237 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 39180 Query: 603 gtgttatgagtgt 615 |||||||||||| Sbjct: 39179 atgttatgagtgt 39167
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 520/547 (95%), Gaps = 3/547 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 65 gtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatg 124 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | Sbjct: 1 gtgttggatttaaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccagagtacg 60 Query: 125 aaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgc 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct: 61 aaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccc 120 Query: 185 ccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgttt 244 | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgttt 180 Query: 245 ggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctg 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 181 ggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccg 240 Query: 305 ttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagg 364 || ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 241 ttcctggggatgaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaag 300 Query: 365 agggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 301 agggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccc 360 Query: 425 tacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaag 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 tacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaag 420 Query: 485 gcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtccttta 544 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 421 gtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtccttta 479 Query: 545 ttggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgt 604 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 480 tt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgt 537 Query: 605 gttatga 611 ||||||| Sbjct: 538 gttatga 544
>emb|AJ746295.1| Molinia caerulea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 529/559 (94%), Gaps = 3/559 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116 ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagccggtgttaaggattataaattgacttactacacccc 60 Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 61 ggagtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccgg 120 Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggac 180 Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240 Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356 |||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cgagcccgttcctggggacgaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacct 300 Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416 |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 301 atttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360 Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 361 caaagccctacgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaac 420 Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 421 tttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-cc 479 Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538 Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615 || |||||||||||||||| Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 531/562 (94%), Gaps = 3/562 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacac 60 Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 120 Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggggttccgcccgaagaagccggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 180 Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 240 Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353 ||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 300 Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 360 Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaa 420 Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 421 aactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg 480 Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593 ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 -ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 538 Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 ggtag-agcgtgttatgagtgt 559
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 531/562 (94%), Gaps = 3/562 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacac 62 Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 63 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 122 Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 gggggttccgcccgaagaagccggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 182 Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 183 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 242 Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353 ||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 243 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 302 Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 362 Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 363 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaa 422 Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 423 aactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg 482 Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593 ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 483 -ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 540 Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 541 ggtag-agcgtgttatgagtgt 561
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccacctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 gggg-tgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 530/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 60 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 ccggaatacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccc 120 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatgg 180 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 ||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 241 atcgaacccgttcctggggaagacagtcaatatatctgttatatagcttatccattagat 300 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcaattgtgggtaacgtatttggt 360 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| Sbjct: 361 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctgcttatgcaaaa 420 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 421 actttccaaggtccacctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg- 479 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 480 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatg 538 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|U31379.1|MPU31379 Monachather paradoxus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|AY632365.1| Melica cupanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1267 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 496/516 (96%), Gaps = 3/516 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 100 ttgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccga 159 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ttgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccga 60 Query: 160 gtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatct 219 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 gtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggagctgcagtagctgccgaatct 120 Query: 220 tctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaa 279 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 tctactggtacatggacaacagtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaa 180 Query: 280 ggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgta 339 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 181 ggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagatggccaatggatcgcttatgta 240 Query: 340 gcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtg 399 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 gcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgta 300 Query: 400 ggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccc 459 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 301 ggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaagatctacgaattccc 360 Query: 460 cctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 519 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 420 Query: 520 ttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattat 579 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattat 478 Query: 580 ccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 ccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 513
>gb|AY691638.1| Pyrrhanthera exigua ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 531/563 (94%), Gaps = 3/563 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108 ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttaaagccggtgttaaagattataaattgacttat 60 Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 61 tacactccagagtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120 Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228 |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 121 cagcctggggttccccctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggt 180 Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240 Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348 |||||||||||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 tatcacatcgagcccgttcctggggatgaagggcaatatatctgttatgtagcttaccca 300 Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaatgta 360 Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttat 420 Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggtccgcctcacggtatccaagttgaaagggataagttgaacaag 480 Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588 ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 tatgg-ccgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538 Query: 589 attatggtagaagcgtgttatga 611 |||||||||| |||||||||||| Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatga 560
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 501/523 (95%), Gaps = 3/523 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 93 ttataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagc 152 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ttataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagc 60 Query: 153 attccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgc 212 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 61 attccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgc 120 Query: 213 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 272 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgaatcttcgactggtacatggacaacagtttggactgacggacttaccagtcttgatcg 180 Query: 273 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctg 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 181 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagagggccaatggatcgc 240 Query: 333 ttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttc 392 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 ttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttc 300 Query: 393 cattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacg 452 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 301 cattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacg 360 Query: 453 aattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaag 512 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 aattccccctacttattcaaaaactttccaagggccgcctcatggtatccaagttgaaag 420 Query: 513 agataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattg 572 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 agataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattg 478 Query: 573 ggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 ggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 520
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 543/579 (93%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaaggccgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaaatacgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattatggtag-agcatgttatgagtgt 576
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 501/523 (95%), Gaps = 3/523 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 93 ttataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagc 152 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ttataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagc 60 Query: 153 attccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgc 212 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 61 attccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgc 120 Query: 213 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 272 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgaatcttcgactggtacatggacaacagtttggactgacggacttaccagtcttgatcg 180 Query: 273 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctg 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 181 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagagggccaatggatcgc 240 Query: 333 ttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttc 392 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 ttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttc 300 Query: 393 cattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacg 452 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 301 cattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacg 360 Query: 453 aattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaag 512 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 aattccccctacttattcaaaaactttccaagggccgcctcatggtatccaagttgaaag 420 Query: 513 agataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattg 572 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 agataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattg 478 Query: 573 ggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 ggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 520
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 543/579 (93%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaggattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagctggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacattgagcccgttgttggggaagaaaatcaatatatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttggtttcaaagctctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 cccactacttactcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-gcgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 533/566 (94%), Gaps = 3/566 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 50 cagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1 cagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttatt 60 Query: 110 acaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 169 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 61 acaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctc 120 Query: 170 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 229 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 agcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 180 Query: 230 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 181 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaagggcgatgct 240 Query: 290 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccat 349 ||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 241 atcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccat 300 Query: 350 tagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 409 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 tagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 360 Query: 410 ttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttatt 469 |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 361 ttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttatt 420 Query: 470 caaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 529 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 421 caaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagt 480 Query: 530 atggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 589 | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 acgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 538 Query: 590 ttatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 ttacggtag-agcgtgttatgagtgt 563
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccagggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 62 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 63 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagccg 122 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 123 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 182 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 183 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 242 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 ||||||||||||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 243 atcgagcctgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 302 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 303 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 362 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 363 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactgcttattcaaaa 422 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 423 actttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 481 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 482 ccgtcctttctt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 540 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 541 gtag-agcgtgttatgagtgt 560
>emb|AJ746175.1| Bambusa emeiensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 707 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 60 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 120 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 180 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 |||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 300 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 360 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 361 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaa 420 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 421 actttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 479 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 538 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 61 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 62 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 121 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 122 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 181 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 182 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 241 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 |||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 242 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 301 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 302 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 361 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 362 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaa 421 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 422 actttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 480 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 539 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 540 gtag-agcgtgttatgagtgt 559
>emb|AJ746170.1| Bambusa multiplex chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 707 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 60 Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 61 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 120 Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 180 Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240 Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354 |||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 300 Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 360 Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 361 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaa 420 Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 421 actttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 479 Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 538 Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccagggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccagggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 ctcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggaatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 517/545 (94%), Gaps = 3/545 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttattacactccagagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 61 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccccct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaggaagcaggagctgcagtagctgcagaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaggaagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatga 611 ||||| Sbjct: 538 tatga 542
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 531/564 (94%), Gaps = 3/564 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 52 gaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactac 111 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1 gaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttattac 60 Query: 112 accccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcag 171 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 61 accccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcag 120 Query: 172 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 231 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 180 Query: 232 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 181 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaagggcgatgctat 240 Query: 292 cacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 351 ||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 241 cacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccatta 300 Query: 352 gacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 411 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 360 Query: 412 gggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattca 471 || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 ggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattca 420 Query: 472 aaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtat 531 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 421 aaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtac 480 Query: 532 ggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaatt 591 || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 gg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaatt 538 Query: 592 atggtagaagcgtgttatgagtgt 615 | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 acggtag-agcgtgttatgagtgt 561
>emb|AJ746174.1| Dendrocalamus brandisii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 703 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 528/560 (94%), Gaps = 3/560 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccc 60 Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgg 120 Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180 Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240 Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355 ||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacc 300 Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 301 tatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360 Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 361 tcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaaa 420 Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | Sbjct: 421 ctttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg-c 479 Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 cgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 538 Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615 ||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>emb|AJ746173.1| Dendrocalamus barbatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 702 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 528/560 (94%), Gaps = 3/560 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccc 60 Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgg 120 Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180 Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240 Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355 ||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 tcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacc 300 Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 301 tatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360 Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 361 tcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaaa 420 Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | Sbjct: 421 ctttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg-c 479 Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 480 cgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 538 Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615 ||| |||||||||||||||| Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 542/579 (93%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60 Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156 |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattc 120 Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 cgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180 Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240 Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336 ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||| Sbjct: 241 aaaggccgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttat 300 Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360 Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacttctggaggatctgcgaatt 420 Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480 Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576 ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 481 aagttgaacaaatacgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538 Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattatggtag-agcatgttatgagtgt 576
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 529/562 (94%), Gaps = 3/562 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 17 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttattacac 76 Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 77 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 136 Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 137 cggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 196 Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 197 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaagggcgatgctatca 256 Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353 ||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 257 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattaga 316 Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 317 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 376 Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 377 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaa 436 Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 437 aactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg 496 Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 497 -ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattac 554 Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 555 ggtag-agcgtgttatgagtgt 575
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 519/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||| Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccggaatacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 519/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttaaagccggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggacgatggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctactacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 519/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttactacactccggagtacgaa 60 Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120 Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180 Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacattgagcccgtt 240 Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366 |||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 241 cctggggaagaaagtcaatatatctgttatatagcttatccattagacctatttgaagag 300 Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360 Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420 Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479 Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537 Query: 607 tatgagtgt 615 ||||||||| Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb|AY632364.1| Glyceria grandis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1267 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 494/516 (95%), Gaps = 3/516 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 100 ttgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccga 159 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1 ttgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccga 60 Query: 160 gtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatct 219 |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 gtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatct 120 Query: 220 tctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaa 279 || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 tcgactggtacatggacaacagtttggactgacggacttaccagtcttgatcgttacaaa 180 Query: 280 ggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgta 339 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 181 ggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagagggccaatggatcgcttatgta 240 Query: 340 gcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtg 399 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 241 gcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgta 300 Query: 400 ggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccc 459 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 301 ggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccc 360 Query: 460 cctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 519 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 cctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 420 Query: 520 ttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattat 579 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 421 ttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattat 478 Query: 580 ccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 479 ccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 513 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,921,215 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4921215 Number of successful extensions: 176934 Number of sequences better than 10.0: 16909 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 16411 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 503 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 123983 Number of HSP's gapped (non-prelim): 34576 length of query: 615 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 592 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10148832240768 effective search space used: 10148832240768 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)